Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_153278.3

Sequence Length

2034 nt

GC Content

0.6037

AGCAGACCCUGAAAGCUGAGCUGCCCUGACCCCCAAAGUGAGGAGAAGCUGCAAGGGAAAAGGGAGGGACAGAUCAGGGAGACCGGGGAAGAAGGAGGAGCAGCCAAGGAGGCUGCUGUCCCCCCACAGAGCAGCUCGGACUCAGCUCCCGGAGCAACCCAGCUGCGGAGGCAACGGCAGUGCUGCUCCUCCAGCGAAGGACAGCAGGCAGGCAGACAGACAGAGGUCCUGGGACUGGAAGGCCUCAGCCCCCAGCCACUGGGCUGGGCCUGGCCCAAUGGCCUUUAAUGACCUCCUGCAGCAGGUGGGGGGUGUCGGCCGCUUCCAGCAGAUCCAGGUCACCCUGGUGGUCCUCCCCCUGCUCCUGAUGGCUUCUCACAACACCCUGCAGAACUUCACUGCUGCCAUCCCUACCCACCACUGCCGCCCGCCUGCCGAUGCCAACCUCAGCAAGAACGGGGGGCUGGAGGUCUGGCUGCCCCGGGACAGGCAGGGGCAGCCUGAGUCCUGCCUCCGCUUCACCUCCCCGCAGUGGGGACUGCCCUUUCUCAAUGGCACAGAAGCCAAUGGCACAGGGGCCACAGAGCCCUGCACCGAUGGCUGGAUCUAUGACAACAGCACCUUCCCAUCUACCAUCGUGACUGAGUGGGACCUUGUGUGCUCUCACAGGGCCCUACGCCAGCUGGCCCAGUCCUUGUACAUGGUGGGGGUGCUGCUCGGAGCCAUGGUGUUCGGCUACCUUGCAGACAGGCUAGGCCGCCGGAAGGUACUCAUCUUGAACUACCUGCAGACAGCUGUGUCAGGGACCUGCGCAGCCUUCGCACCCAACUUCCCCAUCUACUGCGCCUUCCGGCUCCUCUCGGGCAUGGCUCUGGCUGGCAUCUCCCUCAACUGCAUGACACUGAAUGUGGAGUGGAUGCCCAUUCACACACGGGCCUGCGUGGGCACCUUGAUUGGCUAUGUCUACAGCCUGGGCCAGUUCCUCCUGGCUGGUGUGGCCUACGCUGUGCCCCACUGGCGCCACCUGCAGCUACUGGUCUCUGCGCCUUUUUUUGCCUUCUUCAUCUACUCCUGGUUCUUCAUUGAGUCGGCCCGCUGGCACUCCUCCUCCGGGAGGCUGGACCUCACCCUGAGGGCCCUGCAGAGAGUCGCCCGGAUCAAUGGGAAGCGGGAAGAAGGAGCCAAAUUGAGUAUGGAGGUACUCCGGGCCAGUCUGCAGAAGGAGCUGACCAUGGGCAAAGGCCAGGCAUCGGCCAUGGAGCUGCUGCGCUGCCCCACCCUCCGCCACCUCUUCCUCUGCCUCUCCAUGCUGUGGUUUGCCACUAGCUUUGCAUACUAUGGGCUGGUCAUGGACCUGCAGGGCUUUGGAGUCAGCAUCUACCUAAUCCAGGUGAUCUUUGGUGCUGUGGACCUGCCUGCCAAGCUUGUGGGCUUCCUUGUCAUCAACUCCCUGGGUCGCCGGCCUGCCCAGAUGGCUGCACUGCUGCUGGCAGGCAUCUGCAUCCUGCUCAAUGGGGUGAUACCCCAGGACCAGUCCAUUGUCCGAACCUCUCUUGCUGUGCUGGGGAAGGGUUGUCUGGCUGCCUCCUUCAACUGCAUCUUCCUGUAUACUGGGGAACUGUAUCCCACAAUGAUCCGCGCUGUCACUGUCCUCCUGCCAGAGACCCUGGGCCAGCCACUGCCAGACACGGUGCAGGACCUGGAGAGCAGGUGGGCCCCCACUCAGAAAGAAGCAGGGAUAUAUCCCAGGAAAGGGAAACAGACGCGACAGCAACAAGAGCACCAGAAGUAUAUGGUCCCACUGCAGGCCUCAGCACAAGAGAAGAAUGGACUCUGAGGACUGAGAAGGGGCCUUACAGAACCCUAAAGGGAGGGAAGGUCCUACAGGUCUCCGGCCACCCACACAAGGAGGAGGAAGAGGAAAUGGUGACCCAAGUGUGGGGGUUGUGGUUCAGGAAAGCAUCUUCCCAGGGGUCCACCUCCCUUUAUAAACCCCACCAGAACCACAUCAUUAAAAGGUUUGACUGCGCACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-853.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -882.78

Frequency: 0.0000

Diversity: 507.91

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.((((((...(((..((.((((...(((...(((........)))....)))...)))).))..))).))))))((((((((((....(((((((((((.......((((((((..((((.....((((((.((.....((((...))))..)).)))))))).))..))))))))))))))))))).((..(((...((((((((((.(.(.(.(((.(((...((((.(((.(((((.((((((.........)))))))))))((((....))))........((.((((...)))).))(((((((.(((((.....(((((....(((((((....)))).)))....))))).....))))).......)))))))((((.......))))..))))))).....))).)))).).).)))))))..)))...)))..))..(((..((((((.(((..((.(((((((((.(......).))))))))).)).))).))))))..)))...)))))((((((((((...((((...(((.((((......)))).)))...))))(((((((((((.(((.((((((((((((((((((.(..((((((((((((((.(((....(.(((((.(((((.(((((((......))))))).)))))(((....))).))))))..))).)))).))))))))))....)...))))).)))))))))(((.((......)).)))..((((((((((.(.......(((.....(((.((..((((((.(((....)))))))))..)))))......)))..........).)))))))))).....))))))).)))))))..))))...)))))..)))))...........((((((((((....)))))).))))(((((....(((((((((......))...))))))).)))))(((((((..(((((((((((((((((((......(((((....(((.((..((((((..((((((((......(((..((((.(((((((......(((((.((((.((((((.((((...((.(((.(((((((....))))((.((.(((((...)))))..)).)).))).))))))))).)))))))))).))))).))))))).))))..)))...((((...))))))))))))))))))..)).)))......))))).)))))..)))))))))).))))..)))).))).((((((.((.((((((((((((((((.(((......(((((((....)))).)))...........((((.(((((..((((((((((..((((((((((......(((((.....))))).(((((.((((((.((.(((((..((((.((((.(((((((((((((......((...((((..(((.((((((.((((((.((((.(.......))))).))))))....(((.((..((((((...)))))).)).)))((((..((((..(((..(((.((.(((((((...((((((.((((((.............((((......)))).....((((......))))(((.((((.......)))).)))......))))))))))))...)))).))).)).)))...)))...)))).))))..)))))).))).))))...))......)))))).....((((......)))).......((....)).....)))).))).))))...))))......))))))).)))))).)))))......)))))))))).)))....(((((((..(....(((....)))..)..))))))).)))))))..)))))))))....))).)))))))))))...))))).....)).))))))(.((((((((.((((......))))..(((((................)))))....)))))))).).......)))))..))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((.((((((...(((..((.((((..,(({...(((........)))....)))...)))).))..))).)))))){(((((((({.,..(((((((((((,.....,{(((((({,,({({.....((((((.((.....((((...)))}..,),)))))))).))..}))))))}))))))))))).{{..{((...((((((((((.(.{.{.{((,(((,.{(((,,(((,(((((.((((((,,,{....,)))))))))))||||,,..)))),,......{{,{{{({,,||||,||(((({{{.{((({,,,,.||{{{..|{(((.,,,))))),|},)},,},})))))...|,||}}}.......,}}}}}}((((.......)))).}))}))},.....}}}.)))}||.,.)))}|||..|||,..}}|..}}..(((..((((((.(((..((.(((((((((.{......).))))))))).)).))).))))))..)))...|||||({{{{|||||..,((((...{((.((((......)))).})}.,.})))((({(((((((.(((.((((((({((((({{{{(.,..((((((((((((((.(({,|..{.(((((.(((((.(((((((......))))))).)))))(((....))).)))))}.|))).}))).))))))))))...,|,|,|}}|}.}}}}}||}}(((.({.....,)}.}))..((((((((((.,,,,...,||......(((.((..((((((.(((....)))))))))..)))))......,,,..........}.)))))))))).,,..})))))).))))))),,}))),,,)))}}},,})))..,........((((((((((....)))))).)))}{{((({{,,(((((((((......))...))))))),)))})||||{{{..({{{{{(((((({{{(({{...,,,{{|{{...|(((.((..((((((..((((((((....,,{((..((((.(((((((.,....(((((.((({{((((((.{(((...((.(((.(((((((....))))((.((.(((({...})))).,)}.)).))).))))))))}.)))))))))).))))),))))))).))))..}}},..{|||},.)))}))))))))))))))..)).)))}.....))))).})))),,)))))))))}.)))),,)))),))),((((((,({.,{.((((..(((((((.(((((((.,({(((((...,||}}.|||...........{(({.((({{..((((((((((..((((((((((....({(((((.....))))}.(((({.((((((.((.(((((..((((.((((.(((((((((((((......,(,,,((((..(((.((((((((((....((((((((.(((((((((,{,...||....||}....((((((...))))))((({,|,......)))).......,,..,,,(.(((((...((((((.((((((.,...........((((......}}}}....,||||......}}}}(((.((((.......)))).)))......))))))))))))...)))))))))))))).))))))))))...))))...)))))).))).)))}...,,...,,.))))))}....((((......)))).......((....))..,..}))).))).))))...))))......))))))).)))))).})))).,,...)))))))))).)))....((((((({.{....(((....))}..),)))))))).)))))))..)))))}))),,,,.)))}}))).)))))))..)))).,...}).)))))){.((((((((.((((......))))..(((({................}))))....)))))))).}.......)))))..))))......