Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_181755.3
Sequence Length
1420 nt
GC Content
0.4310
AGAGAUGAAACAGAAGGAAAGGCAGAGGAGGAGGGAGAGAGAGAGAAGAGAAGAAAAAGAAAAAAGAACAUCAAUAAAAAGAAGUCAGAUUUGUUCGAAAUCUUGAGGAGUCUUCAGGCCAGCUCCCUGUCGGAUGGCUUUUAUGAAAAAAUAUCUCCUCCCCAUUCUGGGGCUCUUCAUGGCCUACUACUACUAUUCUGCAAACGAGGAAUUCAGACCAGAGAUGCUCCAAGGAAAGAAAGUGAUUGUCACAGGGGCCAGCAAAGGGAUCGGAAGAGAGAUGGCUUAUCAUCUGGCGAAGAUGGGAGCCCAUGUGGUGGUGACAGCGAGGUCAAAAGAAACUCUACAGAAGGUGGUAUCCCACUGCCUGGAGCUUGGAGCAGCCUCAGCACACUACAUUGCUGGCACCAUGGAAGACAUGACCUUCGCAGAGCAAUUUGUUGCCCAAGCAGGAAAGCUCAUGGGAGGACUAGACAUGCUCAUUCUCAACCACAUCACCAACACUUCUUUGAAUCUUUUUCAUGAUGAUAUUCACCAUGUGCGCAAAAGCAUGGAAGUCAACUUCCUCAGUUACGUGGUCCUGACUGUAGCUGCCUUGCCCAUGCUGAAGCAGAGCAAUGGAAGCAUUGUUGUCGUCUCCUCUCUGGCUGGGAAAGUGGCUUAUCCAAUGGUUGCUGCCUAUUCUGCAAGCAAGUUUGCUUUGGAUGGGUUCUUCUCCUCCAUCAGAAAGGAAUAUUCAGUGUCCAGGGUCAAUGUAUCAAUCACUCUCUGUGUUCUUGGCCUCAUAGACACAGAAACAGCCAUGAAGGCAGUUUCUGGGAUAGUCCAUAUGCAAGCAGCUCCAAAGGAGGAAUGUGCCCUGGAGAUCAUCAAAGGGGGAGCUCUGCGCCAAGAAGAAGUGUAUUAUGACAGCUCACUCUGGACCACUCUUCUGAUCAGAAAUCCAUGCAGGAAGAUCCUGGAAUUUCUCUACUCAACGAGCUAUAAUAUGGACAGAUUCAUAAACAAGUAGGAACUCCCUGAGGGCUGGGCAUGCUGAGGGAUUUUGGGACUGUUCUGUCUCAUGUUUAUCUGAGCUCUUAUCUAUGAAGACAUCUUCCCAGAGUGUCCCCAGAGACAUGCAAGUCAUGGGUCACACCUGACAAAUGGAAGGAGUUCCUCUAACAUUUGCAAAAUGGAAAUGUAAUAAUAAUGAAUGUCAUGCACCGCUGCAGCCAGCAGUUGUAAAAUUGUUAGUAAACAUAGGUAUAAUUACCAGAUAGUUAUAUUAAAUUUAUAUCUUAUAUAUAAUAAUAUGUGAUGAUUAAUACAAUAUUAAUUAUAAUAAAGGUCACAUAAACUUUAUAAAUUCAUAACUGGUAGCUAUAACUUGAGCUUAUUCAGGAUGGUUUCUUUAAAACCAUAAACUGUACAAAUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-409.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -434.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 440.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((........(((((((((..(((((.((((..(((((.......((((.....(((((.....................)))))....))))......)))))((((((..(((.....))))))))).............)))))))))..)))).(((((......)))))...........)))))....(((((((((...(((((((((((.((.(((((((..((((...))))...(.(((((.....(((((((((((..((((..((((((((((.(((((((((((....((((((((((.....(((.((....))..)))..(((..(((((....)))))..)))(((....((((((((..((((........)))))))..((((.....))))..((((.((((((..(((.((((....)))).))))))).)).))))........)))))...))).....))))))).))))))))....)))))).))).)))))))....))))((((......))))(((((....))))).(((((((((.......)).)))))))..........(((((((((.(((((((....))))))).).)).((((.(((((..(((((((.(((((((((((.(((((((((.......)).)))).....))))))))))))))))).))))...))))).))))...))))))(((((((((...(((...(((((((.(((....(((((((..........(((((((.(((.....))).)))))))(((...)))....(((.(.((((((..............((((.((.....))..)))))))))))))))))))))))))))).)))...)))....)))))))))..)))))))))))((((((...(.(((((...))))).)))))))...((((..(((((((..((((((....)))))).....))))...)))..)))).))))).)..(((.(((.....((((((......))))))......))).))))))).))).)).)).))))))..(((.((((.((((..(((......))).))))..))))))).....)))...)))))))))..((((((.((...)).)))))).......((((((....((((..(((((.....)))))))))....((((....))))..((((....))))(((((...............)))))(((((((....)))))))((((((((((...)))))))))).((((((..........))))))..))))))..((((.((((........))))...)))).(((((((.....)))))))...))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........((((...,..,{(({({((((,,((((({({((,.(((((.......((((.....(((((,,...............,,..)))))....))))......))))){(((((..(((.....))))))))}.,.,.......,.)))))))|||.}}}},||||||}},.,||}}|.,,....{{,{|||||,,,.(((((((((...(((((((((((,((.(({{(((.,((((,,,,}||,..({(({{{,,{{{((({{((((({.,{{((({(,((((((,,.,,||||}||||}}..{(((((((((...,,(((,((....},..}}}..(((..(((((....)))))..))){{(..{,{{(({({{.{((((........)))))))..((((.....)))).|((((.{{((((..(((.((((....)))).))})))).))}))))........)))))...))).....)))))))}.)}}}}))))..})))))})}|,|||||,,.,}|,|||((((......))},(((((....))))).(((((({{,,,...,,})})}}}))}|,|{{{,{{{(({{,,|||.{||{{((,...))))))},},}}.((((.(((((.,(((({((.(((((((((((.({(((((((.......)),}))),....,},)))))))))))))).)))},,,))))).))))....,}}}}||{{{||||,..|||..,|||||||.{{{.,.{({{(({{..,,..,,,.(((((((.(((.....))).)))))))(((,.,|||,,,,{{,.{.((((({...,,{,,,,,...((((.((.....))..))))|||}}||||}}}}}|||||}}|||.,}}..,|}}....}}))))))})})))))))),,)|||,,|}}.{.(((((...))))).}))))))},.,,,...|||||,,.,||||||}..,)))}},.....})}}|||}}|}}),,,,))))}.}..(((.((({{...((((((......)))))).,.,,.})).))))))).))).)).)).))))))..(((.((((.((((..(((......))).))))..))))))).....)))...)))))))))..{{{|||,||.,,)),}}}})}.......{({{,,.}},|(((..{{{||.,,.,}|||||}}..,,,||||.,,.,}},..((((....)))),{{{{,,|{|,,......,,}}}}}{((((((....})))))}((((((((((...)))))))))}.{(((((..........))))))...,,,}}..||||}||||,...,{{{|},,..,))))}(((((((.....)))))))...))))..........
Back