Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_182919.4
Sequence Length
2684 nt
GC Content
0.6300
AGCGCCCUCAGCGCGCUACGGUCCGCGGGCAACUCCGCAGAAGCCCCAGCCCCCAGGACCCCAGGACCCAGUGGCGCAGCCGGCAGCCCCGGAUCCCUGAUCUGCUUGGGCAGCUCCUGCAGAACCUGGAACAGUGAAUGGGUAGGGGACACUGGGCGUGCAGAAGGCGGGGGGCAGUGUGGAACAUGCCUUCACCACCUCCAGCUUCUGCUGCCGGAGGCUGCACCCACCUGUGCCCAUGGCCUGCACAGGCCCAUCACUUCCUAGCGCCUUCGACAUUCUAGGUGCAGCAGGCCAGGACAAGCUCUUGUAUCUGAAGCACAAACUGAAGACCCCACGCCCAGGCUGCCAGGGGCAGGACCUCCUGCAUGCCAUGGUUCUCCUGAAGCUGGGCCAGGAAACUGAGGCCAGGAUCUCUCUAGAGGCAUUGAAGGCCGAUGCGGUGGCCCGGCUGGUGGCCCGCCAGUGGGCUGGCGUGGACAGCACCGAGGACCCAGAGGAGCCCCCAGAUGUGUCCUGGGCUGUGGCCCGCUUGUACCACCUGCUGGCUGAGGAGAAGCUGUGCCCCGCCUCGCUGCGGGACGUGGCCUACCAGGAAGCCGUCCGCACCCUCAGCUCCAGGGACGACCACCGGCUGGGGGAACUUCAGGAUGAGGCCCGAAACCGGUGUGGGUGGGACAUUGCUGGGGAUCCAGGGAGCAUCCGGACGCUCCAGUCCAAUCUGGGCUGCCUCCCACCAUCCUCGGCUUUGCCCUCUGGGACCAGGAGCCUCCCACGCCCCAUUGACGGUGUUUCGGACUGGAGCCAAGGGUGCUCCCUGCGAUCCACUGGCAGCCCUGCCUCCCUGGCCAGCAACUUGGAAAUCAGCCAGUCCCCUACCAUGCCCUUCCUCAGCCUGCACCGCAGCCCACAUGGGCCCAGCAAGCUCUGUGACGACCCCCAGGCCAGCUUGGUGCCCGAGCCUGUCCCCGGUGGCUGCCAGGAGCCUGAGGAGAUGAGCUGGCCGCCAUCGGGGGAGAUUGCCAGCCCACCAGAGCUGCCAAGCAGCCCACCUCCUGGGCUUCCCGAAGUGGCCCCAGAUGCAACCUCCACUGGCCUCCCUGAUACCCCCGCAGCUCCAGAAACCAGCACCAACUACCCAGUGGAGUGCACCGAGGGGUCUGCAGGCCCCCAGUCUCUCCCCUUGCCUAUUCUGGAGCCGGUCAAAAACCCCUGCUCUGUCAAAGACCAGACGCCACUCCAACUUUCUGUAGAAGAUACCACCUCUCCAAAUACCAAGCCGUGCCCACCUACUCCCACCACCCCAGAAACAUCCCCUCCUCCUCCUCCUCCUCCUCCUUCAUCUACUCCUUGUUCAGCUCACCUGACCCCCUCCUCCCUGUUCCCUUCCUCCCUGGAAUCAUCAUCGGAACAGAAAUUCUAUAACUUUGUGAUCCUCCACGCCAGGGCAGACGAACACAUCGCCCUGCGGGUUCGGGAGAAGCUGGAGGCCCUUGGCGUGCCCGACGGGGCCACCUUCUGCGAGGAUUUCCAGGUGCCGGGGCGCGGGGAGCUGAGCUGCCUGCAGGACGCCAUAGACCACUCAGCUUUCAUCAUCCUACUUCUCACCUCCAACUUCGACUGUCGCCUGAGCCUGCACCAGGUGAACCAAGCCAUGAUGAGCAACCUCACGCGACAGGGGUCGCCAGACUGUGUCAUCCCCUUCCUGCCCCUGGAGAGCUCCCCGGCCCAGCUCAGCUCCGACACGGCCAGCCUGCUCUCCGGGCUGGUGCGGCUGGACGAACACUCCCAGAUCUUCGCCAGGAAGGUGGCCAACACCUUCAAGCCCCACAGGCUUCAGGCCCGAAAGGCCAUGUGGAGGAAGGAACAGGACACCCGAGCCCUGCGGGAACAGAGCCAACACCUGGACGGUGAGCGGAUGCAGGCGGCGGCACUGAACGCAGCCUACUCAGCCUACCUCCAGAGCUACUUGUCCUACCAGGCACAGAUGGAGCAGCUCCAGGUGGCUUUUGGGAGCCACAUGUCAUUUGGGACUGGGGCGCCCUAUGGGGCUCGAAUGCCCUUUGGGGGCCAGGUGCCCCUGGGAGCCCCGCCACCCUUUCCCACUUGGCCGGGGUGCCCGCAGCCGCCACCCCUGCACGCAUGGCAGGCUGGCACCCCCCCACCGCCCUCCCCACAGCCAGCAGCCUUUCCACAGUCACUGCCCUUCCCGCAGUCCCCAGCCUUCCCUACGGCCUCACCCGCACCCCCUCAGAGCCCAGGGCUGCAACCCCUCAUUAUCCACCACGCACAGAUGGUACAGCUGGGGCUGAACAACCACAUGUGGAACCAGAGAGGGUCCCAGGCGCCCGAGGACAAGACGCAGGAGGCAGAAUGACCGCGUGUCCUUGCCUGACCACCUGGGGAACACCCCUGGACCCAGGCAUCGGCCAGGACCCCAUAGAGCACCCCGGUCUGCCCUGUGCCCUGUGGACAGUGGAAGAUGAGGUCAUCUGCCACUUUCAGGACAUUGUCCGGGAGCCCUUCAUUUAGGACAAAACGGGCGCGAUGAUGCCCUGGCUUUCAGGGUGGUCAGAACUGGAUACGGUGUUUACAAUUCCAAUCUCUCUAUUUCUGGGUGAAGGGUCUUGGUGGUGGGGGUAUUGCUACGGUCUUUUAAUUAUAAUAAAUAUUUAUUGAAUGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1124.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1165.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 671.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((....((((((((((((((..(((....(((......((....)).....))))))..)))))..))))))).)).))).((((((((((...))))))...))))..((.((((((((..((((.....((((((((((((((.((((((.(.((.((((((((((.((((.((((.....((((((........((((....))))..)))))).....)))))))).)))..(((((....))))).............)))))))..........((((..((((.(((((.....)))))..))))..))))...(((.(((((((.((....((((((..((((((((....)))))..(((..(.(((....))).)..)))((((.....((((((((...(((....)))(((((...(((((...(((.(((((((..(((((.......(((((((((((...(((((.((.(((((.((..((.....))...)).))))))))))))(((.((...((((((...(((((((..((((..((((.((((......(((((((..((.(((.....((((((.(((((...(((((((((...((.....))...))))))))).......))))).((.......))(((((((..(((((..(((((((((((((((((((((((....((((((((((.....((((.(((.............)))...))))...((((.........))))(((((........)))))...))))))))))...)))))))))))).))))).))))))((...(((.....)))..))....(((.......))))))))...)))))))))))))..)))))..)))))))......)))).))))...)))).............))))))).)))))).)).)))..(((((((((((.(((((....((....)).....))))).)))))))))))....)))))))))))....(((((...))))))))))..)))))))..)))...)))))...)))))........))))))))))))...)))..))))))..........((((...((((...)))).))))..)).))))))).))))))))))))...))))).))))))))).(((((.(((.....)))...)))))(((........))).....))))...)))))))).))......................(((((((.....(((((((((((((..(((...........................((((((((((((.((.(((((((.....((((((((((.....(((((((.((((.....))))........)))))))...............(((......)))(((((((((........((((((((((((((((((((.((((.((((((.......(((((((..(((.(((....(((....)))......))).))))))))))((((((((((..(.(((..((...)).))).)..))))))))))................)))))).))))..(((((((.((((..(((..(((((.......))).))....)))..)))).))))))).((((....)))).((((....(((((((.((((((((((((...(.((((..(.((......)))..)))).)...))))))))))((((((.((((((..........))))..)).))))))(((((((.....)))))))(((((.....)))))..((((.....))))....))))))))).....))))))))))))).)))))..............(((((.((((.((.((.(.((((.(((........))).)))).))).)).)))))))))........((((.((..(((((((.(((((...))))).(((((((....)))))))..........(((((((((.((.(((((((((((((.((((((((((.(((((((((.....(((.((...))..))).....)))))))))((((((((...((((((((..(......)..)))).)))))))))))).((((...........(((((..((((............(((((.......))))).....(((........))).......(((..((((........)))).)))...............(((((.....).))))...)))).)))))...........))))..)))))).(((((((((((....((((((...((((.((...........))))))))))))))))).......((((....)))).)))))).)))))))....)).)))))))).)).)))))))))...)))))))..))))))(((((.(((((....))))).)))))(((.((((...)))).)))((((.................)))))))))).)))))))))....)))).))))))..))))))).)).)).........................))))))))))))).)))))))))))))..)).)))))......(((.((((((....))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((({,....((((((((((((((..(((....{{{,.....{{....)).....)))})),.)))))..))))))).)).|({.((((((((((...))))))...)))).}||.((((((((..((((...,,((((((((((((((.((((((,({((.((((((((((.((((.((((..,,.((((,{....{{..((((....))))..)))))),}...)))))))).))).,(((((....)))))............,)))))))..........((((..((((.(((((.....)))))..))))..))))...(((.(((((((.({....((((((.,(((({{{{..,,))))),.|||.,(,(({..,,|}|,|,,||}((((.....((((((((,..(((....)))(((((...(((((...(((.(((((((..(((((.......(((((((((({.{,((({(,{{.{((((.({..{(....,)}...)).))))}|||||||((,.,{...{,,,{,..,((,(((({{((((..(({{.{{((,{{...{{{|||||,((,{{(((...}}|..|,|||||,..(((((((((...((.....))...))))))))).....{,||.|||||,,,,.....(((((((..(((((.,(((((((((((((((((((((((....((((((((((.....((({,,({({{,,........(((...)))...}))}}...)})))}},,,(((((........)))))...))))))))))...)))))))))))).))))).)))))}|,..,{{{.....))),})}....(((.......))))))))...))))))).}))))))})),)}})))))))}}...,||||{||||..{{,{{{.{......},}}))),,)).})),))})).),|{.(((((((((((.(((((....((....)).....))))).)))))))))))},..,))))))))))....(((((...))))))))))..)))))))..)))...)))))...)))))....,,,.))))))))))))...))),.}))))).,,}.,,,,.((((,.,((,,..,))}).))))..}).))))))).)))))}))))))...)))))}})))))))).(((((.(({.....}}},,.)))))(((........))),....))))...)))))))).||........,...........,,(((((({.....(((((((((((((..(((..........................,((((((((({({.{{.{{(((((,{,.,((((((((({.....(((((((.((((.....))))........)))))))...............(((......)))(((((((({........{{{{||||||{|||{{{|||.{{{||||(((({(..{(({({(({{..{((,((({{(((({,,|||||,,,...|}},}}}|||}|||((((((({{{||{.||{|.{,,.,},..,).}}.}}))))))}}................||||||.,,,,..(((((((.((((..(((..(((((.......))).)}..,.)))..)))).))))))),(({{,...}}}},||{|..,,||{{{{{.{,{{{(((((((...|,((((..{.{{......}},..)))).|...))))))))))||||{{.|{{{{{..,.....,.}})),})),))))))|||||||,,,..}}))})),{||{,,,..)))))|.((((.....)))).,}.)))))))))}..}})),,}}})))}}|,|||||,...,.{{......(((((.((((.((.((.(.((((.(((........))).)))).))).)).))))))))).,||.,,{((((.,,.,(((({{(.(((((...))))}.(((((((....))))))).........{((({(((((,((,((({((((({({..{(((,,.{{||(((((((((.....(((.((...))..))).....)))))))))((((((((...((((((((..{......)..)))).))))))))))))......|{|||{||,,.,|,..,{{|},,,{{{,,||..,||||...,,,,)))),{{{{{(({........||}.{{.,,,{.,,,{{,,.,|||||,||||,.,.....,,,,,,,.,,,(({{,.,,,,|.}|||,..|||||}}|||.......,..})))),....}.}}||||,,(((((....{(((((,..{(((.({.{......}..)))))))))))))))))....{(.((((....)))).)).}}))))))}})},,.)).))))})}).)).)))))))))...))))))),})))}}}|||||.,||||,,,,|||}|,||}}|{((.((((...))))}})}|,(({......})).......}))))})))).})))))))),,..)))).))))}},.}}|}}}}.}}.},........................,))))))))))))).)))))))))))))..)},))))}}}}...,,,.{{{{{,....}}))))},,))}
Back