Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_172200.3

Sequence Length

1467 nt

GC Content

0.5542

CUGGGCAGCGCUCGCCCGGGGAGUCCAGCGGUGUCCUGUGGAGCUGCCGCCAUGGCCCCGCGGCGGGCGCGCGGCUGCCGGACCCUCGGUCUCCCGGCGCUGCUACUGCUGCUGCUGCUCCGGCCGCCGGCGACGCGGGGCAUCACGUGCCCUCCCCCCAUGUCCGUGGAACACGCAGACAUCUGGGUCAAGAGCUACAGCUUGUACUCCAGGGAGCGGUACAUUUGUAACUCUGGUUUCAAGCGUAAAGCCGGCACGUCCAGCCUGACGGAGUGCGUGUUGAACAAGGCCACGAAUGUCGCCCACUGGACAACCCCCAGUCUCAAAUGCAUUAAGCCCGCAGCUUCAUCUCCCAGCUCAAACAACACAGCGGCCACAACAGCAGCUAUUGUCCCGGGCUCCCAGCUGAUGCCUUCAAAAUCACCUUCCACAGGAACCACAGAGAUAAGCAGUCAUGAGUCCUCCCACGGCACCCCCUCUCAGACAACAGCCAAGAACUGGGAACUCACAGCAUCCGCCUCCCACCAGCCGCCAGGUGUGUAUCCACAGGGCCACAGCGACACCACUGUGGCUAUCUCCACGUCCACUGUCCUGCUGUGUGGGCUGAGCGCUGUGUCUCUCCUGGCAUGCUACCUCAAGUCAAGGCAAACUCCCCCGCUGGCCAGCGUUGAAAUGGAAGCCAUGGAGGCUCUGCCGGUGACUUGGGGGACCAGCAGCAGAGAUGAAGACUUGGAAAACUGCUCUCACCACCUAUGAAACUCGGGGAAACCAGCCCAGCUAAGUCCGGAGUGAAGGAGCCUCUCUGCUUUAGCUAAAGACGACUGAGAAGAGGUGCAAGGAAGCGGGCUCCAGGAGCAAGCUCACCAGGCCUCUCAGAAGUCCCAGCAGGAUCUCACGGACUGCCGGGUCGGCGCCUCCUGCGCGAGGGAGCAGGUUCUCCGCAUUCCCAUGGGCACCACCUGCCUGCCUGUCGUGCCUUGGACCCAGGGCCCAGCUUCCCAGGAGAGACCAAAGGCUUCUGAGCAGGAUUUUUAUUUCAUUACAGUGUGAGCUGCCUGGAAUACAUGUGGUAAUGAAAUAAAAACCCUGCCCCGAAUCUUCCGUCCCUCAUCCUAACUUUCAGUUCACAGAGAAAAGUGACAUACCCAAAGCUCUCUGUCAAUUACAAGGCUUCUCCUGGCGUGGGAGACGUCUACAGGGAAGACACCAGCGUUUGGGCUUCUAACCACCCUGUCUCCAGCUGCUCUGCACACAUGGACAGGGACCUGGGAAAGGUGGGAGAGAUGCUGAGCCCAGCGAAUCCUCUCCAUUGAAGGAUUCAGGAAGAAGAAAACUCAACUCAGUGCCAUUUUACGAAUAUAUGCGUUUAUAUUUAUACUUCCUUGUCUAUUAUAUCUAUACAUUAUAUAUUAUUUGUAUUUUGACAUUGUACCUUGUAUAAACAAAAUAAAACAUCUAUUUUCAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-531.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -556.37

Frequency: 0.0000

Diversity: 270.15

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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