Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_152238.4
Sequence Length
1571 nt
GC Content
0.4169
GCACUCUCGGGAUGGAGGGCGAGCGCCGGGCAUCGCAGGCGCCCUCCUCGGGCCUCCCGGCCGGGGGCGCCAACGGGGAGAGCCCGGGGGGCGGCGCCCCCUUUCCGGGCAGCAGUGGCUCUUCCGCCCUGCUGCAGGCGGAGGUGCUGGAUCUGGACGAGGACGAGGACGACCUGGAGGUGUUCAGCAAGGAUGCCUCAUUGAUGGACAUGAACUCCUUCAGCCCUAUGAUGCCAACAUCCCCUUUAUCAAUGAUAAACCAAAUCAAGUUUGAGGAUGAACCAGAUUUAAAGGAUCUCUUCAUCACAGUUGAUGAACCUGAAAGUCAUGUUACUACAAUAGAAACUUUCAUUACGUAUAGGAUUAUUACUAAGACAUCUCGUGGGGAAUUUGACUCCAGUGAAUUUGAAGUUAGGAGACGAUAUCAAGAUUUCCUUUGGUUGAAGGGAAAACUGGAAGAAGCACACCCCACUCUGAUUAUUCCAGAACUCUCUUCUCACAAGAAGCAAGGUCCUGGCUUGCUAAGCAGGAUGGGGCAAACCGUCAGAGCUGUUGCGUCCUCAAUGAGAGGAGUUAAAAACCGCCCAGAGGAGUUCAUGGAAAUGAAUAACUUUAUUGAACUAUUUAGCCAGAAAAUAAAUUUGAUAGAUAAAAUAUCUCAGAGAAUUUAUAAGGAAGAAAGGGAAUAUUUUGAUGAAAUGAAAGAAUAUGGCCCAAUUCAUAUUCUGUGGUCAGCGUCAGAAGAGGAUCUGGUUGAUACUCUAAAGGAUGUUGCCAGCUGCAUUGACAGAUGCUGUAAGGCCACUGAAAAGCGGAUGUCUGGACUCUCAGAGGCCCUGCUUCCUGUUGUACAUGAGUACGUGCUUUAUAGUGAAAUGUUAAUGGGUGUUAUGAAAAGAAGAGACCAAAUACAAGCAGAACUGGAUUCCAAAGUUGAAGUUUUGACCUAUAAAAAGGCAGAUACUGAUCUGCUUCCAGAGGAGAUUGGAAAACUUGAAGAUAAAGUGGAAUGUGCUAAUAAUGCCCUGAAAGCAGAUUGGGAGAGAUGGAAACAAAAUAUGCAAAAUGAUAUCAAGUUAGCAUUUACAGAUAUGGCUGAGGAGAAUAUCCAUUAUUAUGAACAGUGCCUUGCUACGUGGGAGUCAUUCCUUACAUCACAGACCAACCUUCACUUGGAAGAAGCCUCUGAAGAUAAACCUUAAUCCCAUUGAGGACUUCUGUUUGAUCUUUGGGAGACAGCAUUUAUUAACCAAAGUUAUUCUUUCUGGAUCUGCCGUGUCCUUAUAAAGUGGAUGAAAAAUGUUUUGUACCCAUCUGGAAAACCAACAACUUGAAAUCUCAGGUAUUCCAGGUCACUGACAUGAAUUUGAAGAUAUAUCUAUCUGUAUGGAUAUAUAUCUAUAUGUAUAUAGAUAUAUAAAUACAGAGAGAUAUCUGGCUUGGUUUUAAUUAUGUUCUUAAAUUUGUGUGCCAAUAAUUGCAUAUAGAUUUUUUUUCUUAAAUAUUUGACUGUGGAACAUGCCAUUUUAAAUAUGUUGUAAGGACUGUUUUAAUAAAAAGUUUAGUAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-468.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -497.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 362.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((((.((.(((((..((((((((.((...)).)))).(((((((((((((.(..((.....))..).))))).)))))))))))).))))))).)))))))((((((.(((......)))))))))((((.((((((..(((.((((((.(((((....(((..((...(.((....(((((((.(((.(((((((((((.((...(((((.(((((.(((((((....))))(((((((((...)))))).....((((.((((.((((...((((.(((...((.(((((((...((((((((((....(((((((..((((.....))))...)))))))....((.(((........)))..)).....((((((........((((((...(((.((.(.(((((((........).))))))..).)).))).....)))))).........))))))((((.......)))).((..(((((....)))))..))(((((..(((((...)))))..)))))....)))))..))))).((.(((((.....))))))).......(((((((((..((((((....))))))..)))((((..(((((..((((.....((((((((..((((((...))))).)..)))))))).((((((..((((..((((((...))))))..(((((((((......))))))))).(((.(((((((...((((..((.....))..))))....)))))))))).((((.((..(((..(((....)))..)))..)))))).(.(((((....))))).))))).))))))...((((....))))).)))..)))))..))))....)))))).........)))))))))..........))).)))))))))))).))))(((((((.(((......))))))).)))(((((((((.(((.((..(((((...((((.......))))........)))))....))))).))))))))))))..(((((..(((...((((........))))...)))..)))))....))).)))))))))).)).)))))))..))))...)))))))))))).)))..)))..)))))...)).))))))))))))).))))..(((((((((....(((........))).....)))).)))))....(((((..((((((.(((..............)))..)))))).))))))))...((((((((((.(.((((((((....)))))).)))((((((((.(((.................))).))))))))....(((((((...(.(((..((((((.(((((((...((((((((((((....)))))))))))).))))))).))))))....))).)......)))))))...((((((((((((........))))))))))))..........((((((((..((((......)))).)))))))).))))))))))..........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{,,(((((((.((.(((((,,({{{{{||.||,}.||{||||{(((((((((((((,(..{{....,))..}.))))).)))))))))),),))))))).))))))|((((((.(((......)))))))))|{((.((((((..(((.((((((.(((((....(((..((,.,,,{{{,,,{((((((,({{.(((((((((((.{(...(((({{(((((.((((((({.,,{|||{,,((((((...|}}},,.,,.,({{,|||||.{{{{{,,,,(({(({...})}}}}.||||{{,....})))))}..(((((((..((((.....))))...))))))).....,,{({,..,,..,}},..,{{{{{{((((((....,..{((((((...{((((.{({.(,.,,|,}}.}}}}}.||((((({.....))))))},)))))).}.......))))))((((.......))))..((((((((.......((((((.......)))))).(((,,(((((......)))))...}))}||{{.(((((.....)))))},.....,.(((((((((..((((((....))))))..))){(((..(((((..(((,.....((((((((..{(((((...))))).}..)))))))).((((((..((((..,,{{({...,}}},...(((((((({......})))))))).(((.(((((((...((((.,((.....)),.))))....)))))))))),({((,((..{{|,}||{,,..}}|,.||}..,})})).{.((((,....))))).})))).))))))...((((....))))).)))..)))))..)))}....))))))........))))))))...........{{{{{{(,{{{|,,..}}))..}))}})).(((......)))|||,..{{(((((((((.(((.((..(((((...{{((.......))))......,.)))))....))))).}))))))))))..}}||||..,,,...{{((.,....,,}}}}...))).})))),....))).)))))))))).)).)))))))..))))...)),)))))))}},|)),.)))..)))))...)).))))))))))))).)))}..(((((((((....(((........))).....)))).))))),,..(({((.,((({((.{{{,{{,.....,.}}})}}..}))))}.))))),}),..((((((((({.{{(({(((({....})))}).,))||{(((({.{{{....,{{(((....)))))).}}}|||||,...{{{{{{{...|,,((,,((((((.(((((((...((((((((((((....)))))))))))).))))))).)))))),},,}))}),,,...}}}}}},...((((((((((((........))))))))))))..........((((((((..((((......)))).)))))))).)))))))))),,,.,.............,,......
Back