Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_182923.4

Sequence Length

2352 nt

GC Content

0.5391

AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGUCGGCUGGGCUGCUGGUGCGAGGAGCCGCGGGGCUGUGCUCGGCGGCCAAGGGGACAGCGCGUGGGUGGCCGAGGAUGCUGCGGGGCGGUAGCUCCGGCGCCCCUAGCUGGUGACUGCUGCGCCGUGCCUCACACAGCCGAGGCGGGCUCGGCGCACAGUCGCUGCUCCGCGCGCGCGCCCGGCGGCGCUCCAGGUGCUGACAGCGCGAGAGAGCGCGGCCCUCAGGAGCAAGGCGAAUGUAUGACAACAUGUCCACAAUGGUGUACAUAAAGGAAGACAAGUUGGAGAAGCUUACACAGGAUGAAAUUAUUUCUAAGACAAAGCAAGUAAUUCAGGGGCUGGAAGCUUUGAAGAAUGAGCACAAUUCCAUUUUACAAAGUUUGCUGGAGACACUGAAGUGUUUGAAGAAAGAUGAUGAAAGUAAUUUGGUGGAGGAGAAAUCAAACAUGAUCCGGAAGUCACUGGAGAUGUUGGAGCUCGGCCUGAGUGAGGCACAGGUUAUGAUGGCUUUGUCAAAUCACCUGAAUGCUGUGGAGUCCGAGAAGCAGAAACUGCGUGCGCAGGUUCGUCGUCUGUGCCAGGAGAAUCAGUGGCUACGGGAUGAACUGGCCAACACGCAGCAGAAACUGCAGAAGAGUGAGCAGUCUGUGGCUCAACUGGAGGAGGAGAAGAAGCAUCUGGAGUUUAUGAAUCAGCUAAAAAAAUAUGAUGACGACAUUUCCCCAUCCGAGGACAAAGACACUGAUUCUACCAAAGAGCCUCUGGAUGACCUUUUCCCCAAUGAUGAAGACGACCCAGGGCAAGGAAUCCAGCAGCAGCACAGCAGUGCAGCCGCGGCUGCCCAGCAGGGCGGCUACGAGAUCCCCGCGCGGCUGCGGACGCUCCACAACCUGGUGAUCCAGUACGCCUCGCAGGGGCGCUACGAGGUAGCUGUGCCCCUCUGCAAGCAGGCCCUGGAGGACCUGGAGAAGACUUCAGGACACGACCACCCGGACGUGGCCACCAUGCUCAACAUCCUGGCCUUGGUGUACAGGGAUCAGAAUAAAUACAAAGAUGCAGCUAACCUACUGAAUGAUGCCUUGGCUAUUCGUGAGAAAACUUUGGGCAAAGAUCAUCCUGCGGUGGCGGCGACUUUGAAUAACCUUGCAGUCCUUUAUGGUAAAAGAGGGAAGUACAAAGAAGCAGAGCCGUUGUGUAAAAGAGCUCUGGAAAUCCGAGAAAAGGUUUUGGGGAAGGAUCACCCCGAUGUUGCCAAGCAGUUAAAUAACUUGGCCUUACUGUGCCAGAACCAGGGCAAGUAUGAAGAAGUAGAAUAUUAUUAUCAAAGAGCCCUCGAGAUCUACCAGACAAAACUGGGACCUGAUGACCCCAACGUGGCUAAGACGAAAAAUAACCUGGCAUCCUGCUAUUUGAAACAAGGAAAGUUCAAGCAAGCAGAAACACUGUACAAAGAGAUUCUCACUCGUGCACAUGAAAGGGAGUUUGGUUCUGUAGAUGAUGAAAAUAAACCCAUCUGGAUGCAUGCUGAAGAAAGAGAAGAAUGCAAAGGAAAGCAAAAGGAUGGGACAUCUUUUGGAGAGUAUGGCGGCUGGUACAAAGCCUGCAAAGUUGAUAGUCCAACUGUUACAACCACUCUAAAAAACCUUGGGGCACUUUACAGACGUCAAGGCAAAUUUGAAGCUGCAGAAACGUUAGAAGAAGCUGCUAUGAGGUCUCGUAAACAGGGUCUUGACAAUGUUCACAAACAGAGGGUGGCAGAAGUGCUCAAUGACCCUGAGAACAUGGAGAAGCGCAGGAGCCGUGAGAGCCUCAACGUGGACGUGGUCAAGUACGAGAGUGGCCCUGACGGAGGGGAGGAAGUGAGUAUGAGCGUAGAGUGGAACGGGGGCGUCUCUGGCCGAGCCUCUUUUUGUGGAAAACGACAGCAGCAGCAGUGGCCUGGAAGACGCCACCGCUAACUGACCCCGACCUGGCCCCGCUCCAGGAUGGGACUGCCGAGUGUGGCCCGGAGCUGGCCCGGGACAGCCAGGGCGGCAGGGAGGGCCCCUGGCCGGGAGCCGCAGCGCUCACUCAUUUCUCCUGCGUCUGUGUGCAUAGGACAUGAUACUAAUAACCACACGGCUGGCGUGACCUUGGGGCUGGGGCUGGGCCUAAGCUGGUGCCCUGGUGCGGCGUGGUCUCUCCCAGGAGACCUGGGGCAUGAGCUGGGCCCACGGCUCCCUUCCCAUGUGUAACUUCCUCACGUUGUGUGCGAUAACGUAUUUUAUUGUACAUUUUUUUAAAUUAAAAGUUUAUAUGCCUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-868.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -910.70

Frequency: 0.0000

Diversity: 535.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.........((((..((((((.(((.(((((.(((.......))).))))).))).))))))(((((.((((((((((.((((((.....))))))..((((.(((((((((.((((...(((..((..((((((....))))))..)).)))(((.((((((((.(((((((((((((........))))))....)))))))))))))))))))))).)))))))..(((.(((((((..(((((...)))))..).)))))).))).(((((....(.((.(.(((..((((...)))).))).).)).).(((((((((...((((((((((..((((((.((((((((((((((((((.......)).)))))))).((((((((.((((((((.((((((..........)))))).)))))))).((..((((((....))))))..))...((((.(((..(((...((((((..(((...((.(((((..(((((......))))).))))).)).)))((((((.(((((((.(((((.((..((((...)))).)).))))).....(((((((((((....((((...(((((((.((.((((((((..((((((((..........)))).)))))))))))).))...)))))))......))))...(((((.((..((((.((.(((....(((((.(((((.(..(((((...((((........))))..........)))).)..).))))))).))))))..)).)))).)).)))))........((..((((((..((((...(((..................))).)))).))))))..)).((((....))))((((((((((((((....))))))).............))))))).)))..))))))))..((((....))))...)))))))((((((((..(......)..)))))))).......))))))........(((((((....))))))).((((.((....)).)))).)))))))))))).))))(((((((((.....))))).))))................)))))..))).........(((((......(((....)))......)))))....))))))))..)))..)))..)))))).....))))...)))))))))......(((((.............((((((..((......))..)))))).....((.......))..((((((........))))))....((((((...........))))))(.((((.((((........)))))))).)..((((((......)))).))......)))))........((((......))))..))))))).))))..)))))))..............))).)))))(((((.((((((.(.......)))))))..)))))......(((((((.(((((......(((((((((((..(((((((((((((((.((((.((((........(((((((...(((((.((...........)).))))).............))))))).)))).)))).))).....((((((.......)))).))..(((((......)))))......))))((((((......))))))...(((((((((.(((.((((..(((....((((......).)))..)))..)))).))).)))).)))))(((((((((((((....((((.........))))......)).)))).)))))))...((((((.((((....((((((((...(((((((.(.(.((...(((((.((.......(((((..((((.(((((((...((((((..((((((...((((..(((.((((((((((((((.((..((..((((.(....).)))).))..))..))))).)).))))))).)))((..(((...(((.((((((((((..((((..((((.((((.....))))))))...))))..))))...)))))).))))))..))((((...)))).....)))).))))))))))))))))))).)))).(((((..(((.........))).....)))))))))))).))))))).).).)))))))(((((((.(((.((((((((.........(((((((....))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))..))))))))..)).)))))))))......))))).)))))))......((((((...))))))..))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

......((({{{{,,((((((.(((.(((((.(((.......))).))))).))).))))))(((((.{(({(((((({(((,((.{{{,||}|||..{(((...{|{|{{{}||{|},,||{,,((,{{((((({.,.}},}}).}))})))|||.((((((((.(((((((,(((({.,......,,))})}}}.))))))))))))))))))))))})))))))}.(((.(((((((..(((((...)))))..).)))))).))).(((((.{{{{{({...{{(..{{(,.,,|||},||..|,}}},.|||{{{{{{...{((((((,,{..(((..(.((((((((.,{({{{(((.......}}.}}}}}||((((((((((.((((((((.((((((.,........)))))).)))))))).((..((((((....))))))..}}...((((.(({.,(((...((((((..((,...||..,((({.(((((..,{{{||||,{,||||{{{{(||,((((.....|})}.(((((.{(..((((...)))).}).)))))..{(((((((({(((({{..((((...(((((((.((.((((((((..((((((((.{,...,}..)))).)))))))))))).))...)))))))......||||.....,,|.,|}}||}}}}..)||...{(((((.(((((.(..((((({,.,,(({..{....,,,,..,.......)))).}..).))))))).)))},)},}..,,,,.)),})))}......,,((,,((((|{..{(((,,||||...,..,........,}}))).,})),}))))),})),,|||,}}..|((((((((((((((((....)))))))..{{.,.....}})))))))))})}.)))))))).}||||}}}|||||...|(({|{{((((((((,,(...,,,),.}}))))))..,,..}})))),}}}),...(((((((....))))))).{{{{.{{..,,)),)))).)))))))))))).))))(((((((((.....))))).))))................}}}),..))}.))))}}..{((((.|,.,.(((....)))..,,..))))}....)))))))).,,})}},}),,)))}},....})))),..||||||}}}......|||||.............((((((..((......))..)))))).,,{{((,,,....||||{(((((........))))},....((((((..,........)))))){.((((.((((........)))))))).|,.,,{(({.....,)})).)}...,,})))))}.},}...((((......))))..))))),}.})))..})),))}....,,........}}},|||}}(((((.((((((,(.......)))))))..)))))......(((((((.(((((......(((((((((((..((((((((,{{((((.((((.((((........(((((((...(((,{.((...............,,},..}....})}...))))))).)))).)))).))),..,,{{((((.......)))).})..,(((({{{{,.,,)))}},,,.})},((((((......))))))...(((((((((.(((.((((..(((....((((......)},}}..)))..)))).))).)))).))))}((((((((((((,.(,{(({{.........))}|||....)),)))).)))))))...((((((.((((....((((((((...(((((((.{,(.,,{,.(((({.,{,{,...,|((((..((((.((((({{,,(((((({.,((((((...((((..(((.((((((((((((((.((..((..((((.(....).)))).))..))..))))).)),})))))).))),,..,,,..((((.((((({(({(,,(({(,.({({,(({{..,,,})})))}),,,)})).,))))...||||||,,|,{||....|,|}}}})))))))..)))).))))))))))))))))))).)))).(((((..({{.........)},.....)))))}}}}.}),))))),)}),)})))))))((((((,{(((.(((((((({,....{.,(({{{{,.,,,,)}))))}))))))).))))))))))))))))))))))))))))..))))))))..)),}))))))))......))))).)))))))..,,,,{{,,,,,,,}},,,,..))))...