Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_181457.4
Sequence Length
2034 nt
GC Content
0.5728
GCACUCGGUGUCACCACAGGAGGAGACUCAGGCAGGCCGCGCUCCAGCCUCACCAGGCUCCCCGGCUCGCCGUGGCUCUCUGAGCCCCCUUUUCAGGGACCCCAGUCGCUGGAACAUUUGCCCAGACUCGUACCAAACUUUUCCGCCCUGGGCUCGGGAUCCUGGACUCCGGGGCCUCCCCGUCCUCCCCUUUCCCGGGUUCCAGCUCCGGCCUCUGGACUAGGAACCGACAGCCCCCCUCCCCGCGUCCCUCCCUCUCUCUCCAGCCGUUUUGGGGAGGGGCUCUCCACGCUCCGGAUAGUUCCCGAGGGUCAUCCGCGCCGCACUCGCCUUUCCGUUUCGCCUUCACCUGGAUAUAAUUUCCGAGCGAAGCUGCCCCCAGGAUGACCACGCUGGCCGGCGCUGUGCCCAGGAUGAUGCGGCCGGGCCCGGGGCAGAACUACCCGCGUAGCGGGUUCCCGCUGGAAGUGUCCACUCCCCUCGGCCAGGGCCGCGUCAACCAGCUCGGCGGUGUUUUUAUCAACGGCAGGCCGCUGCCCAACCACAUCCGCCACAAGAUCGUGGAGAUGGCCCACCACGGCAUCCGGCCCUGCGUCAUCUCGCGCCAGCUGCGCGUGUCCCACGGCUGCGUCUCCAAGAUCCUGUGCAGGUACCAGGAGACUGGCUCCAUACGUCCUGGUGCCAUCGGCGGCAGCAAGCCCAAGCAGGUGACAACGCCUGACGUGGAGAAGAAAAUUGAGGAAUACAAAAGAGAGAACCCGGGCAUGUUCAGCUGGGAAAUCCGAGACAAAUUACUCAAGGACGCGGUCUGUGAUCGAAACACCGUGCCGUCAGUGAGUUCCAUCAGCCGCAUCCUGAGAAGUAAAUUCGGGAAAGGUGAAGAGGAGGAGGCCGACUUGGAGAGGAAGGAGGCAGAGGAAAGCGAGAAGAAGGCCAAACACAGCAUCGACGGCAUCCUGAGCGAGCGAGCCUCAGCACCCCAAUCAGAUGAAGGCUCUGAUAUUGACUCUGAACCAGAUUUACCACUAAAGAGGAAACAGCGCAGAAGCCGAACCACCUUCACAGCAGAACAGCUGGAGGAACUGGAGCGUGCUUUUGAGAGAACUCAUUACCCUGACAUUUAUACUAGGGAGGAACUGGCCCAGAGGGCGAAGCUCACCGAGGCCCGAGUACAGGUCUGGUUUAGCAACCGCCGUGCAAGAUGGAGGAAGCAAGCUGGGGCCAAUCAACUGAUGGCUUUCAACCAUCUCAUUCCCGGGGGGUUCCCUCCCACUGCCAUGCCGACCUUGCCAACGUACCAGCUGUCGGAGACCUCUUACCAGCCCACAUCUAUUCCACAAGCUGUGUCAGAUCCCAGCAGCACCGUUCACAGACCUCAACCGCUUCCUCCAAGCACUGUACACCAAAGCACGAUUCCUUCCAACCCAGACAGCAGCUCUGCCUACUGCCUCCCCAGCACCAGGCAUGGAUUUUCCAGCUAUACAGACAGCUUUGUGCCUCCGUCGGGGCCCUCCAACCCCAUGAACCCCACCAUUGGCAAUGGCCUCUCACCUCAGGUAAUGGGACUCCUGACCAACCACGGUGGGGUACCUCAUCAGCCCCAGACUGAUUACGCGCUCUCCCCUCUCACCGGGGGUCUGGAACCUACCACCACGGUGUCGGCCAGCUGCAGUCAGAGACUAGACCAUAUGAAGAGCUUGGACAGUCUGCCAACAUCUCAGUCCUACUGUCCACCCACCUAUAGCACCACAGGCUACAGUAUGGACCCUGUCACAGGCUACCAAUAUGGGCAGUAUGGACAAAGUAAGCCUUGGACUUUUUAGGGGGCAAUUUCUCCUGGAAGGGAGAUAAACUCAACUCUUCCUUAAGAAAGGUGAAUUAGAGGCAAGAUUAAGCCACACAUGCCGGUAUCAAUUUUUUUUUUUUUUUGCAAAGCCAGCUGACUGUUCCAGCAGGGGCUUCCUUGUGUAAUUAUUUUCUUAACUGAUGUCAACAACAUCUUGCGGUUAUUAAUUGUUGAGACGUGAAACCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-720.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -758.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 489.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((.((((((((((.((((.....(((.(((((.(....(((((....)))))..)))))).)))..(((((...)))))((((....)))).((((....(((((((((.(((((((((((.((.((((.((((((.(((...))).(((((....(((...(((((...)))))...)))....)))))((((((((.(((((...))))))).))))))((.((((((..((((((((....................)))...))))))))))).))....(((.(((....))).)))((((((((.....(((...........(((((((..((....(((.......))))))))))))))).....))))))))..((((((((((((((((....((.((((((((((.((((.((((.((....((((((...))))))......((((....))))))))))..))))..)))))))))).))(((.((((((((((((.(((....(((((((((..((........(((((((((.((((.(((((((((((......)))...(((((.((.(.((...(((((.....))))))).).)).))))))))))))).)))).))))..((((((((((...((....))....))))))))))...(((........)))....((((((....))))))..)))))........(((((..((......(.((...(((((..........)))))...))).......))..)))))))..)))))))))))).))))))))))...(((((.(((((((((..(((...(((((((.......))))))).((((((.((((.((((((....((((.((((.((.((((((((....((.....(((((.........((.(((.(((....)))..)))))((((((((..............)).)))))).........(((((..((((.(((.........(((.......(.(((((((((..(((.((((.((((......))))))))...)))..)).))))))).)....)))....(((((..........)))))..)))))))..)))))((((..(((.(((.(((((........))))))))..)))...))))((((....((((((((((..((((((((((.((....))))))...................((((((...)))))).........(((((...((..........)).))))).....(((.((((((.................)))).)).))).))))))......(((....))).......)))))))))).))))(((........))).....)))))...........))..)))))))).)).)))).)))).....(((.((((...)))))))..(((((....)))))))))))...((((........))))..........(((((...)))))))))))))))..))).))))))))))))))......(((((((((.........)))))..))))....)).)))..(((((......)))))..(((......))).))))))))))))))))...((((...)))).........)))))).))))))))))))...........(((((((((((((........((((...(((((...((...))...))))).....))))......))))))))).))))........(((((((...)))))))))))).(((.(((..((((((((..........)))))))).....))).))).....(((........)))...((.((.(((..(((.............)))....))).))))..))))))))).)))))))))))))).........((((((((((((.(..(((....)))..).)))))...))))))).)))).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((.(((({((((((((({.....(((.(((((.(....(((((....)))))..,))))).)))..(((((...)))))((((....}))).((((....(((((((({...((((((.,..{,...,....,,,,.|..}))))).(((((....(((...(((((...)))))...)))....)))))((((((((.(((((...))))))).)))))){{.((({(({{((((((((.,................,.})}...))))))))))}.}}.,,.(((.(((....))).))){||{{{{{,.{..{{,.{{{{{{{{{.(((((((.,,.....(((.......))))})))))))|||{{{{.||||||||..((((((((((((((((....((.((((((((((.((((.((((.((....((((((...)))))}..,.,,||{{....}}},))}))),.))))..)))))))))).)).{{.{(((((((((((.(((....(((((((((..((...,,.,.,{{((((((.((((.(((((((((((...,,,|||,..{((({.{(,(.,,...|||||,.,.,))})))).,.}}.))))})))))))).)))).))))..((((((((((...((....}}..,.))))))))))...{{{,,......)))...,((((((....)))))).})))),........{((((..{{......,.((...(((((,{.......})))))...))}.......}}..))))}))..)))))))))))).))))))))}}}},|{{{(,({(((((({..(((.,.(((((({.......})))))).{((((,,((((.((((((((.,,(((.((((.{(.((((((((....((.....(({((.........{{.{{{..((,...{{{{{|,,,,{,||||||}.....,.,{{,|{}}..}}}))}},,.....(((((..((((.,{,.,,......{{|.......,.(((((((((..(((.((((.((((......))))))))...)))..)).))))))).|....)))....(((((..........))))).}}}.))))..)))))((((..(((.(((.(((((........))))))))..)))...))))((((....((((((((((..{.(((((,,........(((((.......)))))........((((((...))))))...,,...,|,,....,{,.,,,|.....(((((.((.({..(((.((((((.................)))).)).))))))).)))))..,}}}....}.)}}}}...)))))))))).))))|||........)}},,...)))))...........}}..)))))))).)).)))).)))}....,(((.((({...}))||||....,,..,}})}}))))))}}||,((((........}}}},||.,{{{{{((,{{||.,}}||}}}}}}}}}}..))).})))))))))))}),,.....||||||||.....,,,,|}}}},,.))),...}).)),}}|||||},,,,,))))),.|||,,,.,,)},.)))))))))))))))).,.,|||...||||.|.|,,...|,,||}.|))),}}}}})}||||...||..(((((((((((((.....,,.((((...,,,{|}}}.}}..|}|..||||,..}}}),},......))))))))).))))..||......,}}}.},,},,,))))))}...{|,|||||((((({({..........))))))},..}}})))})}......(((........}}}...,..||.|||..,{|.............,}}....})}.))}}..))))))))).)))))))))))})).........(((((((,((({.,,,(,,{,...))..),)}}}}...))))))).)))).))).,.
Back