Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_152410.3
Sequence Length
1628 nt
GC Content
0.4730
AGAUCUAUCUGGAGGAGUUUCUGUGGAGCCAGCCACCCUCACCAGGUGCCUUCCAUUAGAGUUUAAUGCUUUGCUGCGGUUUCCUGAAAGAGCCCCACAGAGAGUGGGUCUCGAUGGGUCCUGAACCGCACCACAACCGGCCAGUGAGACCUCCUGCUCACAUCCGUAAAGCCCACUGAUUCUUUUACUACACUUUUUAUGAGAACAAGACAUUUUCUAGGAAGAUGGUGGCAGAAAAAGAGACCCUGAGCUUAAACAAAUGCCCAGACAAGAUGCCGAAGAGGACCAAGCUGCUGGCACAACAGCCGCUCCCGGUGCACCAGCCUCACUCUCUGGUUUCUGAGGGUUUCACAGUCAAAGCCAUGAUGAAAAACUCAGUCGUGAGAGGCCCUCCAGCUGCAGGGGCAUUUAAAGAAAGACCAACCAAGCCCACAGCAUUUCGAAAAUUCUAUGAGCGAGGUGACUUCCCAAUUGCCCUUGAGCAUGAUUCGAAAGGAAACAAAAUCGCCUGGAAGGUAGAAAUUGAGAAGCUGGAUUACCAUCAUUAUCUGCCUCUGUUUUUUGAUGGGCUUUGUGAAAUGACAUUUCCCUAUGAGUUUUUUGCUCGGCAAGGAAUCCACGACAUGCUGGAACACGGUGGGAACAAGAUCCUACCUGUCCUUCCACAGCUCAUUAUCCCGAUAAAAAAUGCCUUGAACCUCCGAAACCGACAGGUCAUCUGUGUCACUCUCAAGGUCCUCCAGCAUCUGGUUGUGUCAGCUGAGAUGGUGGGCAAGGCCUUGGUGCCUUAUUACCGUCAAAUCCUCCCUGUCCUGAACAUCUUUAAGAAUAUGAAUGGGUCUUACUCUUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCAUGGCUCGUUGCAACCUCGACCACCUGGGCUCAAGUGAUCCUCCCACCUCAGCCUCUCAAGUAGCUGAGAUUAUAGUGAACUCCGGAGACGGCAUUGACUACAGCCAGCAGAAGAGGGAGAACAUUGGGGACUUGAUCCAGGAGACACUGGAGGCCUUCGAGCGCUACGGAGGAGAAAAUGCCUUUAUCAACAUUAAGUACGUGGUCCCAACCUACGAGUCUUGCUUGCUAAACUAACAGUGGCAGCAGCUGGGACUUGAAACCUCCCGUUGGUGUUGGGAUCAUCUGUCUCUGUUGCUUUUAGCAUCUCAUUCCUUGUGACUUCCACAGCUUUCUUUUCUACAGCUGCUAAAAUAGUGGCUUAUGGGCCAUUGGACUGUUAGCCCUAUUGAGAGCAAGGCUUUCCAAUACAUAAAUAGUGUCUGUUUCUUAGAUUACAAUAGUGUACUGUGCUUAUUUGUUCUAAGAGAAGAAUUGCUUCUUUAUACAGCUCCGACAGAAGCAGGAGUCCGAGUUAAACCUUCAGUUGUAUAGACAAUAAACUAUAAUUUUCAUAUGCAAUUCAGCAAUUGCUGUUCUGUGUGUGCCUGCCCUGGGGGUGAUGUCAGAGGUUGUAAGGGAAGAGUUUAUGCUGACUGCUUACUAGGUGUUUGUCAUGGAAGAGAAGCAUGGGUUCAGCAGUGCCUCUCUAGCAGCUGUGCGGAAUAAUGUGCUUUGACAUUCAAUAAAACUGUUGAAUCUAUAUUCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-502.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -532.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 426.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((((((.(((((((.((((.((.((((.......)))).))......((((((....((((((((((((((((((....(((.(((((.....))))).)))...)))....))))))))((......))...(((((........)))))....))))))).....)))))).........(((((((.(((((.......))))))))))))((.(((((.((....((((((((.((.............(((((...((.((.(....(.(((.(((.((((......)))).)))...))).)..).)).))....)))))...)).))))))))....))...))))).))(((((((((((((((..(((((((..(((..(((((((((..(((.((.................((((.((((((...((((((...(.((((((.........(((......)))((.(((.....))).))...)))))).)...)))))).)))))).))))........)).)))..)))))))))...)))..))))))).....))))).........)))))))))))))).)).))))))))..........(((.((.(((((((......))))))))))))...((.(((.((((((.(((.........((((((((((((((..(((....))).....(((((.((.(((((.(((((((((..............)))).((((((((..(((((......))))).)))))))).....((((((.(.(((....................((((..(((((....(((((((.(.(((((((((((.((.......))))))))))..))).)...)))))))...)))))....)))).((((((..(....)..))))))....((((.((..(((....)))..)).)))).......))).).))))))......))))))))))...))..)))))))))))..)))))).))...((((((((...(((......(((((...((((.(((((((((((...(((((((((((.(((..(((...)))...)))))).))))))))..(((.......)))))))))))))).)).)).)))))......))))))).))))(((((.....)))))..........(((((((((((....(((((((....)))))))(((((((((((((((((((((((...))))).)))))(((.....)))(((.(((((((((..((((....(((...)))....))))))))))))))))..(((((((((.......(((((((((.((((.((((..((((((((((((.(((((....))))).............((((((((...((((....))))...))))))))((((((((((.(....).)))).)))....))))))).))))).))))))).))......)).))))))..)))))))))))).))))).)))))).))....)))))))))))))).)))))).))).))..((((((((....))))))))......)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........(((((({{({(((((((((,..(,{(((,,.....))}),}}}}}}..|{{{{{....((((((((((((((((((,...(((.(((((.....))))).)))..,)))....)))))))){{......||...(((((........)))))....))))))).....}}||||.,{,{{,..(((((((.(((({.......}))))))))))),}))})}|,||,...(((((((({.({..........}},||,...{((.(({{.{((({({{.(((.((((......)))).)))...|||,|....)),}}.}}}),)))).})).})))))))...{||,,,|||||{||{{,,,,{|||(((((|.{((((((,,{({..(((((((((..({{.{,..,......,..,..,.{(((.((((((...((((((...(.((((((.||......{|||,|||,}},,,.|||,...})},.,....)))))).)...)))))).)))))).))))|.......}}.}}}..)))))))))...}}),.))))))}{{...},|}},.,{{{...|||||,,,,,))))},,..)))}||}|},,,..|.|(({{{(.(((((((......))))))))))},,}}||.|||.((((({.(((.........((((((((((((({...,{...,|||{.{{{(,((({,({((((.((,((((,.(.,((((((({{{{||||{.((((((((..(((((......))))).)))))))).....(((({{.(,(((....,,,....,,....,..{(((..(((((....(((((((.(,(((((((((((,{(.......))})))))))..))).,,,,)))))))...)))))....)))}.((((((..(....)..))))))....|||,.|,..,,|}}}.)))}.,)})),)}))}}}},}}..,,,)))).}}.}))))),,,)))}.}))).))),)))))))..)))))).))...((((((({..,(((......(((((...((,(,(((((((((((,,.((((((({(({{(((..{((...}}),,.)))))).})))))))..{{{.......))}))))))))))).}),)).)))))......))))))).}))){((((.....))))}..........(((((((((((....(((((((....)))))))((((((((((((({(((((((((...)))))},)))}{{{.....}}}{((.(((((((((..(((({((.((,...}))}}},)))})))))))))))}..(((((((((.,,,,{({((..,,,{,{{{|,|||{.{,(.{{{{{{{{{,((((((((({,|{{........,,,.,|{||||||,,,((((,...|||},,,|}}}}}}|({{(((((((.{....}.)))).))).,,.)})))),,))}},})))))))})},....)).}))))}}.})},})))))))).))))).)))))).))....)))))))))))})).)))))).))),))},((((((((....)))))))).....,))),.
Back