Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_177972.3
Sequence Length
6445 nt
GC Content
0.5170
ACUCCCGCCUUGGCGCCAGAGGGGCGCGGGACGGUGCGGUCGGCCUCCCCGCCUCCACGCGCGCGCACGACCCGCGCACUCCCGGAGCUUCGCCCAUCUCGCCUCGCCGCGCCGCGCAGGCAGCCGCUCGCAGAGCCAGCAGCCGGGGCCCUGGCGUGCAGCGCGGGCCUCGGCGGGGCCCAGCGCCCCGGCCCGGGAGGAUGCGGCCCGGGGCGGCCCGGGAGCUGAGCAGGGCCCCCGCGCCGGCCCCUCCGGGCCCCGGCCUCCAGAGCCGCAGCCACCGCCCCGCCCCCGAGAGACAUGACUUCCAAGCCGCAUUCCGACUGGAUUCCCUACAGUGUCUUAGAUGAUGAGGGCAGAAACCUGAGGCAGCAGAAGCUUGAUCGGCAGCGGGCCCUGCUGGAGCAGAAGCAGAAGAAGAAGCGCCAGGAGCCCCUGAUGGUGCAGGCCAAUGCAGAUGGGCGGCCCCGGAGCCGGCGGGCCCGGCAGUCAGAGGAACAAGCCCCCCUGGUGGAGUCCUACCUCAGCAGCAGUGGCAGCACCAGCUACCAAGUUCAAGAGGCCGACUCACUCGCCAGUGUGCAGCUGGGAGCCACGCGCCCAACAGCACCAGCUUCAGCCAAGAGAACCAAGGCGGCAGCUACAGCAGGGGGCCAGGGUGGCGCCGCUAGGAAGGAGAAGAAGGGAAAGCACAAAGGCACCAGCGGGCCAGCAGCACUGGCAGAAGACAAGUCUGAGGCCCAAGGCCCAGUGCAGAUUCUGACUGUGGGCCAGUCAGACCACGCCCAGGACGCAGGGGAGACGGCAGCUGGUGGGGGCGAACGGCCCAGCGGGCAGGAUCUCCGUGCCACGAUGCAGAGGAAGGGCAUCUCCAGCAGCAUGAGCUUUGACGAGGAUGAGGAGGAUGAGGAGGAGAAUAGCUCCAGCUCCUCCCAGCUAAAUAGUAACACCCGCCCCAGCUCUGCUACUAGCAGGAAGUCCGUCAGGGAGGCAGCCUCAGCCCCUAGCCCAACAGCUCCAGAGCAACCAGUGGACGUUGAGGUCCAGGAUCUUGAGGAGUUUGCACUGAGGCCGGCCCCCCAGGGUAUCACCAUCAAAUGCCGCAUCACUCGGGACAAGAAAGGGAUGGACCGGGGCAUGUACCCCACCUACUUUCUGCACCUGGACCGUGAGGAUGGGAAGAAGGUGUUCCUCCUGGCGGGAAGGAAGAGAAAGAAGAGUAAAACUUCCAAUUACCUCAUCUCUGUGGACCCAACAGACUUGUCUCGAGGAGGGGACAGCUAUAUCGGGAAACUGCGGUCCAACUUGAUGGGCACCAAGUUCACUGUUUAUGACAAUGGAGUCAACCCUCAGAAGGCCUCAUCCUCCACUUUGGAAAGUGGAACCUUACGUCAGGAGCUGGCAGCUGUGUGCUACGAGACAAACGUCUUAGGCUUCAAGGGGCCUCGGAAGAUGAGCGUGAUUGUCCCAGGCAUGAACAUGGUUCAUGAGAGAGUCUCUAUCCGCCCCCGCAACGAGCAUGAGACACUGCUAGCACGCUGGCAGAAUAAGAACACGGAGAGUAUCAUCGAGCUGCAAAACAAGACACCUGUCUGGAAUGAUGACACACAGUCCUAUGUACUCAACUUCCAUGGGCGCGUCACACAGGCCUCCGUGAAGAACUUCCAGAUCAUCCAUGGCAAUGACCCGGACUACAUCGUGAUGCAGUUUGGCCGGGUAGCAGAGGAUGUGUUCACCAUGGAUUACAACUACCCGCUGUGUGCACUGCAGGCCUUUGCCAUUGCCCUGUCCAGCUUCGACAGCAAGCUGGCGUGCGAGUAGAGGCCUCUUCGUGCCCUUUGGGGUUGCCCAGCCUGGAGCGGAGCUUGCCUGCCUGCCUGUGGAGACAGCCCUGCCUAUCCUCUGUAUAUAGGCCUUCCGCCAGAUGAAGCUUUGGCCCUCAGUGGGCUCCCUGGCCCAGCCAGCCAGGAACUGGCUCCUUUGCCUCUGCUACUGAGGCAGGGGAGUAGUGGAGAGCGGGUGGGUGGGUGUGAAGGGAUGAGAAUAAUUCUUUCCAUGCCACGAGAUCAACACACACUCCCACCCUUGGGGUAGUAGUGUGUUGUAGUCGUACUUACCAAGCUGAGCAACCUCUUCAGCUGGGAAGGCCGCAAGAGGCAUAGAGGGAGAGGAAGCACACUGCAGGGCUGCUGUGGCCCAGUCGUCCGCUCAGCCAAGGAGUCAGAUGGCAAUGGGUACUCCAGCAGGUAGGGGCACAGUGAAUGUGUGUAUGUAUGAAGGCCACAUCAACUUUAUGUAGCAAAGGGCUUGGUGGCCAAGCCUGGCCCUUAAACAACUGCAGAAAGCCCUUCAACUUCAGAAGGCCUCACUCAAGCCUGAGAGAAGUUGGGAGGGUGGUGGGGACAGGUAAGUGGCAGGACCCUGUCAGGAUUGCAGGUGCCUGGCUUGCUGUGGCUAUGGGAAUCAGCUGGUGGCUAGGUUUCUAGCGCAUUUGAUUUCUCCAGGUUUGCUGUGUCUCACAGAGGCAGUAGGAACCCAGCUCUCAGGGCUGUCUUGGUGGAUGGGCCCUGCAAGACACAGGCUCAGCAUGCAGAAGUGCAUGAACAGGGUCCCUGGAUCAGGGUUGUUCUGGGAGUCCUGUCAGCUUCCCCAGGAGCUCUCUGCUGAGCAGCCCAGCACAACCCCCAGGAAACACAAAUGGGGUCCAGGUCACCAGCCUGACUGCACACAGCUAGGCAUGCCUGGGAAUCCUGCUGCCAGAGAACCAUUCCCAAGCCAUGGCAUGCUCCUUGAAGAAUCUCUCCUCUCUCUCUCUCUCUGGAAAGACCCAACUUUCUCACUGCUGUCAGCCAAGUCAUGGUUGGUAACCAUGUAGGUUCUUGGGAGGGAAUGGGACAGGGUGAAUAAAGCAGGGAAUAUUUUAGAACCACAAGAGAUCAGCAGUGGCAGGACCCUUAGGAAUCUAGUACAACCUUGUUGCUUUAGGUGAGUCACACUCAGAAAAUGGGGCUUGCCCUGGGUCACCUAGCUGGUUAAUGGCAGCAUUCAGAACUUCAAGUUCUCUUGAUUUCUUUGUUCCCACUGUCCCCCAAGAAACUAGUAUCUCUGGCCUCCUGGGGGCCCAUUCUGCAUGCCCUCCCCACUUCCCCCGAUUCAGAGACUUAGAAGCAUCAGAGUUGAUAAAUUAGAUUGAAACCAUUCCAGUAGGAAAUCAGGCAGUUCCCUGUUGAAAGUUGUCUGGCUUUUUGCACGUGAGUAUGAUCCAGGAUUGGCCUGUGUCUGGCCCCUCCGCGAGGGCUACUCAGCAGUAAGCAGGCCUUAGUACGGCUGCUGCACACUUCUCGGUCUAGGUGGGAGAGAGUGCAUAAAGGUUCUGGGGCUGGGCCUGAGCCUAACUCCCUCCACUACCGCUAUUUCUCCUUGGAUGGCACCAUCCACCCUGCAGGCUUGGGAACUGUAAGCUCAAGCUUUUGCUCAUUUGUCAUUUACCCUGGUGGAGGCUUCUUGCCCAGAUAGAGAUCUGAAAUUGGUGGGAAGCAAGCAGGGGUCGUACCUUGCUUUAGAGUAGAUGUUUGGAAAAGCUAAGUAGAAAUUUUUUAAAAUAGAAGUUGUAUUUUAAACGUGUUAGGCUUUAUAGGUGAAGGACUUGUUUUGACUUAAGUAGAAGUAAUAUGCUCUCAUUUCUUUGUAAUCUAGAUUUUCCUAUGUUGAAUGCUUAAAGCAAGGCAUACCUGUCCUAGCAGGAUCUGCCCACACCUCGGCCGUACAUCUCUGUGAGAGACCCCCUCCAACGAUUAGCUUUUGCAACAUGGUCCAGUUUCUAGAGGGCACUAGAACUUUGUGCCAGCGCUGGCGAGAUACCAUGGUGCCAUCCUCCUUUCUAUAGUUCCAGUUUAGCCCUUCCCUGCCUUUAAGGAGAAGAGAUCUUCAUGGUGACAUUUGAGAUGAUGGAAACUAGAUCGUCUCUAAUGUUAGGUCAAGCUAUUUCUCUGGAUCUAUGAUUUUAAGAUAGAACAGGCUGGUUCUGAGUUCUGGUGAGACGGAGACCCCGGUGGCAGUGGAAAAAUCAGAAGCACAAAGGAAAACUCUUGGCCUCUGCUUUCUCCUGUAGCACAAAGAGGGAGUUGGCUGGAUCUUUUGGUGGAGUCAGGAAAGACAGGCUGAGCUUUCUAGCCUAAGUGUGGAGAAGGAUAGCCUCAGCCACAAAACUCUGUCAGGCAUUGAAUGACAAGCAUCAGUAGCUGAGUGCACUCCUGGUGAUCCUGGUUUUCCUUGACCACUGGCCCUGGGGCCAUGGGUGCAUGGACUCGUAAAGCUGCUAGGGCCCCUAGAAACCACCUGGGUUCAGCCUCUCCCACAAUAAGAGUUCUUGCCCUUCAUACCCUCUACCUGGAUGGAUGGUCUUUGGGCAGGGAAUUAAUGACAGAAUGAGCAGUCCCUAAUGGUAUUGGGCAGUUGGGAGUGAGUUUAGGCAGCUUCUCUGUAACCGCUUCUGGGGCCACACCCCAAAACUCUACACCCUCUGCCCCAGAACAAUUCUGCAGAGUGGUGAAGUUCACUUCCCCAACUCUUCUCCAAGUCUAGCUUUCCUUUCCUUCUGGCUCCAAGGUGCUCUGUGUCCGUCUGUGUAUGUGUGUGUCUGUGCGUCUGUGUGUUUAUUUGGGGAAAAGGGCAAUCAGCAAUCAACUGAGGUUUCUUAAUUGUGAUUAUAUUCCUGAGAAUGAAUGAGUAGGAAAGGAAUAAGGAUGUUGUUAUGAUCGCCUGUGGAUUUUGUCCAUUCAUCUCAUGCUCUCUGAACAGAAGGUAUACCUGGGAAGAUACCAGCUUUUUCUCUCAGGGUUCUGAGUCAGAGGACACCAUCCAAGAAUGUUGUUAGCUUUUCAGUUCCCGCUCUGCAUUGCCUGAAAAAACUGGUAUGUUGCACGUAUGCUUUUGGUUGAAAUUGAACAUACUCUAGUGAAUGUGCCUUAAAAAUCAAGACACUAGUUCAGAGGAAGCAC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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2356.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2471.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 1833.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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