Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_152796.2
Sequence Length
1777 nt
GC Content
0.6083
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-672.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -703.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 506.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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