Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_178862.3
Sequence Length
4107 nt
GC Content
0.4052
GUCCCCGCCCAGCACCCCUCGCACCAGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGAGCUAGACCCGCCGCCGGGGCACAACAUGGCGGAGCCCUCGGCCCCGGAGAGCAAGCACAAGUCGUCCCUCAACUCGUCCCCGUGGAGUGGCCUCAUGGCCCUGGGAAACAGCCGGCACGGCCACCACGGGCCCGGGGCCCAGUGCGCGCACAAGGCGGCGGGCGGCGCGGCGCCGCCGAAGCCGGCCCCGGCGGGGCUGUCCGGGGGGCUGUCGCAGCCGGCUGGGUGGCAGUCGCUUCUCUCCUUCACCAUCCUCUUCCUGGCCUGGCUUGCCGGCUUCAGCUCGCGCCUCUUCGCCGUCAUCCGCUUCGAAAGCAUCAUCCACGAGUUCGACCCGUGGUUUAACUAUAGAUCAACACAUCAUCUUGCAUCUCAUGGGUUCUAUGAAUUUUUAAAUUGGUUUGAUGAAAGAGCAUGGUAUCCACUAGGAAGAAUAGUAGGUGGUACUGUUUACCCAGGGUUGAUGAUAACCGCUGGCCUUAUUCAUUGGAUUUUAAAUACAUUGAACAUAACUGUUCACAUAAGAGACGUAUGUGUGUUCCUUGCACCAACUUUUAGCGGCCUUACAUCUAUAUCUACUUUCCUGCUUACAAGAGAACUUUGGAACCAAGGAGCAGGACUUUUAGCUGCUUGUUUUAUUGCUAUUGUACCAGGCUACAUAUCUCGGUCAGUAGCUGGAUCCUUUGAUAAUGAAGGCAUUGCUAUUUUUGCACUUCAGUUCACAUACUAUUUAUGGGUAAAAUCUGUAAAAACUGGGUCAGUUUUUUGGACAAUGUGCUGCUGCUUAUCCUAUUUCUAUAUGGUCUCUGCUUGGGGUGGUUAUGUAUUUAUCAUCAAUCUUAUUCCACUGCAUGUAUUUGUGUUGUUACUGAUGCAGAGAUACAGCAAAAGAGUCUACAUAGCAUAUAGCACUUUCUACAUUGUGGGUUUAAUAUUAUCAAUGCAGAUACCUUUUGUGGGAUUCCAGCCAAUCAGAACAAGUGAACACAUGGCAGCUGCAGGUGUCUUUGCAUUGCUGCAAGCUUAUGCUUUCUUGCAGUAUCUGAGAGACCGAUUAACAAAACAAGAGUUCCAGACCCUUUUCUUUUUGGGUGUAUCACUAGCUGCAGGUGCUGUGUUCCUUAGUGUCAUCUAUUUGACUUAUACAGGUUACAUUGCACCAUGGAGUGGCAGGUUUUAUUCAUUGUGGGAUACUGGGUAUGCAAAAAUACACAUUCCAAUUAUUGCAUCAGUGUCUGAGCAUCAACCUACGACUUGGGUGUCUUUCUUCUUUGAUCUACAUAUUCUUGUAUGUACCUUCCCAGCAGGCCUUUGGUUCUGCAUCAAAAAUAUCAACGAUGAAAGAGUAUUUGUUGCUCUAUAUGCAAUCAGUGCUGUCUACUUUGCUGGAGUGAUGGUGCGACUGAUGUUGACUUUGACUCCAGUCGUGUGUAUGCUGUCUGCAAUUGCCUUUUCAAAUGUUUUUGAGCACUAUUUGGGGGAUGACAUGAAAAGGGAAAAUCCACCUGUGGAGGACAGCAGUGAUGAGGAUGACAAAAGAAACCAAGGAAAUUUGUAUGAUAAGGCAGGUAAAGUGAGGAAACAUGCAACUGAACAGGAAAAAACUGAAGAGGGAUUAGGCCCUAAUAUAAAAAGCAUUGUCACCAUGUUGAUGCUGAUGCUAUUGAUGAUGUUUGCUGUCCACUGUACCUGGGUCACAAGCAAUGCCUACUCUAGUCCAAGUGUAGUCCUGGCCUCAUACAAUCAUGAUGGCACCAGGAAUAUCUUAGAUGAUUUUAGAGAAGCUUACUUUUGGCUAAGGCAAAAUACAGAUGAACAUGCACGAGUAAUGUCUUGGUGGGAUUAUGGCUAUCAGAUAGCUGGAAUGGCUAAUAGAACUACGUUGGUGGAUAAUAACACCUGGAAUAACAGCCACAUAGCACUGGUGGGAAAAGCUAUGUCUUCUAAUGAAACAGCAGCCUAUAAAAUCAUGAGGACUCUAGAUGUAGAUUAUGUUUUGGUUAUUUUUGGAGGGGUUAUUGGCUAUUCUGGUGAUGAUAUCAACAAAUUUCUCUGGAUGGUUAGGAUAGCUGAAGGAGAACAUCCCAAAGACAUUCGGGAAAGUGACUAUUUUACCCCACAGGGAGAAUUCCGUGUAGACAAAGCAGGAUCCCCUACUUUGUUGAAUUGCCUUAUGUAUAAAAUGUCAUACUACAGAUUUGGAGAAAUGCAGCUGGAUUUUCGUACACCCCCAGGUUUUGACCGAACACGUAAUGCUGAGAUUGGAAAUAAGGACAUUAAAUUCAAACAUUUGGAAGAAGCCUUUACAUCAGAACACUGGCUUGUUAGGAUAUAUAAAGUAAAAGCACCUGAUAACAGGGAGACAUUAGAUCACAAACCUCGAGUCACCAACAUUUUCCCAAAACAGAAGUAUUUGUCAAAGAAGACUACCAAAAGGAAGCGUGGCUACAUUAAAAAUAAGCUGGUUUUUAAGAAAGGCAAGAAAAUAUCUAAGAAGACUGUUUAAAUGCACUGUUCUGGUUCCUAACUUGAAGCAGUUGUCCUUGUGAGAACCGGUCUUUGCCUUUAGCUCAUGUCGUGUUUCACAGCAAAGAGGGUACAGAACCAUCACUGGUCCAGGUUAAUGUACAAAAUUUUCUGGCAAUGCCUGAUUAAAAAAAUAAAAUUGGCUUGUUGAGAACAGCUGUUUUCGAUUUCUAAUGUGAAGCAAGACAGAGCACUGCUGUAAAUGUCUAGCAGCAGAUUUUUUUUUUAUUGGUACAUAUUAUCCUUCAAAUCUGAGAAUUUGGACUAACUGCACCAAAGAACCCUCUAAUUUGGUCCCUGGCACAUGCAUACUUGUCAAUGUUUUUAUUCUUUUACAAGACCUGCAUUUUAUUUGAAUUACCCGAAUAGCAAUAUGUAAAAUACAAGUGACAAAAUGUGAUGAGAGCUUCUUGAACCGGUAAACUAGUACAGGUCUGAGAAAGACAUAUUAGAAGAAUCAUUAUACUUCCUUGAAUUAUAUUUAUUUUCAUGUUUCUCUAAUGCAAAGAAUGUUUCAUCAAAUGUAUAUUUUCUGUUGCUUACUGUUUGCUCUGAGAAGAAGCUGCUGUUUCAAAGAUGGACCUCUGAGUAGCUAAUUGAUUCAAGUAGUUUUUUUAUGUUGACACAUUAUUACUGCUGUUAGCAGUCGUUUUCACCAGGUACUUACAGAGCAGAUUUCAUACAUCAUUCAUUCAAGGGCUAAAUUUAUAUUUUUUGGAAAUCAUGGCAACUACACAGGAUGUUGCUUACCAGGACGGAGUUUUGGUAUCUUAGUACUGAAGUUAGCACUAUGUUUACAUGCAAAAGAUUAAGGAAAAAACCCUUAAAGUGGACAGGUAUCCAAAGUUCAUUUUCUGUGACUCAUCAAAGUGACAAAAGACUUGUAACAACUUUGCCUGGACUUUUUUCAUUUUACAACAGUUCAUCCAUUCACAAUGAUUUUGUUCUCUGCUCCAUAUUUUUUAAUCCCUUAAGCAUUUGAUGAAACACUCUUUAGUGCUAUAUGCAUUUUCUUACUUUUGUUAAAAAUGUGACAGUUGUCAAAAAAUGCACUAAAAUGUAAAUGGAGAUUGAACAAGUUCACUUUCCAGCUUAUAGGCAACUUUAUACAGACUUGAACAUUUUCUCCAGUUGUUUAGUAAAAGUGAAAGAGAAAGGGUUUUUCCUGCCACAGGAUAUAACUUUUUUUUAUAUAACAAGCAUAACACACCACUGCUUUUGGUGGAAAAGUGCAGAAUAGUAUGUACCUUUUAUGAAGAAAAAUGUAAUUUACAAUAUUCAGUGAGAAUGUUACUGCUGAUUUUCUUUUCCAAGGUGUAGAAUAUUCUUUGAUUUAUAGAAUUCAUUUUUGACCCAGAUGAUGGUUCCUUUACAGAACAAUAAAAUGGCUGAACAUUUUCACAAAUAGAGUGUAACGAAGUCUGGAUUUCUGAUACCUUGUCAUUUGGGGGAUUUUAUUUUACUUUGUUGCUUUAAAAUUCAAUGCAGAGAAGUUGUUGACUGUAGGGGAAAUAAAGUUAAUUCAAAUUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1134.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1219.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 970.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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