Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_152501.5
Sequence Length
2088 nt
GC Content
0.3807
AGAGUAUGAGGAAGCCAGCACUAGUCAAGUGACUCUAAGAAGGGCCAUUUUCCCUUGUUGUCUUUGAAAAUACUUCAUUUUCUUAGCAUUUCAGGAGAUUAUAACAUCCUGUAUUUCAGUUUCUGAGAGCUUUACUGACUGAUUUCCCUAUUCAAAACAAUCCUCAUUUCCUACAUUUCUGAAGAUCUCAAGAUCUGGACUACUGUUGAAGAAAUUCCCAGUAAGGCUCACUUAUAUCUUUAGAGAUGGCAAAUAACUACAAGAAAAUUGUUCUACUGAAAGGAUUAGAGGUCAUCAAUGAUUAUCAUUUUAGAAUUGUUAAGUCCUUACUGAGUAACGAUUUAAAACUUAAUCCAAAAAUGAAAGAAGAGUAUGACAAAAUUCAGAUUGCUGACUUGAUGGAGGAAAAGUUCCCAGGUGAUGCCGGUUUGGGCAAACUAAUAGAAUUCUUCAAAGAAAUACCAACACUGGGAGACCUUGCUGAAACUCUUAAAAGAGAAAAGUUAAAAGUUGCAAAUAAAAUUGAAUCCAUUCCAGUCAAAGGAAUAAUCCCAUCUAAAAAGACGAAACAGAAAGAAGUGUAUCCUGCUACACCUGCAUGCACCCCAAGCAACCGUCUCACAGCUAAAGGAGCAGAGGAGACUCUUGGACCUCAGAAAAGAAAAAAACCAUCUGAAGAAGAGACUGGAACCAAAAGGAGUAAGAUGUCCAAAGAGCAGACUCGGCCUUCCUGCUCUGCAGGAGCCAGCACGUCCACAGCCAUGGGCCGUUCCCCACCUCCCCAGACCUCAUCAUCAGCUCCACCCAACACUUCCUCAACUGAGAGCCUAAAACCAUUGGCCAACCGUCACGCAACUGCCAGUAAAAAUAUUUUCCGAGAAGACCCAAUAAUCGCGAUGGUACUAAAUGCAACAAAAGUAUUUAAAUAUGAAUCCUCAGAAAAUGAGCAAAGAAGAAUGUUUCAUGCUACAGUGGCUACGCAGACACAGUUCUUUCAUGUGAAGGUUUUAAACAUCAACUUGAAGAGGAAAUUCAUUAAAAAGAGAAUCAUCAUUAUAUCAAAUUAUUCCAAACGUAAUAGUCUCCUAGAGGUGAAUGAAGCCUCUUCUGUAUCUGAAGCUGGUCCUGACCAAACGUUUGAGGUUCCAAAGGACAUCAUCAGAAGAGCAAAGAAAAUUCCGAAGAUCAAUAUUCUUCACAAACAAACUUCAGGAUAUAUUGUAUAUGGAUUAUUUAUGCUACAUACGAAAAUUGUAAAUAGGAAGACGACAAUCUAUGAAAUUCAGGAUAAAACAGGAAGUAUGGCUGUAGUAGGAAAAGGAGAAUGCCACAAUAUCCCCUGUGAAAAAGGAGAUAAGCUUCGACUCUUCUGCUUUCGACUGAGAAAGAGGGAAAAUAUGUCAAAACUGAUGUCAGAAAUGCAUAGUUUCAUCCAGAUACAGAAAAAUACAAACCAGAGAAGCCAUGACUCCAGGAGCAUGGCACUACCCCAGGAACAGAGUCAGCAUCCAAAACCUUCAGAGGCCAGCACAACCCUACCUGAAAGCCAUCUCAAGACUCCUCAGAUGCCACCAACAACCCCAUCCAGCAGUUCCUUCACCAAGAAGGAUGAAACCCACCCAGGAGCACAGUCAUCGCCUGCAAACUUUAGAAUCACCUCACCAACUGUGGCCCCUCCUCUUUCUUCUGACACUUCCACCAACCGCCAUCCAGCAGUUCCUUAAAUAAGGUCACCAAGGACAAGGAUAUCAAAUAACUACUGUUCAAUCUUUACUCAAGUGUGGAAAUUUUGCCUGAAGUCCUCCACCUAAAAACCUGAUGCCAUUGGUAAUGAUGUUUAUGAAGAUAAGAUCAAAGCACAGAAAAUAAUAUAUGUAUAUAUAUCUGGUUGAAAUACUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUACCAGCUAUUAAUUCUAGGAAAUGGAGUAUUAAGGGUGCAUUUUAUUUCAUUAGUUUUACUUUUAUGCAUUUUCUUCAUAUCAUAUUUUGCAUUCAGAAUUUUCAUAAUUUGAAAAAAAAUAAACUUUUUUUUCUUAAAGAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-454.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -496.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 635.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((...(((.(((..((((((..((((((((.........((((((............((((((((((((((((((.....((((((((((.((..........((((...))))(((((((((((...((((((....(((((.....(((...................(((((....))))))))......)))))))))))..)))))))))))...............((((((...(((((.((((((.....))))..))...)).)))...)))))).((((((.((.((((((((((......(((((..(((((.....((((((((((..((.....(((((((((.(((((((....((((...(((((.(.((....(((((..........(((((((..((((((((.............((((....))))............(((.(.((((((....((((....))))..........((((........)))).......((((((((...(((....)))(.(((....))).)............(((((...(((.......)))))))).(((((.....(((((...(((.....)))....))))).)))))...(((((..............)))))......))))))))((....)))))))).).)))...(((....)))(((..((((((...))))))))).....(((((......))))).............)))))))).)))))))..................(((....))).(((..........)))..((((((.(((....))...........(((((...)))))..........).))))))..(((((((.......)))))))........)))))...)).).)))))....))))...)))))))...(((....)))........)))))))))..)))))))))))).....)))))..))))))))))..))))).)).)))))).......................)).)))))))))).(((((((.(((((.((((((((((((((......(((((((((..........))))....))))).....(((((((((.(((....(((((((((.......)))))(((..((.(((((..(.(((.(((..((((((((.((..(.(((..(((((...)))))..))).)....)).)))))))).....))).)))...)..))))).))..)))....))))..((......))....((((.(((.......))).))))..))).).))))))))(((((......)))))...((((.((((.((...(((....)))...)))))).))))...))))))))))............))))..((((((.(((...))))))))).......((((....((.(..((.(((.....(((.(((((((((...........)))...))).))).)))(((.((..((((.............)))).)).)))((((((.....)))))).............)))))..).))....))))....)))))...))))))).....(((((........(((((((((.((((.....(((((..((.(((.(((((((((((.......(((......))))))))............)))))).............((.(((((.(((((....)))))..)))))))........)))))..))))).....))))...))))).))))......)))))......((((((((((((((((.((((......)))).))))))))))))))))((((((((((((....))))))))))))....))))........)))))))))))))))))))).........)))).))))..))))))))))))..)))))))))))..((((((...((((((..........))))))..)))))).(((((((......))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.{((((((((((...(((.{{{..{(({((..{((({(((,,.......|||||,,,,.,,,....{((((((((((((((((((((({(((((((({({.{{.,|{||,.,,((((,.,||||(((((((((((...((((((....(((({.....(((,,........,,....||,(((((....))))))))....,,)))))))))))..))))))))))).,,,..,{{{||,||{||{{{.........,,{,....})))|||.||},,}}}||,,}}}|{{||,.{({{{{.((,((((,(,{{({{{,,,(({((,,,{{||}}.|}|||||{{{{|,,|{|..,,||||{{{{{.{{{||||,...,{||.|.,{(((|{,{{,.{{({(({...,{|,...(((((((..((((((((.............{(((....}))}....,.....||(({{{,{{((((....((((....})))....,,.....{{{.|,.......}},......((((((((...(((....))),.(((....})}.,............(((((,..{((.......)))))))).(((((.....(((((.,.(((.....))).,..))))).)))))...(((((...,..........))))).,....)))))))},,....|||}},,}.,.)))...(((....)))(((..((((((...))))))))).|,,,(((({......})))}.}},.,,,,....)))))))).))))))).,}},..........,,,{{{...,|||.(((..........)))..{{((({.{{,....}}.,}}......,{{{{{.,,},,,,........,}).))))))..(((((((.......)))))))........,,||||,....},}|||,.{{{|,,}.|,))})))).,.(((.,..,}},}.}}}..})))))}})||}},)))))}}},..}}.}}})},.))))),|||},,},,,,.}},}}}}}}.............,,,.......)}.))))))))}}.|||||}..,,,,|}|||{(((({{((({{.,.,,(({{{{|||,....,,,.,)))},...}))))..,.,|||||||||.,,{.....,,.(((((.......)))))..,..,,.,||||,,({(((({{(((((((,((({(({.(,(({..(((({...}))))..|||{,.{{.{{,.,}},,,,...{{||{{,||,,.,.{|||||.||..|||{{.{(({{.{((({...{{{{{{.((((.(((.......))).)))).{||,.{{||||||||(((((......))))).{{((({.((((,{{...(((....)))...}))))).})))..,},,,,,,,},..................((((((.(((...))))))))).......,}}}...,)))))}|||{{......{((,((((({,,,...........))),..))),))).})),,,.||..||||}............,,,,..|,||.((((((.....)))))).,....,,....,)),||...,......,))),........{.......,,.....,}))))}..))))|,|}|||||}||}|}}}}},,,{{,.({,,{,.,||.|||((((....,}}|.......{||||||||,.........,..,}))},...,{{{,,...,|.||)}|..||||,}}))))))).)),.))),....,|}},|||,.}})))..,|{{,|{{{,,,,,)}))})}}}.,))),},.,}}}}}|,|||||||}}))}}}|((({{..,,|,|{(((((((((((((((((({,,.|||)))))))))))))))))))),.}}))),......}})))))))))))))))))))),,,,.....}}}}.})))..}))))}}}))))..))))))))))),.{(((((...{(({{{,{{.....,,})))))..}))}}}.(((((((......))))))).
Back