Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_176795.5
Sequence Length
1260 nt
GC Content
0.6611
AGGCCCGCCCGAGUCUCCGCCGCCCGUGCCCUGCGCCCGCAACCCGAGCCGCACCCGCCGCGGACGGAGCCCAUGCGCGGGGCGAACCGCGCGCCCCCGCCCCCGCCCCGCCCCGGCCUCGGCCCCGGCCCUGGCCCCGGGGGCAGUCGCGCCUGUGAACGGUGGGGCAGGAGACCCUGUAGGAGGACCCCGGGCCGCAGGCCCCUGAGGAGCGAUGACGGAAUAUAAGCUGGUGGUGGUGGGCGCCGGCGGUGUGGGCAAGAGUGCGCUGACCAUCCAGCUGAUCCAGAACCAUUUUGUGGACGAAUACGACCCCACUAUAGAGGAUUCCUACCGGAAGCAGGUGGUCAUUGAUGGGGAGACGUGCCUGUUGGACAUCCUGGAUACCGCCGGCCAGGAGGAGUACAGCGCCAUGCGGGACCAGUACAUGCGCACCGGGGAGGGCUUCCUGUGUGUGUUUGCCAUCAACAACACCAAGUCUUUUGAGGACAUCCACCAGUACAGGGAGCAGAUCAAACGGGUGAAGGACUCGGAUGACGUGCCCAUGGUGCUGGUGGGGAACAAGUGUGACCUGGCUGCACGCACUGUGGAAUCUCGGCAGGCUCAGGACCUCGCCCGAAGCUACGGCAUCCCCUACAUCGAGACCUCGGCCAAGACCCGGCAGGGCAGCCGCUCUGGCUCUAGCUCCAGCUCCGGGACCCUCUGGGACCCCCCGGGACCCAUGUGACCCAGCGGCCCCUCGCGCUGGAGUGGAGGAUGCCUUCUACACGUUGGUGCGUGAGAUCCGGCAGCACAAGCUGCGGAAGCUGAACCCUCCUGAUGAGAGUGGCCCCGGCUGCAUGAGCUGCAAGUGUGUGCUCUCCUGACGCAGGUGAGGGGGACUCCCAGGGCGGCCGCCACGCCCACCGGAUGACCCCGGCUCCCCGCCCCUGCCGGUCUCCUGGCCUGCGGUCAGCAGCCUCCCUUGUGCCCCGCCCAGCACAAGCUCAGGACAUGGAGGUGCCGGAUGCAGGAAGGAGGUGCAGACGGAAGGAGGAGGAAGGAAGGACGGAAGCAAGGAAGGAAGGAAGGGCUGCUGGAGCCCAGUCACCCCGGGACCGUGGGCCGAGGUGACUGCAGACCCUCCCAGGGAGGCUGUGCACAGACUGUCUUGAACAUCCCAAAUGCCACCGGAACCCCAGCCCUUAGCUCCCCUCCCAGGCCUCUGUGGGCCCUUGUCGGGCACAGAUGGGAUCACAGUAAAUUAUUGGAUGGUCUUGA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-553.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -573.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 305.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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