Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_181900.3
Sequence Length
4887 nt
GC Content
0.4909
AUAACACCCGCGACCCCGCAGCUAAGCGCAGCUCCCGACGCAAUGGACCCGGCGCUGGCAGCCCAGAUGAGCGAGGCUGUGGCCGAGAAGAUGCUCCAGUACCGGCGGGACACAGCAGGCUGGAAGAUUUGCCGGGAAGGCAAUGGAGUUUCAGUUUCCUGGAGGCCAUCUGUGGAGUUUCCAGGGAACCUGUACCGAGGAGAAGGCAUUGUAUAUGGGACACUAGAGGAGGUGUGGGACUGUGUGAAGCCAGCUGUUGGAGGCCUACGAGUGAAGUGGGAUGAGAAUGUGACCGGUUUUGAAAUUAUCCAAAGCAUCACUGACACCCUGUGUGUAAGCAGAACCUCCACUCCCUCCGCUGCCAUGAAGCUCAUUUCUCCCAGAGAUUUUGUGGACUUGGUGCUAGUCAAGAGAUAUGAGGAUGGGACCAUCAGUUCCAACGCCACCCAUGUGGAGCAUCCGUUAUGUCCCCCGAAGCCAGGUUUUGUGAGAGGAUUUAACCAUCCUUGUGGUUGCUUCUGUGAACCUCUUCCAGGGGAACCCACCAAGACCAACCUGGUCACAUUCUUCCAUACCGACCUCAGCGGUUACCUCCCACAGAACGUGGUGGACUCCUUCUUCCCCCGCAGCAUGACCCGGUUUUAUGCCAACCUUCAGAAAGCAGUGAAGCAAUUCCAUGAGUAAUGCUAUCGUUACUUCUUGGCAAAGAACUCCCGUGACUCAUCGAGGAGCUCCAGCUGUUGGGACACCAAGGAGCCUGGGAGCACGCAGAGGCCUGUGUUCACUCUUUGGAACAAGCUGAUGGACUGCGCAUCUCUGAGAAUGCCAACCAGAGGCGGCAGCCCACCCUUCCUGCCUCCUGCCCCACUCAGGGUUGGCGUGUGAUGAGCCAUUCAUGUGUUCCAAACUCCAUCUGCCUGUUACCCAAACACGCCUCUCCUGGCAGGGUAGACCCAGGCCUCUAACCAUCUGACAGAGACUCGGCCUGGACACCAUGCGAUGCACUCUGGCACCAAGGCUUUAUGUGCCCAUCACUCUCAGAGACCACGUUUCCCUGACUGUCAUAGAGAAUCAUCAUCGCCACUGAAAACCAGGCCCUGUUGCCUUUUAAGCAUGUACCGCUCCCUCAGUCCUGUGCUGCAGCCCCCCAAAUAUAUUUUUCUGAUAUAGACCUUGUAUAUGGCUUUAAUGCCGCAAAAUAUUUAUUUUUCCUUAAAAAAGGUGUCAACUUGGAAAUAAUGGUUUAAAAACAGGAUAAGCAUUAAGGAAAAACACUUUCAAUGUGUCUUCCAUUUGAUGAAUUUGUUUUUCUCUCUUUAUCCCCGCAAGGUGGAGUUUCAUGUCCUCGGUGAAACCAGACAGUGUGAAUCUGUUCCAGCCCAAAUCUGCAGCAUUAGGGAUGAGUUCUCAGAAGUGAUUCUGAACUGAGCACGCACUCAUGUCUGCAUGGGGAACUCUGGGGAGAAGAGCCUUCCUUUUCUUUCCCUUGGGCAUUUGCCUUUCCUUGUCGUCUUACUGAGGCGGAGGCAGGAGGUCUCUGUCUUCCAGGCCCUGGCCAGGCCAUCCUGCCAUCAGGAAAGAUGGAAGAGUAGGCCUCCGUCUAGCAGCCCUGGCUGGAAAUCCCCCCUCUAGAUCCUGCUGCAAGACUGUACAAACUCACAGGGGCCAUGUCCACCCAGGCACAUCAUCAGAACCAGGGAGCACAGCCUUGCCACCUAGAAGGGGCCUCAGCAGCCGUGCAACUUUCUUUCCCUAUCUCCAAUCCAGAGAGGGAUCCUCUAACAUUCUCUAGCAACCUCAUCUGCACCCCCACCACCUUCCUUGUAAGAAAGACCACGUGUGACUAAAAUCCCUUCACGCUGCAUUUACCCAGGUUACUAUUGUGCGCGCAAAAUGUUUUCACAGUGUUCUCAGCCUUUGCUCCUCCAAACAGAAAACGUUUCCCCUGCGUUACUGUUACUUCCCUAUUUUUGAGUCCUGGGGUGACUGUCUCUUAAAUGUGCCAAGAUGUGAGCAAGCUUUAAAACAUGACAGCUCAGUGUUAAGGAGACAGAAAGCUUCCUCUUUCUCUGUUCUAUUGCAACUACAAAUUCUACAGUCAUGCCUAAGAUCCUUUAGCUAACACCCUUUUCAAGAAAUCAUCAGACUCUUGGAUUGACUUAGAAUUCAUUCAUUCAUUAAGUGCUUACCGAGUCCCCGCUCUGUGGCAAGCACUGUUCUAUAUCAACUUCUCAUGAGUUCAGCCAAUUCUAGGUGCACCAGCCAAGGAAACUUCAUGCCUGCCCUCUCUGAGCUCCAUACUCUGAGGUGGUGGUCUUAUCAAGAUGGGAUCGCCUUGUACAUCCCUGUGUAGCCAAGUGGAAGGCCAGCCAACCAAGAAUGCAUCUCACUGGGCCUAUGGGACAUACUGUGCCUGCACUGCUCCUCCACGUGACUGCAUCAGGUUAAACUGGUCAGAGCCCUGGAUGAGGAGCUGGAAAACAUGCAUCCAGUCCAAGCUCUGCCACUUGGGCCAAGUGUGCUCUUGAACAGUCACUUAAUAUAUCUGCUUUGAUUUGUCUUUUAAAGAAAAUAUGGAGGCAGGAAUACCAGUGUCAGUGUAGCCUGCUUCUUGAGUGUUGGCACAAGUGAGAUAAUGUAUGAAUCAGUAAAAUGCUGGGCAAAGCAAAGAAGUAGGGCUGCCUGGGAGUGGAUUCCUUUUUAUGGUGAGUUAAGACGACUUCACAAUUGUUAGCUGUGAUGCCUGCAGUGUUUGAGGAUGGCAUUGCCUUCAUCCUGUGUCAGCUCUGAAGAAGUUGGCAGAGCAAAGCUAAGCCUCAAGUGUAAAUCCCAGCAUCAUGGAACGCAAAUGGAUGAGCUUUUGUUUUAGGAUCUUCUUGCUGAUUCCUACCCAGAGGACUUCCCCAGCCUAGAGACCAGAAACCUGGGCAAUAGUUAUAUCUUCAGUGGCCCUAGGAGUUGUUGUGUCUCCUUGGGGAGGAGAGAACCUUCUAAAACAGGCCAGAGACAGGAGGUACUGGGAGGGCCAUGGGCUCACCUGCAUCUAUGCCCAGAUAACCUGGGACAGAUAACCUCUGUCCCAAUCACUUGCUUUGCCUGGUCUCUCAAGGAGUCUCUUGGUACCCCAGGCCCACGGCCAGCUCCAUGCUCAUCCCUGUCCCCACCUUCCAGUCUUGAUGAAAACCCACCUUCUCUUUCAUCCCUUGGCUGCUUGAUAAGACUUAAAACAAUUCCCUGAUUUUAGGGAAGGCCACUGCGUGCACAGAUGGUGAGUUUGUGCAGGCAAGGAAUGUGCCCUCCACAUCACGUGGCCUCCUUGCCCAGCCUGGGUCAUGGGAAGGGAGUGUUGAAUUGAAUCACGUCUUUCGUUGGUAGAUUAUGUUCAUCUUCAAUGUUUCUAUUAAGUCUAAAAAGUGGAUACAAAUGGUGCCUCCAAGUUCUUGUCUAAUUGCUUGUCUACUGCUUGACAAAAUCCAGAAUGGAAUAGGCCAAACAAGUUAACCAGCAGGACAGAAACUGCUCUAAGCCCAUUAUUCCUUGAGAUGAAUAGAACAGUGAGCUGAACGCCUGCUCUAAUGAAGCCACUAAAGGGGUUUACAGGAAGGUUAGGAGCCCAGAUGGGUUUUGAGUCCACUGCUGGGAAACAGAUUCUUCACUUCCUGUGGACCCUGGAGAAGCCAUCAGAUUACAUUAACAUGGCUCCACUGAUGAUGGCCUGAGAAUUACUAUUGUUUGUGUUUCAUCUGUGUCCUUGCCAGGUCUUCCCCCACAUCCUUACUUCACAGGAUCAGGGGCUGAGAGGAGACCAAUACUCUGGCCCAGGCCUGGUCAAGGGAUGCUGGUUGUUGCUGAUGCAAAGUCACAUUGCCUGGUCCUGAGCUUGGCAAUCAGGCAUCCAGAGAUGGCCAAACCAAAUAUCCCUUUGGCCAGGCACUCAGGCAUUCCCUGUAAUGUUGUGCACUUAAAGCAUCUUGGGCUGAUAGUCUCCACCGAAUCACAGAAGAAAACUCAAUCUGCCGCAUCACUCACCAGCUGGAUAAGCCAUUUACUGUACACAGUGUGUGCCCUCUUAUCAAUACAUUGGCACAGAACCAUACACCGUAGAAGCUGCUGUGAUCACUAAAGGCAAUGCCCGUUUAGCCCUGAGCACAGUGCUUGGCAUGUGGUAGGUAAGUAGUAGCAAUUUUAUUUGAUACCCUCAUAUACACGCUGGUUCCUUCUGUCGGCACACCUGUCCACGCUUUGAGCUUGGUGCUUCACCUGUACUCCUCUGUUUACUGGCUCCACCACCCUUCCCUAGGAUUACUUCUCCAAUCCAACCAAAAACAAUUUUGCAAAUGUUUCAUGUGACAAACUGUAUUUUUCAUAAAUGACCCCAGCAAUAUUUCCUCUCCCCUUAAACCCAGGCAGGUUUGUGUCAGCUCUAACUGAUGGAGUAUGGUGGAGGUGAUGCCAUGCAACUUCCAAGGCAAAGGUAUAAACAAGAUGCAGCUUCUACAUGGCUCUUGCGAUCCUGGGAUGCUCAUCCUGGGAAUCCAGACACCAUGUUGUGAGGAGGCCCAGGCCACAAGGAGAGGCCACCUAUAAGCAUUCAGGCCAGCAGCCCCAGGUGAGUUCCCAGCCAACAUCAACGGCCAGAUGUAUGAGUGAAUGAUCUCACGUGGUCCCAGCCUUUGCAUGACUUUGCAUGACGCCAGCUGAUGCCAAGUGGGACAGAGAUGAGCUGCCCAUUCCAAUCUCUGCCCACAUUGCAGAUUCAUGAGAAAAAUAAAUGUCACUGUUUGGGGGUGAAUCAUGACACAGUUACAGUACUUGAAACAUUUUGCGAAGCCAGGCAUGAAUGUCAUAUGAAAUUCUAAUAAAUCCAUUUUAUUUGUGGCACCACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1574.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1665.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 1381.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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