Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_183352.3
Sequence Length
1359 nt
GC Content
0.5475
GUUCCGAGGCGCCGCCGGGAGCUGCCACGUCCGAGACCUGGAGCAGCCACCGCCGCAAUCAUGGUGUCAGUAAUUAACACUGUGGAUACCUCCCAUGAGGACAUGAUUCACGACGCCCAGAUGGACUACUAUGGCACCCGCCUGGCAACCUGCUCAUCAGACAGGUCCGUCAAAAUCUUUGAUGUGCGCAAUGGAGGGCAGAUCCUUAUCGCCGACCUCAGGGGUCAUGAGGGUCCUGUGUGGCAAGUGGCCUGGGCUCACCCCAUGUACGGCAACAUCCUGGCAUCGUGCUCCUAUGACCGGAAAGUCAUUAUCUGGAGAGAGGAAAACGGCACCUGGGAGAAGAGCCACGAGCAUGCGGGACACGACUCCUCAGUGAACUCGGUGUGCUGGGCCCCCCAUGACUACGGCCUGAUCCUGGCCUGUGGGAGCUCGGAUGGGGCCAUCUCCCUGCUGACUUACACCGGGGAAGGCCAAUGGGAAGUAAAGAAGAUCAACAACGCUCACACCAUUGGCUGCAAUGCCGUCAGCUGGGCCCCUGCUGUUGUACCUGGAAGCCUCAUAGACCACCCAUCGGGGCAGAAACCCAAUUACAUCAAGAGGUUUGCAUCAGGUGGCUGUGACAACCUCAUCAAGCUGUGGAAGGAGGAGGAGGACGGCCAGUGGAAGGAGGAGCAGAAGCUAGAAGCGCACAGUGACUGGGUUCGAGAUGUGGCCUGGGCCCCCUCCAUCGGCCUGCCCACCAGCACCAUCGCCAGCUGCUCCCAGGAUGGUCGUGUGUUCAUUUGGACCUGUGAUGAUGCCUCAAGCAAUACGUGGUCCCCUAAAUUGUUGCACAAGUUCAACGAUGUGGUGUGGCAUGUGAGCUGGUCCAUCACAGCCAACAUCCUGGCUGUCUCUGGUGGAGACAAUAAGGUGACCCUGUGGAAGGAGUCAGUUGAUGGGCAGUGGGUGUGCAUCAGUGAUGUCAACAAGGGCCAGGGCUCCGUAUCAGCAUCAGUGACAGAGGGCCAGCAGAACGAGCAGUGACAAGACAGGUGGGGCCUGGCUCCCCACCCGCCAGCUCCAGGACUGCCCCUUCCUGGGCCAACUAACCAGACAACUGGGAAGAGCCCCCAACUCCAACAGGAUUAUUUUCCCAGGAGGAGUUACAGAUGCAGCCACAGAUUGAUCAUCUGCCUUAACGUGAUCGGAGAUGCUUUGUAAUCUACUGUCCAGCUGAAAGCACUCAUGUUACGAGGAAGAAACUACAAGUGAUGUUCAAAUCUAUUUUGGGUCAUUUUUAUGUACCUUUGGGUUCAGGCAUUAUUUGGGGGGUUUUGUUUCCAAAGGAACUAAAUAAAGUCAUAUUGCUUAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-491.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -513.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 275.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.((.((..(((((....((((.....)))))))))..)))).))...((((((((.........))))))))....((((....))))........(((((.(((..((((..((((.((((.....(((((((.((.(((....((.(((((.((.(((..((((((((.((..((....((((......))))...))..)).))))))))..))).)).))))).))))).)).))).)))).....))))))).)....))))..))).))))).((((....(((((.........)))))....))))....(((.((.(((((...((((..((((..(((((.(((.........))).....((.(.((((((((((((.((.((..(((((.((((.(((((...)).))).)))).)))))...((((((.((.....)).)))))).(((((((((..(((................)))....))))))))).((.(((((((.(((((.((((((.((.((((..(((..(((((..............)))))......)))..)))).)).((((((..((.(((....)))))..)))))).....(((((((.(((..(((((((..((((...((..(.(......(((.((((..((.....))..)))).)))....).)..))..)))).))))).))..)))..))).))))..((.((((.(((((((((((((((...(((....)))((((..((((((((..(((...(((..((((((.(.(((...(((((((........)))))))..)).).).)))))).)))))).)))))))))))))))))))).(((((((...)))))))...((.(((((((.....))).)))).))...))))))).))))))..(((.((((((......((((....)).))......)))))).)))))).)))))))).).))).))).))...)).)))).)))))))))).).)).)))))..))))..)).))....))))).)))))......((((....))))..(((((((((((((((..(.(((......)))..)..)))))).(((((((((.......)))..))))))(((...((((((..(((.((((((...................)))))))))..))))))))).........(((((((((((..((((((....((..(((....)))..))..))))))..)))))))))))))))))))))))))....)))))......((((......))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({((({((.(,(((..(((((,..{((,,.,,,.})),)))))..)))}.))..{((((((((.,.......))))))))}...((((....))))...,....(((((.(((..((((..((((.((((.....(((((((.((.(((....{{.(((((.((.(((..((((((((.((..((.{,,((((,....,))))}}.))..)).))))))))..))).)).))))).))))).)).))).)))).....))))))).)....))))..))).))))).((((.{..(((((.,....,,.)))))..,.))))....(((.((.(((((..{((((..((((..(((((.(((,,.....,.))).....((.(.((((((((((((.((.{{..(((((.((((.((({{...,}.))).)))).)))))...((((((.((.....)).)))))).{((((((((..{((................}})....))))))))|{((.(((((((.((((({(((((({(({((({,.(((..(((((,{,{.{{,,{{,,.|||||.....}))....,,,.,..((((({,,((.(((....))))).,)))))).....(((({((.{((..{{(((((..((((.,.((..(.{....|.(((.((((..((.....))..)))).))),...}.)..)),.)))).))))).)}.,))}.,))},|}})..{,,((((,{{{(({{((((((((,,.{{{....},,{{((.,((((((((..(((...(((..((((({,{{{{(,,.(((((((........))))))).})).).)})))))).)))))).))))))))))},)))))))).{(((((|...))))))}...,{.(((((((.....))).)))).)}||||}|||}}.}}))}||||||.||||||......||||}.}})))))},..,,)))})),}},))).)))))))).),})).))).)).}.}}.)))).)))))))))).),)}.)))))..))))..)).)).,..))))).)))))......((((....))))..{((((((((((((((..(.(((......)))..)..)))))).(((((({({.......,))..))))))(((...((((((..(((.((((((.....,.........,...)))))))))..))))))))).........(((((((((((..((((((....((..(((....)))..))..))))))..)))))))))))))))))))}}}}))....)))))......{{{{......))))....
Back