Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_178022.2

Sequence Length

2608 nt

GC Content

0.5629

AUUUCCUCUCUGCCGGUCUUCUUGGCCAACAAGCGUUUCUCCCUCUUCCCUGUUCUCCCCACUUCCCCACUUCAUCCCCCUUCAUCCCCCCUUCCUCGCCCCUCCACAGACCCAGGGCAUUUGGUGGACACUUUUGCUUGCAGUUAGGUCAAGUGGAGCCCUGACCCUCUAUUCUGCACCCUGUGAGCCACCGAGACUGAACCAAACCCAGGAAGCGGCGCCACCAACCAGCCUCGCAGAGGCAGAGGCCCUGGAGCAGUGACAGCACAGGAGAUCUGCUGGCUCGGGGGAAGGGGAGGAAAGAGGAAAACAAAGGGAGUGAUCGAGUGAGCCUCGCCCCGCCCUCCCUGCGCCGGCCCAUGAUGUGUCAGUCAGAGGCGCGGCAAGGACCAGAGCUCCGCGCGGCGAAAUGGUUGCACUUCCCCCAGCUGGCCCUGAGGCGGAGGCUGGGGCAGCUGAGCUGCAUGUCCAGACCCGCUCUGAAACUGCGCUCCUGGCCCUUGACCGUCCUCUACUACCUCCUGCCCUUCGGCGCCCUCAGACCGCUCAGCCGGGUGGGAUGGAGGCCCGUAAGCAGGGUGGCUUUGUACAAGUCAGUGCCAACGCGCUUGCUGUCACGGGCCUGGGGUCGCCUCAAUCAGGUGGAGCUGCCACACUGGCUGCGCAGGCCCGUCUACAGCCUGUACAUCUGGACGUUUGGGGUGAACAUGAAAGAGGCCGCUGUGGAGGACCUGCAUCACUACCGCAACCUCAGCGAGUUCUUCCGGCGCAAGCUGAAGCCGCAGGCCCGGCCUGUCUGUGGCCUGCACAGCGUGAUUAGCCCAUCGGAUGGAAGGAUCCUCAACUUUGGGCAGGUGAAGAACUGUGAGGUGGAGCAGGUAAAGGGGGUCACCUACUCCCUGGAGUCGUUCCUGGGCCCGCGUAUGUGCACAGAGGACCUGCCCUUCCCACCAGCCGCGUCGUGUGACUCCUUCAAGAACCAGCUGGUCACCCGGGAAGGGAAUGAGCUCUAUCACUGUGUCAUCUACCUGGCCCCUGGGGACUACCACUGCUUCCACUCCCCCACCGACUGGACUGUGUCCCACCGGCGCCACUUCCCAGGCUCCCUGAUGUCAGUGAACCCUGGCAUGGCUCGCUGGAUCAAAGAGCUCUUCUGCCAUAACGAGCGGGUGGUCCUGACGGGGGACUGGAAACAUGGCUUCUUCUCACUGACAGCUGUGGGGGCCACCAACGUGGGCUCCAUUCGCAUCUACUUUGACCGGGACCUGCACACAAACAGCCCAAGGCACAGCAAGGGCUCCUACAAUGACUUCAGCUUCGUGACGCACACCAAUAGAGAGGGCGUCCCCAUGCGUAAGGGCGAGCACCUGGGCGAGUUCAACCUGGGCUCCACCAUCGUGCUCAUCUUCGAGGCCCCCAAGGACUUCAAUUUCCAGCUGAAAACAGGACAGAAAAUCCGCUUUGGGGAAGCCCUGGGCUCGCUCUAGAGUCUCUUUCCUGAUUAUGGCUGCUAAGGGAUCUUUUCCAAACAGAGUGAGGGUCUUUUCAAGAGGGAGGCCCAUGAGGCCAUCCAGGUAAGGGCCUGCCUCAGCGUGGUUGGGAGUCUGACCAGGUAGGACUUGAAUGAUUCGGCUACCACCUGUUCCAGAGGUGCAGACAAGAGGUGGCGAGAGCCCCCAUCAUGCCCCUCAACCUAUCCCGUUCCUUCUGCCUACAAAUAAAAAGUGCAGGCUGGAAUGAUCUCAGUCACAUUUGGAUCUUUUUAAACACUGUAUAGACGGAAGAGCCUGCAUUCCUGACCGAACCUUCAGUUGGUCUCGGUUGUCGUUUUUUCUUGCUGCUCCUCCCCCCAUCACCUGAGCUGUUUUCUGUUGGCCCCUUUUGUUUUUUGGCCUUAACGCUCCUGCUGCACAGGGUGAGGUGCCUCCUUGGCACAGACUGUGGAUGCCUCUCCCCCAGCAGAGCCACACAGCCUUCGUGACAACUGCUUUCCGUUCCCACAUUCACCUCAUCCUGCUCUUUAGAAAAAGCAGUCUUUGUGCUUGUGGCUGAACGCAUCACCCUGGACUCUGCUAGUGUCUUCUGAGGACACUGAUGACACUGAUUAAUGAUACAGACCUUUGCAGGACCUGAUGAGUGACCCUUCUGGAGCUGGCCAGGUCCUCUGCAGCAGGCAAGACCAAUCAAUCACUGAACCUGCCUCAUGGCACCAGAGUGAACAGGGCAGGCAGGUAGUAGGCCCAGCUGGGGAAAUGGGAGAGUUCCUGUCCCCCUCCACAUAUCCCUACAUGAAAUAUGGGAAAGUUGCUGCUAUUGAUUCAGGGUCUGUCUUGGAGGCAGAGGACCCUUGGUGGAUAGUUGGUCAGUGCCUGGAAAACCUGUCCCAGUUUAUCAGGAACGCAGGCCUGGGGAGCCCCCAGUGGCGGGGACAGGGCCAGAUUUCAUGUUGACCCUGGGGAUGCUGUGAAUUUCUCCUGCAGGAGAGACAUCAUUGAAUUUUUUCAACUGUAUCAGUAGCACAGUAUUUUUGUAUGAAAAGUGGGAGACUUCUGAACAGUAAUUCAUUUAAUUGCAAAGCAUUUUGAAAUAAAAAAAAUCAAACUUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-990.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1036.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 494.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.....(((.((((.....))))..........((((((.(((.....((((((((((((((........(((..(((..(((((((((((((.......(((.(..(((((((..(((((((........((((((((...((((((((((((........))))))).)).)))))))))))..(((...(((.........)))....)))..)))))))...(((((...)))))....)))))))..).)))..(((.(((........))))))..)))))))))).)))))).))).......)))))))...((((((((((((((.(((.((((((..(((((((..((((......))))..))).)))).)))....)))....))).)))))...)))).))))).((((((((((((..(((((((.....(((.(((..((((.(((.((.((((.....))))..)))))))))))).)))....))).))))((((((((((((((((..((.(((..((((.....(((((((((..(((((((((((((.(((((((((.....((((......))))...))).))))))...))))))))((((((((((.....)))))).((.((((...)))).))((((((((((((((((.((((((.(((((((((.((((..((((.((...((((..((.((((..((......)).)))).))..))))..)).)))).....(((.(((((((((..((((((((((.......(((((((.((((((((.(...(((((..(...(((....)))....)..))))).(((.....)))((((((.(((((......(((((((.....)))))))((((((..(((.(((((.(.(((.((((((((((......((((((((((((((.(.((....(((.....)))...))).)))))).....))))))))......)))......)))).))).)))).)))))..))))))).))..((.(((((.((((((.(((...((((...))))...))).((((....(((((.((.(((....))).))..)))))..)))).....((((((....((((............))))...))))))....)))))).))))).))..))))).))))))).)).)))))).)))))))(((.((((((.......))..)))).))).))))).)))))........(((((...((...))..)))))..........))))))))))))(((((.(..(......)..)))))))))).)))).(((((((((.((.(((((((((((...)))))))(((....)))(((......)))..((((((((.......((((...(((....)))....)))).....))))))))..)))).)))))))))))...(((...((((((((((((.((...(((((((((((.(........).)))))))))))...((((.((((((.....(((.....)))..)))))).))))))))))))))))))...)))(((((.(((.(((((...))))).).)))))))..))))).))))))....((((.((((.((.......)).))))))))..........(((((.(((((((..........)).)))))..)))))((((.(((......)))))))..........))))..))))))....))))))......(((((((((.......))).))))))((.((........)).))....)))))))))))))).))))...))))..))).)).........((((.(((......(((((((((((((((((.(((((.....)))))((.(((((..((.((((........)))).))))))).))..((....)).......((((((((((..(((......(((((..........))))).....)))..)))))..)))))..))))))))........(((((((((...)))))))))......((((((...))).)))........((((((((.(.(((..((.....)).))).).)))))))).))))))))).))).))))....(((((.....((((....))))....)))))..)))))))).)))))))))).))))))))))....))))))).((((((((((..((((...((((............))))........((((((.(((.(((((((((((...))))...))))))).))).)))))).((((.((((((((.((((........)))).)))))..))).))))(((((...))))))))).))))))))))((((...(((...)))..))))((((((((((..(((((((....)))))))......((((....))))((((...))))..)))))))))).........))).))))))..........((((((.....))))))...)))....)))))....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{{{{.....(((.((((.....))))..,....},,((((((.(((.....{((((((((((((({.......{,{.,(((..(((((((((((((.,,....(((.(..(((((((..(((((((........((((((((...((((((((((((........))))))).)).))))))))))),.(((...(((.........)))....))).}))))))}...(((((...)))))....)))))))..).))).,(((.{((......},)))))}.})))))))))).))),}),)),.......)))))))...((((((((((((((.(((.((((((..(((((((..((((......))))..))).)))).)))....)))....))).)))))...)))).))))).(((((((((({(,.(((((((.....(((.(((..((((.(((.{(.((((.....))))..}})))))))))).)))....))).))))((((((((((((((((..((.(((..((((,.{{{(((,,((({({{{,((((((((((.((((((((({{.{,({{{....,})})),,.,}),))))))...)))))))}((((,(((((.....)))))|.((.((({...)))).))((((((((((((((((.((((((.(((((((((.(((({.,..,.,(.{{((({,(((((,{((((,..{{{.........))}.))})}))).}))))}.},{((.(((((((((.,((((((((((,,,({..(((((((.((((((,(,....(((((..{{,.(((....))),,..,..))))).({{.....})}((((((.(((((......(((((((.....)))))))({{(({{{(((,(((((.(.(((.(((((((({(,.,...((((((((((((((.(.{({.,.{({.....})).},,}).)))))).....))))))))...,..}))}....})))).))).)))).)))))..))))))},)}.,{{.(((((.((((((.,((...((((...}}||,..|||,((({....,{(((,((.{((,,.{|||.||..|}}}}.,}))||||}}||||||..|,||||...,,|,.....)}))})))))))),}..)))))).))))).)}.,))))).)))))),.}),)))))).)))))))..}}|{||({.......)).,|,,,...).))))).)))))........(((((..,{{...})..)))))........}.)))))))))}))|((((.{.,(......}.,)))))))))).)))}.(((((((((.((.(((((((((({...})))))){,{,...))){{{......))),.((((((((.,.....((((...(((....)))....)))}....,))))))))..)))).)))))))))))...(((...((((((((((({{((,..{((((((((((.(,.....}.}.))))))))))}...((((.((((((.....(((.....)))..)))))).))))}}))))))))))))...)))(((((.((,.{((({...})))).,.))))))).,))))).))))))....((((.((((.((.......)).))))))))..........(((((.(((((((..........)).)))))..)))))((((.(((......)))))))..........)))}..})))))....))))))......(((((((((.......))).))))))|,.{{........)).)),))}))}))))))}})))})),)...))))..))),)}.........{(((.(({...{,.(((((((((((((((((.(((((.....))))),(.(((((...(,{(((......}.))))},,))))).},..{{....,}.,.....((((((((((..(((......(((((.{{....,}.))))).....)))..)))))..))))),.))))))))...,,.,.((((((({{...}}}})})))..},,,|||,,,...,,,.)))......,.((((((((.(.(((..((.....)).))).).)))))))).))))))))),))).)))}....(((((.....((((....))))....)))))..)))))))).)))))))))),))))))))))....))))))}.{(((((((((..((((...((((............))))........((((((.(((.((((((({(((...}}}))},,)))))).))).)))))).((((.((((((((.((((,{{...,,)))).)))))..))).))))(((((...))))))))).)))))))))}((((...((,...,))..)))){(((((((((..(((((((....)))))))......((((....)))){(((...))))..)))))))))}......,..))).))))))..........((((({.....})))))...)))...,}}}}}....................