Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_181309.2

Sequence Length

2797 nt

GC Content

0.3643

CUUUACCACUACUCGCUAUAGAGCCCUGGUCAAGUUCUCUCCACCUCUCUAUCUAUGUCUCAGUUUCUUCAUCUGUAACAUCAAAUGAAUAAUAAUACCAAUCUCCUAGACUUCAUAAGAGGAUUAACAAAGACAAAAUAUGGGAAAAACAUAACAUGGCGUCCCAUAAUUAUUAGAUCUUAUUAUUGACACUAAAAUGGCAUUAAAAUUACCAAAAGGAAGACAGCAUCUGUUUCCUCUUUGGUCCUGAGCUGGUUAAAAGGAACACUGGUUGCCUGAACAGUCACACUUGCAACCAUGAUGCCUAAACAUUGCUUUCUAGGCUUCCUCAUCAGUUUCUUCCUUACUGGUGUAGCAGGAACUCAGUCAACGCAUGAGUCUCUGAAGCCUCAGAGGGUACAAUUUCAGUCCCGAAAUUUUCACAACAUUUUGCAAUGGCAGCCUGGGAGGGCACUUACUGGCAACAGCAGUGUCUAUUUUGUGCAGUACAAAAUAUAUGGACAGAGACAAUGGAAAAAUAAAGAAGACUGUUGGGGUACUCAAGAACUCUCUUGUGACCUUACCAGUGAAACCUCAGACAUACAGGAACCUUAUUACGGGAGGGUGAGGGCGGCCUCGGCUGGGAGCUACUCAGAAUGGAGCAUGACGCCGCGGUUCACUCCCUGGUGGGAAACAAAAAUAGAUCCUCCAGUCAUGAAUAUAACCCAAGUCAAUGGCUCUUUGUUGGUAAUUCUCCAUGCUCCAAAUUUACCAUAUAGAUACCAAAAGGAAAAAAAUGUAUCUAUAGAAGAUUACUAUGAACUACUAUACCGAGUUUUUAUAAUUAACAAUUCACUAGAAAAGGAGCAAAAGGUUUAUGAAGGGGCUCACAGAGCGGUUGAAAUUGAAGCUCUAACACCACACUCCAGCUACUGUGUAGUGGCUGAAAUAUAUCAGCCCAUGUUAGACAGAAGAAGUCAGAGAAGUGAAGAGAGAUGUGUGGAAAUUCCAUGACUUGUGGAAUUUGGCAUUCAGCAAUGUGGAAAUUCUAAAGCUCCCUGAGAACAGGAUGACUCGUGUUUGAAGGAUCUUAUUUAAAAUUGUUUUUGUAUUUUCUUAAAGCAAUAUUCACUGUUACACCUUGGGGACUUCUUUGUUUAUCCAUUCUUUUAUCCUUUAUAUUUCAUUUGUAAACUAUAUUUGAACGACAUUCCCCCCGAAAAAUUGAAAUGUAAAGAUGAGGCAGAGAAUAAAGUGUUCUAUGAAAUUCAGAACUUUAUUUCUGAAUGUAACAUCCCUAAUAACAACCUUCAUUCUUCUAAUACAGCAAAAUAAAAAUUUAACAACCAAGGAAUAGUAUUUAAGAAAAUGUUGAAAUAAUUUUUUUAAAAUAGCAUUACAGACUGAGGCGGUCCUGAAGCAAUGGUUUUUCACUCUCUUAUUGAGCCAAUUAAAUUGACAUUGCUUUGACAAUUUAAAACUUCUAUAAAGGUGAAUAUUUUUCAUACAUUUCUAUUUUAUAUGAAUAUACUUUUUAUAUAUUUAUUAUUAUUAAAUAUUUCUACUUAAUGAAUCAAAAUUUUGUUUUAAAGUCUACUUUAUGUAAAUAAGAACAGGUUUUGGGGAAAAAAAUCUUAUGAUUUCUGGAUUGAUAUCUGAAUUAAAACUAUCAACAACAAGGAAGUCUGCUCUGUACAAUUGUCCCUCAUUUAAAAGAUAUAUUAAGCUUUUCUUUUCUGUUUGUUUUUGUUUUGUUUAGUUUUUAAUCCUGUCUUAGAAGAACUUAUCUUUAUUCUCAAAAUUAAAUGUAAUUUUUUUAGUGACAAAGAAGAAAGGAAACCUCAUUACUCAAUCCUUCUGGCCAAGAGUGUCUUGCUUGUGGCGCCUUCCUCAUCUCUAUAUAGGAGGAUCCCAUGAAUGAUGGUUUAUUGGGAACUGCUGGGGUCGACCCCAUACAGAGAACUCAGCUUGAAGCUGGAAGCACACAGUGGGUAGCAGGAGAAGGACCGGUGUUGGUAGGUGCCUACAGAGACUAUAGAGCUAGACAAAGCCCUCCAAACUGGCCCCUCCUGCUCACUGCCUCUCCUGAGUAGAAAUCUGGUGACCUAAGGCUCAGUGUGGUCAACAGAAAGCUGCCUUCUUCACUUGAGGCUAAGUCUUCAUAUAUGUUUAAGGUUGUCUUUCUAGUGAGGAGAUACAUAUCAGAGAACAUUUGUACAAUUCCCCAUGAAAAUUGCUCCAAAGUUGAUAACAAUAUAGUCGGUGCUUCUAGUUAUAUGCAAGUACUCAGUGAUAAAUGGAUUAAAAAAUAUUCAGAAAUGUAUUGGGGGGUGGAGGAGAAUAAGAGGCAGAGCAAGAGCUAGAGAAUUGGUUUCCUUGCUUCCCUGUAUGCUCAGAAAACAUUGAUUUGAGCAUAGACGCAGAGACUGAAAAAAAAAUUUACUUUGAUCUCUGUUUUUGAAUUCUUAUUAUUUAUAUUUUGCUUACUACCUUUUUUGCCUUUUGUCCUUUUGUGGAGAGGGCGAUGAAUUAAGAGUAGUGGGGUGGGUGGCGAGUAAGUAAAAUUUCAAAUAGCAUUUUAGUGAAUGCAAUUCAGUAGUCCUGAAGCCUGACUUAAUAAAACAAAAUUCAUUUAUGGUUGUUUCAUGAAAGUUAUUAGAUAGGAUCAAGUUUUGUUUGUAUAUUGUUUGCCUUGCUCUGUUUUUGCUUUUGUGCUUAGGCAAGUGCAAAAUACUCUAUGGAAAUCAUAAUUGUCAUCUUCUUCAUGGUGUUAGGGAUAUAUUGUCACAUGAUUUCAAUAAAUCCUUUUUUUGCUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-714.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -769.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 848.59

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

............(((((...(((((((..(((....(((((..((((((..((((((((((.((((.(((((.((......)).))))).............(((((((.((((....))))................(((((((....(((...)))...)))))))....((((.((........))..))))...(((((((......(((((((((.(((((...))))))))).)))))((((............))))....(((((((.((........))...)))))))))))))).......((((((((((((((.(((((((((.........))))))).))((((.(((((((....)).))))).)))))))))).)))))))).((((((......))))))...........((((....)))).)))))))((((((..(((....))).))))))(((((((((...)))))))))...)))).))))).)))))............((((.((((((.(.(((((....))))).))))))).))))....(((.........)))...........))))))..)))))((((....))))((((.(((.(((...(((((.((((......(((((....((((.((((............))))))))...))))).........))))...)))))...))))))...)))).((((((..........(((((((((...............)))))))))...(((((.((.(((((.(......)))))).))))))).....(((....)))..)))))).........))).)))))))....))))).......((((((.((((((((..((((((((..((((.(((.((((((......))))))....))).)))).((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.....)))))))))...(((((.(..(((((((........((((..(((((.((((((..((((.(((((...(((.(((((((((((((((((..((((((((((((.........((((((...((((((((((..((((((((......(((((((((.(((((((((((.((............((.....))............)).)))))))))))))))))..))))))))))).))))......((((((((......))))))))..........................................................)))))))))))).))))))))))))..)))))))))))....)))))).))).)))))))))...))))))((((....)))).......)))))..))))...((((((((.((......)).))))))))...)))))))..).))))).....)))))))))))).))))))(((((((((.......)))))))))..(((((((.((....)).))))))).(((((((((.(((((...((.(((.....))).)).)))))))))))))).........)))).))))))))(((((((...((((((.(((((....(((((((.(((((...(((..(((....((((............)))))))..)))....))))).)).)))))...)))))))))))...)))))))(((((((((((((.((((.((((..........)))).))))))))))))).))))....((((.(((...............))))))).((((.((((.....)))).))))..((((((...........)))))).((((((((((....))))).)))))...))))))))...((((((((((((.(((..((.((.((((((((((((.(((((...((((((((..((.(((((.((((.(((.((......((.((....)))).......)))))))))))))))).)))))))))))))..((((((.(.((((((((((.(((((.............))))).))))..((.(((((...((..(((((......)))))....))...))))).)).)))))).).))))))....(((((....((.((((..(((((.........)))))...)))))))))))............)))))))))))).)).)).))).))).........(((((........)))))....)))).))))).((((((((((...(((((((((((((((((.((.(((.....))))).)))....(.((((((((((.........)))))))))).).(((((((.((((............)))).))))))).((((((......((((((((...(((((..(((((((..(((((((((((((((((...))))))))))......))).)))).)))))))..)))))))))))))...))))))..((((((....))))))..(((((.....)))))((..(((......((((((((((......(((((.(.((.(((......))))).).))))))))))))))).......))).))))))))))))))))..((((((((((....)))))))))).....((((.....)))).......))))))))))))))))))((((.(((((...........))))).)))).......))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

....{{{{...(((,,,...|||,,,|}}|,|,{{((((((((((((((..{{((((((((.((({.(((((.((......)).))))}.............(((((((.((((....))))................(((((((....(((...)))...))))))).,,.{{{(.{{........))..}}}}...(((((((.....{(((((((((((((((...))))))))).)))))|(((............))),....(((((((.{(........,,...)))))))))))))).......(((((((((((((({(((((((((.........))))))).}),(((.(((((({....}).))))).)))))))))).)))))))).((((((......))))))...........{(((....)))}.)))))))((((((..(((....))).))))))(((((((({...}))))))))...}))}.)))))||||||.,,,,,,{{{{{((((.((((((.(.(((((....))))).))))))).))))....((({,,....,,|||,..{{{,...,{((|({(((((|(({(({(({{(({{{{{,{,|,|||...{{||{.{||,}}}|,,{||||,}}}||||,|||,.....,,,,{{{||||,|||.{{{{{........{,{,|||{|.|||||.{,||||||,.,||,}.((((((..,,,,....(((((((((...............))))))))),.,||||,.{{.{{{,{,(,.....|||||}|||}},,}.....|||....}},..))))))..|||.|||},}|||}||||,.||))),}}}},..,||.,,{{{{..{{{{,,.({{,.{({.({{{.{{||((((((......)))))),}|..}}.))}}.||,|||,.}}|..|||{{,||||{.{{{(((({.{(((({,..{{|||||||||.{{|||,.||}}}))|}}}.})))}..|||,((({.{,,||}|{....))}))|})}.)))}}}|,||||.,,((((((((.{,,,,,,|,,|||}}}}}.|}}.}}|}|...,.|||||}|}}})}}})))}.,}}}},.|{{{((|{(((((((((((.{{............{{.....,,............}}.)))))))))))))))))}||||||{{{.,,||||}}.||..((((((((......))))))))......,}}},.,,,..,,,,,,..|||||,,.....,,...,,,....,,,,.......,,|}||}}|},|||||||||||,,.,,,}}})))))}}}}}}.}}}|,}|.||||}}}}}|}.})}}}|{(((,,{{|||||.,,|,|||,|,..))),...{{{{{{{{.||,,,,,.)).)}}}}}}}..,||||,,,.|}||(((.....)))}|{{{{{{{,....,,,{(((((({..,,||||}}||{{{{{{{{{,,,{|.,,.,,,...,},}})},,{{{(((((((((((,,,({.{{(.....))).}}.))}}}|||||||||{{,...{((((....)))))..(((((((.,.(((((,,(((((.,..(((((({,(((((...(((..(((....({{{............)))))))..)))....))))}.))})))))..,))))))))))).,.)))))))(((((((((((((.((((.((((..........)))).))))))))))))).))))..{{((,{((((,,,,.......,,..}}}}}}}.((({.((((....,)))}.}))).,{{(((({,{{{,,....||}}|}.((((((((((....)))))}})))).}|.,{((((....))))}.,|.(((.(((..((.{(.((((((((((((.(((((,..((((((((..((.(((((.((((.{((,((.,....{{.{{....}))}.......)))}}))))))))))).)))))))))))))..((((((.(.((((({((((.(((((..,.,,....}..))))}.))))..((.(((((...({..((((({...,,)))))....})...))))).)).)))))).).))))))....,{{{{....,{.{{{(.,(((((......,..}))))...}}}}}}}|}},.,......,,..)))))))))))).)}.)).))).))),))}}},,,||{{{,,,,,,,}))))),,,}))))}.))))))))))))))}},.,{{{{|{{((({{{,{{,{||||||,|||||}}}|||}}|..{.((((((((((.........)))))))))).}.(((((((,{{{{............}}}|,))))))).{(((((......((((((({...(((((..(((((((..(((((((((((((((({...))))))))))......))).)))).)))))))..))))))))))))),,.)))))}..((((((....))))))..{{{{{....,)))))}},||||||.,|,||||||||||...,,||{{||,|}}|}}|,},}}}},,|||||||||}}}))))))))),.,,,,,,||||||||||}}}}}}|}|{{.,{{{{||,,,,}}))),)))))}.{|.,||||||,..,,,,..,,.,,,,,,,)}}})))})),|(((((.(((((,,....,,...))))).))))),....,))},,.