Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_182678.3

Sequence Length

1405 nt

GC Content

0.4797

GGCACAGGCUCCGCGGCCAAGGGCGGCAGGGGCCAGCCCGCCGGGUCCCCGCCGCGCUCUUUGUCCUGGCCGCGCGCGGGCGGACGCGUGCACCCCCAGGGUGAGGGGAGGUGUGGAGAGCGCGCACGGGAGCGCGCGGGAACAGCUCGCGCCCGCCGGGCGUCGGCGGCGCGCGCCCCUCCGCCAGCGGCGCGCGAGCGGGCCGGGCGGGCGGCCGAGUUUUCCAAGAGAUAACUUCACCAAGAUGUCCAGUGAUAGGCAAAGGUCCGAUGAUGAGAGCCCCAGCACCAGCAGUGGCAGUUCAGAUGCGGACCAGCGAGACCCAGCCGCUCCAGAGCCUGAAGAACAAGAGGAAAGAAAACCUUCUGCCACCCAGCAGAAGAAAAACACCAAACUCUCUAGCAAAACCACUGCUAAGUUAUCCACUAGUGCUAAAAGAAUUCAGAAGGAGCUAGCUGAAAUAACCCUUGAUCCUCCUCCUAAUUGCAGUGCUGGGCCUAAAGGAGAUAACAUUUAUGAAUGGAGAUCAACUAUACUUGGUCCACCGGGUUCUGUAUAUGAAGGUGGUGUGUUUUUUCUGGAUAUCACAUUUUCAUCAGAUUAUCCAUUUAAGCCACCAAAGGUUACUUUCCGCACCAGAAUCUAUCACUGCAACAUCAACAGUCAGGGAGUCAUCUGUCUGGACAUCCUUAAAGACAACUGGAGUCCCGCUUUGACUAUUUCAAAGGUUUUGCUGUCUAUUUGUUCCCUUUUGACAGACUGCAACCCUGCGGAUCCUCUGGUUGGAAGCAUAGCCACUCAGUAUUUGACCAACAGAGCAGAACACGACAGGAUAGCCAGACAGUGGACCAAGAGAUACGCAACAUAAUUCACAUAAUUUGUAUGCAGUGUGAAGGAGCAGAAGGCAUCUUCUCACUGUGCUGCAAAUCUUUAUAGCCUUUACAAUACGGACUUCUGUGUAUAUGUUAUACUGAUUCUACUCUGCUUUUAUCCUUUGGAGCCUGGGAGACUCCCCAAAAAGGUAAAUGCUAUCAAGAGUAGAACUUUGUAGCUGUAGAUUAGUUAUGUUUAAAACGCCUACUUGCAAGUCUUGCUUCUUUGGGAUAUCAAAAUGUAUUUUGUGAUGUACUAAGGAUACUGGUCCUGAAGUCUACCAAAUAUUAUAGUGCAUUUUAGCCUAAUUCAUUAUCUGUAUGAAGUUAUAAAAGUAGCUGUAGAUGGCUAGGAAUUAUGUCAUUUGUAUUAAACCCAGAUCUAUUUCUGAGUAUGUGGUUCAUGCUGUUGUGAAAAAUGUUUUACCUUUUACCUUUGUCAGUUUGUAAUGAGAGGAUUUCCUUUUACCCUUUGUAGCUCAGAGAGCACCUGAUGUAUCAUCUCAAACACAAUAAACAUGCUCCUGAAGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-459.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -480.55

Frequency: 0.0000

Diversity: 343.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((((.(((((...((((.((...((((.(((((((.((..((((((((((.....((((((((.(((((((......)))))))((((...))))((((((((.(((.....((((((......))))))....))).))(((((((((((.....)))))).))))))))))).))))).)))))))).))))))).)))))))))))(((((.((.....)).)))))........((((........))))..((((((....((((.(((.(.((....)).).)))..))))....)))))).))..).))).)))))....)))))))(((...(((((((((......(((((((......))))))).................(((((.......))))).(((((.(((((((.((..............)).))))).))..))))).........(((((...(((((((.(((((...((((((.(((..((((....))))...))).......((((((((((((.(((((((...((..(((((((.((((....((((((((............)).))))))...))))))))...(((((.((((((.((((((.......((((.........))))..((((.((...(((((((....))....)))))....)).)))).((((((.....))))))......(((((...............))))).(((((....)))))....))))))))))))..)))))............)))..))..))))))).))...((....)).....)))))))))).((((((..(((((((((.....((((((((((((((.(((((.((.....)).))))).))))))).))))))).....(((((((((((((((((....))))))....((((((..(.(((((((((((.((((.(((((((((.((...)).))))....))))))))).)).....))))))))))..)))))).((((....(((........)))..))))..((((...))))....(((((.....(((((((((..(((((((((((.(((((....)))))..))).......)))))))))))))))))..)))))(((((.......)))))(((((....))))))))))).))))).)))))))))....)))))).....((((......))))((((((.....))))))...((((((....))))))......))))))))))))))))))..))))))))))))))...)))....((((((.(((((...((((...))))................)))))))))..)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,.(((((((.(((((...((((,((.,,((((.(((((((.(({{((((((((((,,,,,((((((({.(((((((......))))))){{{{,,,)))}||||||,|,{||,....((((((......))))))....,},{||((((((((({{(,,,.}||}||{}}}})))))}}})))}),))}))))),))))))).))))))))))){((((.((.....)).})))}........{{{{....,...))),..((((((....((((.(((.{.((....)).).)))..))))....)))))).))..,.))).))))),,..))))))),,,...((((((({,......(((((((......))))))).................(((((.......))))).(((((.{{(((((.((..............)}.))))).})..}}}}}....,{{{{({{((...{((((({.(((((,,.,(((((.{{,,,((((,...||||,.,||},,,,.,.((((((((((,({((((((,...,((((((((((.((((....((((((((............)),})))))...)))))))),..,,,,|})))},,..,)))}}}}}...((((.........))))..((((.((...((((({{....}}....)))))....)).)))).((((((.....))))))({{{.(((((({...{{{{...,,,,|,,,|{(((((....))))).},{|||||{(({,.|.,||||,.....},.,.}},))},)))))}})))},,),..))}}}}),})}).)))))))))).((((((..(((((((((.....((((((((((((((.(((((.((.....)).))))).))))))).))))))).....(((((((((({((((((....))))))....((((((..(.(((((((((((.((((.((((((({(.,,,,,,}.)))),...))))))))).)).....))))))))))..)))))).({{(....{{{,.......}}}..}}}}..((({...,)))....(((((.,...(((((((({..{((((((((((.(((((....)))))..))).......)))))))))))))))))..))))},((((.......))))|(((((....))))))))))).))))),)))))))))....)))))).....((((......)))){||{{|,,,,,}))))),..{{{{{|.,,})))),),,,,..}}}},}}))))}))))))}}))))))))))))))...}}},,,.{{((((.(((((...{{((,..,,,,................))))))))}.,)).