Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_181786.4
Sequence Length
2950 nt
GC Content
0.5024
ACUUCCGGUCGGUGGCCCAGGCGCGUUAAGCUGGUUGGGACCCGGGAAGGCCUCCCUCUUAAGGUCUUUCCCACACCUCUGCACCUUGUUACCUGACUUUCGGCUUCAGGAUCCGCAGCGUGCACCCGCGUUCCAUCUGUCUUCUGAGACUUUGCCCUUCUCCAGGAAGAGCACUCAGGAGACCAGGAAAAUGGCCACAGGGCUCCUGAGAGCCAAAAAAGAGCUGGCAAGCAGAUGAAUUAACUCCCCCAAGCUUCUAGCUGUGUUUCUACUCAGUGGGAGAGAUUUGGAGUGAAUCAUGAGGGUCAACCACACAGUGUCUACAAUGCUCCCUACAUGCAUGGUUCACAGACAAACCAUGAGUUGUUCCGGGGCUGGAGGAAUAACGGCGUUCGUGGCAUUCAGGGAUGUGGCUGUGUACUUCACCCAGGAGGAGUGGAGGUUGUUGAGCCCUGCUCAGAGGACCCUGCACAGGGAGGUGAUGCUGGAGACUUAUAACCAUCUGGUCUCACUGGAAAUUCCAUCUUCUAAACCAAAACUCAUUGCUCAGCUGGAGCGAGGGGAAGCGCCCUGGAGAGAGGAGAGAAAAUGUCCACUGGACCUCUGUCCAGAAUCGAAGCCAGAAAUUCAACUUAGUCCCUCCUGCCCUCUGAUUUUCUCCAGUCAGCAAGCUCUCAGCCAACAUGUGUGGCUGAGUCAUCUCUCUCAGCUGUUUUCAAGUUUAUGGGCAGGAAAUCCUCUCCACCUGGGAAAACACUAUCCAGAAGAUCAGAAACAACAGCAGGAUCCAUUCUGCUUUAGUGGCAAAGCAGAAUGGAUUCAAGAGGGAGAAGACUCCAGACUCCUGUUUGGGAGAGUAAGCAAAAAUGGCACUUCAAAGGCACUUUCCAGCCCACCUGAAGAACAACAGCCAGCACAGUCCAAGGAAGACAACACAGUGGUGGAUAUAGGGUCCAGCCCUGAACGGAGGGCAGAUCUAGAGGAAACAGACAAAGUAUUGCAUGGUUUAGAAGUCUCAGGAUUUGGAGAAAUCAAAUAUGAAGAGUUUGGGCCAGGCUUUAUCAAGGAGUCAAACCUCCUUAGCCUCCAGAAGACACAAACUGGGGAGACACCUUACAUGUACACUGAGUGGGGAGACAGCUUUGGCAGUAUGUCAGUCCUCAUCAAAAACCCAAGGACACACUCUGGGGGAAAGCCUUAUGUGUGCAGGGAAUGUGGGCGAGGCUUUACGUGGAAGUCAAACCUGAUCACACAUCAGAGGACACACUCAGGGGAGAAACCUUAUGUGUGCAAGGAUUGUGGACGAGGCUUUACUUGGAAGUCGAACCUCUUUACACAUCAGCGGACACACUCAGGGCUCAAGCCUUAUGUGUGCAAGGAAUGUGGGCAGAGCUUUAGCCUGAAGUCAAACCUCAUUACCCACCAGAGGGCGCACACUGGGGAGAAGCCUUAUGUUUGCAGGGAAUGUGGGCGUGGCUUUCGCCAGCAUUCACACCUGGUCAGACACAAGAGGACACAUUCAGGAGAGAAGCCUUACAUUUGCAGGGAGUGUGAGCAAGGCUUUAGCCAGAAGUCACACCUCAUCAGACACUUAAGGACACACACAGGAGAGAAGCCUUAUGUAUGCACAGAAUGUGGGCGUCACUUUAGCUGGAAAUCAAACCUCAAAACACACCAGAGGACACACUCAGGGGUUAAACCUUAUGUCUGCCUGGAGUGCGGGCAGUGCUUUAGCCUGAAGUCAAACCUUAACAAACACCAGAGGUCACACACGGGGGAGAAGCCAUUUGUAUGUACGGAGUGUGGGCGAGGCUUUACCCGGAAAUCAACCCUGAGCACGCACCAGAGGACACACUCAGGGGAGAAGCCAUUUGUAUGUGCUGAGUGUGGACGAGGCUUUAAUGAUAAGUCCACCCUCAUUUCACACCAGAGGACACAUUCAGGGGAAAAGCCUUUUAUGUGCAGGGAGUGUGGCAGAAGGUUUCGGCAGAAGCCUAACCUGUUUAGGCACAAGAGGGCACACUCAGGUGCCUUUGUGUGCAGGGAGUGUGGGCAAGGCUUUUGUGCUAAGUUAACUCUCAUUAAACACCAGAGAGCACACGCAGGGGGGAAGCCUCAUGUGUGCAGGGAGUGUGGGCAAGGCUUUAGCCGGCAGUCACACCUCAUUAGACACCAGAGGACACAUUCAGGAGAGAAGCCUUAUAUUUGCAGAAAGUGUGGACGGGGCUUUAGUCGGAAGUCCAACCUUAUCAGACAUCAGAGGACACACUCAGGAUAGAAACUUUAUGUGUAUAGGGAAUGUGGUACAGCCUUUAGCCAGGAGUCAUACUUCAUCAGACACCAGAGGACACACACAGUGCUGUGGCUUUUUCAGCCAUUGCUAGAUACCAAAGUGGAGACAUUCUGUGUGUGAUUAUGCAUGAGACUGUACUGGUAAGACUUGUAUCUCCAUCCACCUGAAGGAGAAUUGCUGGCUCAUUUUCAGGAGCCCUGCCCUUCCUCACUGUGGAUGGUGGGUUGUGGAAACCCGGUCAGGUAAUGAUAGUGGCAGGAGGCAGUCAAAUGCCCAGGCAGAUAGGGGUGGGUACCUGGUGAAACCCAACCUUAAAGCUGAAGACAGUCCCGGCUAAAUCCUCAUACUGAAUUGAGAACCUGUCUUCCCAUUUGGUGUGCUUUCCUCCGAUUGAUCCCAACCCUUCACCUAUUUUACGUAUACCUGCCCUUUCCUAAUUGGUUUUUACACUGCUGUGCCCACCUUUUGAGUGGUGCCUUUGCAUACUUACAAAUCAGUCAACGUGUAUUCCCCUAUUCUGAGCCCAUAAAAGACCCAGACUCAGCUGCAGUGAGGAGAGAAAUCACCCUGCUGUGGGGGUUGGGGACCACUCCCUGCAUCCCCUCUCCACUGAGAGCUGUUCUUUUGCUCAAUAAAAUUCUUUUCUACCCAUCCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1017.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1066.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 616.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((.((((((((((.(((.....)).).)))))..((((((((((((((((.....(((.((((((..(((((((....((((((..(((((((.((((((....(((.(((.((((.((((((((((....((((((((((....(((.(((((...))))).)))))))))))))(((((.....(((....))))))))...((((.........))))..(((.((((.....((((((..((.....((((((.(((((((((((((.....(((((.....))))).((((((((..((.((..((((((......((((((...((((.(((((....((((........))))(((.(((.(((((..(((.(.((((((.((.....)).)))))).).)))...)))))))).))).((((((.((((....))))))))))...))))).)))).))))))((((.((((((............)))))).))))((((...)))).(((((((((((...(((.((((((.....)))))))))........(((((.(((((..........(((...)))))))).)))))....(((........))).((((.(((((((((((((((((.......(((....((..(((((((((((.......))))).((((.((((((((.(((((((((..((((.((((.(((....))).)))).((((...........)))).))))..)))..)))))).((((((((((((((((......))))))))))))))))..)))))))).))))((((((....))))))))))))..)).....)))..(((((..(((........)))....)))))........(((.(((.((....(.....)...)).))).)))...((((((...))))))..)))))))))).....)))).....))).))))......)))))))))))((((........))))..(((....)))....(((((...(((((.....((((((......))))))))))))))))))))))....))))..))).)))))......))))))))))))).)))))).(((((...)))))((((((........((((((......)).))))(..(((((((..((.((((.....)))).)))))))))..)(((...((((....))))..)))....))))))...))..)))))).....)))).)))((...(((((((((.((((.((.(((....))).)).)))))))))).))).))...(((((..(((((....)))))..)))))...))))))))))(((.((....)))))........((((...........))))..)))).))).)))))))))...((((((((((((((((.((((.......)))).))))))...))))..))))))...((((.....((((((((.((.((((.((((((((((((.((((((....(((....))).....))))))))).......((.(((((.....(......).....))))).)).))))...))))))))).)).)))...))))).......))))........((.(((......))).))(((((((......(((((((((.....))))))).))))))))).))))))).....))))))....))))))).........)))))).))).(((((....)))))....))).)))))))).)))))..........((((((......(((((((((.(((((.(((((((((((....))).)))(((.((((((....(......)....)))))).)))....((((((....(.(((((..((((......))))..))))))...).)))))((((.(((((((....)))))))...))))..((((((..(((......)))..))))))....(((((((((((((((((..((((((((.((((((....(((((...........)))))..((((((.((((....)))).))))))..(((.((((((((..(((....))).))..))))))))).............((((...(((..((..((((((((...((((((.....)))))).))))))))..)).)))))))..((((((.(.((((.((((...................)))))))).))))))).....(((...)))))))))))))))))........(((((....((.((((((((((((.((.((((((.....)))))).))..........((((....)))))))))))))...(((((((.(((((.....(((((......((((((((((((.(((.((((....((.(((((........)))))..))..)))))))..)))))))).))))((((((((((.((.((((((((((((((((.((((((((.(((((((...((((((.(((((.(((((..(....)..))))).))))).(((((..........))))).....((((........))))...))))))...)))))))..))).))))))))..(((..........))).))))....))).)))))).))..........)))))))))).(((...(((((((....).)))).))....)))..)))))....)))))..)))))))))).))..)))))))))).......((((..(((.((.((((.(..((......))..))))).)).)))..))))...))))))))))))....))))).))))).).)))))))))))))).............))))).)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(({.((((({,,{({{((.....)},|{||||,..((((((((((((((((,....(((,((((((.,(((((((....((((((..(((((({.((((((....(((.(((.((((.((((((((((..,,((((((((((....(((.(((((...))))).))))))))))))){||{,...,,(((.,.,||}})))).}.|||{.......,,|}}}..||,,{{{......,((((({,.({,...((((((.(((((((((((((.....(((((.....))))).((((((((..((.,,..((((((......((((((...{,(({((((,.....,.|}}}}}}..}|,{(((.(((.(((((..(((.(.((((((.((,...,)).)))))).).)))...)))))))).)))},|((({,((((.{{((((,..))))},.,)))),)})),))))))((((.((((((,...........)))))).))))((((...)))).(((((((((((...{{{.((((((.....))))))|||,.....,,(((((.(((((..........{{{.,,}}}))))).)))))....{{{........}}}.((((.(((((((((((((((((.......,,{,,,,((..(((((((((({.{....})))))|((((.((((((((.(((((((((..((({.((((.(((....))).}))}.(((({,......,.))))).})}}..))),.}))))).((((((((((((((((......))))))))))))))))..)))))))).))))((((((....))))))))))))..)).....))),.(((((..(((........)))....)))))........(((.(((.((....,.....}...,}.))).)))...,(((((...))))))..)))))))))).....)))).....))).))))......))))))))))){((({..{((({|,,...}}}}}}.}},,}}.(((((...{((((.....((((((......)))))))))))))))}))))))....})))..))).)))))......))))))))))))).)))))).,|||,...|||},(((((,........,,,.}|}}}...,,.)))))}|(((((({.,((.((((.....)))).)))))))))}.,{{{...{{{{...,))}},.))),,,.)}}}}|{{{{..{|||,,,...}})),,})))||...{{{((((((.((((.((.(((....))).)).)))))))))),))).}}.,.(((((..(((((....)))))..)))))}..))))))))))(((.((....)))))........{{{{....,,,....}})),.)))).))).)))))))))...((((((((((((((((.((((.......)))).))))))...))))..))))))...((((.....(((((,(({(,.((({{((((((((((((.((((((....(((....))).....))))))))).......({.(((((.....,......,.....))))).)).)))}..,))))))))).},.))),..))))).......))))........((.({(,.....}}}.||({{,,,,}},,.,||{{{{|||..,.,)))))}}.,}}}}}))),))))))).....))))))....))))))).......}})))))).))).{((((....)))))..,.))).)))))))).)))))...}}}}}}.{(((((......(((((((((.(((((.(((((.{((,({{{..||{|,((((.((((((....(......)....)))))).))))...}}}}.}})})}.|{{{{..((((,.....}}}}..}}}||(((((((((,{((((.(((((((....)))))))...)))),...(((((.((((((((......)))))))).))))),,{{,,(((((((.,(((({{((,((((,{,...(((((...........)))))..(((({{,((({....)))).))))))..(((.((((((((..(((....))).))..)))))))))............,((((...(((..((..((((((((...((((({....,))))}}.})))))))..)).)))))))..((((((.{.((((.,(((......}}}.,,.......}}},}))).))))))),,}.}|||}}}}}}}},}}}}}|||||}..,,,,,.(((((....((.(({(((((((((.((.((((((.....)))))).)).......,..,{{|....)}},)))))))))...(((((((.(((((.....(((((......{,{,((((((((.((,{((((....((.(((((........)))))..))..)))))))..)))))))).}|||(((((((({{,((.(((((({{({{((,((.((((((((.(((((((...{((,((,(((((,(((((..{....}..))))},)),,,.(((((..,.......))))).....((((........))))..,)))))).},)))))))..)))}}}))}))}..{{....},..,..}}..}}}}....,}}.))))))})}...,,.....)))))))))}.{{{.|.(((((((....).)))).))....)))..)))))....)))))..)))))))))).))..))))))))))}}.....((({{{(((.,({(((({{.((.{{....)).})})))}))}))))))})),..)))))))))))),}}}))))).))))).).)))))))))))))}.............))))).}}),...
Back