Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_198232.3

Sequence Length

982 nt

GC Content

0.5224

AGUAUUCAAAGAUAGGAACUGACAGGAUUUUAGGUCACUUUGUAGGUCACCACCUAGAGGGGAGGAAGACCUCGCUUUGGAGAGUGGGAAUAAAACGCUCGUGGAAAAGGGUACACGCUUUUCUGGGAAAGUGAGGCCACCAUGGCUCUGGAGAAGUCUCUUGUCCGGCUCCUUCUGCUUGUCCUGAUACUGCUGGUGCUGGGCUGGGUCCAGCCUUCCCUGGGCAAGGAAUCCCGGGCCAAGAAAUUCCAGCGGCAGCAUAUGGACUCAGACAGUUCCCCCAGCAGCAGCUCCACCUACUGUAACCAAAUGAUGAGGCGCCGGAAUAUGACACAGGGGCGGUGCAAACCAGUGAACACCUUUGUGCACGAGCCCCUGGUAGAUGUCCAGAAUGUCUGUUUCCAGGAAAAGGUCACCUGCAAGAACGGGCAGGGCAACUGCUACAAGAGCAACUCCAGCAUGCACAUCACAGACUGCCGCCUGACAAACGGCUCCAGGUACCCCAACUGUGCAUACCGGACCAGCCCGAAGGAGAGACACAUCAUUGUGGCCUGUGAAGGGAGCCCAUAUGUGCCAGUCCACUUUGAUGCUUCUGUGGAGGACUCUACCUAAGGUCAGAGCAGCGAGAUACCCCACCUCCCUCAACCUCAUCCUCUCCACAGCUGCCUCUUCCCUCUUCCUUCCCUGCUGUGAAAGAAGUAACUACAGUUAGGGCUCCUAUUCAACACACACAUGCUUCCCUUUCCUGAGUCCCAUCCCUGCGUGAUUUUGGGGGUGAAGAGUGGGUUGUGAGGUGGGCCCCAUGUUAACCCCUCCACUCUUUCUUUCAAUAAAACGCAGUUGCAAACACCUGAUUUCUGAAGCGGUUCUGUCUAGGUACUGUUUCUGGCAUUGCCUUCCAGCAAGGGGUAAGAACUGUAAAUCUGAUUCACUUUGGAGAACGGUGAAUGGAGUAAUUAAAUGCCUUCCCUUCUGACUUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-332.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -349.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 133.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((((((((.(((((...(((..((((((...(((((((((..((((((.((((.((((....)))).))))..)).))))..))...((..((.((((((((.(....).)))))))).))..))..(((((...)))))((((((..(.((((((((((((.(((((((...((((..(((.(((((.(((((((((((((((.((((.....))))..)))..)))))..........))))))).)))))))))))).)))(((((......(((....)))......)))))...........)))).))))))........(((((((.(((((.....((....)).....)))))..)))))))((((.(((((....(((((((((.((((.........))))...)))))))))))))).))))..)))))))..)))))).(((((((.......(((..(((........)))..)))..........)))))))...(((((((...(((((.(((.((......((((.....((((((((((((....(((......)))...((.((..(((((((((.(((((((...))).)))).((.(((.........))).))...........)))))))))..)).))......((((.(((.(....).))).))))((((....)))))))))))).)))).....))))))))).))))).))).)))).....((((((....(((((((.((((((((((...(((.((((...)))).))).....)))))))))))))))))....))))))))))))).))))))..)))....)))))))))))(((((.((((...)))).)))))..(((.((((((.............(((.(((((((.(.....).))))))))))..............)))))))))..)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

....,,,..((((((((((((.,.(((..((((((...(((((({,(,.((((((.((((.((((....)))).))))..)).)))),,,,...,({{((.((((((((.(....).)))))))).))..))}.(((({...}))))((((((..(.((((((((((((.(((((((...((((..((,,(((((.(((((({((((((((.((((.....))))..)))..))))),))..,.....}))))),)))))),.)))).)))(((((......(((....)))......)))))...........)))).)))))}........(((((((.(((((....,(,....,},....)))))..)))))))((((.(((((....(((((((((.((((.........))))...)))))))))))))).)))).,)))))))..)))))).(((((((.......{(({{(((........)))..,,)}},.......)))))))...(((((((...(((((.(((.{{......((((...{{((((((((((((...,(((......}}}...((.((..(((((((((.(((((((...))).)))).,{.(((.........))).}}...........,))))))))..)).))......((((.(((.{....).))).)))),,,{,,,,,,),)))))))).)))).}}..))))))})),))))).))).)))).....((((((....(((((((.((((((((((..,(((.((((...)))).))).,...}))))))))))))))))....))))))})))))).))))))..)))....)))))))))))(((((.(((,...}))).))))),{(((,((((((.,,{.....,...(((.(((((((.{.....}.)))))))}))............},)))))),)).,}}))}