Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_175842.3

Sequence Length

2095 nt

GC Content

0.6019

ACACAGGCCGCGGCGGCUGGCUCGGGCCCCUACGGUCCCGGCGGCGGCUGGAGGAGGAAGCCAGGCGGCUGGCGGAGGAGGAGAGACGGAGGAGGCCGAGACCGGAGCGCCGCUCGCCGCAGACUUACUUCCCCGGCUCAGCAGGGAAAGGUUCCUAGAAGGUGAGCGCGGACGGUAUGCAAAGUUGUGAAUCCAGUGGUGACAGUGCGGAUGACCCUCUCAGUCGCGGCCUACGGAGAAGGGGACAGCCUCGUGUGGUGGUGAUCGGCGCCGGCUUGGCUGGCCUGGCUGCAGCCAAAGCACUUCUUGAGCAGGGUUUCACGGAUGUCACUGUGCUUGAGGCUUCCAGCCACAUCGGAGGCCGUGUGCAGAGUGUGAAACUUGGACACGCCACCUUUGAGCUGGGAGCCACCUGGAUCCAUGGCUCCCAUGGGAACCCUAUCUAUCAUCUAGCAGAAGCCAACGGCCUCCUGGAAGAGACAACCGAUGGGGAACGCAGCGUGGGCCGCAUCAGCCUCUAUUCCAAGAAUGGCGUGGCCUGCUACCUUACCAACCACGGCCGCAGGAUCCCCAAGGACGUGGUUGAGGAAUUCAGCGAUUUAUACAACGAGGUCUAUAACUUGACCCAGGAGUUCUUCCGGCACGAUAAACCAGUCAAUGCUGAAAGUCAAAAUAGCGUGGGGGUGUUCACCCGAGAGGAGGUGCGUAACCGCAUCAGGAAUGACCCUGACGACCCAGAGGCUACCAAGCGCCUGAAGCUCGCCAUGAUCCAGCAGUACCUGAAGGUGGAGAGCUGUGAGAGCAGCUCACACAGCAUGGACGAGGUGUCCCUGAGCGCCUUCGGGGAGUGGACCGAGAUCCCCGGCGCUCACCACAUCAUCCCCUCGGGCUUCAUGCGGGUUGUGGAGCUGCUGGCGGAGGGCAUCCCUGCCCACGUCAUCCAGCUAGGGAAACCUGUCCGCUGCAUUCACUGGGACCAGGCCUCAGCCCGCCCCAGAGGCCCUGAGAUUGAGCCCCGGGGUGUGCUAAAGAGGCAGUACACCAGUUUCUUCCGGCCAGGCCUGCCCACAGAGAAGGUGGCUGCCAUCCACCGCCUGGGCAUUGGCACCACCGACAAGAUCUUUCUGGAAUUCGAGGAGCCCUUCUGGGGCCCUGAGUGCAACAGCCUACAGUUUGUGUGGGAGGACGAAGCAGAGAGCCACACCCUCACCUACCCACCUGAGCUCUGGUACCGCAAGAUCUGCGGCUUUGAUGUCCUCUACCCGCCUGAGCGCUACGGCCAUGUGCUGAGCGGCUGGAUCUGCGGGGAGGAGGCCCUCGUCAUGGAGAAGUGUGAUGACGAGGCAGUGGCCGAGAUCUGCACGGAGAUGCUGCGUCAGUUCACAGGGAACCCCAACAUUCCAAAACCUCGGCGAAUCUUGCGCUCGGCCUGGGGCAGCAACCCUUACUUCCGCGGCUCCUAUUCAUACACGCAGGUGGGCUCCAGCGGGGCGGAUGUGGAGAAGCUGGCCAAGCCCCUGCCGUACACAGAGAGCUCAAAGACAGCGCAUGGAAGCUCCACAAAGCAGCAGCCUGGUCACCUUUUCUCUUCCAAGUGCCCAGAACAGCCCCUGGAUGCUAACAGGGGCGCCGUAAAGCCCAUGCAGGUGCUGUUUUCCGGUGAGGCCACCCACCGCAAGUACUAUUCCACCACCCACGGUGCUCUGCUGUCCGGCCAGCGUGAGGCUGCCCGCCUCAUUGAGAUGUACCGAGACCUCUUCCAGCAGGGGACCUGAGGGCUGUCCUCGCUGCUGAGAAGAGCCACUAACUCGUGACCUCCAGCCUGCCCCUUGCUGCCGUGUGCUCCUGCCUUCCUGAUCCUCUGUAGAAAGGAUUUUUAUCUUCUGUAGAGCUAGCCGCCCUGACUGCCUUCAGACCUGGCCCUGUAGCUUUUCUUUUUCUCCAGGCUGGGCCGUGAGCAGGUGGGCCGUUGAGUUACCUCUGUGCUGGAUCCCGUGCCCCCACUUGCCUACCCUCUGUCCUGCCUUGUUAUUGUAAGUGCCUUCAAUACUUUGCAUUUUGGGAUAAUAAAAAAGGCUCCCUCCCCUGCCCCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-855.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -892.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 370.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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