Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_187841.3

Sequence Length

1930 nt

GC Content

0.5979

AAACAGUGCUACCCACAGAGUGAACAAGAGAGAGUCAUUUGGGAAACAAAAGGAGAAUUUUACAGAGAGAGAGGGAUAGCUAAAACUACGUGAGCCUGGCGAGGGUGCAGAGCAGAAAGUAGAGACUGUCCGAAGACUGCUAUCUGGGACGAGACAAGUUGUUAAAGGGACAGGAGAGAAAGCAGAGCUAUUUCAAGAGUGAGCCACAGAAGGGAAUCCAGAGGCCAUCUAAGCGAGGAAGGGUCUACAGGCAGUGAGUGAAGGCCAGGAGCAGGGCCCAGGCCAGGCACGACCACCGAGGGGAUGAACUUCACAGUGGGUUUCAAGCCGCUGCUAGGGGAUGCACACAGCAUGGACAACCUGGAGAAGCAGCUCAUCUGCCCCAUCUGCCUGGAGAUGUUCUCCAAACCAGUGGUGAUCCUGCCCUGCCAACACAACCUGUGCCGCAAAUGUGCCAACGACGUCUUCCAGGCCUCGAAUCCUCUAUGGCAGUCCCGGGGCUCCACCACUGUGUCUUCAGGAGGCCGUUUCCGCUGCCCAUCGUGCAGGCAUGAGGUUGUCCUGGACAGACACGGUGUCUACGGCCUGCAGCGAAACCUGCUAGUGGAGAACAUUAUCGACAUUUACAAGCAGGAGUCAUCCAGGCCGCUGCACUCCAAGGCUGAGCAGCACCUCAUGUGCGAGGAGCAUGAAGAAGAGAAGAUCAAUAUUUACUGCCUGAGCUGUGAGGUGCCCACCUGCUCUCUCUGCAAGGUCUUCGGUGCCCACAAGGACUGUGAGGUGGCCCCACUGCCCACCAUUUACAAACGCCAGAAGAGUGAGCUCAGCGAUGGCAUCGCGAUGCUGGUGGCAGGCAAUGACCGCGUGCAAGCAGUGAUCACACAGAUGGAGGAGGUGUGCCAGACUAUCGAGGACAAUAGCCGGAGGCAGAAGCAGUUGUUAAACCAGAGGUUUGAGAGCCUGUGCGCAGUGCUGGAGGAGCGCAAGGGUGAGCUGCUGCAGGCGCUGGCCCGGGAGCAAGAGGAGAAGCUGCAGCGCGUCCGCGGCCUCAUCCGUCAGUAUGGCGACCACCUGGAGGCCUCCUCUAAGCUGGUGGAGUCUGCCAUCCAGUCCAUGGAAGAGCCACAAAUGGCGCUGUAUCUCCAGCAGGCCAAGGAGCUGAUCAAUAAGGUCGGGGCCAUGUCGAAGGUGGAGCUGGCAGGGCGGCCGGAGCCAGGCUAUGAGAGCAUGGAGCAAUUCACCGUAAGGGUGGAGCACGUGGCCGAAAUGCUGCGGACCAUCGACUUCCAGCCAGGCGCUUCCGGGGAGGAAGAGGAGGUGGCCCCAGACGGAGAGGAGGGCAGCGCGGGGCCGGAGGAAGAGCGGCCGGAUGGGCCUUAAGGCCUGCGCCGACCCGACCCUGCUCGAGAGCCCGCGCUAGAGUCGGGGAGGAUCUGCGCAGAGACCGCAGCAUCACCCAAAUCGGCGCCGGCCCCGGGAGGAUCUCAAUAAAGAACUCGAGCGUCCCAGACCCGUAUCUCCUUUCGCUGCCCAACCCCGCAGCCUGGGCUUCGAAGGCGACCCGCCCACCAUCCUGCCCUUCCCAGAACCUGAGACCGUCUGGGGGGCGGAAGCCAAAUGAACCCCUAUUGGGCACCUCUGUGAUGCCAGGAGCGAACUGGUGAGCCCAGCGCCCUGGGAAGAGGGCCGAGGGCGGGGCGGUGGUGCCGGGACCUCUGAGGUCCUGGGGAUUUGGGGACCCUUGGGGUCCACAUGCACCUGGCUGACCUGGCUGAAAGCCGCUGUCUCGGAGCCCCCCACAGCAUUUUGUUCCCCUCCCGCUGGCCCGGGGGCCCCACCUUCCCACGGGUUCCCACGCUGCUGUGACUGCCCUGCCUCUACGACAAAAGCCAACGGGUCUUCAGUACUUUUAUUAAAAAAUAGUCACGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-776.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -807.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 432.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.......(((((((.............((((...((.((((.....))))..))...))))...........))).))))(((((.(((..((.(((((((((((.((((.((((..(((((...((((((...(((.(((.(((......)))..))).)))....))))))..((((.(((...))).))))....(((...)))....(((((((((((.....)))..(.(.((((((......((((((((.((...(((((((((((((((((((((..((((.((.(((((.(((((.((((.((.((((((........))))))((((((((((....(((.((((.....(((......))).)))))))...))))).))))).)).)))))))...))..))))).)).))))..)))........(((.(((((....((....))....((((((.(((((((..((((((...((..(((((((.(..(..((((((((((((((((.(((.......(((((....).))))......)))..))))))..))))))))))......(((((((((....((((((((((..((......))..))))....))))))((((((((..((.(((.(.(((((..((((.((.((((((((((.((..((.(((((((...((.....))....)))).)))))..))))))))))))....((((.((((..((...((((((((((((((((.....)))).))((((..((((..((.((((((.....((((((....((((((.((....)))).))))....))))))(((.((.......)).))).....(((....))))))))).)).)))).))))...))))))))))....)).))))))))..((((((.(((((((...))))))).)).)))))).))))..)))))))))))..)))))).))))))))))))..).))))))))).))))))...(((((..(((....))).((((.((((((.(...(((.(((.(((.....(((((((...((((((((......))).)))))....(((((.(((.....((((((((......)))).((((...((.((........)).))..))))..(((((.(((...((.((((...(((((((..(((.(((.....))).)))..)..((((((.....)))))).....))))))...))))))..))).))))).....))))))).))))))))))))...))).))).))).).))))))))))...))))).)))))))))))))...)))))))).))))))))..((((.(((((((.(((((.((((.((......)).)).)).)))))((..((((((((.......))))).)))..))...))))))).))))..((((.(..(((............)))).))))....(((.((((((....(((((........)))))..((((((((.(((...((((((((((.((((((((((((((((.(........))))))).(((....)))................(((.(((((....(.(((((.(((..((((.....)))))))))))).))))))))))))))))))).))))).).)))).))).)))))))).)))))).)))((((((...))))))...........)))..)))))))....)))))))))).((.((((((..((((................))))....)))))).)).))))))).)))))))))...)))))....)))).)))))))).).......))))..)).))....))).)))))..................

Thermodynamic Ensemble Prediction

....,((((({(((,..,((((,.(........}))))))}}}........,,,...||||....,,,,.,,{{{.||{|{...,{{,({(,,(({((,((((((.((((.((((..(((((.,.((((((...(((.(((.(((......)))..))).)))....))))))..((((.(((...))).))))....(((...}}}....((((((((.{,((((.,,...{{(.(((,(((...,{(((((((,{(,{..(((((((.(((((((((((((..((((.((.(((((,((({{,{,.{{||.((((((........))))))(({((.,((((.....)))),.....)))}}.|,,||{|.,,..)}}),}||,|||..{(({({...)))))}..,),,))))).)).)))),.)))........(((.(((((...,((....,,,,}.{(((((.(((((((..((((((...((..(((((((.(..,..((((((((((((((((,(((.,.....(((({....}.))))....,.)))}.))))))..})))))))))......(((((((((,...((((((,((({{{,......,}..,,))}}}.)))))){{((((((..({{(((.(.(((((..((((.((.((((((((({.((..((.(((((((...((.....))....)))).)))))..))})))))))))....((((.((({{.((...((((((((((((((((.....)))).))|(((..((((.,({.((((((.....((((((....((((((.((....)))).))))....))))))(((.((.......)).))).....(((....))))))))).)).)))).))),...})))))))))....)).))))))))..{(((((.(((((((...))))))).))}}))))).))))..)))))))))))..)))))).))))))))))),..),))))))))).))))))...(((((.,(((...,))}.((((.((((((.{...(((.(((.(((.....(((((((...((((((((......))).)))))....(((((.(((.....((((((((......)))).((((...{,.(({{{{....,)}))}}))))..(((((.(((...((.((((...((((({,..(((.(((.....))).))).{|..((((((.....))))))}}...})))))...))))))..))).))))).....))))))).))))))))))))...))).))).))).}.))))))))))..,))))).)))))))}}}))).,.)))))))).})))))}...((((.(((((((,(((((.((((.((......)).)).)).)))))|(..((((((((.......))))).)))..)}...))))))).))))..((((.(.,(({............))}).)))).,.{(((.((((((....(((((........)))))..((((((((.(((...((((((((((.((((((((((((((({.{........))))))),(((....)))................(((.(((((....{.(((((.(((..((((.....)))))))))))).}))))))))}))))))))).))))).)}}))).))).)))))))).)))))).)))|(((((...)))))}...,)}.)))))))..))),))),...}})|||||,..((.,,,|||.}||||....,},..}},}}}}))))}}},|||||}.},.,}})))}..)))))))).,.)))))....)))).)))))))).}}.},...)),.,}))))}})}}))}})}}}.........,,,.,.....