Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_153481.2
Sequence Length
2543 nt
GC Content
0.6221
GUGUUCGCUGCUGCACAGCAAGGCCCUGCCACCCACCUUCAGGCCAUGCAGCCAUGUUCCGGGAGCCCUAAUUGCACAGAAGCCCAUGGGGAGCUCCAGACUGGCAGCCCUGCUCCUGCCUCUCCUCCUCAUAGUCAUCGACCUCUCUGACUCUGCUGGGAUUGGCUUUCGCCACCUGCCCCACUGGAACACCCGCUGUCCUCUGGCCUCCCACACGGUCUUCAACGGGGCCUCUUCCACCUCCUGGUGCAGAAAUCCAAAAAGUCUUCCACAUUCAAGUUCUAUAGGAGACACAAGAUGCCAGCACCUGCUCAGAGGAAGCUGCUGCCUCGUCGUCACCUGUCUGAGAAGAGCCAUCACAUUUCCAUCCCCUCCCCAGACAUCUCCCACAAGGGACUUCGCUCUAAAAGGACCCAACCUUCGGAUCCAGAGACAUGGGAAAGUCUUCCCAGAUUGGACUCACAAAGGCAUGGAGGACCCGAGUUCUCCUUUGAUUUGCUGCCUGAGGCCCGGGCUAUUCGGGUGACCAUAUCUUCAGGCCCUGAGGUCAGCGUGCGUCUUUGUCACCAGUGGGCACUGGAGUGUGAAGAGCUGAGCAGUCCCUAUGAUGUCCAGAAAAUUGUGUCUGGGGGCCACACUGUAGAGCUGCCUUAUGAAUUCCUUCUGCCCUGUCUGUGCAUAGAGGCAUCCUACCUGCAAGAGGACACUGUGAGGCGCAAAAAAUGUCCCUUCCAGAGCUGGCCAGAAGCCUAUGGCUCGGACUUCUGGAAGUCAGUGCACUUCACUGACUACAGCCAGCACACUCAGAUGGUCAUGGCCCUGACACUCCGCUGCCCACUGAAGCUGGAAGCUGCCCUCUGCCAGAGGCACGACUGGCAUACCCUUUGCAAAGACCUCCCGAAUGCCACAGCUCGAGAGUCAGAUGGGUGGUAUGUUUUGGAGAAGGUGGACCUGCACCCCCAGCUCUGCUUCAAGUUCUCUUUUGGAAACAGCAGCCAUGUUGAAUGCCCCCACCAGACUGGGUCUCUCACAUCCUGGAAUGUAAGCAUGGAUACCCAAGCCCAGCAGCUGAUUCUUCACUUCUCCUCAAGAAUGCAUGCCACCUUCAGUGCUGCCUGGAGCCUCCCAGGCUUGGGGCAGGACACUUUGGUGCCCCCCGUGUACACUGUCAGCCAGGCCCGGGGCUCAAGCCCAGUGUCACUAGACCUCAUCAUUCCCUUCCUGAGGCCAGGGUGCUGUGUCCUGGUGUGGCGGUCAGAUGUCCAGUUUGCCUGGAAGCACCUCUUGUGUCCGGAUGUCUCUUACAGACACCUGGGGCUCUUGAUCCUGGCACUGCUGGCCCUCCUCACCCUACUGGGUGUUGUUCUGGCCCUCACCUGCCGGCGCCCACAGUCAGGCCCGGGCCCAGCGCGGCCAGUGCUCCUCCUGCACGCGGCGGACUCGGAGGCGCAGCGGCGCCUGGUGGGAGCGCUGGCUGAACUGCUACGGGCAGCGCUGGGCGGCGGGCGCGACGUGAUCGUGGACCUGUGGGAGGGGAGGCACGUGGCGCGCGUGGGCCCGCUGCCGUGGCUCUGGGCGGCGCGGACGCGCGUAGCGCGGGAGCAGGGCACUGUGCUGCUGCUGUGGAGCGGCGCCGACCUUCGCCCGGUCAGCGGCCCCGACCCCCGCGCCGCGCCCCUGCUCGCCCUGCUCCACGCUGCCCCGCGCCCGCUGCUGCUGCUCGCUUACUUCAGUCGCCUCUGCGCCAAGGGCGACAUCCCCCCGCCGCUGCGCGCCCUGCCGCGCUACCGCCUGCUGCGCGACCUGCCGCGUCUGCUGCGGGCGCUGGACGCGCGGCCUUUCGCAGAGGCCACCAGCUGGGGCCGCCUUGGGGCGCGGCAGCGCAGGCAGAGCCGCCUAGAGCUGUGCAGCCGGCUCGAACGAGAGGCCGCCCGACUUGCAGACCUAGGUUGAGCAGAGCUCCACCGCAGUCCCGGGUGUCUGCGGCCGCAACGCAACGGACACUGGCUGGAACCCCGGAAUGAGCCUUCGACCCUGAAAUCCUUGGGGUGCCUCGAGGACGACUGGCCGAAAAGCCGCAUUCCCUGCCUCACAGGCCGGAAGUCCCAGCCCAGUCCCCGCGCGCGUCCCUCUUCCUCCUCAUACUUUCCCUUGACUGAGAGCUCCUCUAACCCCUGUUCUGAUGGGGGAGGGCGGUCUUCCCACUUCCUCUCCAGAACUCCAGAAAGAGCAGUGUGCUUAUGCUUCAGUCCAGGCUGGAGAGGUUGGGGCCGGGGUAGGGAGGCAGGAGCCAUGUCAGUUCUGAAGGAGGGUGAGGCGGUGGGGGAUUGCAGGGGGCGGCUGAGAGAAAACCUCCUUGGGGGCCAGGGAUUCCCUUUCCCACUCUGAGGCUCUGGCCAGAGGGAGAGAGGACUCUGGACCUAGGAAAAGAGGCUUUUGGCUCCAGGUGGUCAGGACAGUGGGGGUUGGGGGUGGGGUGGGUGGGUGCUGGCGGUGGGGACCAAGAUCCGGAAAGAUGAAUAAAGACAAACAUGACAAACUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1108.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1156.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 693.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((((((.(((.((((.((...........)))))).)))(((((.(((((((.((........((......))..((((((((.....((..(((((........)))))..))))))))))(((((..(....)..))))))).))))))))))))....((((((((((((((..(((.(((((((((((..((((.((.....(((((.((((((((((((((.((((....))))..............((((((.................))))))....((.(((.((((..((((..(((..(((.(((((((((.(((...((((((.(..(((..................))).)))))))..((((....))))...........((((......)))).(((((.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((..(((((((....))))))).(((((((...(((((((((((((.....))))).........))))))))....))))))).....))))))))...(((((((((.((((((((.(..((((..((((((((........(((((........))))))))....)))))..))))((((((((...(((((.(((.......((((......)))).......))).)))))...))))))))(((.....)))....((((((((((((((........)))).))).).))))))((((((((.....))))))))...((((..((.(......)))..))))..).)))))))).))))))))).((((...))))(((.(((...))))))..(((((.((((((.........(((.((.(((..((....))))).))))).((.((((((((((((((((((((((((((.(((......))).)))))((((((......))))))..(((((....)))))...........(((.(((((.((.....((((..(........)..)))).....)))))))...)))........)))))))....))).)))))))))))))......((((.((((((...)))))).))))(((((((...(((((((...(((.((((((...((..((((...))))...)).)))))))))....(((((............)))))...)))))))))))))))))))).))))).)).))))))))))...))))).)).))))))))((((.(((((.....))))).))))..)))).)))))(((((.((..((((..(..(((((....)))))..)....))))..))..)))))((((((.(((...(((((.(((...(((((.((((((((.........((((((((((.(((((((((.((((((...(((((.(((((.(((((((......((((((((....(((((((((((((..(((..((((((.(...(((.(((.(((..(((((((((.(((((.(((((((((.(((...(((((((((.....(((....(((((.(((((.((...)).))))).)))))..))))))))).)))..)))))).)))))).))).))...)))))))))..))).))).))).).)))))).)))..))))))))))))))))))))).....)))))))((....((((((..((((.........))))..)).))))...)).))))).)))))))))))))).))).))).)))))))))))))))))).)))))(((((((...)))))))....))).)))))...)))))))))))).))).)))))))))..))).)))).))))....)))))....)))))))..))))..))).)))))..(((.((((...)))).))).......(.((((((((..((......))..)))))))).)((((....))))...(((((....(((((((.....)))))))(((((..((((..((((((....((..(((.....)))))....))))))..))))(((((..((((((..(((.(((((((..((.((((..(((((((.((((((((.(((((((((.(((((.(((((((..(((((((....)))))))....(((((((((..((...((..(((((.........)))))...)).)).)))))))))))))))).))))).)).....))))))..).))))))..)).))))))))))).)).)))))))))).))))))))))).(((.....)))((((((..((((((..((((((((((..(((..(((....))))))))))))).))))))))).))))))....)))))....)))))..)).))))))))))))))).)))...)))))))))))))))))).))))))))).))..........................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,((((((((((({(,(((.((({{((,..........}}))}}.}}},((((.({({{{((((((({,...((......))..,|{|||,|}}}}.||,,|||((,...,,..}}|||..||||},,||,(((((..{....,.,))))),)}.,)))),,))),....((((((((((((((..(((.(((((((((({.,((((.{(.....((,,..,,,.{(((((((((...,,({{{(((.((((..(({....,(,((((({..,,,..........||,|||{.{{(((((((((.(((......}))..)}}|{{((((|{,.{{{.{,,(((((.({{((,........,{{{{,,...||,..,|||,,..((((....))))....,{{{{....(((.({.......)).)))|}))...||||||..,,)))}))}}),))},.,.|,||}}||.(((((((....)))))))..,,.,,||,,(((({((((({(({...,}}||}...,,....})))}))),.}}))).))))}.)}}}}}}))}}.,|((((((((.((((((((.{.{((((..(((((((({,.{,{..{(({{.....,.,))))))))....)))))..))))((((((({...(((((.(((...,,..((((......)))).......))).)))))...}))))))){{{.....}}}...,((((((((((((((........)))).))).)}})))))((((((((.....))))))))...((((,.,(.{......)))..)))).,).)))))))).))))))))),},,|}}}))}|,(((((({{{{{|||||{{.,,|||{,.......,,,,,|||{((.({{..((,..,}}}}},)})}}.({.((((((((((({({(((((((((((....({{....((({{((({((((((......}})))}..||||}}...})}})..}}}..}}}}|,{.{((((,,,.....(({(,{{.......,}.,))}}..,,,,))))))..,,||,....,},}))))))....}},.))))))))))))).((.((((((.((((((...)))))).)))))).)).,...|}}|||,,,}}}}}...((.((((((((((((((((.((.(((({((((((......(((((.........,..))))){(((({,.....,)))))|(((,((((((((((((((.,.......(({.{{{.....,)),}))))))))))....(((((((((((((((,..,....,(((.(((((((((,,(..(((((....)))))..|,{{.||||.....((((({{(((((.(((...(((((.(((...(((((.((((((({(,....({{((((((((....((..(((((((((((..,(({(((((,((.(((((({..,...((((((((,...(((((((((((((..((,..((((((...,,(((.(((.(((..(((((((((,({(((,(((((((((.(((...(((((((((...,,({({{,,(((((.{(({{.{{.,,)),))))},)))))..})})))))).)))..)))))).))))))})))).,...)))))))))..))).))).))).),)))))).}))..))))))))))))))))))))).....})))))}|||}}|.}}}}}.|||}|.,..}}))}))))))))))).,)).,.(((((........,..)))))..))))))))),})).).))))))))).)))))(((((({...}))))))....))).)))))...)))))))))))))).|..}||}},}}}{{,,,{,|{{{|||.||||||||....}}),))))),.{{,{,{|}}}..})))))}||||},.)))}....}.))))))))))))))).)))))).,)))...,)))))))))).)).)))))).....)))},,,(((((((.....))))))),,,|||.((((..((((((....{(..(((.....)))}}....))))))..))))|,|,,..((((((..(((.(((((((..((.(((({.,((((((,{,((((((.{((((((((.(((((.(((((({.,(((((((....})))))).}..(((((((((..{{...({..(((((.......,.))))},..}}.,).)))))))))}}))))).))))).})},,..})))))..}.))))))..}}.))))))))))).)).)))))))))).)))))))))))).))....{{{|..,||({|,,((((...}}}}.}))),}}|,}}))))})))),))))))}}.,.))),)))).))).)))).)})))))))}}))}}}}.)).))))))))))))))).)))...)))))))))))))))))).))))))))),)).....,,......,,,..........................
Back