Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_181697.3

Sequence Length

945 nt

GC Content

0.4624

GCGUCUUGUUCUUGCCUGGUGUCGGUGGUUAGUUUCUGCGACUUGUGUUGGGACUGCUGAUAGGAAGAUGUCUUCAGGAAAUGCUAAAAUUGGGCACCCUGCCCCCAACUUCAAAGCCACAGCUGUUAUGCCAGAUGGUCAGUUUAAAGAUAUCAGCCUGUCUGACUACAAAGGAAAAUAUGUUGUGUUCUUCUUUUACCCUCUUGACUUCACCUUUGUGUGCCCCACGGAGAUCAUUGCUUUCAGUGAUAGGGCAGAAGAAUUUAAGAAACUCAACUGCCAAGUGAUUGGUGCUUCUGUGGAUUCUCACUUCUGUCAUCUAGCAUGGGUCAAUACACCUAAGAAACAAGGAGGACUGGGACCCAUGAACAUUCCUUUGGUAUCAGACCCGAAGCGCACCAUUGCUCAGGAUUAUGGGGUCUUAAAGGCUGAUGAAGGCAUCUCGUUCAGGGGCCUUUUUAUCAUUGAUGAUAAGGGUAUUCUUCGGCAGAUCACUGUAAAUGACCUCCCUGUUGGCCGCUCUGUGGAUGAGACUUUGAGACUAGUUCAGGCCUUCCAGUUCACUGACAAACAUGGGGAAGUGUGCCCAGCUGGCUGGAAACCUGGCAGUGAUACCAUCAAGCCUGAUGUCCAAAAGAGCAAAGAAUAUUUCUCCAAGCAGAAGUGAGCGCUGGGCUGUUUUAGUGCCAGGCUGCGGUGGGCAGCCAUGAGAACAAAACCUCUUCUGUAUUUUUUUUUUCCAUUAGUAAAACACAAGACUUCAGAUUCAGCCGAAUUGUGGUGUCUUACAAGGCAGGCCUUUCCUACAGGGGGUGGAGAGACCAGCCUUUCUUCCUUUGGUAGGAAUGGCCUGAGUUGGCGUUGUGGGCAGGCUACUGGUUUGUAUGAUGUAUUAGUAGAGCAACCCAUUAAUCUUUUGUAGUUUGUAUUAAACUUGAACUGAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-291.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -309.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 264.03

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((.((....((..(.(((.(((.((((((.(((.((((....)))))))..))))))..((((.((....((((...((((.......)))).))))....)).))))...)))))).).))...)).))))).((((((((((((((......)))))((((((((((((....(((...((((((.((..(((..((((...(((((....(((.(((.((.((((.(((((.....(((((((..(.(.(((((((((((((..((((....((.((((((.(((((....((((....)))).............((((((((....(.(((........))).)......)))))))).......((((((........)))))).)))))))))))..))....)))).))))))(((((..((((.(.....).))))..)))))((((((((....))))))))..)))))))).)..)))))))..))))).)))).))..))))))...))))).)))).....((((((((...(((((((((...(.(((((.....(((((((((((.....(((...((((.....(((..((((...)))).))).....))))....))).....))))))))))).(((((((.(.(((((((......)))))))((((((((.....)))))).))..........).)))))))..........................(((((.((((((((....))))).))).)))))......((((((.(((((((.(((((.((((((......)))))).))))).))))))).)))))).))))).)...)))).))))))))))))).......)))..)).))))))...)))...))))))))))))..........)))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

...((((((((..({{,{,,,.||}|{(,{((((((.{((,,...,)),))))))))}((((((..((((((((.,{{...,,,,......(((({...}))))...........{||,.,{(((....{{{.,.}))}}}}}}..})))))))..)))))).((((((((((((....(((...((((((.((..(((..((.,.{{...(((...((.((((((((((,((((((((....}}||}||..(((((,{((,{{{.,,||.,||..}}|||,{{{,.}}}}||{|,,,{||||..,|{{{{{{{{|...{{,,(,((((({....{.(((,.......|||.|{{{{{{||,||,||{{{....((((((........)))))).{,,,,,,}}}|,.,}....}}}(((((((((((((......))).((((((((((.((((...,(((({....))))){(((...((....((((....))))....))...))))...)))).),...})))))))))))))))))}.|}}||||..|}}}}||||.||......,.||||,,,||||,},}}|||}}.((((...,.(((..(({,..,))}}.))).,...))))...|||},,,..,,,))))))},.}}}}})))))|((((({|,...,)))))))|,((((((.....))))))..{((........}))}},}},..........,}},,.}},,.,,,,,(((((.{(({((((....))))).))).))))).(((..((((((.(((((((.{((((.((((((......)))))).))))}.))))))).))))))..))).}.}})}))))).))....)))..})..)).)))..)).))))))...)))...)))))))))))).,,......,..)))).)))}