Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_172037.5
Sequence Length
3959 nt
GC Content
0.4814
AGAGCCGGCCCGGAGCGCUCUGACUUGCAAGCGGGCUGCGCUGCGGAGCCCAGUGCCCGAGUGACACCCGCGGAGAGUGCAGGGCCGGGGAACGCGAGCCCUCGGGGGCAGCUGCAAGGCGUUGGGCAGCGCUUGCCUGCGCCGAGCGAGUCUCCCCUUCCCGGCGCUCCGCCGCCCCGCACCCCACUCUCCCACCCUCUCGCAACUUGGGUCGAGUUGACAACUCCCGCGGCAGCCCGCUGGCCCGUGCCGCCUCCGCUGCGCACCCCUCCCCCGGGGUGAGAGGGAGCCGGCGCGCCGGUUCCGGGGACGCUCGGGCGGCAGCAGCUUGGCCAUGAGGGCAGUUCGAGUAGUCUAACUCGCGGCUGUCACCGCCACUGCAGCGGAGCCGGCCGGCCGGGCGCUGCGGGACGGGCGGGCGGCUGCCGGCAGGAGGCGCCGAGCCGGGUGACUGCCGCGGCGGGCACAGUCCGGGGCCACAGCGCCGAGCCCGGGCGGGAGUGGCCCCGCGCAGGCAGGGAGCGGCGCCGCGCACUCCAACCCGGCGGGCACCUCGGGGGCGGGCGCGGGGCGCAGCCUUCUCGUCCCGGCCUCUGUGACAAGCGCCCCGGAGCCGGGAGCCCGAUUGCCGGGCUCGGGGUGGGCGCGGACGCAGGCACUGGGCUCGUGCGGGGCCCCGGGCGUCGCGAUGAACAUCGUGGUGGAGUUCUUCGUGGUCACUUUCAAAGUGCUCUGGGCGUUCGUGCUGGCCGCGGCGCGCUGGCUGGUGCGGCCCAAGGAGAAGAGCGUGGCGGGCCAGGUGUGCCUCAUCACCGGCGCCGGCAGCGGCCUGGGCCGCCUCUUCGCGCUGGAGUUCGCCCGGCGUCGGGCGCUGCUGGUGCUGUGGGACAUCAACACGCAAAGCAACGAGGAGACGGCUGGCAUGGUGCGCCACAUCUACCGCGACCUGGAGGCGGCCGACGCCGCUGCGCUGCAAGCUGGGAAUGGUGAGGAAGAAAUUCUGCCCCACUGUAACUUGCAGGUUUUUACCUACACCUGUGACGUGGGGAAGAGGGAGAACGUCUACCUGACGGCUGAAAGAGUCCGCAAGGAGGUUGGCGAAGUCUCAGUCCUGGUCAAUAAUGCUGGUGUGGUCUCUGGGCAUCACCUUCUGGAAUGUCCUGAUGAGCUCAUUGAGAGAACCAUGAUGGUCAAUUGCCAUGCACACUUCUGGACCACUAAGGCUUUUCUUCCUACGAUGCUGGAGAUUAAUCAUGGUCAUAUUGUGACAGUUGCAAGUUCCUUGGGAUUGUUCAGUACUGCCGGAGUUGAGGAUUACUGUGCCAGUAAAUUUGGAGUUGUGGGUUUUCAUGAAUCCCUGAGCCAUGAACUAAAGGCUGCUGAAAAGGAUGGAAUUAAAACAACCUUGGUUUGCCCUUAUCUUGUAGACACUGGCAUGUUCAGAGGCUGCCGAAUCAGGAAAGAAAUUGAGCCUUUUCUGCCACCUCUGAAGCCUGAUUACUGUGUGAAGCAGGCCAUGAAGGCCAUCCUCACUGACCAGCCCAUGAUCUGCACUCCCCGCCUCAUGUACAUCGUGACCUUCAUGAAGAGCAUCCUACCAUUUGAAGCAGUUGUGUGCAUGUAUCGGUUCCUAGGAGCGGACAAGUGUAUGUACCCCUUUAUUGCUCAAAGAAAGCAAGCCACAAACAAUAAUGAAGCAAAAAAUGGAAUCUAAGAAUCUUUUUGUAUGGAAUAUUACUUCUAUCAGAAGAUGAUCAAGAUGUUUCAGUCCAGUGCACAUCAGCAUUGCUGACAUUUUAUGGAUUCUAAACUUGUGUUGUUUCUUUUUUAAAUCAACUUUUUAAAAAAAUAAAGUGUAAAUUAACCGACUAGAGUACUUGGAAAAUGUGAUCAGUACAAGUGAACUUAGGUUGUUGCCAACAGGGUCCUUUUAGGCAGAACCCAGAAACCAGUCAAAUCUGUAGAGAAGCAGUGUGACAUCUUCAGGUUACCAUUAUUUUUUAAUGAGCAGGAAGUCUAGAAAUGAUAACUAGACUGUAUGUUUCAUGUGUGUGAUUUUUCAGAAUUCCCAGAGUUUACUCAUUCUUGUUAUUAAACUCUAGCCAGUUGACAUCUUCGCAAUUUCAAGGACUGAUAGUGCUGUAUUUUCUCACGUUUUCUAAGUUUCCGUUUUGCAAGGCCUAGGUGACUUUUUCAUGGUGUUUGUAUGUUUAGCUCUUUUGAAAAGGAAUUUUGAAAUCUCCAUCAACUGAAGUAAAUGAUGUCUGAGUGUUACAGUAAAGGUGACCAAGUCUCUUUCUUAAAGUCACAAUGACUAAAGUAUUAGUUGAAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAUGGAGUCUCGCUCUGUCACCAGGCUGGAGUGCAGUAGCACAAUCACGGCUCACUGCAAUCUCUGCCUCCCAGUUUCAAGUGAUUCUGCUGUCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCAUGCGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGUCAGGAUGGUCUCCAUCUCUUGACAUUGUGAUCCACCUGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUGCACCCAGCCUUGAAUUUUUAAUUUUAUCUCUGAUAUACUUCAUUAAGUGUCUGGAGACCUAAUUAUCCUAAAAGAUCAUACAUUUUCUACCUAUGAAUUUUGCUGCAUACAGAAAGUGCCCUUUCCUCAGGAAGUUGCUGUGUUUCAUUUCUUUGGAUGGACUCUUAUCUAGAAUACAUAGCAGCUCUGCAAAGGAACAGUUUUUAAAAAUGGGAACUUCUACAUUGAAAAGUCCCCAUUUUUGUGCCAACUAUGAUUAGUGAGAGGAAGAAAUCUUAUUCUAUGGCAUAUGUAUGGAAGGGUGUAAAGAUUCUUUUGAAAGGUUUAUUCACAUUGUAGAACAGCAAAUGACAUUUUUACAGUAUUUUUUUGUAAAGCAAACUAUUUUGUGCCUUGAAUUUGGUAUAUGUGUAUUAGUGAAACAUUGUAAAGGUGAACUUCUACCUCUGUAUCUAAAUGUAUACCAUCCACUUGUAAAUGACUAUAAACUAUUAUGUGAUUGCUUUUUUUUUUAGAAUGUCUUGUUUAAAUAGUGGCCAAUGUUUAAGGCUGUUAAAAUAAGCCAACUUUUACUAAUUGGGGAGUUUUAUAAAUGACUGAUUAAAUUUAAAGAAUUAACUUACAUGCAAUUGUGUGAUUAUUAGUUAUCAGCAGUGUUGUAAGGAAAAUUAUUGUGUUUUUUUUUAUGAUCAUUAUCCCACUUUAGGUAAAGAAAAAUAUUGGAAUGGAAUAGUGUUGGGAAACAGACAUUAACAACCUAGGGUGCCUGCACUCAAAUAGCCGAUGUUACUGUCCCUAGAUUAGAGACUUGAUUAAGGGCUUGUUUGUACCAAAAGUGGGGAAACAAUGCCAUGACCUGUGUUUUAGUUUGGCUGCACCACAGAUCAAAUCUGCACUGUGUCUACAUAUAGGAAAGGUCCUGGUGUGUGCUAAUGUUCCCAAUGCAGGACUUGAGGAAGAGCUCUGUUAUAUGUUUCCAUUUCUCUUUAUCAAAGAUAACCAAACCUUAUGGCCCUUAUAACAAUGGAGGCACUGGCUGCCUCUUAAUUUUCAAUCAUGGACCUAAAGAAGUACUCUGAAGGGUCUCAACAAUGCCAGGUGGGGACAGAUAUACUCAGAGAUUAUCCAGGUCUGCCUCCCAGCGAGCCUGGAGUACACCAGACCCUCCUAGAGAAAUCUGUUAUAAUUUAACAACCCACUUAUCCACCUUAAAACUGAGGAAAGUCGUCUUUACAUCUAAUUUUAUUCUUGUGUGUUAUAACUUAAACCUAUUUCUAUUUUUGUUUGUUAUUGCCCUUAUAAGGGUGUCCAUCUCCAAGUUCAAUAAACUAAUUCAUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1364.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1445.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 998.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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