Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_172244.3

Sequence Length

1166 nt

GC Content

0.4425

AGAGCUGCUCAGCACGCCCUGGGAUCGCGGGCGGUUUUCAUCGGCCGGUUUGUGAAACGGACAAGAGAGAGACAUUACUGCCGGGAGUGUUGAGUGAAGGGACCAGGUGGAGAUGAUGCCUCAGGAGCAGUACACUCACCACCGGAGCACCAUGCCUGGCUCUGUGGGGCCACAGGUAUACAAGGUGGGGAUUUAUGGCUGGCGGAAACGAUGCCUGUAUUUCUUUGUCCUGCUCCUCAUGAUUUUAAUACUGGUGAACUUGGCCAUGACCAUCUGGAUUCUCAAAGUCAUGAACUUCACAAUUGAUGGAAUGGGAAACCUGAGGAUCACAGAAAAAGGUCUAAAGCUAGAAGGAGACUCUGAAUUCUUACAACCUCUCUACGCCAAAGAAAUCCAGUCCCGACCAGGUAAUGCCCUGUACUUCAAGUCUGCCAGAAAUGUUACAGUGAACAUUCUCAAUGACCAGACUAAAGUGCUAACUCAGCUUAUAACAGGUCCAAAAGCCGUAGAAGCUUAUGGUAAAAAAUUUGAGGUAAAAACUGUUUCUGGAAAAUUGCUCUUCUCUGCAGACAAUAAUGAAGUGGUAGUAGGAGCUGAAAGAUUACGAGUUUUAGGAGCGGAGGGCACAGUGUUCCCUAAAUCUAUAGAAACACCUAAUGUCAGGGCAGACCCCUUCAAAGAACUAAGGUUGGAGUCCCCAACCCGGUCUCUAGUGAUGGAGGCCCCAAAAGGAGUGGAAAUCAAUGCAGAAGCUGGCAAUAUGGAAGCCACCUGCAGGACAGAGCUGAGACUGGAAUCCAAAGAUGGAGAGGUGAGGGAUGAGAAGGACAGAAGUUCAAAGAGCUACAGCUUCAACAGGCCAACCCUUCCCAUAACUGGUUGACCUCGGAGUUGGAUCCUACAGUGUAUCAACAAAAGGAGCCAAGCAGGUUUUAUUUCUGAAACAAUUAAUUGAGCAGCAUGAUUAUAAGCCAAACCCACAAUCCAUCAAAGUGAUGAUUUCUUAUUUGUAAAAUGCAGAGAUAAUGGCAUGUAUUCCAAGUACAGAAUUAUAUGACCAUGAAAAUGAAUGCUAUUUUCAAAUUCUCUCUUGUCACCUUAAAAUAAGAUUUUGUUAGCCAACAUAAUUAAGCUGUAUAUAUUAUACACAUCUGGCUCAAGAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-332.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -353.22

Frequency: 0.0000

Diversity: 273.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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