Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_152899.2

Sequence Length

1795 nt

GC Content

0.6418

AGUGGAGGGCAGUGGAGAGGACCGCGCUGUCCUGCUGUCACCAAGAGCUGGAGACACCAUCUCCCACCGAGAGUCAUGGCCCCAUUGGCCCUGCACCUCCUCGUCCUCGUCCCCAUCCUCCUCAGCCUGGUGGCCUCCCAGGACUGGAAGGCUGAACGCAGCCAAGACCCCUUCGAGAAAUGCAUGCAGGAUCCUGACUAUGAGCAGCUGCUCAAGGUGGUGACCUGGGGGCUCAAUCGGACCCUGAAGCCCCAGAGGGUGAUUGUGGUUGGCGCUGGUGUGGCCGGGCUGGUGGCCGCCAAGGUGCUCAGCGAUGCUGGACACAAGGUCACCAUCCUGGAGGCAGAUAACAGGAUCGGGGGCCGCAUCUUCACCUACCGGGACCAGAACACGGGCUGGAUUGGGGAGCUGGGAGCCAUGCGCAUGCCCAGCUCUCACAGGAUCCUCCACAAGCUCUGCCAGGGCCUGGGGCUCAACCUGACCAAGUUCACCCAGUACGACAAGAACACGUGGACGGAGGUGCACGAAGUGAAGCUGCGCAACUAUGUGGUGGAGAAGGUGCCCGAGAAGCUGGGCUACGCCUUGCGUCCCCAGGAAAAGGGCCACUCGCCCGAAGACAUCUACCAGAUGGCUCUCAACCAGGCCCUCAAAGACCUCAAGGCACUGGGCUGCAGAAAGGCGAUGAAGAAGUUUGAAAGGCACACGCUCUUGGAAUAUCUUCUCGGGGAGGGGAACCUGAGCCGGCCGGCCGUGCAGCUUCUGGGAGACGUGAUGUCCGAGGAUGGCUUCUUCUAUCUCAGCUUCGCCGAGGCCCUCCGGGCCCACAGCUGCCUCAGCGACAGACUCCAGUACAGCCGCAUCGUGGGUGGCUGGGACCUGCUGCCGCGCGCGCUGCUGAGCUCGCUGUCCGGGCUUGUGCUGUUGAACGCGCCCGUGGUGGCGAUGACCCAGGGACCGCACGAUGUGCACGUGCAGAUCGAGACCUCUCCCCCGGCGCGGAAUCUGAAGGUGCUGAAGGCCGACGUGGUGCUGCUGACGGCGAGCGGACCGGCGGUGAAGCGCAUCACCUUCUCGCCGCCGCUGCCCCGCCACAUGCAGGAGGCGCUGCGGAGGCUGCACUACGUGCCGGCCACCAAGGUGUUCCUAAGCUUCCGCAGGCCCUUCUGGCGCGAGGAGCACAUUGAAGGCGGCCACUCAAACACCGAUCGCCCGUCGCGCAUGAUUUUCUACCCGCCGCCGCGCGAGGGCGCGCUGCUGCUGGCCUCGUACACGUGGUCGGACGCGGCGGCAGCGUUCGCCGGCUUGAGCCGGGAAGAGGCGUUGCGCUUGGCGCUCGACGACGUGGCGGCAUUGCACGGGCCUGUCGUGCGCCAGCUCUGGGACGGCACCGGCGUCGUCAAGCGUUGGGCGGAGGACCAGCACAGCCAGGGUGGCUUUGUGGUACAGCCGCCGGCGCUCUGGCAAACCGAAAAGGAUGACUGGACGGUCCCUUAUGGCCGCAUCUACUUUGCCGGCGAGCACACCGCCUACCCGCACGGCUGGGUGGAGACGGCGGUCAAGUCGGCGCUGCGCGCCGCCAUCAAGAUCAACAGCCGGAAGGGGCCUGCAUCGGACACGGCCAGCCCCGAGGGGCACGCAUCUGACAUGGAGGGGCAGGGGCAUGUGCAUGGGGUGGCCAGCAGCCCCUCGCAUGACCUGGCAAAGGAAGAAGGCAGCCACCCUCCAGUCCAAGGCCAGUUAUCUCUCCAAAACACGACCCACACGAGGACCUCGCAUUAAAGUAUUUUCGGAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-791.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -820.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 377.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((((((..(....)..)))))))))(((.(.....).)))((((((.....((((.....))))(((((((((((((((.((((((.(((((..(((...((((.((((((..((.(((.((((.(((((((((.((((..(((((....)))))............(((((..((((((((.((.(.(((.(((((....))))).))).).))))).((((((...((((...)))))))))).(((((((((((..((((((.(((((...))))))))((((((((((...((((((..((.(((((....)).((((.((((((((...........)))))).)).))))(((.((((((...(((((.((....((.(((((((((((((((((((((.((.....))...)))))))))).))..))))......)))))))....)))))))((.(((...)))))..((((..............)))).((((.((....)).))))..)))))).))).....((((((((((..((((((((((......)))))...)))))((((((((((((...((((.....))))((((.(((((...))))).)).))..(((((((..............))).))))((((((....(((...(((((.((((.((.(((....))).)).)))).))))).(((..(((....)))...)))))).....))))))))))))).)))))((((...(((((.....)))))))))(((((..((((..(((((...))))).((..(.(((((((((.((((.(((......((.(((((((((((..(((((...((((((((((.((((.((((((((((.....)))))))).))........)))).))))))))))....)))))..))).))))))))))..((((.....(((....))).....))))))).))))....))))).)))).)..))))))..))))).(((.(((((..((((((.((((........))))))))))))))))))))))))))))(((((((..(((((((((((((((...)))).((.(((....)))..))..)))))))))))..))))))))))))..))))))......))))))))))..)))..))))))))).))..)))))..)))))....(((((((((((.(((((((((((..((((((.((....)).))))))..))))).(((((((((.(((((....)))))))....))))))).....))))))..)).)))))))))..(((((((.....))))))))))).))))))).)))))))))...((((((((((((.(((..(((((.((.(((((...))))).)))))).)..))))))))))).)))).....))..))))))...))))((((((((.((((.(.((((((((.((((.((......(((((((.((....)).)))))))...)).)))).))))((((((...))))))......))))...).)))).)))))))).....((....))((..((((....))))..))....)))..))))).)))))).)).....)))))))(((.....))).....))))))(((((...(((.((.((......)).))...)))...))))).....)))))).........)))).((((...))))......................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((((((((((,.{....}..)))))))))({(,{,.,,...}}}|(({({.....||||}....||||{,,,(((((.,,,{(,((((((.(((((..(((..{((((.((((((..((.(((.((({,({(((((((.((((..(((((....))))).,{....,,,..(((((..((((((((.((,(.(((.(((((....))))).))).).))))),((((((...((((...)))))))))).{{((((((((({({{((((.(((((...)))))))}((((((((((.,.((((((..((.((({{....},.((((.((((((((..,.....,..)))))).)).))))(((.((((((...(((((.((....((.(((((((((((((((((((((.((.....))...)))))))))).)},,}}}},,,...}))))))...,)))))))((.{{,...})}))..((((.,...,........)})).((((.((....)).))))..)))))).))),....{(((((((((.,,(((,(((((.{{{{{||||}...||}||((((((((((((...((((.....))))({{(.(((((...))))).}),}}..(((((((..............))).))))((((((....(((...(((((.((((.((.(((....))).)).)))).))))).(((..{((....)))...)))))).....))))))))))))).)))))||.|,..(((((.....))))),},)|||||}}|,,|}.|||||}.,|||||{((..(.(((((((((.((((.(((......(,{(((((((((((..(((((.,.((((((((((.((((.((,(((((((.....)))))))}.)).......,)))).))))))))))..,.)))))..))).))))))))))..((((.....(((....))).....))))))).))))....))))),,))).)..)))),)},}}}},.(((.(((((..((((((.((((.,.....,))))))))))))))))))))))))))))(((((((,.(((((((((((((((...)))).{{.{{{...,)))..)}..))))))))))),,))))))))))))..)))))).,}...)))))))))),,,,),,))))))))).))..)))))..)))))....(((((((((((.(((((((((((..((((((.((....)).))))))..))))),(((((((((.(((((....))))),,.,,,))))))).....))))))..)).)))))))))..{((((((.....))))))})))).))))))).))))))))),,.((((((((((,(((((..(((({.((.(((({...})))).)))))).)..))))))))))).)))).....))..))))))...))))|({{{(({.({((((..(((((({.(((((((.({.....||,,..,})).}))).)))))))..))))|}|,..|.((((((...)))))).,....,|||,....|||,.,,|||||,,{,..((....))}|,.||||}...})))..,..,,,)))..))))).)))))).|},|{{,.,(({||{{|...,.)))}},,})}}|||{((({..,(({.{,.{{...,,.})})),,,))}..,))))}...,)))))},.........))}).(((({{.,||,.......}..})))})......