Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_182709.3

Sequence Length

1825 nt

GC Content

0.5584

AGUGGAGGGAGGGAAGAUGGCGGAGGUGGGGGAGAUAAUCGAGGGCUGCCGCCUACCCGUGCUGCGGCGGAACCAGGACAACGAAGAUGAGUGGCCCCUGGCCGAGAUCCUGAGCGUGAAGGACAUCAGUGGCCGGAAGCUUUUCUACGUCCAUUACAUUGACUUCAACAAACGUCUGGAUGAAUGGGUGACGCAUGAGCGGCUGGACCUAAAGAAGAUCCAGUUCCCCAAGAAAGAGGCCAAGACCCCCACUAAGAACGGACUUCCUGGGUCCCGUCCUGGCUCUCCAGAGAGAGAGGUGAAACGGAAGGUGGAGGUGGUUUCACCAGCAACUCCAGUGCCCAGCGAGACAGCCCCGGCCUCGGUUUUUCCCCAGAAUGGAGCCGCCCGUAGGGCAGUGGCAGCCCAGCCAGGACGGAAGCGAAAAUCGAAUUGUUUGGGCACUGAUGAGGACUCCCAGGACAGCUCUGAUGGAAUACCGUCAGCACCACGCAUGACUGGCAGCCUGGUGUCUGAUCGAAGCCACGACGACAUCGUCACCCGGAUGAAGAACAUUGAGUGCAUUGAGCUGGGCCGGCACCGCCUCAAGCCGUGGUACUUCUCCCCGUACCCACAGGAACUCACCACAUUGCCUGUCCUCUACCUGUGCGAGUUCUGCCUCAAGUACGGCCGUAGUCUCAAGUGUCUUCAGCGUCAUUUGACCAAGUGUGACCUACGACAUCCUCCAGGCAAUGAGAUUUACCGCAAGGGCACCAUCUCCUUCUUUGAGAUUGAUGGACGUAAGAACAAGAGUUAUUCCCAGAACCUGUGUCUUUUGGCCAAGUGUUUCCUUGACCAUAAGACACUGUACUAUGACACAGACCCUUUCCUCUUCUACGUCAUGACAGAGUAUGACUGUAAGGGCUUCCACAUCGUGGGCUACUUCUCCAAGGAGAAAGAAUCAACGGAAGACUACAAUGUGGCCUGCAUCCUAACCCUGCCUCCCUACCAGCGCCGGGGCUACGGCAAGCUGCUGAUCGAGUUCAGCUAUGAACUCUCCAAAGUGGAAGGGAAAACAGGGACCCCUGAGAAGCCCCUCUCAGACCUUGGCCUCCUAUCCUAUCGAAGCUACUGGUCCCAGACCAUCCUGGAGAUCCUGAUGGGGCUGAAGUCGGAGAGCGGGGAGAGGCCACAGAUCACCAUCAAUGAGAUUAGUGAAAUCACCAGCAUCAAGAAGGAGGAUGUCAUCUCCACUCUGCAGUACCUCAAUCUCAUCAACUACUACAAGGGCCAGUACAUCCUCACACUGUCAGAGGACAUCGUGGAUGGCCAUGAGCGGGCCAUGCUCAAGCGGCUCCUGCGGAUCGACUCCAAGUGUCUGCACUUCACUCCCAAGGACUGGAGCAAGAGGGGGAAGUGGUGACCAGACACUGCCCACUGCAGUGCCAAGACGGCAGCAGGACUGGGGCUGAUAGCCCACCCCGCCCCCACUGCAGCUCCCACAAAGCACUCUAAGGGAGAUGGGGCUGAGGACAGCUCAAAAAGGAGAGGACAGGCCUGGCAGGGGCCCACUGGUGCCCAGCACCAAGGCGAGCUCCGGGCUCAGACCAACUCCAAGGUCAGCUGGCCACAGGCCCAGGCCUCCUCUGAAGCAGGGACCAGAGGGAGCCAGGCAGCUGUGUACAGUGAGAAGGGAUCCGGAUGGGGGAGCUCUGUACAGAGGGCUGGUGAUUGUAAAAAUUUCUUUUGUAAAGUAGAAGUUGGGGGUGGGGUGGGUGCUGGCUGCAAAAAUUUCUGGCUUCUCUUACCCCUAUUGCCCCCGGCAAUAAAUUGUUUCUAUAUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-663.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -697.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 441.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((((.(((((.(..(((((((((((.......((((((((((...(((.(((.(.(((((..(((((((.(((.(((.((((..((...(((((.((((((........))))..))..)))))))..)))).))).)))(((((.(((((((..........)))..)))))))))....(((....)))...(((((((..((((.(((.((((....((...(.((......)))...))..))))))))))).))))))).)))))))(((((....))))).((.(((((.((.(((.(.(((.(((((.(..(((.......)))...).))))).))).).))))).))))).))(((...)))..))))))))))))..)))))))))).(((.((....((((((........)))))).(((..((((..((((..(((((.(.((((((((((....)))))))..............))).)))))).)))).))))..)))..((((....)))).(((((.(.((..((.....))...)).).))))))))))(((((........)))))...))))))).))))..).((......)).(((((((((....(((((((((((((......)))..))))))..))))......(((((...((.(((((..........)))))))..)))))....))))))))).......((....))...))))))))))))))........(((.(((((((((((...(((((.((.......(((((((.(((.((((......)))).))).)))))))..(((.((.((.(((.(((((...........((((((......))))))(((((((((((((.((((((((((((((((((....)))))......................)))))))))(((((..((((((((((((..((((((((......))))..))))......(((((((....)))))))((((...)))))))))....((((....((((((......)))))).))))((((((((.((((.....((((....(((((((.(((((((((((....((.((((((((.(((.((.(.((((((.(.(((..(((.((.(((((.((((((((.(((....)))..(((...((..((((........)))).)).)))........))))))))............((((.......(((((.........)))))..((((((....))))))(((((...(((....)))...)))))(((.....))).((((((((((((((.(((((..(........)..).)))))))))).....)))))))))))).((((..((((.....)))))))))).))))))))...)))).))))))))).))).)))).)))))).....))))...)).)))))..))).)))))))).....)))).))))..)))).)))))))(((...((((((...)))))).)))(((((...))))).((((........)))).((((..((((((((..(((.(((((((..........))))))).))).)))..)))))..)))).....)))))...)))).))))))))).)))))))))))))).)).)))..(((((((.((....)).)))))))((((((((((((((.(..((((............)))).).))))))))....)))))))).))))).))).)))).)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{.,{((((((({{(((((,{{,(((((((((({.......((((((((((.,.(((.(((.(,(((((..(((((((.(((.(((.((((..({.,,(((((,{{((((........))))..))..}))))))..)))).))).)))(((((.(((((((..........)))..)))))))))....(((....)))...(((((((..((((.(((.((((....{{...(.((......))}...}}..))))))))))).))))))).)))))))(((((....))))).((.(((((.({,(((,(.(((.(((((.(..(((.,....,)))...).))))).))),).))))).))))).))(({...}))..))))},)))))).,)))))))))).(((.{((((,...(((...)))..}))))}.))).,{{{{.,{{,|,,||{({.{,{{{(((((((....))))))),{{{{,{{.{{...|||.|||}|||}||}.,||}..|||,|({({....))}).{{{{(,{,{{..,{,,...)),,.}},},)))}},,}}}.}}))))),.)})))})}.,,))))))).}}}),.}.((......}}.(((((((((....({{{(((((((((......}}}..)))))).,||||,,{{{,((({(...{{.{{{{|,|,,....,.}})))}),.))))}....))))))))),,.....((....}),,.)))))))))))))).,......|((.(((({(((({{...(((({.({.......(((((((.(((.((((......)))).))).))))))).,{{(.{(.((.(((.(((({,.,,,,,,...{((((|,....,}))))}{(({(((((((((.(((({((((((,((((((....}}}}}.....,...{,..,.,..,..,}}||||}||.{{{,..((((((((((((..((((((((......))))..)))),,,...(((((((....)))))))((({...}))))))))...,{(((....((((((......)))))).)))}((((((((.((((.....((((.,,,(((((({.{({((((((((...,(,.((((((((.(((.((.(.((((((.,.((({.,.{.,,.,,,,,.{(((((({.(((....)}}..((,...{{,.(((({......,)))).,},)}}.|,.....})))))))............||||}....{{((({{.,..{{{{.,,,))}}..||||,}}|||.||{(((,,...}|}}}}.,|||,{|||||(((.....))).(((((((({{({((,(((((.....,,....,.,}.}})))))))),.,..)))))))){{,,.{{||..((((.....)))))))))}.}}|||||,..,)))).))))))}))}))).)))).)))),,.,}..))))..))),,,))),,))).))}})))),....)))).)))}.,)))).)))))))(((...((((((...)))))).)))(((((...))))).((((........)))).|(((..(((({(((..(((.(((((((..........))))))).))).)))..)))))..)))),,},,))),)},,)))).))))))))).)))))))))))))).)).))}..{((((((.{{....}}.))))))}((((((((((((((.{..(((({.,,....,,.})))).}.))))))))....)))))))),}}}}}.}))})))).)))))),