Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_152868.3
Sequence Length
2065 nt
GC Content
0.6552
GGGAGCGGCGCGGGACGGCCGGGACGCGCGGAGACCCCAAGACCCACGCGCAGACCGAGCGGCAGCCGGGGAGGGGAGCGCGGGCCGGCCGGCCGAGUUCGCGGGCAGGGGGCGCCGGGACUCCCCUUUCCGCGCCCGGGACGCCGCCCGCCGGAUCGCGCCUUGGGAUGUAGCGCCCGCUCGCCGCCUCCCGGACUCUCGUCGGACCCUCCGCCCAGCGGCCCUGCGUCUUCCCAGGUGACCACGCCGGCUUCAGGACAUGCACGGACACAGCCGCAACGGCCAGGCCCACGUGCCCCGGCGGAAGCGCCGCAACCGCUUCGUCAAGAAGAACGGCCAAUGCAACGUGUACUUCGCCAACCUGAGCAACAAGUCGCAGCGCUACAUGGCGGACAUCUUCACCACCUGCGUGGACACGCGCUGGCGCUACAUGCUCAUGAUCUUCUCCGCGGCCUUCCUUGUCUCCUGGCUCUUUUUCGGCCUCCUCUUCUGGUGUAUCGCCUUCUUCCACGGUGACCUGGAGGCCAGCCCAGGGGUGCCUGCGGCGGGGGGCCCGGCGGCGGGUGGUGGCGGAGCAGCCCCGGUGGCCCCCAAGCCCUGCAUCAUGCACGUGAACGGCUUCCUGGGUGCCUUCCUGUUCUCGGUGGAGACGCAGACGACCAUCGGCUAUGGGUUCCGGUGCGUGACAGAGGAGUGCCCGCUGGCAGUCAUCGCUGUGGUGGUCCAGUCCAUCGUGGGCUGCGUCAUCGACUCCUUCAUGAUUGGCACCAUCAUGGCCAAGAUGGCGCGGCCCAAGAAGCGGGCGCAGACGUUGCUGUUCAGCCACCACGCGGUCAUUUCGGUGCGCGACGGCAAGCUCUGCCUCAUGUGGCGCGUGGGCAACCUGCGCAAGAGCCACAUUGUGGAGGCCCACGUGCGGGCCCAGCUCAUCAAGCCCUACAUGACCCAGGAGGGCGAGUACCUGCCCCUGGACCAGCGGGACCUCAACGUGGGCUAUGACAUCGGCCUGGACCGCAUCUUCCUGGUGUCGCCCAUCAUCAUUGUCCACGAGAUCGACGAGGACAGCCCGCUUUAUGGCAUGGGCAAGGAGGAGCUGGAGUCGGAGGACUUUGAGAUCGUGGUCAUCCUGGAGGGCAUGGUGGAGGCCACGGCCAUGACCACCCAGGCCCGCAGCUCCUACCUGGCCAGCGAGAUCCUGUGGGGCCACCGCUUUGAGCCUGUGGUCUUCGAGGAGAAGAGCCACUACAAGGUGGACUACUCACGUUUUCACAAGACCUACGAGGUGGCCGGCACGCCCUGCUGCUCGGCCCGGGAGCUGCAGGAGAGUAAGAUCACCGUGCUGCCCGCCCCACCGCCCCCUCCCAGUGCCUUCUGCUACGAGAACGAGCUGGCCCUUAUGAGCCAGGAGGAAGAGGAGAUGGAGGAGGAGGCAGCUGCGGCGGCCGCGGUGGCCGCAGGCCUGGGCCUGGAGGCGGGUUCCAAGGAGGAGGCGGGCAUCAUCCGGAUGCUGGAGUUCGGCAGCCACCUGGACCUGGAGCGCAUGCAGGCUUCCCUCCCGCUGGACAACAUCUCCUACCGCAGGGAGUCUGCCAUCUGACCUCCAGGCCCGGCCCUCACCACUGCCCACAAGAGCCUCUGCCGGGGGUGGGAUGCCAGGACACCCCCUCCCACACUCAGGACAGAGCCAACCCUGGCUCCGUGGACCUUCUGGAGGAAGGUGGGGGUUUCAAAGACUGGGGGACCCCUUCCUCCUGACUCCAGCACCCAGGCCUGGGAAGAGCUCGGCCCCGAUCAGCCUGAGUUCCGCCAGCGCCUACUUCUGGUGGCUCUAGGUCCCCGGAUCCACCACCCUUCCCCCACUGACUCUUCAAGGACGUGCCCUCUUUGCUCUCAGAACCUUGGGGAAGGUGGCUGGACUGCUGGGCGGGGGACAUCUCGGGGUUUCAGGGUGGGCAGGGGGUUAGUUUGGGGAGGGGGGGGUGCGUUUCUUUUGCAUGACUGUGGCCUGUUGCUCAUGACUUUCUUUUGUAAAUAUCUAUAAAUGGAGACAGAUGGAGACACCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-956.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -992.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 644.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((((.(.((.(((..(((((..(..........)..)))))...(((.((....)))))((((((..(((((..(((((.(((.(.((((.(((((.(.(((....(((....)))..))).)))))))))).).))).)))))..)))))..(((((.((.(((......))).)).)))))(((....)))...)))))).))).)).).))))))))))))).((((....))))((((.(((..((((((.(((.((.((((...))))..(((((((...((((((((((.((((((((.(.(((((............(((.((((((...)))).)).)))....((((((...(((..((((((..((((..((............))..)))).....))))))..)))...))))))....((((((((.....((((((.(((((((((((......((((..(((((((.(((....((...((((((.((...))))))))...)).((((((.(((((.((.(((((((..((.(((((((((((.(((.(((((((((((((((((....(((((..((((((((..(((((((.........)))...((((((((....)))).))))....((((.....))))))))..))))))))))).))...(((((((.(((((....)))))(((((......))))).((((((((((((((.......(((((((.(....))))))))....))))))))))))))...)))))))(((((..((((((((..((((((.............)))).))))))))))..))))).(((((((((((((((((...((.(((((........))))).))))))))))))((((............))))))))))).(((((..((((......)))))))))....((((((.(((...((((((...((((((((...(((.....)))..))))))))))))))......(((((.((.......)).)))))(((........)))...(((.((((((((((((((((....))))))......((((....(((((..((((((((.(......).)))))).))..))))).))))))))))).))).)))...))).))))))))))))))).......((((((((((((.(((((...((((((((....)))))....)))...)))))..)))))).)).))))((((((((.((...))))).))))).))).)))))....((......)).))))))))))))))))...)))))))))))).)))))))).))).)))).)))..)))).....)))))))))))..)))))).))))))))))))).).))))))((..(((((((..(..((((.((((((((((((((((((((.(((((.(((..((....(((((...))))).....)).))).)))...))))))))....(((((((.((((.(.(..(((.......)))..).).)))))))))))...))).)))))))))))))))..).)))))))))......)).))))))))))))))...)))..(.((((((((((..(((.((((((.((((((....)))))).))((.....((((((..(((.(((((((((.........)))))))))....)))..))))))...))((((((((...(((((((((........))).))))))..)))).))))...)))))))........(((((((((..(((.((((.(((((.((((..((((..(((.((.(((((((.((((.(((.(((((....)))))..)))))..)).))).)))).)).))).))))..)))))).))).)))))))..)))))))))))))))))))))).)))..)))))).))).))))((((..((((...(((((((((((......)))))).)))))...)))).)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((((((((.(.((.(((.,(((((..{..........}..)))))...(((.((....)))))(((((({.((((({.(((((.(((.(.((((.(((((.({(((....{{{.,.}))),,})).,)))))}))).).))).))))).}))))),.{((((.((.(((......))).)).))))}(((....)))...)))))),))).)).).))))))))))))).((((....))))((((.(((..((((((.(({.,,.((({...}))}..{{(((((...((((((((((.((((((((.{.{((((.,...||,|..,(((.,,(((,...}))}.}}.)))....((((((...(({{{((((((..{{(({,((.........,,.|}.|}})).....)))))),,)))...)))))).|.,(((((((,,...{((((((.(((((((((((......((((..(((((((.(((,,{((((.........))))},,,(||{|{..{{{((((,..,)))}.|||(((((({,.((.(({{(((((,(((((.(((((..(((((((((({(((((,{,({,..{|||.|||...}}}}|..,})).|}|{((((((((((((((((((({,.((,{(((({,((({,,(({{.,(((((.((.,({.{{{{,,.{.((((|((,,||||,||}|}|||{|||{{{,((,{{.((((((((((((((.......{((((({,(....})))))))....)))))))))))))).}},,,|||}(((((..((((((((..((((((.............)))).))))))))))..))))),||((((((((((((((,..|||,|||{{..,,,,,,)}}}),))))))))))))((((,,.{{,..,...||||,,|}}|}.(((({.{((({......}))))))))..,||||||.},,....{(((((...((((((((...({{.....}}}..)))))))))))))}......(((((.((.......)).)))))|||||||,,,,)}}.,)))).{(((((((((({{(((,,..||||}{,....}|.||}}..|((((..((((((((.(......).)))))).))..))))),)}})))))))).))),}))}))}.,.}}}),}).,))))))}|}}..)))}.||||||,|},.,(((.,{{{(((((....))))).)).))).)))))))})...|{{{...))))((((((((.((...))))).)))))}))))},,))}))}|,......}))))).)))))))))))))))))))))}))).).))))))))),)).)))).)))..)))).....)))))))))))..)))))).)})}))))))))).}.)))))){{,.(((((((..|..(({(,((((((((((((((((((({,(((((.(((.,((....(((((...)))))....,)).))).)))...))))))))....(((((({{((((.{.(..(((.......)))..}.).)))))))))))...))).)))))))))))))}),,|.))}))))||......}}.))))))))))})))}..}}}.,{.{{((((({(({.,.{.{{{{{{.((((({....}))))),|}({,{{{,((((((|,{{{.(((((((((.........))))))))).}}}))},.}}}}||,,.,.((((((((...(((((((((........))).))))))..)))).))))...|||||,||,,...}}||{{|||{(,,(((,((((,(((((.((((..{{{(,{(((.({.{{{||||,|{..||||.{{{{{,,,,))))),,})))}..)),))).)))),)}.))).))))..)))))),))),)))))))..))))))))))))))))))),}}.}}}..)))))).))).)))){(|{,{{({(...(((((((((((......)))))).)))))...)))),),)).,...
Back