Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_173209.3
Sequence Length
3205 nt
GC Content
0.4353
AGAGGCGGCUGUCUCGUGCGGCUAGAGCAGGGCCAGUAGAGUUCGGGGCAGCUGUCAAAAACGAGACGGGGAGGCUUUUCUUCCCGGGGGUGGAGGAGGGAAGGAGGGAGGUGUCCUUUUUUCCAUCUGUUGCAGUUUCCGAACCAAACGCACCCUCGCCAGCCCCGGGAAGAAAGGCCCAAGGGAGAAACCUGGGGCGCUCGGCUGGUGCCCCCACCGCCGGGCGAGGGAUGCGGGCGGUCCGUGCGCGGCAGGCGGAAAGGAUCGUGUUUCUGGACCCGGCCACCCCCCGCGUCCGCACCGCCGCCCCCGAGGGACGAGUGACAGCGGCCGCCGCGCUCGGUCCAGUCUUCCCGGCUGGAAGGUAUUGUUGCAGCAUCUGGCAGUGAGACUGAGGAUGAGGACAGCAUGGACAUUCCCUUGGACCUUUCUUCAUCCGCUGGCUCAGGCAAGAGAAGGAGAAGGGGCAACCUACCCAAGGAGUCUGUGCAGAUUCUUCGGGAUUGGCUGUAUGAGCACCGUUACAAUGCCUAUCCUUCAGAGCAAGAAAAAGCGUUGCUGUCCCAGCAAACACACCUGUCUACGCUACAGGUCUGUAACUGGUUCAUCAACGCCCGCCGCAGGCUCCUCCCUGACAUGCUGAGAAAGGAUGGCAAAGAUCCAAAUCAGUUCACAAUUUCCCGCCGUGGGGCCAAGAUUUCUGAAACGAGCUCUGUGGAGUCCGUGAUGGGCAUCAAAAACUUCAUGCCAGCUCUAGAGGAGACCCCAUUUCAUUCCUGUACAGCUGGGCCAAACCCAACCCUAGGGAGGCCACUGUCUCCUAAGCCGUCAUCCCCGGGAUCAGUUUUGGCUCGUCCAUCAGUGAUCUGCCAUACCACUGUGACUGCAUUGAAAGAUGUCCCUUUCUCUCUCUGCCAGUCGGUCGGUGUGGGACAAAACACAGAUAUACAGCAGAUAGCGGCCAAAAACUUCACAGACACCUCUCUCAUGUACCCAGAGGACACUUGUAAAUCUGGACCAAGUACGAAUACACAGAGUGGUCUUUUCAACACUCCUCCCCCUACUCCACCGGACCUCAACCAGGACUUCAGUGGAUUUCAGCUUCUAGUGGAUGUUGCACUCAAACGGGCUGCAGAGAUGGAGCUUCAGGCAAAACUUACAGCUUAACCCAUUUUCAAGCAAAACAGUUCUCAGAAAUGUCAUGAUUGCCGGGGUGAAGGCAAGAGAUGAAUUGCAUUAUUUUAUAUAUUUUUUAUUAAUAUUUGCACAUGGGAUUGCUAAAACAGCUUCCUGUUACUGAGAUGUCUUCAAUGGAAUACAGUCAUUCCAAGAACUAUAAACUUAAAGCUACUGUAGAAACAAAGGGUUUUCUUUUUUAAAUGUUUCUUGGUAGAUUAUUCAUAAUGUGAGAUGGUUCCCAAUAUCAUGUGAUUUUUUUUUUCCUCCCCUUCCCUUUUUUUGUUAUUUUUUCAGACUGUGCAAUACUUAGAGAACCUAUAGCAUCUUCUCAUUCCCAUGUGGAACAGGAUGCCCACAUACUGUCUAAUUAAUAAAUUUUCCAUUUUUUUUCAAACAAGUAUGAAUCUAGUUGGUUGAUGCCUUUUUUUUCAUGACAUAAUAAAGUAUUUUCUUUAAAAAUUGUUGUAAUUCAGAGUAUUUCUGUUGAGGGAGGUGCUUCUUAAAAAUAAGUAGGAAUAUAGCACCCCAGUGAGCAGGAAGCUGGGGGGGUAGGGUGCAGUGUUAGGGGGUGUCACCAGCUCUUUGAAAACCUGUGGACAACAAGCCAGUUUGCAUAAACAGGAUGUGUGAUAUUUACUCUUGAUAGGAGGCAUAGCAGGCCCUUAGAGCUUUACUUAAACUGCAUGGCAAAUUGAAAUGAAUCAUUUUAGUGUUUAGCUAGCCACUAAAUCCCUUGCUGAUCUGUCCUGCGUAGUUUAAAACGUGGCCAUGUUAUAAAGAAAAGUCUUGAAGCAUCCGGUUAUUGCUGAGUUUUCAGAAGAAAACAACGCAAGCAAUCUCUUGCCCUUUUUCCACGUUACCCUUUAAAAUAACCUUUGUUCAGUGGUACAUUUAGUUAAGGCAUUUGUAUUCAAAUGUAGCAUAGUAUUUGCAGAGAAAUUACCUUUUAAAACAUCUCAAAAGUGUUUUCUAAAAUGAUGAAAUAAACGGUGGGGUUCUGUCUAUGGUGGGAUUGUCAGUUUAUUAGGUGAGUAUUUUCCAAGGUCUCAGUUUGUGAAAAAAUGGUGCUAUGUACAAGUGGAGUUUGUUGGGAUAGACAAUCACUUACAAAGCCCAGAUGGCCAGAAGGGAAUUGGUGUUGCUCCUUUCACUUGUAUGGUUGAGCAGAUUUGUCACAUGCCACAAAACCAUUCUUUGUAGUCAUGCUUAGUAUGAGCUUGCUUUGUUGUUACGGUCAUGUUCUUUCCAGCCCUGCCCCAGCUAUGAAUUGUCUAAGUGUGAGGGAGCAUCAGAGCUUCAGUAUUGUUUAAAGAAUGUAGAAAAAUACAAAUUUGUCUAAUUUUGAAACUAUUUUAGAAAGUCCCUACUGUAGAAAGAGCUAAACUCAAAGACUUUCCUUGUAAGUGAAAGAAAAAAACUGCUGAUGAUUACCAAGAGGCGUAAGAAAAUUAGGUGAGGGAAUGUUGUGCUCUAGCCUGUGGGGUGCAGCUUCGUAGGGCACAUCAGCUUAGAAUGGUCUGGCCUCACCUCAGAGAGUCACAGAAAUAGACAAAAACCCAAAAAGUACUAGUAAAGUAAAUACAAGGAACAAAAUAAACAUUAAUAAAAAUGAAUGACGCAAAGGUGAUCCAGAAUCAUUACUUGCUCCAACAGCUAGAUCAAAGGCUGAACAUUUUGCUUUAGUAUAGAUGAGGGAAAUGAGCAAGUCCUAAAAGGUUUGCCCUGUUACGGUGUUUCAUCACUCAUACUGGAAGGAGAAGGAAAGGAGCCAUAUGACUCAUUUAAAAGAAAAACUGUAAGUCACCUUAAAUUCCCUAUGUUUUACUUCAUUUUUUCCCUAUUGAGGUUGUUACAGGUCAUGGUUGAUAAUAGUUGGUGUUGAAUGAAUGUAAUCCAUUAUUUAAAAACAGGUACAUUUAAGUGAAAAGAUAAAUGUAAAAAGCUGUUCAUAUCAAAGCCAAAUAGAAAUGAUUUUUAUGCUUAUAAUUUACAUGGUGCAAUAUAUCUUUUUAAUUUGUUUACUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-937.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -995.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 895.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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