Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_182710.3
Sequence Length
2080 nt
GC Content
0.5779
AGUGGAGGGAGGGAAGAUGGCGGAGGUGGUGAGUCCGGUGCCCGGGGCGGGGCGGAGGGAGCCAGGGGAGGUGGGUAGAGCCCGAGGCCCCCCAGUAGCCGACCCUGGCGUCGCGCUGUCUCCCCAGGGGGAGAUAAUCGAGGGCUGCCGCCUACCCGUGCUGCGGCGGAACCAGGACAACGAAGAUGAGUGGCCCCUGGCCGAGAUCCUGAGCGUGAAGGACAUCAGUGGCCGGAAGCUUUUCUACGUCCAUUACAUUGACUUCAACAAACGUCUGGAUGAAUGGGUGACGCAUGAGCGGCUGGACCUAAAGAAGAUCCAGUUCCCCAAGAAAGAGGCCAAGACCCCCACUAAGAACGGACUUCCUGGGUCCCGUCCUGGCUCUCCAGAGAGAGAGGUGCCGGCCUCGGCGCAGGCCAGCGGGAAGACCUUGCCAAUCCCGGUCCAGAUCACACUCCGCUUCAACCUGCCCAAGGAGCGGGAGGCCAUUCCCGGUGGCGAGCCUGACCAGCCGCUCUCCUCCAGCUCCUGCCUGCAGCCCAACCACCGCUCAACGAAACGGAAGGUGGAGGUGGUUUCACCAGCAACUCCAGUGCCCAGCGAGACAGCCCCGGCCUCGGUUUUUCCCCAGAAUGGAGCCGCCCGUAGGGCAGUGGCAGCCCAGCCAGGACGGAAGCGAAAAUCGAAUUGUUUGGGCACUGAUGAGGACUCCCAGGACAGCUCUGAUGGAAUACCGUCAGCACCACGCAUGACUGGCAGCCUGGUGUCUGAUCGAAGCCACGACGACAUCGUCACCCGGAUGAAGAACAUUGAGUGCAUUGAGCUGGGCCGGCACCGCCUCAAGCCGUGGUACUUCUCCCCGUACCCACAGGAACUCACCACAUUGCCUGUCCUCUACCUGUGCGAGUUCUGCCUCAAGUACGGCCGUAGUCUCAAGUGUCUUCAGCGUCAUUUGACCAAGUGUGACCUACGACAUCCUCCAGGCAAUGAGAUUUACCGCAAGGGCACCAUCUCCUUCUUUGAGAUUGAUGGACGUAAGAACAAGAGUUAUUCCCAGAACCUGUGUCUUUUGGCCAAGUGUUUCCUUGACCAUAAGACACUGUACUAUGACACAGACCCUUUCCUCUUCUACGUCAUGACAGAGUAUGACUGUAAGGGCUUCCACAUCGUGGGCUACUUCUCCAAGGAGAAAGAAUCAACGGAAGACUACAAUGUGGCCUGCAUCCUAACCCUGCCUCCCUACCAGCGCCGGGGCUACGGCAAGCUGCUGAUCGAGUUCAGCUAUGAACUCUCCAAAGUGGAAGGGAAAACAGGGACCCCUGAGAAGCCCCUCUCAGACCUUGGCCUCCUAUCCUAUCGAAGCUACUGGUCCCAGACCAUCCUGGAGAUCCUGAUGGGGCUGAAGUCGGAGAGCGGGGAGAGGCCACAGAUCACCAUCAAUGAGAUUAGUGAAAUCACCAGCAUCAAGAAGGAGGAUGUCAUCUCCACUCUGCAGUACCUCAAUCUCAUCAACUACUACAAGGGCCAGUACAUCCUCACACUGUCAGAGGACAUCGUGGAUGGCCAUGAGCGGGCCAUGCUCAAGCGGCUCCUGCGGAUCGACUCCAAGUGUCUGCACUUCACUCCCAAGGACUGGAGCAAGAGGGGGAAGUGGUGACCAGACACUGCCCACUGCAGUGCCAAGACGGCAGCAGGACUGGGGCUGAUAGCCCACCCCGCCCCCACUGCAGCUCCCACAAAGCACUCUAAGGGAGAUGGGGCUGAGGACAGCUCAAAAAGGAGAGGACAGGCCUGGCAGGGGCCCACUGGUGCCCAGCACCAAGGCGAGCUCCGGGCUCAGACCAACUCCAAGGUCAGCUGGCCACAGGCCCAGGCCUCCUCUGAAGCAGGGACCAGAGGGAGCCAGGCAGCUGUGUACAGUGAGAAGGGAUCCGGAUGGGGGAGCUCUGUACAGAGGGCUGGUGAUUGUAAAAAUUUCUUUUGUAAAGUAGAAGUUGGGGGUGGGGUGGGUGCUGGCUGCAAAAAUUUCUGGCUUCUCUUACCCCUAUUGCCCCCGGCAAUAAAUUGUUUCUAUAUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-792.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -831.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 513.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((.....(((((..(((((((((((.(((...((.((((((.((((((.(((((((..((((((..(.(((...)))).)))....)))..))))))).)).((.((((((((....))))))))..)).((((....))))(((((.((((.(((((..(((((((.(((.(((.((((..((...(((((.((((((........))))..))..)))))))..)))).))).)))(((((.(((((((..........)))..)))))))))....(((....)))...(((((((..((((.(((.((((....((...(.((......)))...))..))))))))))).))))))).)))))))(((((......)))))((((((....)))))).(((.((.(......))).)))....(((((((((.((((((((..(((((.(((((...((((((.(((((........((((((...........))))))..))))).))))))....)))......(((((..((........))..)))))..((((((((........((((((((((((((((....((.(((.(((.(((............(((.(((((((...))))...)))...))))))))).)))..)).....)))......))))))))))..)))(((..(((((.(.((((((((((....)))))))..............))).)))))).))).....))))))))((((....))))....)).)))))......)))))...))).)))))))))..))))).).))))).))).)))).)))))).))))).)).))))))))).)))))..)))))...(((((((((......)))..)))))).((((((((((((((.(......).)))))))........)).)))))....))))))((((..(((((...((....))...(((((....(((...)))..)))))........(((((((..(((..........(((((((.(((.((((......)))).))).)))))))..(((.((.((.(((.(((((...........((((((......))))))(((((((((((((.((((((((((((((((((....)))))......................)))))))))(((((..((((((((((((..((((((((......))))..))))......(((((((....)))))))((((...)))))))))....((((....((((((......)))))).))))((((((((.((((.....((((....(((((((.(((((((((((....((.((((((((.(((.((.(.((((((.(.(((..(((.((.(((((.((((((((.(((....)))..(((...((..((((........)))).)).)))........))))))))............((((.......(((((.........)))))..((((((....))))))(((((...(((....)))...)))))(((.....))).((((((((((((((.(((((..(........)..).)))))))))).....)))))))))))).((((..((((.....)))))))))).))))))))...)))).))))))))).))).)))).)))))).....))))...)).)))))..))).)))))))).....)))).))))..)))).)))))))(((...((((((...)))))).)))(((((...))))).((((........)))).((((..((((((((..(((.(((((((..........))))))).))).)))..)))))..)))).....)))))...)))).))))))))).)))))))))))))).)).)))..)))..))))))).........(((((((((((((((((.(..((((............)))).).))))))))....)))))))))........)))))....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((((,.,,,(((((..(((((((((((.(((...((,((((((.(((({(,(((((((..((((((..{.(((...))),,)))....}))..))))))).)).|,.{(((((((....)))))))}..,,.((((....)))}{{{{(.((((,(((((..(((((((.(((.(((.((((..({.,,(((((,{{((((........))))..))..}))))))..)))).))).)))(((((.(((((((..........)))..)))))))))....(((....)))...(((((((..((((.(((.((((....{{...(.((......))}...}}..))))))))))).))))))).)))))))(((((....}}))),|((((((,,,.)))})).(((,({,((,....})},))}....(((((((((.{(((((((.,(((((.{((((...((((((.(((((,,,|,...||||||{,{{.......}}})))}.})))).))))))....))),.....(((((..{{........))..)))))..((((((((,.{{(,..{,.((((((((((({{....(({((((,,{({(((({.....,}}}},)))))|,||,..))))..{(((......)))}.,.||,...|{,...}}}..)))})))))))))).,.(((.((.((((,.{,(({(((((((....))))))).,....}}.}}.}})).)))))}))),))).,.))))))))((((....))))....}).)))))......)))))...))).))))))))).,))))).).,)))),))),)))),)))))).))))).)),,)))))))).))))).,))}}||.,(((((((((......)))..)))))).{{{{{{{{(({(((,(...,,.|,|||}}}}......},))}})}}),},}}))})){{{{,,{{{{,...((....})|,.{{{{|||||||,..,}},..}}}||.,{{,,,{(({{,.{{{{{{.,,.....,.(((((((.(((.((((......)))).))).))))))).,(((.((.((.(((.(((({..,,,.,,...{{{{{|,...,,}}})}|{((((((((((((.(((({(((((({((((((....}}}},....,,...{............))))}))}},{{{{..((((((((((((..((((((((......))))..)))),,,...(((((((....)))))))((({...}))))))))...,{(((....((((((......)))))).)))}((((((((.((((.....((((.,,,(((((({.{({((((((((...,(,.((((((((.(((.((.(.((((((.,.((({.,.{.,,.,,,,,.{(((((({.(((....)}}..((,...{{,.(((({......,)))).,},)}}.|,.....})))))))............||||}....{{(((|{.,..{{{{.,,,))}}.,||||,}}|||.||{(((,,...}|}}}}.,|}|,{|||||(((.....))).(((((((({{({((,(((((.....,,....,.,}.}})))}}))),.,..)))))))){{,,.{{||..((((.....)))))))))}.}}|||||,..,)))).))))))}))}))).)))).)))),,.,}..))))..))),,,))),,))}.)}}})))).....)))).)))}.,)))).)))))))(((...((((((...)))))).)))(((((...))))).((((........)))).{(((..((((((((..(((.(((((((..........))))))).))).)))..)))))..)))),,,,,))),),,.)))).))))))))).)))))))))))))).)).)))..{{{{{{|,||....,}.)))}|||((((((((((((((.{..(((({.{,....,,.})))).}.))))))))....))))))))}}}},,.,})}}))}.}.)))).
Back