Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_173197.3
Sequence Length
787 nt
GC Content
0.5934
AGCUCCGCUCUGCCUCCGGCUCUGCGCUCACCUGCUGCCUAGUGUUCCCUCUCCUGCUCCAGGACCUCCGGGUAGACCUCAGACCCCGGGCCCAUUCCCAGACUCAGCCUCAGCCCGGACUUCCCCAGCCCCGACAGCACAGUAGGCCGCCAGGGGGCGCCGUGUGAGCGCCCUAUCCCGGCCACCCGGCGCCCCCUCCCACGGCCCGGGCGGGAGCGGGGCGCCGGGGGCCAUGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGUUUGUCCGAUUCCCGAGACCUGGACGGCUCCUACGACCAGCUCACGGACAGCGUGGACGAUGAAUUUGAAUUGUCCACCGUGUGUCACCGGCCUGAGGGUCUGGAGCAGCUGCAGGAGCAAACCAAAUUCACGCGCAAGGAGUUGCAGGUCCUGUACCGGGGCUUCAAGAACGAAUGUCCCAGCGGAAUUGUCAAUGAGGAGAACUUCAAGCAGAUUUACUCCCAGUUCUUUCCUCAAGGAGACUCCAGCACCUAUGCCACUUUUCUCUUCAAUGCCUUUGACACCAACCAUGAUGGCUCGGUCAGUUUUGAGGAAAUGCUUGACAUCAUGAAGUCCAUCUAUGACAUGAUGGGCAAGUACACGUACCCUGCACUCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGUGGAGAGCUUCUUCCAGAAGAUGGACAGAAACAAGGAUGGUGUGGUGACCAUUGAGGAAUUCAUUGAGUCUUGUCAAAAGGUACAGCUCCCUGCCCUCUACAUUACCCUGACCUGGACUCAGGCCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-310.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -322.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 192.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((.(((..(((((.(((((((...............((((((..(..(((((((((((((....)))...))).((((((((((((......(((((((..(((.....(((....(((..((((((.((((......(((((....((((((((....).)))))))....))))).((((((((((((((((.(.......).))))).))))))))))).))..))))))))..))))))..))).)))))))........(((.((.((((.((.......)).)))).)).)))(((..(((((((((........)))))))))..)))......)))))).)))))))))))))..)..))))))............))))).((((..(((((..(((((((((((((((......))).))))).(((((..(.((..(((((((((((...((........))...)))))..))))))..)).).))).))................(((((((((....(.((((((.((....((..((.(((.(((((..((((..((((..(........(((((((........))))))).....(((((.((((((.((((....))))))....))))...)))))).))))...))))..))))).))).))..)).)).)))))).)....))))))))).....((((......))))..)))))))...))))).))))..........)).)))))..)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((.((({{(((((((((((((((.(((((.(((((.(((.,.,(,,,..(((...(((..(((((((.({.{{.,({..(.(((......))).}.})},}..}}.)))))))..)))..)))...)).,).))).))))).),,)))))))||,..(((((((((((.,(((((((.((((((((((((((((.(.......).))))).)))))))))))))))....))))..)))))||..{(({{,|,{{(((({..,,.,,.||.,|||}||,}}}}}.)).,,,)}))})}|((({{(((((((((........))))))))).}),)}))...},,..,)))),)))))))))..)).))))).............,.....((((..(((((..(((((((((((((((......))).))))).{,(((..{.((..(((((((((((...((........))...))))),.})))))..)).}.))).||,....,}}........(((((((((....{.((((((.((,{,.{{,,((.(((,{({((..{{||..{{{{|.|,,,,,,..(((((((........))))))).....(((((.((((((.((((....))))))....))))...)))))..}}}}|{{||||{.,,,,)})),})),.)}.)).)))))).).,..))))))))).....,{((,,....)}},..)))))))...))))).)))).......,,,|||{{|...,)))),..,.
Back