Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_152827.4

Sequence Length

1439 nt

GC Content

0.4156

CUCUUCGCGACCGCUGCGCGCGAGCCCCGUGUCCCCACGGCGGGCAGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCUGAACGCGGAGGGGGCGGAGGGAGCCCGCGGCGGCGGCAGCAGCUACAGCGAAAUGGCGGAGACCGUGGCUGACACCCGGCGGCUGAUCACCAAGCCGCAGAACCUGAAUGACGCCUACGGACCCCCCAGCAACUUCCUCGAGAUCGAUGUGAGCAACCCGCAAACGGUGGGGGUCGGCCGGGGCCGCUUCACCACUUACGAAAUCAGGGUCAAGGUCGUAGUUCCCCCGCUCCCUGGGAAAGCGUUUUUGCGUCAGCUUCCUUUUAGAGGAGAUGAUGGAAUAUUUGAUGACAAUUUUAUUGAGGAAAGAAAACAAGGGCUGGAGCAGUUUAUAAACAAGGUCGCUGGUCAUCCUCUGGCACAGAACGAACGUUGUCUUCACAUGUUUUUACAAGAUGAAAUAAUAGAUAAAAGCUAUACUCCAUCUAAAAUAAGACAUGCCUGAAAUUUGGCAAGAAGGGGCAAAAACGUGACUAUUAAUGAUUGAUAAGCACCAGUGAAGAAGUUCUAACUUUUAGCAUGCUGCACAGAAACUGGUAUAACAUGCCUUCAGUAUACUAACACUCAUAUGCUCAGUUUUGUUUUGUUUUGGCAGUUGACAAGAAGUUAAUUUGCUUUAGUAAAAAUCCCUCAUUCCAGCCUUUCUAUAUAAAUAGCUCUUUCUUGCUGUUUUAAUGUGGUGCACACUAUAGCCUCACAAACCUGUUAUUCCAGUGUAAUCUGCAGUGUCGUAACUAAAGUUACUGGCUUGGUCUUAUUUGCACAGUUUUUGCGUCUUGUUUGCUUCUUGCAUCUGAUUAACUAGAAUAUUUCUCUUUCCCCCUUUUAAUUUGUGAUGUCACUUGACCCCAUUUAUGUGUAGGAGCACUACACCAUUGGUUUCCAAUACUGCACACAUAAGAUACAUACUUGUGUGCAGAAAGUAUCUUCCUCCAGGCUUGUAAUACCCUUCACAUGGAAGAUUAAUGAGGGAAAUCUUUAUAUUCUGUAUAAAAACAAAAGCAAAUUUAUAUACUAAAAUCAUUUGUCUAAAAAUUUAAGUUGUUUUCAAAUAAAAAUUAAAAUGCAUUUCUGAUAUGCACUGAUUGUGUUGCCUCCAGCUUUUUUUGCUCUCUAUGAGUGACUACUUAAGUCACUUGUUGAGAGGGAUUAUUUACUAAUUAUAUACUUCUCAUUCCUGUAACUCCAUUCCCUUUAAACAGUGGUGAUAUCAAAUAUACUUCCAUCCAUUGAAUGGGGUAUUUUUAACAACAACAAAAGUGAUAUACUAAAAAAUGUAUUGCUUAAGGCUUAUUGAAUCAUUUUGAAGCACUUUGUGUAUUUGAAAACUGCUUUAUAAUCUCAUUUAUUAAAAGGACUUUCAAAGAUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-397.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -426.10

Frequency: 0.0000

Diversity: 304.09

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.((..(((((((.((((.(((((.(((((((.(.(((..((((.((.((....)).)).))))..))).).)))))))..))).)).)))))))))))..))((((((.((((((..((((.(.(((((((.(.((..((((((((........))))))......))..)).)))).)))).)))(((((........(((....))).((..((.....))..))((((((((.(((((..((((......................))))..))))).....))))))))..)))))...))..)))))))).))))(((((((((..(((((((((((((((((((((.((.........(((((((((...(((((((((((((........((((.(((((((((((.....)))).)))..)).)).)))).((((((((((((....(((((.....((((.......))))....))))).....))))))))..))))....((((((((((.(((((((((((.............((((((.((((((..((((((....)))))).))..((((((.....(((((.((((((.......((((((..........))))))........(((((((..((((((((((.....))))).)))))..))))))).........................(((((((........)))))))...(((((.((........)).)))))....)))))).)))))......))))))((((((((....))))).))).))))))))))..))).)))))))).)))).))))))...(((((.(((((...((((((((.....((((((...........(((..(((....)))..)))....((((((.....)))))).(((((...))))).(((((((((.............))))))))).....(((((((...(((.(......).)))......)))))))......)))))).....))))))))....(((((((....((((((.((.((...........)).)).))))))...)))))))........)))))..)))))..........((((.....)))))).))))))))))).((.(((((.((((((((((.....)))))))))).))))).))...................))))..)))))......(((((..........))))))).))))))))))...))))))......(((((((((((((((..(((.(((((((((((((........)))))))))).((((((...(((....))).)))).))))))))..))))))).)))))))).))))).....)))))))))......)))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{{{{,((..(((((((.((((.(((((,(({{{{{,|.{{{..{{{{.||.{{.,..)).)).}}}|..|||.}.|||||||,.|||,||.}}}||}})}}}..}|(((({{.(({{{{..{|((.,.|{|||||||.{.,,{{((((((........)))))).....,,,...,.,||}.,}}|.|||(({{{.....,..(((....))).|{|.|,...,|}}...}||||||||}|{|||,.||||.||,,..,......,.....,})))}..}))))..,,,))))))))},))}}}...})..}))))))),)))}((((((((({,(((((((((((((((((((((.{{.....,|,|((((({((,...(((((((((((((,...,...((((.(((((((((((.....)))).)))..)),,).)))).{(((((((((((....(((((.....((((.......))))....))))).....))))))))..)))}....{(((({((((.(((((((((((.............((((((.((((((.,((((((....)))))}.||{{((((((.,...(((((.((((((.{.....((((((..........}))))}.,|....,{((({,,..((((((((((.....)))))}}})))..,}}}))}.........................(((((((........)))))))...(((((.((........)).)))))....)))))).)))))......))))))||{(((((....))))),}))}))))))))))..))).)))))))).)))).)))))),,.,||....|,,,...{(((((((.....((((((.,..,..,,..(((..(((....)))..)))..,.((((((.....)))))).(((((...))))).(((((((((.............))))))))).....(((((((...(((.,......,.)))......))))))),,,.}.)))))).....)))))))),...{((((((....((((((.{{.((.,,.....,,,)).}}.))))))...))))))}........||||{...{((((.......))))).,,,}}}}}))),})))))))))).{{.(((((.((((((((((.....)))))))))).))))).||..,................,}}),.})))),,....{{{{{..........))))),).)))))))))}..,))))))......(((((((((((((((..((,,(({((((((((((........)))))))))}.{{((({..,(({....)}},)))).))))))))..))))))).)))))))).))))).,},.,))))))))......}})}.....