Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_198235.3

Sequence Length

997 nt

GC Content

0.5296

GCAGAAACUGGCCUUCCAUCUCUCUCAGACACCAAGCUGCAGAUCCAGGUCACUUUGUAGGUCACCACCUAGAGGGGAGGAAGACCUCGCUUUGGAGAGUGGGAAUAAAACGCUCGUGGAAAAGGGUACACGCUUUUCUGGGAAAGUGAGGCCACCAUGGCUCUGGAGAAGUCUCUUGUCCGGCUCCUUCUGCUUGUCCUGAUACUGCUGGUGCUGGGCUGGGUCCAGCCUUCCCUGGGCAAGGAAUCCCGGGCCAAGAAAUUCCAGCGGCAGCAUAUGGACUCAGACAGUUCCCCCAGCAGCAGCUCCACCUACUGUAACCAAAUGAUGAGGCGCCGGAAUAUGACACAGGGGCGGUGCAAACCAGUGAACACCUUUGUGCACGAGCCCCUGGUAGAUGUCCAGAAUGUCUGUUUCCAGGAAAAGGUCACCUGCAAGAACGGGCAGGGCAACUGCUACAAGAGCAACUCCAGCAUGCACAUCACAGACUGCCGCCUGACAAACGGCUCCAGGUACCCCAACUGUGCAUACCGGACCAGCCCGAAGGAGAGACACAUCAUUGUGGCCUGUGAAGGGAGCCCAUAUGUGCCAGUCCACUUUGAUGCUUCUGUGGAGGACUCUACCUAAGGUCAGAGCAGCGAGAUACCCCACCUCCCUCAACCUCAUCCUCUCCACAGCUGCCUCUUCCCUCUUCCUUCCCUGCUGUGAAAGAAGUAACUACAGUUAGGGCUCCUAUUCAACACACACAUGCUUCCCUUUCCUGAGUCCCAUCCCUGCGUGAUUUUGGGGGUGAAGAGUGGGUUGUGAGGUGGGCCCCAUGUUAACCCCUCCACUCUUUCUUUCAAUAAAACGCAGUUGCAAACACCUGAUUUCUGAAGCGGUUCUGUCUAGGUACUGUUUCUGGCAUUGCCUUCCAGCAAGGGGUAAGAACUGUAAAUCUGAUUCACUUUGGAGAACGGUGAAUGGAGUAAUUAAAUGCCUUCCCUUCUGACUUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-336.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -352.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 149.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((..((((...........((((.(((..(((.((((..(((((...(((((((((..((((((.((((.((((....)))).))))..)).))))..))...((..((.((((((((.(....).)))))))).))..))..(((((...)))))((((((..(.((((((((((((.(((((((...((((..(((.(((((.(((((((((((((((.((((.....))))..)))..)))))..........))))))).)))))))))))).)))(((((......(((....)))......)))))...........)))).))))))........(((((((.(((((.....((....)).....)))))..)))))))((((.(((((....(((((((((.((((.........))))...)))))))))))))).))))..)))))))..)))))).(((((((.......(((..(((........)))..)))..........)))))))...(((((((...(((((.(((.((......((((.....((((((((((((....(((......)))...((.((..(((((((((.(((((((...))).)))).((.(((.........))).))...........)))))))))..)).))......((((.(((.(....).))).))))((((....)))))))))))).)))).....))))))))).))))).))).)))).....((((((....(((((((.((((((((((...(((.((((...)))).))).....)))))))))))))))))....))))))))))))).)))))...)))).))))))))))...))))...)))))))......((...(((.((((((.............(((.(((((((.(.....).))))))))))..............)))))))))....)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(((((((.{((((...........{(((.(((..(((.((((..(((((...(((((({,(,.((((((.((((.((((....)))).))))..)).)))),,,,...,({{((.((((((((.(....).)))))))).))..))}.(((({...}))))((((((..(.((((((((((((.(((((((...((((..((,,(((((.(((((({((((((((.((((.....))))..)))..))))),))..,.....}))))),)))))),.)))).)))(((((......(((....)))......)))))...........)))).)))))}........(((((((.(((((....,(,....,},....)))))..)))))))((((.(((((....(((((((((.((((.........))))...)))))))))))))).)))).,)))))))..)))))).(((((((.......{(({{(((........)))..,,)}},.......)))))))...(((((((...(((((.(((.{{......((((...{{((((((((((((...,(((......}}}...((.((..(((((((((.(((((((...))).)))).,{.(((.........))).}}...........,))))))))..)).))......((((.(((.{....).))).)))),,,{,,,,,,),)))))))).)))).}}..))))))})),))))).))).)))).....((((((....(((((((.((((((((((..,(((.((((...)))).))).,...}))))))))))))))))....))))))})))))).)))))...)))).))))))}})),,,)))).,.))))))},}....{{.,,(((,((((((.,,{.....,...(((.(((((((.{.....}.)))))))}))............},))))))})).,..)),