Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_173471.4

Sequence Length

2669 nt

GC Content

0.4743

AACCUGAAGCUCUCAGAGCUUCCCUGUCUUCAUCUAUCAGCCCAGGGAGAGGAAUCAGUGGUUUUCCAAAAGCUGUACCUCUUUCCAUAAAUACAAGGAUGAAGGGCUGAGAUGAUGGCAGUUAGAAUUAUAUUGAGAAAUGGUAGCGGGAUCUGAGAAAGCAAGGCCAUGAGUUGAAAGCAGAGAGAAGGCGGUUCGAGUGGAGCCCUGAUGAAGUUCAUGCUCAUGGUUGCCCAGCCAUUAACACGGGCUCAUCACAUCUGUUUCCAGAUUGCUUCUAGAACUUAGCUACCCUCGUUCUAUAAGAUGGAAUGAAAAUGCGUACUACAUACAGAUCAUGAAAAGACGCAAAGAAAAUGCAUCUUCACAUUGCAGUUCAGAAUCACGCCGGCCUCAUUCUACCGCUGCUCUCUCCUGGAUCUCGGCCACGGAUCUUUUGCUCGCGAAAGUUCCUCCGUCUAGCUGCACACAACGCUGCUGCAGGAAACCGAGGUAAGGGAUUUGCCGAGACUUAGCUCCACCACACUCCCCGAGGCCCCGCCCCUCCUCUCUGGCCCUCCCCUAGGCCCAGGUGUCUCGCGUUGCACGUGCAGUUGUUGUGGUUCUACGUCACGUGGUCCCGGAAGUUCAAGACAGACCCGCCUCAAACAUGGCGGCGCCCAGCGCGCGAGGACGUGAUCCGCUUCUGCUCCGGCUUGGAUUGUAGCCUUGACGAGGUCUGAGCGACCAUGGACCGGCCGGGGUUCGUGGCAGCGCUGGUGGCUGGUGGGGUAGCAGGUGUUUCUGUUGACUUGAUAUUAUUUCCUCUGGAUACCAUUAAAACCAGGCUGCAGAGUCCCCAAGGAUUUAGUAAGGCUGGUGGUUUUCAUGGAAUAUAUGCUGGCGUUCCUUCUGCUGCUAUUGGAUCCUUUCCUAAUGCUGCUGCAUUUUUUAUCACCUAUGAAUAUGUGAAGUGGUUUUUGCAUGCUGAUUCAUCUUCAUAUUUGACACCUAUGAAACAUAUGUUGGCUGCCUCUGCUGGAGAAGUGGUUGCCUGCCUGAUUCGAGUUCCAUCUGAAGUGGUUAAGCAGAGGGCACAGGUAUCUGCUUCUACAAGAACAUUUCAGAUUUUCUCUAACAUCUUAUAUGAAGAGGGUAUCCAAGGGUUGUAUCGAGGCUAUAAAAGCACAGUUUUAAGAGAGAUUCCUUUUUCUUUGGUCCAGUUUCCCUUAUGGGAGUCCUUAAAAGCCCUCUGGUCCUGGAGGCAGGAUCAUGUGGUGGAUUCUUGGCAGUCAGCAGUCUGUGGAGCUUUUGCAGGUGGAUUUGCCGCUGCAGUCACCACCCCUCUAGACGUGGCAAAGACAAGAAUUACGCUGGCAAAGGCUGGCUCCAGCACUGCUGAUGGGAAUGUGCUCUCUGUCCUGCAUGGGGUCUGGCGGUCACAGGGGCUGGCAGGAUUAUUUGCAGGUGUCUUCCCUCGAAUGGCAGCCAUCAGUCUGGGAGGUUUCAUCUUUCUGGGGGCUUAUGACCGAACGCACAGCUUGCUGUUGGAAGUUGGCAGAAAGAGUCCUUGAAGCAGAGACAAGCCUCACCUCCACUUCUGUCAAGAGAGGGGCCUGCAGUGCAAACCCUCUUCCGCUGAGCAGCUGUCUGAACUAUAGGCCCCAGUGCUGAAGACCAGUUGUGCUAAGAUACCGGCAUGGAGAUUGUGCCAUCCGUGGUAUAGGCUGGCUGGUAUGAAGUCAUUGGCCUGUAUGCCAGAGAGCUAAGAGAAGAAAACGGGGUCUGUGGCGGUACUCUGAACAAUUUCCUCAGAACCUCUUAAUAAAUAAGUUUGGUAAUGCUGAGGCCAGGCCUUUUAGAGCUUUCAUUUGAUCUGUAUCUGAUCUUUCAUUUCCUGCCACCUGAUGGUGGAUUCAGCAGAAGGCAAGAUGGUUAUAAUUCUAAAAGAAUAGCUUGUUUGUUUGUUUGGGAAAAGGAGACUUGGGGAAGAGUUGUGUAUGUGGGUGUUUCUCCCCCUAGUUAAUUCCUGUUGUGUAAGGGUAGGCUUUGUUGAAAAAGAAAGAAAGAUUGAACUACAGGUGCAUAGCAAGCACUCUUUCUGGGUAACUAGGCUGCUGGUUUUAAUUACCCUCAGAUUUCACCCAUAAAAACGCACAAUUGUAUUAUUUUACAGAGAUGUGUCCAGCGCCCCCUGUGGUGUGUGAGAGAAAGCAGCUGCAACUCAAGUGACUAGGUGGGCCCAGCUGGCUUCGUGCAGGAGGGCACGGUGGGUGAGCCAUUCUCGCCAUUCUCAUGUCAGACUGAAAGGAGGGCCUGGGCCAGCUUUGAAAAGGCAGGAUGAAAUGGAAAGGUCACCACACUUAGGGAUUUUAGACCUUGACUAACAAGCUCCAGGUGUAGAAAAAUUCAAAACAAAAUGUCAGGAAUCUAGCAGUGUUGUCUGCCCUGGAGCAAACAAACAGUAUGUGAUUUUGCUUCGCCUAUUUUUUUUUUCUUUUUUGGGGGAAGAUAAUUAAAGGCAGAAUGACUGCGUUUGUAAAAGAAGGACCACCAACUAUACUGACAUUUAUAAAUGAACCUUUAUUAAAGACACUUCAAUGCCAUUUGUUAGACACUUCAAUAUUUUACAUGGUUUUCAAUGUACACUGUACCAAAAUUUCUAUAAAUAAAUAACUUUGUACAUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-868.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -919.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 679.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((...))))))).(((((.(((((..(((((((.((((((((...((((((....))....))))..))))))))(((..........)))..)))))))))))).))))).......(((((((((((..(((((((((.(((.((((.(((.((((((((((((((...........((.(((((.....))))))).......)))).))))))))))((((............)))).......(((((....))))))))))))))).))).)))))).(((((((((...)))))))))...(((((.((.(((.......)))...)))))))..(((..((((.........)))).)))..((((..(((((((((.....(((((((((((.((((..(((((((....(((.((((((....)))))).)))(((...((((.((.......)).))))..)))..)))))))..))))..((((((((......((((((((((((...)))((((((((((.((..(((((.(((.....))).)))))......(((((((.((.((((.....((((.((.(((((.(((((((................))))((((........))))((((...)))))))..))))))).))))..))))..))(((((((((...(......)..)))))))))...((((((((......))))))))))))))).)).))..))))))))(((..((((((.(((...((((((((....((((.((((((((......(((((.((((.((((((....)))))).)).)).)))))..((((((((((((....((.((((.(((((((.(.((....(((.....))).(((((....))))).....((((.((....)).))))((.(((....(((((.((.(((((..(((....))).....))))).))))))).....))).)))).).))))).)).)))).))...))))(((....((((((((((((.(((((((..((....)).)))))))..)).....))))))))))...)))..........)))))))).))))))))))))..))))))))...))).)))))).)))..((((((((....))))))))((((((.((((((...((.((((..((....))..)))).))...)))))).))))))))))))))).))))))))((((((((((((.(((((((((((.((((..((((((((....(((............)))))))))))...........)))).)))))))))..)).))).)))))))))((((..(......)..))))....)))))..))))))....)))))))))..))))..(((.((((((((.....(((((((((....(((((.(((..(((....(((((((...((....(((((...((..((.((((((.((.(((((((((...(((....)))....(((((((..(((.((((((..(((((.(...(((((((...(((...)))..)))))))..((...))((((.((((...((((((((..((((((....((((((((.(((...(((((((.((((........))))))..))))).)))))))))))....)).))))))))))))...)))).)))).).))))).....)))))..).))).)).)))))........((((((.(((.((((.....))))...)))....))))))((((((((((.....((((((((((((.((....(((....)))....((((((((....)))))...))).(((((((.(((((((.....(((((((.((((((.....)))))).)))))))..((((((((.((((.((((................)))).)))).))))...))))((((((((...((((.((((.((........)).))))......))))...))))))))..........(((((((((((((....)))))......)))))..)))..((((((((......(((((.(((((......)))))...)))))((((((((((((..(((...((((.....((....))..))))....)))))).))))...)))))...(((((......))))))))))))))))).))).))).)))))).)))))).))))))))))))))))))))))))).))..)))))).))...))....)))))))....((((((........)))))).......((((((((.(((((.........((((...(((.((....)).))).)))).)))))))))))))..((((((.(((.((.(((((((((.....(((.(((((((((.....))))))))).)))...))))))))).)))))))))))...)))))))..)))..))).)))))((((....))))...((((...)))).........)))))))))..)))))))))))............)))))))))))...(((((.(((...................)))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,,.(((((((...))))))).(((((.(((((,.{((((((.((((((((...((((((....}},...))))..)))))))){.,..........,}}..)))))))))))).))))).......,((((((({{,..((((((,((.(((,{({(((((,{(((((((((((({..,........((.(((((.....)))))))..}....)))).)))))))))}((((............)))).......{((((....))))))))))))))).)),.)))))).(((((((((...)))))))))...(((((.((.(((.......}))...}})))))..(({..((({.........)))),}}}..((((..(((((((((.....(((((((((((,((((..(((((((....(((.((((((....)))))).)))(((...((((.((.......)).))))..)))..)))))))..))))..((((((((......((((((((((((...)))((((((((((.((..,(((({(,,.....,)),)}))|,{..{{(((({,{,|{||{,{,,,,{,(((..(((((.,.}})))..)}}.},..,,..,,|.|||(((((........))))|{{{.,,))))}||,{|}}}}}|.|}}}..},||.,.|||{||||||,..|}},,},,,}))))}}|||{.(((((((((......))))))))),.})))})).))..)))))))){((,,({{{{|,|||,..((((((((....{(((.((((((((......(((((.((((.((((((....)))))).)),}).))))),{..{{{,{{((((.,,.((.((((.{{(((((,(.((....(((.....))).{((((....))))}.....{({,.{{||||.,.||||({,(((....{{{,|}|{.|||||.||||||..}}}....,}}}}}.}}}},)}.|||.|||.||}}.}.))))).)).}))).)).,,}))){||..,,((((((((((,{,(((((((..((....)).)))))))..,,.....))))))))))...|||,....{|....}})))))}))))))))))))..)))))))),{,}}}.})))}}.}},..,(((((((....,,))))))|((({{.(,(((({..,,}||||..||....,},,}}}|{||{{{|,,,,)}))))))))))))))),))))))))((((((((((((.(((((((((((.((((..((((((((....({{............))}))))))))...........)))).)))))))))..)).))).)))))))))((((..(......)..}}}}....))))}..))))))....)))))))))..))))..|||,{(((((((.....(((((((((....{{{((.(((,,(((,,..((((((({{{{{....{((((...,,,,((.((((((.{(.((((((((({{{((({{{.{{{{...(((((((..(((.{(((((..{((((.{,..(((((((...(((...)))..)))))))..{{...}}((((.((((...((((((((..((((((....((((((({.(((...(((((((.((((........))))})..))))).)))})))))))....)).))))))))))))...)))).))))...)}})),....))))}.,}.))).)}.)))))........((((((.(((.((((.....))))...)))....)))))),,{((({{,,.,,.}|||{{,{,{{(({(({{,,{(({{{{{{.{(({,,.(((((....))))).,{||{{(({{(((,{{,,{{({{,..{((({{,.||||||,,..,)))))).})})}}}..{(((((((.((((.((((...,........,...)))).)))).)))}...)))),,|{{{{{,..{{{{,||||}||,,,...}}))}))))}}},..,)))}}})}}},,,)}}).)))))}}}}(((({{{{((.,,,}}))}......,)))}.,}}...,,||||,.....,,((({{.(((((......)))))...)))))((((.(((((((.,(((.({((((({,,{(({{{{{...||||.....,,,}}}))),.}})))}}}}|(((((......)))))},,||||||,....)))))).})))),.,,)).)))},.))).))))))))))))))))).))..)))))).})...}}...,))))}}}...,|{{{||......,,))))},.......((((((((.(((((......,...{({...(((.((....)).))).,,)),)))))))))))))..((((((.(((.((.(((((((((.....(({,(((((((({.....))))))))).}},...))))))))).)))))))))))...}}}}})}..}))..))}.})))},,,,....,|}}...|||}....,}},........)))))))))..))))))))))),,,.......}}))},,,|||||,,.,((,,.,..,{{,.............},,,)))))),....