Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_182398.3

Sequence Length

2298 nt

GC Content

0.4252

GCGGUACUAGCGGUGCCCGCCGAAGGGGGAGGAGGCGAGGAGCGAGCCGUGCGGCCAGAGCGGGAAAGAGACUCGUCUUUGCGUCCGAGUUCUGGAGCCGCCGCACCCCGACUCCUGGGGCCGCGGCAGCGGCUGCGAGGGGACGGGCGUCCGCUGUCUCCUGGGUUCCCCUCGUAGCGACCCGCGGGAUCGGAAAAAAAGGAGAAGAUGGAGGAGGAGGGUGGCAGCAGCGGCGGCGCCGCGGGGACCAGCGCGGACGGCGGCGACGGAGGAGAGCAGCUCCUCACUGUCAAGCACGAGCUGCGGACUGCUAAUUUGACAGGACAUGCUGAGAAGGUGGGAAUAGAAAAUUUUGAGCUCCUGAAGGUCCUAGGAACUGGAGCUUAUGGAAAAGUAUUUCUAGUUCGUAAAAUAAGUGGCCAUGAUACUGGAAAGCUGUAUGCCAUGAAAGUUUUGAAAAAGGCAACAAUCGUUCAAAAGGCCAAAACCACAGAGCAUACAAGGACAGAACGACAAGUCCUGGAACACAUUAGGCAGUCGCCAUUUUUGGUAACAUUACAUUAUGCUUUCCAGACAGAAACCAAACUUCAUCUCAUUUUAGAUUAUAUAAAUGGUGGUGAACUUUUUACUCAUCUUUCUCAAAGAGAGCGUUUCACAGAGCAUGAGGUGCAGAUUUAUGUUGGAGAGAUUGUGCUUGCCCUCGAACAUCUCCACAAGUUGGGGAUUAUAUAUCGUGAUAUUAAGCUUGAGAAUAUUCUACUUGAUUCUAAUGGCCAUGUGGUGCUGACAGAUUUUGGUCUGAGUAAGGAGUUUGUGGCUGAUGAAACUGAAAGAGCAUAUUCCUUUUGUGGAACUAUUGAAUACAUGGCACCAGAUAUUGUCAGAGGGGGAGAUUCAGGACAUGACAAGGCAGUUGACUGGUGGAGUUUGGGUGUUCUAAUGUAUGAAUUACUAACUGGAGCAUCUCCUUUCACUGUUGAUGGAGAAAAAAAUUCCCAAGCUGAGAUAUCUAGGAGAAUAUUAAAAAGUGAGCCUCCAUAUCCCCAAGAAAUGAGUGCUUUAGCGAAAGACCUAAUUCAGCGUCUUUUGAUGAAAGAUCCCAAGAAGAGAUUGGGAUGUGGUCCACGUGAUGCAGAUGAAAUCAAAGAACAUCUCUUCUUUCAGAAAAUAAAUUGGGAUGAUUUAGCCGCCAAAAAAGUGCCUGCACCAUUUAAGCCAGUCAUUCGAGAUGAAUUAGAUGUGAGUAACUUUGCAGAAGAGUUCACAGAAAUGGAUCCCACUUAUUCUCCCGCAGCCCUGCCCCAGAGUUCUGAGAAGCUGUUUCAGGGCUAUUCCUUUGUUGCUCCUUCCAUCCUAUUCAAGCGUAAUGCAGCUGUCAUAGACCCUCUUCAGUUUCACAUGGGAGUUGAACGUCCUGGAGUGACAAAUGUUGCCAGGAGUGCAAUGAUGAAGGACUCUCCAUUCUAUCAACACUAUGACCUAGAUUUGAAGGACAAACCCCUGGGAGAAGGUAGUUUUUCAAUUUGUCGAAAGUGUGUGCAUAAAAAAAGUAACCAAGCUUUUGCAGUCAAAAUAAUCAGCAAAAGGAUGGAAGCCAAUACUCAAAAGGAAAUAACAGCUCUGAAACUCUGUGAAGGACACCCCAAUAUUGUGAAGUUGCAUGAAGUUUUUCAUGAUCAGCUUCACACGUUUCUAGUGAUGGAACUUCUGAAUGGAGGAGAACUGUUUGAGCGCAUUAAGAAAAAGAAGCACUUCAGUGAGACGGAAGCCAGCUACAUCAUGAGGAAGCUUGUUUCAGCUGUAAGCCACAUGCAUGAUGUUGGAGUGGUGCACAGGGAUCUGAAACCUGAGGUAUAAAAUCACUGGAUCUCUUACGUAAUUCAGUCUAGCACCAUUAUUAAAGAUCUCCCAAACAUGGGGGAAGUUUCUGGGGAGGUUUCCUUAUUUUUUUACUUUUCAAGGCUGUUAAAUAGAUAAUUGAAAAUACGUUUCUUUGAUGUUUUUUCUUUUAUAUUUCAGUCUAAAAUAAAUUUGUCUUUGUUUAUUUUUUGCCAGCUGAUCAUCUUGAGGUUAUAUUUGUAAGUGUGAGAACCUUUUAUGGAAAAAAUACUUUAUGCAACAGUUGUGGACUAAAAAUAGCAAUGGAAAUUUUUAUAGCAGAAAAUAAUAUCUCUUACAUAUAAUUUUAGAGGGUUUUUUUUCCAAAUGAUGUAUUUUGAAAACUUAUUUUUUACAUUUGUAAUCAAAUUGGUUAGCUCAUGAAUAAAAAUGUAUAUAAUUCUAUUCUAAAUACUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-662.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -707.16

Frequency: 0.0000

Diversity: 670.67

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.((.((((((((.((((.((((...(((.(((((((.((((((((.(.....).))))........))))))))))).)))...))))...((.(((((.((((..((((((.((((((....)))))).))((.((((....)))).)).((((((...((((.(((((........)))))...))))....))))))....))))..)).))))))).))..)))))))))))).)).))).))((((.(.(((((((((((((((.....))))))..))))........))))).).))))........(((......)))...((((((((((((((.....((((((((...((.((....)).))))))))))..((((((((............((((((((.((((......((((((((((((((((..((...((((((........(((....)))........))))))..))..)))))))(((((..........)))))...............((.((((....)))).))..........))))))))).(((((((((((((((.((((..((((((.........(((.((((..((((...(((.(((((...)))))))).(((((.((((((.((.((.((((.....(((.((((((...((((((.(((((..(((((((((.....)))))))..................(((..(((((..........)))))...))).((.((((((((....(((((((((((...(((((((.(((..((............)).))).)))))))...))).))))..))))...)))))))).))...))..))))).)))..(((.....)))..(((((.((...(((((((((((((((((((((..(((.....)))....)))))))(((((..(((....))).)))))........))))))))..(((((((...)).))))).......(((((((.((.((.....)).))))).))))...((((((((((.....)).)))))))).((((..(((((((..(((((..(((((((..((....((((.........))))..))))))))).)))))...........)))))))..)))).))))))...)).))))).(((.((((((....(((......)))...))))))))).((((((((.....)))))).))............)))...)))))).)))...))))))))..)))))).))))).(((((((((((.(((((((((((...((((((((((.....(((........)))(((((((.(((...............))).((((.((.((((((...(((....))).)))))))).))))(((((((((...))).))).)))....)))))))......(((((((((.....(((......)))..)))))))))(((((.((...((..((((.....(((((......)))))))))..))......)).))))))))))))))).))))).....)))))).....))))))))))).....))))..)))))))....((((((((((((((((....))))))..)))))))))).(((((.......))))).))))))..)))).)))..))))).((................)).((((.((...)).))))(((((..(((((((.((.((((......)))).....)).)))).)))..)))))((((((((.((((.........)))).(((.....)))(((((((..(....)..)))))))...))))))))........(((((((....))))))).)))))))....))))..))))))))..)))))))).((((((..(((((..(((..(((((.(((((.....))))).)))))..))))))))))))))(((((((((........))))))))).....(((((((((..((((..(((((..((((((.(((((..((......))............(((((.((....((((..((((((.((.(((((....))))).))...........(((((.............)))))))))))..))))..)).)))))........)))))..))))))..)))))))))..)))))))))(((........))).......)))))))))...)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((...})))}}}}|{{,..{{(((((.{.(((((.(((((({(((((((((((((.(((.(((({....)))))...)))..)))))),.,,,|)))}}}((((.((((((.((((((....)))))).).))))).)))){|{({({{,((((((...{(((|{{{{{.{{.,,{|}}}}}.,|}},,....,}}}}},,.}})),}.,|,|||||||.||,{{||(|,|||||||,},,,,.,}}|)).)}|))|}{{{{((((((.....)))))).||))}.,|,....}}}}}.{{{{||{{{{.{|.((({{{.,{{(,{{{(,,({{{,,{,,,,..||||,|||(((..{((.(({...,,.,,))),)))..}}}.,|||.||||||||||{{,......,,,,,,}|},.,|||||||||{((((((..((...((((((......{.{{{....))),.......))))))..))..))))))},{{{{..........)))))}...,,.}}},||}}}}}|||{....)}}}..,....,...,.}||||||||,{{.,{,,,..{{((((((((,,{{,{........,}}}||{||||||.,,}}}}},))}}|{{{{|...))))}.{{{{{.,.}||,|||}|}}...|.}}}.))))}}})))...},)))))))))))..}.))))).,.,,,}}{((((((((((,(.,((((((.((((((.((((,{(({{((,,,,{{,,{(,(({((.(((((((,....((({(((((({...(((((((.(((..((............}}.))).)))))))...})),,)))..})})...}))))))).)).,{||||..,,,,|,...}),.....}}}}}||||,}||}|,.||||||||,,{(((((((((..(((.....)))....)))))))||{((..{{|....))).))))}.....}))).))))))..))))))..}(((({....((((((((((...((...(((((,,((((({,{,{{(((,.((((((((((.....)).)))))))).,}}}{.(((((((.......))))))).|..{{{{{{(,(({{,{{((...((({{.,..,(((((((({((((({.....{(((((.{{.,,,.,,|{{,....,|||},||,(({{((((((..{,{((......)))}..)))))))}),}..|||||,,.,.,}}}|(({((((..{({...})}....{{(({..{,({{.{||,..})).)))},)}))}...(((((((((((,(((((((((((...((((((((((.....,((,.....{,|||,(({{{({{.,,...,,}|}}...,)))}))}||.||.((((((..,(((....))),))))))||{||.((((((((((...))).))).))))(((((.((((..,((,(((((((((..,,,{((......})),.)))))))))})})))}..))))).|||},....{((((......)))))|||............,.))},.)))))))))).))))}....})))))).,...)))))))))))))))))))}..)}.))))))..((((((((((((((((....))))))..)))))))))).(((((.,....,)))))})))))).))))))))..},)))))...)}}}........,,|||.||{((((((({{,,,{{(...({.{,...,}}),..)))}}))))}|||}..,}{{{{,|,}},.))),}))|(((((((.((((.........)))).{{{.....,,}(((((((..(....)..)))))))...)))))))}........(((((((....))))))).)))))))))))))....))))))))))...))))).((((((..{(((,.,(((..(((((.(((((.....))))).)))))..)))))))})))))){((((((((........))))))))}.....(((((((((..((({.,(((((..((((((.(((((..((......))..{{{{{{{.{{{({{{.,,,,||{{{{..{,,,{{.{(.{{{({....})))}.)).{{{{,..,..{((((.............)))))}}))})}}))}}.})),.))))}}}.....)))))..))))))..)))))))))..))))))))),,.........,,))))))))))))...,,...........