Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_174895.3
Sequence Length
747 nt
GC Content
0.6171
AGUCAUUGCUGCUGGGCACAGCGAGGUCCAAGCUCAGGUCGCCCUGCCCCCUACCCACCAUGCCAGAUCCAGCAUCGUUGUGGGCAAACAAUUAUCUGGAUGAUCUUUAUGGGGCUUAAGCUUGGGUGGGAGCAGAUGGGGCAUGAGCUGGGGAUUUGGGGAUGGGGGGAAUCCACACCCCCACGUCCUGGACGUUUAAAAGGCCCUCUCUGGCACUGGGCCGGGGCAGAGGCCAGCAGAAAAGUGACUGGAGUCCAGGGACAUGAUGGAUCAGGAGGAGAAGACGGAGGAAGGCUCAGGCCCCUGUGCCGAGGCGGGCUCCCCAGACCAGGAGGGCUUCUUCAAUCUGCUGAGCCACGUGCAGGGCGACCGGAUGGAGGGACAGCGCUGUUCACUGCAAGCCGGGCCGGGCCAGACCACCAAGAGCCAGAGCGACCCCACCCCCGAGAUGGACAGCCUCAUGGACAUGCUGGCCAGUACCCAGGGCCGCCGCAUGGAUGACCAACGUGUGACAGUCAGCAGCCUGCCCGGCUUCCAGCCCGUGGGGUCCAAGGACGGAGCACAGAAACGAGCUGGGACCCUCAGUCCCCAACCCCUGCUCACCCCUCAGGACCCGACCGCUCUCGGCUUCCGUCGGAACAGCAGCCCCCAGCCCCCGACACAAGCCCCCUGAGGGCCUGAGGCAUCCUGGGUCUCACUCGGCCCCCAAAAACUGAUAAAAGAAUAAAACACUUAAAUGAAUAACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-293.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -304.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 279.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..((..((((..((.(((......(((((((..(((((((.(((.((((((((((....((((((.((.(((((......))))).))))))))......)))))(((....))))))))))).))))..((((..(((((.((((..(((((((((((((.........))))).(((((((.((((......(((((((((((((.....))))))).)).)))).........((..((((...))))..)).....((.((((.(((.(((((((.(((..(((....)))))).))(((...)))((((.((......)).)))).)))))..))).)))).)))))).)))))))..(((.(((((((.(((.((((((.((((...((((((...((((((....(((.((((((...((..........))...))).....))).))).....))))))....)))..)))...((((((.........)))))).)))).))))))))))))....))))..))).(((((((.((..((...........))..)).)))))))..)))))))))))).)))))))))(((((.(((..........(((((..(((((....((........))..)))))..)))))......)))))))))))..)))))))))).))..)))).))..)).))))..............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,(((((,{(({.({(,,{(({(,,{{((..,(((,(({{(((((((.{(({((((((((((..,,((((((.((.(((((......))))).)))))))}..,,,.)))))(((....))))))))))),||||,,((((,.{({{({{{((.,(((((({((((((,........))))),|{(({{{||{,,......((((((((({(((,,.,,|||}|||,}}.}}||,,((,.....|,.||||.|||||},.,|.,..|||,||||.,{,.,,,{,{,.,{,..{||}|.|}))},,}})}}}}}|,}|||||}||}},,,.}|.|}})})))))..)))}))},.}},})}})))))))}}},|}.|..{||,|,,}|||||{,,|{|},,||{((({{{(({,(({{,.{{{.((((({,,(((...{,,....,|.|.|||..,|||}}.}||.,.,{|||||}....|}}..||},,,({{{{|,....,,..})}))).,,)),)))))))))}}}}})})))),}}}|||((((((.(({.,,{{{{,......,|.,||{||||,},,.))))),,.,},,})))).,,))|{{||,|||.},,},}}},||{{{..(((((....((........))..)))))..}}}}},...,.))))}))|)}}..)))}))))),.)))})))).,,.....|,,,...,,.............,}}},.......
Back