Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_174918.3
Sequence Length
1271 nt
GC Content
0.5153
GGAGGAAAUCUACAAGCACCAGGAAGUCAAGAUGCAAGCACCAGCCUUCAGGGACAAGAAACAGGGGGUCUCAGCCAAGAAUCAAGGUGCCCAUGACCCAGACUAUGAGAAUAUCACCUUGGCCUUCAAAAAUCAGGACCAUGCAAAGGGUGGUCAUUCACGACCCACGAGCCAAGUCCCAGCCCAGUGCAGGCCGCCCUCAGACUCCACCCAGGUCCCCUGCUGGUUGUACAGAGCCAUCCUGAGCCUGUACAUCCUCCUGGCCCUGGCCUUUGUCCUCUGCAUCAUCCUGUCAGCCUUCAUCAUGGUGAAGAAUGCUGAGAUGUCCAAGGAGCUGCUGGGCUUUAAAAGGGAGCUUUGGAAUGUCUCAAACUCCGUACAAGCAUGCGAAGAGAGACAGAAGAGAGGCUGGGAUUCCGUUCAGCAGAGCAUCACCAUGGUCAGGAGCAAGAUUGAUAGAUUAGAGACGACAUUAGCAGGCAUAAAAAACAUUGACACAAAGGUACAGAAAAUCUUGGAGGUGCUGCAGAAAAUGCCACAGUCCUCACCUCAAUAAAUGAGAGGACAUUGUGGCAGCCAAAGCCACAACUUGGAAGAUGGGGCUGCACCUGCCAACGAAGACGGGAAAUGACCCCCCCCCCCCAGCCUAGUGUGAACCUGCCCCUCGUCCCACGUAUAGAAAAACCUCGAGUCAUGGUGAAUGAGUGUCUCGGAGUUGCUCGUGUGUGUGUACACCUGCGUGCGUGUGUGUGCGUGUGUGCGCGUGUGUUCGUGUAUGUGCGUGUGUGCGUGCGCGUGUGUGUGCAUUUUGCAAAGGGUGGACAUUUCAGUGUAUCUCCCAGAAAGGUGAUGAAUGAAUAGGACUGAGAGUCACAGUGAAUGUGGCAUGCAUGCCUGUGUCAUGUGACAUAUGUGAGUCUCGGCAUGUCACGGUGGGUGGCUGUGUCUGAGCACCUCCAGCAGAUGUCACUCUGAGUGUGGGUGUUGGUGACAUGCAUUGCACGGGCCUGUCUCCCUGUUUGUGUAAACAUACUAGAGUAUACUGCGGCGUGUUUUCUGUCUACCCAUGUCAUGGUGGGGGAGAUUUAUCUCCGUACAUGUGGGUGUCGCCAUGUGUGCCCUGUCACUAUCUGUGGCUGGGUGAACGGCUGUGUCAUUAUGAGUGUGCCGAGUUAUGCCACCCUGUGUGCUCAGGGCACAUGCACACAGACAUUUAUCUCUGCACUCACAUUUUGUGACUUAUGAAGAUAAAUAAAGUCAAGGGAAAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-439.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -462.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 268.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((....((((.((..(((((........((((...((((((.....(((((.........(((((((.((.........(((((((.((((........)))).).....))))))(((((.((.......((((...((...((((.((.....)).))))....))...))))........)).)))))...)).)))))))......)))))..))))))))))........))))).)).))))..))))))...(((((((...(((((((((.((((((..(((.(((((.((((((((((.(..(((((((..((((..((((((....)))))).......((((((....((((((...((.((((......)))).)).)))))).....)))))).))))....)))))))...).)))))))))).))).))..))).))).))))))))..))))......(((((((..((((((.((((..((((...((..((((((((((((((.((((....(((((.((((((...(((.....))))))))).(((((((.......)))))))((.((..(..(((((....((((.(......).))))....).))))..)..)).)).(((.(((((.(.((((....((((((((((((((..(((.(((((.(((.........))).))))).)))..)).)))))))).((((.(((((((((((....)))..)))))))).)))).(((((((((((....)))))))))))...((((.((((((....)))))).))))((((...((((.((......)).))))..))))..)))).((((.(((((....((((.((((((((....))).))))).)))).))))).)))))))).)))))).))))))))....))))))))))))))..)))).)))).))..)))).))))))((((((((.(((((.(((((...(((((((.((.(((....))).))(((((.((((......)))).))))).(((((........)))))))))))).....))))).)).))).))))))))......((((.(((((.....))))).))))...((((....(((...)))....))))..)))))))...((((((((...........))))))))..(((((((((.....(((((...))))).....).))))))))...))).)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((....((((.((..(((((.,.,..,.((((...((((((.....(((((.........(((((((.{(,.......,((((((,.{(((........}})).).....))))))|((((.{{.......((((...((...((((,((,....}}.))))....))...))))..,.....)).))))),..}}.)))))))......)))))..)))))))))},.,.|,,.))))).)).))))..))))))...(((((((.,{(((((((((.((((((..(((.(((((.((((((((((.{..(((((((..((((..((((((....)))))).......((((((....((((((...((.((((......)))).)).)))))).....)))))).))))....)))))))...}.)))))))))).))).))..))).))).)))))))),,))}|..,{,.((((((,..,{((((,((((..{(({{{{{{,,(({{((((((((((.((((....(((({.((((((..,(((.....))))))))).{((((((.......))))))}.{{((..{..(((({....((((.{......}.))))....}.}))),.....)})|{(((.(((({,(.((((..,,((((({{{{,,.((..(((.(((((.(((.........))).))))).)))..)).||||}|(((((((.{((((((((((,,,{(((({{(((((((......)))))))}}))))},}}))))))))))).))))))}|..|}},..|||}|,||{,,{{,,},|{||.||,.....)).))))..}}},..}},}.((((.(((((....{(((.((((((((....))).))))).)))}.))))).)))))))).)))))).))))))))....))))))))))))))|,||,|||.||{||..||||,}|||||({{{{||{.{{(((,(((((...({{{{{{.||,|||,,,.})),))|||||,||||,,,...)})),))))),|{{(({{{.....})))))||||}}....})))}}.||,|||,}}}}}}))},||,|((((.(((((.....))))).))))..,|{{{,,,,|||...}}}.,,,))),.,)))))}}...((((((((...........))))))))..(((((((((.....(((({...})))).....),})))))))...))),}))).......
Back