Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_177424.3
Sequence Length
3034 nt
GC Content
0.4031
CCCAGUUUCUCCGUCAGCCUGCGGGUCCCGGCUGGCGGCUGCUUCCGGUAGGAGAGCGGUGUAGAGCGAGCAGGUCUCAGCUCCUCGUCAUGUCAUACGGUCCCUUAGACAUGUACCGGAACCCGGGGCCCUCGGGGCCCCAGCUCCGGGACUUCAGCAGCAUCAUCCAGACGUGCAGCGGCAACAUCCAGCGGAUCAGCCAAGCCACUGCUCAGAUAAAGAAUUUGAUGAGCCAGCUAGGAACUAAGCAGGACUCAAGCAAGCUACAGGAAAAUCUGCAACAGUUACAACACUCCACAAAUCAGCUCGCCAAGGAAACAAAUGAAUUGCUGAAAGAAUUAGGGUCCUUGCCCCUUCCCUUAUCUACUUCAGAACAGCGCCAGCAGAGACUUCAGAAGGAACGCCUCAUGAAUGACUUCUCUGCAGCCUUAAACAAUUUCCAGGCUGUGCAGAGAAGGGUAUCUGAAAAGGAAAAGGAGAGUAUUGCCAGAGCAAGAGCUGGAUCUCGUCUUUCUGCAGAAGAGAGGCAAAGAGAGGAGCAGCUGGUCUCAUUUGACAGCCAUGAGGAGUGGAACCAGAUGCAGAGCCAGGAGGAUGAGGUGGCCAUCACUGAGCAGGAUUUGGAACUUAUUAAAGAAAGAGAAACGGCAAUUCGGCAGCUGGAGGCUGACAUUUUGGAUGUCAAUCAGAUAUUUAAAGAUUUGGCCAUGAUGAUCCAUGACCAGGGUGAUCUGAUUGAUAGCAUAGAAGCCAAUGUGGAAAGCUCAGAGGUGCACGUCGAAAGAGCCACUGAACAGUUACAGCGAGCUGCUUACUAUCAGAAAAAAUCUCGCAAGAAGAUGUGUAUCCUGGUGCUUGUCCUGUCAGUGAUUAUUCUAAUCUUGGGACUUAUUAUCUGGCUAGUUUAUAAAACGAAGUGAUUGCCUCCGAUCGUUCUCCCGCUGAGCUGUUUUCAAGGGCAAGUGCUUGUUGAAGUCUUGCCAGAACAAACUGAUCACAAGAAGACAGCAUAUAUCAGAACGUCCUGUAAUCAUUUAGUUAGAAACUAACUACUAACUAGUCUUUGGAAUUCGUGACCUAUGGAGACAGUAAUUAUCAAUUUAUUGAUUCUAUUGAUUUCUCAAAUUAGGAAUUAACUUAUGUGGAUUUUGCUUCCUCUUGUAUUCUGAUUGCCCUUCAUCCCAAGUGUUUACUGAAAAUUCCAUUCUAGAUAUUCUUGUUUUGACAAAUGACACUACAGUCUCGUAAUAUUGUCUUUUAUGUAUAUACAAAAUUUACCUUUUUACUAGCAUCUGAGAUAGAGUUACUUUCUGGUACCCAGUAUAUUGGAGUCUGUCAGAAACUCUAUAAUAGGCCACCAGUUUUUAUUAUUUAACAUUUUUAUUUGAAUUUCUAAGAAGCCUAUUCUCUAUCUAUUUUGAAAGAUUUUGGCACUAUAUUUAAUUGGAAGGUAAAAUAUUGUACAUGUGAUCCAGAGUAAAUGAGAAGUCUCUAUCUGAGCUGGUCAGUUACUGGAGUACAUGUUACUAAUCUGGGUUUAAAGUUUACUUCAUUAUCUGCUAGUGUCAUCCACAGCAGUUCAUCCUCAUCCACACUAAGCCAUCCUGUUAGCUUUUAAAGGAAGUUAAUUUAAUUAACAUUAAUAUACUCUAUGGGCUCCCUCUCCCACCUGUCUGCAUAGAAAGGCAGAAUUAGACAUAGCAUGCUUUGGAAAAGCAAAUAGGAAUUGUUGGGAAUGAUUUAAUCUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUCACUUGUGGUUCUACAUUCCUGGUGAAUGAUGAAUGUUGCUGUCAAAGGGCUGCCCCCUACCUUAUAAGGGUUGCUGGGCAUUUGAAGGCAGGAAGAUUUUUAAAGAUAGAUUGAGGUUGGUUUAAAAUUAUUCCUGUAAACCAACAAUAAAGCAAAGAAGAGGUUCAUUUUUGUAAAUAACACUGGUUUCAAAUAGUGAUGUUAGACUUAACCUAAUUUAUAAACAAGAGAUUAAUAUCUCCAUGCAUAGUUUUAGACAAAAAAAGAUGUUUCAAUAAAAUUACUGUCUUGUAAUAUAAAUGUUGUCCACUUCCCUUUUCCACAGGCCUAGAACAGUUAAAGGGAACAUAAUUUGUUUAGGCUCCCACAUAAAUGUGAAUCUGGCCAACAACUUUGGUUCAUCCUUUAGUGAAUUAGAGGAUUUGGCUACCCUGAGUAUAUUUAUAUUCAUUUCUUCUGUUCUCCUUCUGUUAUUAUACUUAAUCUUCUAAACUAAACUAAUGUGAACAGUAGGGAAGCAAGGGCCCAAAUGCAUAAGUUUCUUUGCACUGUUGCACUUACUUAAUACAAAUAAAUGUUUUUUAAAGCUUUUGUAGUAUGUUUUUAUGAGUUAACAUCCUAAUGUGGUAGGUAUUAGGUAAUGUGCUGUCAUGAGAAAAAUUGAGACUUCCAAGAAAACUGGACACCAGGUGAGGGUUGGUUUGGAGACGGAAUAGGUGUAGCUGCCUUUCCUUGAAAAACAGUGUGUAGAGAUGGCUGAGUGCAAUGGCUCACACUUGUAAUCCCAACACUUUGGAAGGCUGAGGCGGGAGGAUCAGUAUAUCGGUACGUCUGAGCCCAAGAGUUCAAGAUCAGCCUGGGCAGUAUAGCAAGACCCCAUCUCCAUUUUUUUUUUAAUGAUUUUUUAAUUAAAAAAAAGAACAACAGGAUAGAGCUGUUGGGGUGGCACAGUGGCCCAAAGAGCAGCUUCAGAGAUAAUUCCUUGGUUCUAUGAUCCCUGUUUAACUCCAAAUUACAGUCGGACUUGGAUACAUCAUUUGUAACAUUGUAGGAAAGAAAAAAGUCUUGGUUGUGAAAAACGAUUUGCAUUUGGGUAAAAUAAAGUGACCAUGCUUUUGUUCUGUAAUACUGUGUGACCUGUGGUUGUUGUAAUGGUGAUCAUGGAGAGCAAAUAUGAACUUGGCCUGGAUUUUAAAUGGCCUAGAAUUUGUGGUAGUUGCCAAAGAGGUUCUCCUAGGUGGUCUUAAUAAACCUAUUCACAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-844.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -902.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 924.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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