Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_181985.4

Sequence Length

1354 nt

GC Content

0.5532

GCAUUUCUCCUCUGUGCUCAUUGCCACAUGCAGCUCAGCCUGGGCUACACAGCCAGGUGUCAGAUGUGUCUCUGCUGAUCUGAGUCUGCCUGUGGCAUGGACCUGCAUCUUCCCUGAAGCAUCUCCAGGGCUGAAAAAUCACUGACCAUGGCACCAUGGUCUCAUCCAUCUGCACAGCUGCAGCCAGUGGGAGGAGACGCCGUGAGCCCUGCCCUCAUGGUUCUGCUCUGCCUCGGGAACCUCUCCAAAGCCACCCUCUGGGCUGAGCCAGGCUCUGUGAUCAGCCGGGGGAACUCUGUGACCAUCCGGUGUCAGGGGACCCUGGAGGCCCAGGAAUACCGUCUGGUUAAAGAGGGAAGCCCAGAACCCUGGGACACACAGAACCCACUGGAGCCCAAGAACAAGGCCAGAUUCUCCAUCCCAUCCAUGACAGAGCACCAUGCAGGGAGAUACCGCUGUUACUACUACAGCCCUGCAGGCUGGUCAGAGCCCAGCGACCCCCUGGAGCUGGUGGUGACAGGAUUCUACAACAAACCCACCCUCUCAGCCCUGCCCAGUCCUGUGGUGACCUCAGGAGAGAACGUGACCCUCCAGUGUGGCUCACGGCUGAGAUUCGACAGGUUCAUUCUGACUGAGGAAGGAGACCACAAGCUCUCCUGGACCUUGGACUCACAGCUGACCCCCAGUGGGCAGUUCCAGGCCCUGUUCCCUGUGGGCCCUGUGACCCCCAGCCACAGGUGGAUGCUCAGAUGCUAUGGCUCUCGCAGGCAUAUCCUGCAGGUAUGGUCAGAACCCAGUGACCUCCUGGAGAUUCCGGUCUCAGGAGCAGCUGAUAACCUCAGUCCGUCACAAAACAAGUCUGACUCUGGGACUGCCUCACACCUUCAGGAUUACGCAGUAGAGAAUCUCAUCCGCAUGGGCAUGGCCGGCUUGAUCCUGGUGGUCCUUGGGAUUCUGAUAUUUCAGGAUUGGCACAGCCAGAGAAGCCCCCAAGCUGCAGCUGGAAGGUGAACAGAAGAGAGAACAAUGCACCAUUGAAUGCUGGAGCCUUGGAAGCGAAUCUGAUGGUCCUAGGAGGUUCGGGAAGACCAUCUGAGGCCUAUGCCAUCUGGACUGUCUGCUGGCAAUUUCUUUUUUUCUUUCUUUUCUUUUCUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCACCAGGCUGGAAUGCAGUGGCGCAAUCUGGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCUCGGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUGGCAAUUUCUAGAGGGAGGAAUGGGUGUUUGAGUGCAGAGACACUGGUCUGGGGUGAUCCAUGGAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-515.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -541.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 298.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((.((....))))))).(((((...........)))))))))).)))).)))))))...(((((..((((((((..((.....((((((((((..((((((((((((((....))))))).............((((((((((...((((((.(((.((((((((.......))))))))))).)).((.((..(((.....)))..)).))..((((((.(((.((((((.((((((.....((((((...((((.((((((..(((((((..(((.((.....)))))..).))))))..)))))).))))((....))....))))))....)))))).))........((((((.((...(((((........((((...((((.........))))..))))......(((((.......)))))....(((((((((((..((((((((..((((((..(((((.(((.(((((..((((((............((((((((.....(..(((((.((...)).)))))..)...((((.((........)).))))))))))))...((((((.((....(((((((((.((((((........))))))...))))))..))).(((((.(((.....))))))))...)).))))))...)))))).))))).))).)))))..)))).))..((......)).((((.((((....((..((((((.((((..((.(((..(((((....((((((.((((....))))))))))..(((((.....)))))..((((...........)))).))))).)))))....)))).))))))...))....))))...)))).))).))))).)))))))))))...))))).)).))))))(((((((....))))))))))).))))))))).....)))).))))))))))(((((.(((.((((((((((((((((...)))))....((((.((((((((......))))).))).))))(((((((.((.((((..((((((((....))).)).)))..)))).)).).)))))).....))))))))))).))).)))))..........................((((((((...))))))))(((((((.(((.(((((((((.((...)).)).)))))))...)))))))....)))...)))))))........)))))).))))......))..)))))))).)))))...))))))))))(((....)))((((....)))).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

....{(((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((({((....))))))).(((((........},,))))}))))).)))).))))))).,.((((,..((((((((..((.,...((((((((((..((((((((((((((....))))))).....(((((.,.((((((((((..,((((((,(((.((((((((.......))))))))))).}}|{(,{{.,(((.....}}}..,},|...(((({(((((.{(((({.((((({.,,..{{{(((,..((((.((((((..(((((((..(((.((.....)))))..),,)))))..)))))).)))){{...,||,,..}})))),...)})}}}.}},.,}}}.,{({{{{.,{..,||{{{..,,,,,.||||...{{{{...,,.,,.|}}|,|||}}......(((((.......))))),,,,{((((((((((..((((((((.,({((((..(((((.(((.(((((..{(((({.....,......((((((((..,..(..(((((.((...)).)))))..)...((((,((......,.)).)))))))))))).,,,.((({.,...|||,.,,}}}}}((((((.,....}.))))))((.{({{(((,,....((((.{{{.,,,,}))})))))}))),)},}},...)))))).))))).))).)))))..)))).))..{{....,,|}.,{{{,((((,,..((.,((((((.((((.,((.(((..(((((,,..((((({{((((....))))))))))..(((((.....)))))..((({...........}))).))))).)))}).,,.)))).)))))).,.)).,,.))))...,}}}.))).))))).)))))))))))...})))),}),}})))}(((((((....)))))))}|||.}})))))}}...,,)))}.)))))))))){,|||}|,,.(((((((((({((({(,..}}}}}....||((,|({{((({......})}}}.)|}|},||(((((({.((.{{{(..{{{{{{{{....))).)).)))..)))}.)).),)}}})),....,}}}}}})))).}}},)}}}}........................,,((((((((...)))))))),((((((.(((.(((((((((.({...}).)).)))))))...)))))))...,)}}...))))))).,......)))))).))))......))..)))))))).})))).}.))))))))))(((....)))|(({....}))}.)))))}