Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_180977.3

Sequence Length

2655 nt

GC Content

0.5435

GCAGCGCGCAGGCGGUGGCGAAGAGACGCCGAGCGGGCCGAGUGCGGCCGAGCAAAGCCGGAGCCGGAGCGGGGCCGCAGGAGACGGGCCGGGUCCGGACGGGCCGAGAUGCCCUAUAAACUGAAAAAGGAGAAGGAGCUGUUUAUCCAGAAGCUACGCCAGUGCUGUGUCCUCUUUGACUUCGUGUCAGACCCACUCAGUGACCUCAAAUUCAAGGAGGUGAAGCGGGCAGGACUCAACGAGAUGGUGGAGUACAUCACCCAUAGCCGUGAUGUUGUCACUGAGGCCAUUUACCCUGAGGCUGUCACCAUGUUUUCAGUGAACCUCUUCCGGACGCUGCCACCUUCAUCGAAUCCCACAGGGGCUGAGUUUGACCCAGAGGAAGAUGAGCCCACCCUGGAAGCUGCUUGGCCACAUCUCCAGCUCGUGUAUGAGUUCUUCUUACGUUUCCUUGAGUCUCCUGAUUUCCAGCCAAACAUAGCCAAGAAGUACAUCGACCAGAAGUUUGUACUUGCUCUCCUAGACCUAUUUGACAGUGAGGAUCCUCGAGAGCGGGACUUCCUCAAGACCAUUUUGCAUCGCAUCUAUGGCAAGUUUUUGGGGCUCCGGGCUUAUAUCCGUAGGCAGAUCAACCACAUCUUCUACAGGUUCAUCUACGAGACGGAGCAUCACAACGGGAUUGCUGAGCUCCUGGAGAUCCUGGGCAGCAUCAUCAAUGGCUUUGCCCUGCCCCUUAAAGAAGAGCACAAGAUGUUCCUCAUCCGUGUCCUACUUCCCCUUCACAAGGUCAAGUCCCUGAGUGUCUACCACCCUCAGCUGGCAUACUGUGUGGUACAAUUCCUGGAGAAGGAGAGCAGUCUGACUGAGCCGGUAAUUGUGGGACUUCUCAAGUUUUGGCCCAAGACCCACAGCCCCAAGGAGGUGAUGUUCUUGAAUGAGCUGGAGGAGAUUCUGGACGUCAUUGAACCUUCUGAGUUCAGCAAAGUGAUGGAACCCCUCUUCCGCCAGCUGGCCAAGUGUGUCUCUAGCCCCCAUUUCCAGGUGGCAGAGCGUGCUCUCUAUUACUGGAACAAUGAGUACAUCAUGAGCCUGAUAAGUGACAAUGCUGCCCGAGUCCUCCCCAUCAUGUUCCCUGCACUCUACAGGAACUCCAAGAGCCACUGGAACAAGACAAUCCAUGGACUGAUCUAUAAUGCCCUGAAGUUGUUUAUGGAAAUGAAUCAGAAGCUGUUUGAUGACUGCACACAACAAUACAAGGCAGAGAAGCAGAAGGGCCGGUUCCGAAUGAAGGAAAGGGAAGAGAUGUGGCAAAAAAUCGAGGAGCUGGCCCGGCUUAAUCCCCAGUAUCCCAUGUUCCGAGCCCCUCCACCACUGCCCCCUGUGUACUCGAUGGAGACAGAGACCCCCACAGCUGAGGACAUCCAGCUUCUGAAGAGGACUGUGGAGACUGAGGCUGUUCAGAUGCUAAAAGACAUCAAGAAGGAGAAAGUGCUGCUGCGGAGGAAGUCGGAGCUGCCCCAGGACGUGUACACCAUCAAGGCACUGGAGGCGCACAAGCGGGCGGAAGAGUUCCUAACUGCCAGCCAGGAGGCUCUCUGACCCCUCACGUUCCUACCACAGGGCCACAGCCCACACAGCCCUGGGACACUGCCCUGGCCCUCCAUACUCUGCUCCCUACUGGCUGUCUUGGGGGAAGGCAGCGCCUCUCUAGCUACUCAAGGGAGGGGGAUGUGGGCACUUGAAGCAGGGACACCCACAGAAUGGUCCCUCUUCUCCCCAAAAGGUGUUCAUGCCUCCCUGUGGCUAGUACAGGCUGAGCACUAAGAUGCUUAGUGCUCAGACAACCUGGGGAUGCCUGUCCCCUACCUGCUCCUCACCCACAGCUACCUGAGGCUGCUCUGAGAAGUACACACAGGAAUACAUACGCUCCUCUAUUCUUCCCUUCAUCCUCAUUUGAACGCCAGGUAUCUCCCCUCCUCUCUCUCCCCUGCAGAGGCAUGUAGGGAACAGCAGGAGAUUAUUCUCACCAAAGUUAUGUCAAGCCCCAUUGGUCCCAGAGUAGCUGAAGGGAAGCCAACCCCCCUGCAGCACAAAUAGGCCCCCCAGUCCCAGCCGUGUGCUGGCAGAUAGGGUUGUAUUAUUUCUUCUUACCCCAUGCCUGACCAAGGGAGGUCAAAAGGAGAAAAGUAUAGGCUGUGGACAAUAACUGAUGAAUAUAGGGCCCAGAUGGACCAAGUGGGGCCGGGGAGGGAUGAAUAAACACCCUACCCCGUGCCCUGUCUUUGGUGAGCAGCAGCCCUGGGGUCACAGACAUGGAAGGGACCACCCUGGGGCUGACUGCUUUUCUGUGCUGUUGGUUCCCAAAACUAGAAAGAAGGAAGCAGGGAGCGGUGCCCCAAGCAUGGCUCCUGCCAACACCUAUUUAUUUCCUUGUUUGUGCUAUGCUGGGCAGGCCUUCUCUUGUCCCUUAUAGGUACCUUGGAGGGGCCAGGGGCUGAGGAAGGCCGGACCCAGGUUCCAGGGGCGCAGGCAGUGCGGCUUUUGGCUGUGUACAUAGGGUGCUUUAUUCUCCACAGAGUGAUACAUGCUAAGGUGGGUUGGGCUUGGACCGAUGUCCCCAUAUGUACAGAACUGAAUAAAGUGGGUCUCUGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-957.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1005.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 634.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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