Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_194458.2
Sequence Length
2389 nt
GC Content
0.6015
GGUUCCGCCCCGCGAGCGGCCAUCUUGGAGGCUGAGGCGGCGGCGGCGGCGCUGCGGCGGGUUCGGUGGGCCCAAUCCCGGGGCGGUGCGGCUGUUUCGGGCGCGGGCCCCGCUUUUCCGCACCCUGCUCCGGCCUCGACUACGGCGAGCCUGAGCGCGGCGGCGGCCCACGCGCAGCGACAGGGAGAGAUGAGCAGCACCAGCAGUAAGAGGGCUCCGACCACGGCAACCCAGAGGCUGAAGCAGGACUACCUUCGCAUUAAGAAAGACCCGGUGCCUUACAUCUGUGCCGAGCCCCUCCCUUCGAAUAUUCUCGAGUGGUAAGGCUCCGCGCCACUGAUCGCCCUGCGCUGACUGUCGCUGCCACGCAGGCCUCUGCCGGCCCCUGCUGGGCGAGCCUGGUGCCCCAGUCAUGGCAUUGGCAAGGUGCUCCUGCACCCUCCCCCGGGGCACUAUGUCGUCCGAGGCCCAGAGAUGACCCCUUAUGAAGGUGGCUAUUAUCAUGGAAAACUAAUUUUUCCCAGAGAAUUUCCUUUCAAACCUCCCAGUAUCUAUAUGAUCACUCCCAACGGGAGGUUUAAGUGCAACACCAGGCUGUGUCUUUCUAUCACGGAUUUCCACCCGGACACGUGGAACCCGGCCUGGUCUGUCUCCACCAUCCUGACUGGGCUCCUGAGCUUCAUGGUGGAGAAGGGCCCCACCCUGGGCAGUAUAGAGACGUCGGACUUCACGAAAAGACAACUGGCAGUGCAGAGUUUAGCAUUUAAUUUGAAAGAUAAAGUCUUUUGUGAAUUAUUUCCUGAAGUCGUGGAGGAGAUUAAACAAAAACAGAAAGCACAAGACGAACUCAGUAGCAGACCCCAGACUCUCCCCUUGCCAGACGUGGUUCCAGACGGGGAGACGCACCUCGUCCAGAACGGGAUUCAGCUGCUCAACGGGCAUGCGCCGGGGGCCGUCCCAAACCUCGCAGGGCUCCAGCAGGCCAACCGGCACCACGGACUCCUGGGUGGCGCCCUGGCGAACUUGUUUGUGAUAGUUGGGUUUGCAGCCUUUGCUUACACGGUCAAGUACGUGCUGAGGAGCAUCGCGCAGGAGUGAGGCCCAGGCGCCGAGACCCAAGGCGCCACUGAGGGCACCGCGCACCAGAGCGUGACCUCGGCAGGCUGGACACACUGCCCAGCACAGGCAGACCCACCAGGCUCCUAGGUUUAGCUUUUAAAAACCUGAAAGGGGAAGCAAAAACCAAAAUGUGUGACUGGGCUUUGGAGGAGACUGGAGCCUCAGCCCUGUCCUGGCCACGGGCCGCUGGGGCUGGUGUGGGUGGGCCUUGUGUGCUGGAUUUGUAGCUUAUCUUCCGUGUUGUCUUUGGACCUGUUUUAGUAAACCCGUUUUUCAUUUUAUUAGAUGUGGUCACUUAGAAAUGCAAACUUGCUGCCGACCGCGGGCUGCUCCUGCGUUCUUGGAGCUCCUGGCGCGUUUCUCGGAGCUCCCGGCUCCUCAGCGGGUGGGAACCUCGGGGCCCAGGGGUGGAGCUGGCGUCCGCGGGUGCUGGUCUGGCCUGGCCGUGUGGUGAUGAGGCUUAGCGGGGCCAGUGACGGCCGUGGCUCAGGAUCCAUAAGUCGGGGUUUGGUCUCAGCAUUUACAAAUGUGUUUACAGUCAGAAUGAAACACAUUCCUUCUAGAAAGUGCUUGGGGGUUUUUGCUGCCCUGGAAGCCAGGAGCCUGCUCACUCCAACCACAAGUCGCCCUUGACUGCGGCGGCCGCGAGCGGGGCGGGGGCUGCCGGUGCCCUCCGCAGGCCGGGCCUCCUGGGCGCCCCUCGGUGCUGCAGGCUGGGGGGCCUUGGGUACCUGCAGAGCCUUUUCUCUGAAUUCCUUAUGUCCGGUGGGCCAGAAGCCCGUCCUCCUAUGCUGGUGGAAGGCGGAGGACCGGAGUCCCUGCAGAAGGCCCCGUGCACUCGGGGGCCUCCCUCACAUCCCGUGCCCCCUGCGCUGGCCUUCACAGUAGGUAAUGGCUCCGGCCCGGGUGUUCGCUGUCCACGGAACAUGGCAGAGGGGCACCCCGGCCCGGAAAGACGCCAGAGCCAGCAGGGGCUGUUUCGGGCCGCGUGGCUCCCCGGGUCUCGGCCGUCUCCCCUCUUCUGCGUCUGUUCCGUGACUUCGCCUGGGUGGGAUGUACCGCAGGUGCAUCGCGUCGAGGUGGGGCACGGCCGCCGGCAAGAAACCCACCCUGUCCGGAGGCGGGCGUGAGACAAGCCCAGCCCGCACGCGCUCAUCUUUCUUCGUUUUUUGAUCAGUUUAUUCAGAAUUGCUCUAUAAUUUACCAAUUGUAUGUAUUUAACCUAUUCUUGUGGAAAAAAAAGGUCUUUCAUUAUAUCUUUAUUUCUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1034.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1072.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 507.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((...(((((........))))).....)))).)))))((((((((.(((...(((((((((...(((((((((((...)))))))))))...))).))))))...((((..(((((((.(((.(((.(....))))))).))))).))..))))))).).)))))))((.(((((((((((((((((...((((.(((((((..(((....)))......(((((((((.(((((....)))..)).........(((((((.((..(.((...((((.(((((...((.(((((......))))).))...))))).))))...)))..))...((((.....).))).(((((((.(((((....(((((((((((((...(((((((((.(((.((((......))))..(((((....))))).......)))(((((..(((((((........).)))))).((((...)))).((..(((.((..((((((.....))))))..)).)))..))....(((((((((((((((.....))).)))......))))))))).)))))..)))))))))((((((((((.....((....))..(((((((...((((...((((((((((((((((((((...(((...((((....))))))))))))))).((((.....))))((((............(((.......))).......(((((((((.(.((.(((((.(..(((((((((((((...)))))))..))))))..).))))).)).((((((((......(((((((...((((((........((.((.(.((((((((.((((((((((((((((....))))....)).))))))........(((.....)))((((((((((((....(.(((....))).).(((((((.....(((((((((.(((...((((((((((((((((.(((((.((..(((..((((((.(((.(((((.(((((..(((.(((((...)))))..)))..))))).))))).)))((((((((((...((((((((((..(((((.((((((.........)))))).((((((.(((.((........))))).))))))((((((((((((((((((((((((((((..(((((((.((((((..(((((.(((((......(((....))))))))..))))).........(((.(((((...((((.........))))))))).))).(((((...)))))..)))))).).))))))..)))...))))))))....)))...........))).)))))..)).)))).(((((((((............))))))))).((((((..........(((....)))....)))))))))))))))))))))....((((((((.((.......)).))))))))..))))))))))...((((..(....)..))))))))))..))))).)))))..))))))))).)))))))(((....)))...))).))).)))))).....)))))))))))))..))))))...)))))))))))).))).))........(((((((((.((.......)))))))))))...........))))))....)))))))..(((((((...))))).))...))).)))))........(((((((.(..(((((...)))))..))))))))).)))))))))))))...)))))))))))).((((((.((((((((((.......))))))))))))))))......(((((......)))))..))))...))))))).((((.....))))(((((((...(((.......)))))))))).(((((((((((.(((((((..(((((...(((((((.............).))))))))))).)))))))...)))))....))))))((((.((((((((.(((.(((.......))))))..)))))))).)))).)))))))))).....)))))))))))))....))))))))))))...))))))))))))).))).)))))))))))...)))).((((.((((((((.((((.((((((((...)))))))).)))).))))))))))))(((.((((((.(........).)).)))).)))((((.........)))).((......))))))))))))))).)).((((((.........)))))).(((..(((((((....))))))).)))...)))).........(((((..((((((.(......).)))))).)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((...(((((........)))))..}}})})),))}}}((((((((.(((...(((((((((...(((((((((((...)))))))))))...))))))))))...((((..(((((((.(({{(((.(....))))))).))))).))..))))))).).))))))){(.(((((((((((((,(({...((((.(((((((..(((....)))......{((((((({.(((((....)))..))........{(((((((.(,....{{...((((.(((((...((.(((((......))))).))...))))).))))...,},..}}...((((.....).))).(((((((.(((((....((((((((((((({(,((({((((({(((.((({......))))..(((((....))))).......)))|||||..|||||||..,,,...}.||||||{(({,...|||}.||..{||.||..((((((.....))))))..}},|},..,}}))}(((((((((((((((.....))).)))......))))))))).,|||,..}})}}||||((((((((((.....((....}}..(((((((...((({,.,(((((((((({((((((((({..,({,,,(({{.,,.}))}}|)))))))))}{{((||{,.}}|}((((,,{...{,,,{{((,...,,{,|||...|||.,(({{((((,(.{{.{{{{|,|..({{{{{{{{(({{...))))))),,)))})},,|,||}}}.}},{{{|||||,.....,,,{,,{...{{{{{{..,,,,..||,,{.{.((((((((.(((((((((({{((((....))))....}}.)))))),.,..,||||||....,},((((((,((((({...,,|||,.},|||{,.(((((((.,...(((((((((,(((...((((((((((((((((.(((((.((..(((..((((((.{({.(((((.{((((..(((.(((({...}))))..)))..))))}.))))).}}|((((((((((...((((((((((..(((((.((((((.........)))))).{(((((.((,{((.,......))))).)))))|(((((((((((((({{{(((((((((((..((((((({((((((..(((((.(((((,.....(((....))))))))..}}})).....,,..{,{.{((((|,|({{{...}}}}}})))||||||{|}}.{((((...))))).,))))))}}.))))))..)))}..})))))))....||||..........}))|})))}..}).)))).(((((((((............))))))))).((((((....||..,.{{,....,})}},.)))))))))))))))))))))....((((((((.((.......)}.))))))))..)))))))))),.,{(((..(....)..)))}))))))..))))).)))))..))))))))).)))))))(((....)))...))),))).))))))...,.))))))),)))),,.))))))...}))))))))))),)}}.||,,,,,...(((((((((.((.......))))))))))).......,..,)))))),}},)))))))|,||(((((...))))).}|,,{|||.|}}|..||.|..,((({{{,,|,|||{||..,}})})}}))))|||||,||}}}}}}})))),,,})))))))))}}.((((((.((((((((((.......))))))))))))))))......(((((......)))))..})))...))))))).((((.....))))(((((((...{{(...,,..)))))))))),(((((((((((.(((((((..(((((...((((((,.............).))))))))))).)))))))...)))))....))))))((((.((((((((.(((.(((.......))))))..)))))))).)))).))))))))))....))))))))))))))....))))))))))))...))))))))))))).))).)))))))))))...})},(((((.((((((((.((((.((((((((...)))))))).)))).))))))))))))),{.((((((.(........}.)).)))).}((((((.{(.,.....,})}))))))..,,))))))))))))).)}.,{{{((.........}}}))).||{..(((((((....))))))).}}}...})))........,(((((..((((((.,......}.)))))).))))),..
Back