Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_153480.2
Sequence Length
2679 nt
GC Content
0.6193
GUGUUCGCUGCUGCACAGCAAGGCCCUGCCACCCACCUUCAGGCCAUGCAGCCAUGUUCCGGGAGCCCUAAUUGCACAGAAGCCCAUGGGGAGCUCCAGACUGGCAGCCCUGCUCCUGCCUCUCCUCCUCAUAGUCAUCGACCUCUCUGACUCUGCUGGGAUUGGCUUUCGCCACCUGCCCCACUGGAACACCCGCUGUCCUCUGGCCUCCCACACGGAUGACAGUUUCACUGGAAGUUCUGCCUAUAUCCCUUGCCGCACCUGGUGGGCCCUCUUCUCCACAAAGCCUUGGUGUGUGCGAGUCUGGCACUGUUCCCGCUGUUUGUGCCAGCAUCUGCUGUCAGGUGGCUCAGGUCUUCAACGGGGCCUCUUCCACCUCCUGGUGCAGAAAUCCAAAAAGUCUUCCACAUUCAAGUUCUAUAGGAGACACAAGAUGCCAGCACCUGCUCAGAGGAAGCUGCUGCCUCGUCGUCACCUGUCUGAGAAGAGCCAUCACAUUUCCAUCCCCUCCCCAGACAUCUCCCACAAGGGACUUCGCUCUAAAAGGACCCAACCUUCGGAUCCAGAGACAUGGGAAAGUCUUCCCAGAUUGGACUCACAAAGGCAUGGAGGACCCGAGUUCUCCUUUGAUUUGCUGCCUGAGGCCCGGGCUAUUCGGGUGACCAUAUCUUCAGGCCCUGAGGUCAGCGUGCGUCUUUGUCACCAGUGGGCACUGGAGUGUGAAGAGCUGAGCAGUCCCUAUGAUGUCCAGAAAAUUGUGUCUGGGGGCCACACUGUAGAGCUGCCUUAUGAAUUCCUUCUGCCCUGUCUGUGCAUAGAGGCAUCCUACCUGCAAGAGGACACUGUGAGGCGCAAAAAAUGUCCCUUCCAGAGCUGGCCAGAAGCCUAUGGCUCGGACUUCUGGAAGUCAGUGCACUUCACUGACUACAGCCAGCACACUCAGAUGGUCAUGGCCCUGACACUCCGCUGCCCACUGAAGCUGGAAGCUGCCCUCUGCCAGAGGCACGACUGGCAUACCCUUUGCAAAGACCUCCCGAAUGCCACAGCUCGAGAGUCAGAUGGGUGGUAUGUUUUGGAGAAGGUGGACCUGCACCCCCAGCUCUGCUUCAAGUUCUCUUUUGGAAACAGCAGCCAUGUUGAAUGCCCCCACCAGACUGGGUCUCUCACAUCCUGGAAUGUAAGCAUGGAUACCCAAGCCCAGCAGCUGAUUCUUCACUUCUCCUCAAGAAUGCAUGCCACCUUCAGUGCUGCCUGGAGCCUCCCAGGCUUGGGGCAGGACACUUUGGUGCCCCCCGUGUACACUGUCAGCCAGGCCCGGGGCUCAAGCCCAGUGUCACUAGACCUCAUCAUUCCCUUCCUGAGGCCAGGGUGCUGUGUCCUGGUGUGGCGGUCAGAUGUCCAGUUUGCCUGGAAGCACCUCUUGUGUCCGGAUGUCUCUUACAGACACCUGGGGCUCUUGAUCCUGGCACUGCUGGCCCUCCUCACCCUACUGGGUGUUGUUCUGGCCCUCACCUGCCGGCGCCCACAGUCAGGCCCGGGCCCAGCGCGGCCAGUGCUCCUCCUGCACGCGGCGGACUCGGAGGCGCAGCGGCGCCUGGUGGGAGCGCUGGCUGAACUGCUACGGGCAGCGCUGGGCGGCGGGCGCGACGUGAUCGUGGACCUGUGGGAGGGGAGGCACGUGGCGCGCGUGGGCCCGCUGCCGUGGCUCUGGGCGGCGCGGACGCGCGUAGCGCGGGAGCAGGGCACUGUGCUGCUGCUGUGGAGCGGCGCCGACCUUCGCCCGGUCAGCGGCCCCGACCCCCGCGCCGCGCCCCUGCUCGCCCUGCUCCACGCUGCCCCGCGCCCGCUGCUGCUGCUCGCUUACUUCAGUCGCCUCUGCGCCAAGGGCGACAUCCCCCCGCCGCUGCGCGCCCUGCCGCGCUACCGCCUGCUGCGCGACCUGCCGCGUCUGCUGCGGGCGCUGGACGCGCGGCCUUUCGCAGAGGCCACCAGCUGGGGCCGCCUUGGGGCGCGGCAGCGCAGGCAGAGCCGCCUAGAGCUGUGCAGCCGGCUCGAACGAGAGGCCGCCCGACUUGCAGACCUAGGUUGAGCAGAGCUCCACCGCAGUCCCGGGUGUCUGCGGCCGCAACGCAACGGACACUGGCUGGAACCCCGGAAUGAGCCUUCGACCCUGAAAUCCUUGGGGUGCCUCGAGGACGACUGGCCGAAAAGCCGCAUUCCCUGCCUCACAGGCCGGAAGUCCCAGCCCAGUCCCCGCGCGCGUCCCUCUUCCUCCUCAUACUUUCCCUUGACUGAGAGCUCCUCUAACCCCUGUUCUGAUGGGGGAGGGCGGUCUUCCCACUUCCUCUCCAGAACUCCAGAAAGAGCAGUGUGCUUAUGCUUCAGUCCAGGCUGGAGAGGUUGGGGCCGGGGUAGGGAGGCAGGAGCCAUGUCAGUUCUGAAGGAGGGUGAGGCGGUGGGGGAUUGCAGGGGGCGGCUGAGAGAAAACCUCCUUGGGGGCCAGGGAUUCCCUUUCCCACUCUGAGGCUCUGGCCAGAGGGAGAGAGGACUCUGGACCUAGGAAAAGAGGCUUUUGGCUCCAGGUGGUCAGGACAGUGGGGGUUGGGGGUGGGGUGGGUGGGUGCUGGCGGUGGGGACCAAGAUCCGGAAAGAUGAAUAAAGACAAACAUGACAAACUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1160.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1210.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 609.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((((((.(((.((((.((...........)))))).)))(((((.(((((((.((........((......))..((((((((.....((..(((((........)))))..))))))))))(((((..(....)..))))))).))))))))))))....((((((((((((((..(((.(((((((((((..((((.((.....((.(((((((..(((.((..((...(((.......(((((((((((..(((((........)))))........)))))).))))).(((((((..............)))))))((((((((.((((((((((((((((((....(((((..((((((.((...(((((.(..(((......((((((.................))))))....)))..).)))))((..((((((..((((((((((((..(((....(((((.(((((.........(((((((................((((....)))).....((((....(((.((.......)).)))))))..)))))))..))))).)))))..)))...((((.....(((((((....))))))).....))))..(((((((((((((.....))))).........))))))))..))))).))))).)).)))))).)).(((((((((.((((((((.(..((((..((((((((........(((((........))))))))....)))))..))))((((((((...(((((.(((.......((((......)))).......))).)))))...))))))))(((.....)))....((((((((((((((........)))).))).).))))))((((((((.....))))))))...((((..((.(......)))..))))..).)))))))).))))))))).)).))))))..))))).((((((........))))))...........)))))))...))..)))))..)).)).)).))))))(((((((((((((((((((((((((.(((......))).)))))((((((......))))))..(((((....)))))...........(((.(((((.((.....((((..(........)..)))).....)))))))...)))........)))))))....))).))))))))))....((.((((((.((((((...)))))).)))))).)).....)))))..)).)))...))))))).))....((((((.((.((((.((((((......(((((............)))))((((((.......))))))((((((((((((((((((.........(((.(((.....))).)))))))))))....(((((((((((((((.........(((.((((((((((((..(((((....)))))..((((.((((.....((((((.(((((.(((...(((((.(((...(((((.((((((((.........((((((((((.(((((((((.((((((...(((((.(((((.(((((((......((((((((....(((((((((((((..(((..((((((.(...(((.(((.(((..(((((((((.(((((.(((((((((.(((...(((((((((.....(((....(((((.(((((.((...)).))))).)))))..))))))))).)))..)))))).)))))).))).))...)))))))))..))).))).))).).)))))).)))..))))))))))))))))))))).....)))))))((....((((((..((((.........))))..)).))))...)).))))).)))))))))))))).))).))).)))))))))))))))))).)))))(((((((...)))))))....))).)))))...)))))))))))))).((..(((.((((.....).))).))).)).)))).))))))).))))...(((((((......)))))))))))).))).......))))))))))))))).))))))..))))...)))))))))).)).))))))...(((((....(((((((.....)))))))(((((..((((..((((((....((..(((.....)))))....))))))..))))(((((..((((((..(((.(((((((..((.((((..(((((((.((((((((.(((((((((.(((((.(((((((..(((((((....)))))))....(((((((((..((...((..(((((.........)))))...)).)).)))))))))))))))).))))).)).....))))))..).))))))..)).))))))))))).)).)))))))))).))))))))))).(((.....)))((((((..((((((..((((((((((..(((..(((....))))))))))))).))))))))).))))))....)))))....)))))..)).))))))))))))))).)))...)))))))))))))))))).))))))))).))..........................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,(((((((((((((.(((.((({{((...........}})))).})},((((.((({{{(((((({{....((......))..,|{|||,|}}}}.||,,|||((,...,,..}}|||..||||},,||,(((((..{....,.,))))),)).,)))),,))),....((((((((((((((..(((.((((((((((,.{((((.((.....((.(((((((..(((.((..((...(({.......(((((((((((.{(((((........)))}}...,,}..)))))).))))).(((((((..............)))))))((((((((.(((((((((((((((((((((.((((,.,((,,((((....||||,}|}..,,......({(((({,...............)))|||,.,,|(((({(({.{{(,..{{{|||..|||((((((({{..,,,.,.,(((((.(,{((,........,,,,,,,...|||..,}}}},..((((....)))).....{{{{....(((.(,.......)).)))})))...||||||..,,)))}))}}},})},.,.{{{|}}|,.(((((((....)))))))..,,.}}}|..(((((((((((((,...,})))).........})))))))..}}))).))))}.)}})))))),}.,(((((((((.((((((((.{.{((((..(((((((({,.{,{..{(({{.....,.,))))))))....)))))..))))((((((({...(((((.(((...,,..((((......)))).......))).)))))...}))))))){{{.....}}}...,((((((((((((((........)))).))).)}})))))((((((((.....))))))))...((((,.,(.{......)))..)))).,).)))))))).))))))))).}}.}))}))}}|}}}}|||{{||,}},..,.)))))}..))).)))..)))))))...))..)))))..)).)).)).))))))(((((((((({({(((((((((((....({{....((({{((({((((((......}})))}..||}|}}...})}})..}}}..}}}}|,{.{((((,,,.....(({(,{{.......,}.,))}}..,,,,))))))..,,||,....,},}))))))....}},.))))))))))....((.((((((.((((((...)))))).)))))).)).....)))))..)).))).,.))))))).))....((((((.((.(((({((((((......(((((.........,..))))){(((({.......)))))|(((,((((((((((((((.,.......(({.{{{.....,)),}))))))))))....(((((((((((((((...,.....(((.(((((((((,,(..(((((....)))))..|,,,.||||.....((((({{(((((.(((...(((((.(((...(((((.((((((({({....({(((((((((....((..(((((((((((..,(({(((((,((.(((((({..,...((((((((,...(((((((((((((..((,..((((((...,,(((.(((.(((..(((((((((,({(((,(((((((((.(((...(((((((((...,,({({{,,(((((.{(({{.{{.,,)),))))},)))))..})})))))).)))..)))))).))))))})))).,...)))))))))..))).))).))).),)))))).}))..))))))))))))))))))))).....}))))))|||}}|.}}}}}.|||}|.,..}}))}))))))))))).,)).,.(((((........,..)))))..))))))))),,)).).))))))))).)))))(((((({...}))))))....))).)))))...)))))))))))))).|..}||}},))}{{,,,(,|(({|||.|||||||{....}}),))))),.,{,{,{|}}}..})))))}||||},.)))}....}.))))))))))))))).)))))).,)))...,)))))))))).)).))))))...(((((....(((((((.....)))))))(((((..((((..((((((....{(..(((.....)))}}....))))))..))))(((((..((((((..(((.(((((((..((.(((({.,((((((,{,((((((.{((((((((.(((((.(((((({.,(((((((....})))))).}..(((((((((..{{...({..(((((.......,.))))},..}}.,).)))))))))}}))))).))))).})},,..})))))..}.))))))..}}.))))))))))).)).)))))))))).))))))))))).(((.....)))((((((..((((((..((((((((((.,(((,.({(....})))))))))))).))))))))).))))))....)))))....)))))..)).))))))))))))))).)))...)))))))))))))))))).))))))))),)).....,,......,,,..........................
Back