Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_198282.4

Sequence Length

2170 nt

GC Content

0.5696

GUUCAUUUUUCACUCCUCCCUCCUAGGUCACACUUUUCAGAAAAAGAAUCUGCAUCCUGGAAACCAGAAGAAAAAUAUGAGACGGGGAAUCAUCGUGUGAUGUGUGUGCUGCCUUUGGCUGAGUGUGUGGAGUCCUGCUCAGGUGUUAGGUACAGUGUGUUUGAUCGUGGUGGCUUGAGGGGAACCCGCUGUUCAGAGCUGUGACUGCGGCUGCACUCAGAGAAGCUGCCCUUGGCUGCUCGUAGCGCCGGGCCUUCUCUCCUCGUCAUCAUCCAGAGCAGCCAGUGUCCGGGAGGCAGAAGAUGCCCCACUCCAGCCUGCAUCCAUCCAUCCCGUGUCCCAGGGGUCACGGGGCCCAGAAGGCAGCCUUGGUUCUGCUGAGUGCCUGCCUGGUGACCCUUUGGGGGCUAGGAGAGCCACCAGAGCACACUCUCCGGUACCUGGUGCUCCACCUAGCCUCCCUGCAGCUGGGACUGCUGUUAAACGGGGUCUGCAGCCUGGCUGAGGAGCUGCGCCACAUCCACUCCAGGUACCGGGGCAGCUACUGGAGGACUGUGCGGGCCUGCCUGGGCUGCCCCCUCCGCCGUGGGGCCCUGUUGCUGCUGUCCAUCUAUUUCUACUACUCCCUCCCAAAUGCGGUCGGCCCGCCCUUCACUUGGAUGCUUGCCCUCCUGGGCCUCUCGCAGGCACUGAACAUCCUCCUGGGCCUCAAGGGCCUGGCCCCAGCUGAGAUCUCUGCAGUGUGUGAAAAAGGGAAUUUCAACGUGGCCCAUGGGCUGGCAUGGUCAUAUUACAUCGGAUAUCUGCGGCUGAUCCUGCCAGAGCUCCAGGCCCGGAUUCGAACUUACAAUCAGCAUUACAACAACCUGCUACGGGGUGCAGUGAGCCAGCGGCUGUAUAUUCUCCUCCCAUUGGACUGUGGGGUGCCUGAUAACCUGAGUAUGGCUGACCCCAACAUUCGCUUCCUGGAUAAACUGCCCCAGCAGACCGGUGACCAUGCUGGCAUCAAGGAUCGGGUUUACAGCAACAGCAUCUAUGAGCUUCUGGAGAACGGGCAGCGGGCGGGCACCUGUGUCCUGGAGUACGCCACCCCCUUGCAGACUUUGUUUGCCAUGUCACAAUACAGUCAAGCUGGCUUUAGCCGGGAGGAUAGGCUUGAGCAGGCCAAACUCUUCUGCCGGACACUUGAGGACAUCCUGGCAGAUGCCCCUGAGUCUCAGAACAACUGCCGCCUCAUUGCCUACCAGGAACCUGCAGAUGACAGCAGCUUCUCGCUGUCCCAGGAGGUUCUCCGGCACCUGCGGCAGGAGGAAAAGGAAGAGGUUACUGUGGGCAGCUUGAAGACCUCAGCGGUGCCCAGUACCUCCACGAUGUCCCAAGAGCCUGAGCUCCUCAUCAGUGGAAUGGAAAAGCCCCUCCCUCUCCGCACGGAUUUCUCUUGAGACCCAGGGUCACCAGGCCAGAGCCUCCAGUGGUCUCCAAGCCUCUGGACUGGGGGCUCUCUUCAGUGGCUGAAUGUCCAGCAGAGCUAUUUCCUUCCACAGGGGGCCUUGCAGGGAAGGGUCCAGGACUUGACAUCUUAAGAUGCGUCUUGUCCCCUUGGGCCAGUCAUUUCCCCUCUCUGAGCCUCGGUGUCUUCAACCUGUGAAAUGGGAUCAUAAUCACUGCCUUACCUCCCUCACGGUUGUUGUGAGGACUGAGUGUGUGGAAGUUUUUCAUAAACUUUGGAUGCUAGUGUACUUAGGGGGUGUGCCAGGUGUCUUUCAUGGGGCCUUCCAGACCCACUCCCCACCCUUCUCCCCUUCCUUUGCCCGGGGACGCCGAACUCUCUCAAUGGUAUCAACAGGCUCCUUCGCCCUCUGGCUCCUGGUCAUGUUCCAUUAUUGGGGAGCCCCAGCAGAAGAAUGGAGAGGAGGAGGAGGCUGAGUUUGGGGUAUUGAAUCCCCCGGCUCCCACCCUGCAGCAUCAAGGUUGCUAUGGACUCUCCUGCCGGGCAACUCUUGCGUAAUCAUGACUAUCUCUAGGAUUCUGGCACCACUUCCUUCCCUGGCCCCUUAAGCCUAGCUGUGUAUCGGCACCCCCACCCCACUAGAGUACUCCCUCUCACUUGCGGUUUCCUUAUACUCCACCCCUUUCUCAACGGUCCUUUUUUAAAGCACAUCUCAGAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-823.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -860.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 494.15

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........(((((.((((...((.(((((((((....((((.......))))....((((...)))).......((((.(.((((.......)))).).)))))))))..))))..))..))).).)))))(((((((......).)))).)).(((((((((((((((((((..((.((((((.((((.((((((((((..((((((((((((.((.(((((((..((((..(((.(((...)))))))))))))))))..............)).))))))(((((((....(((((((((((.((..(((.(((((......((((.(((((.((...(((((((((.((((.....(((((..((((((...))))))))))))))).))))))))).((((((((((.((((.(((((.(.((........)).))))))))))..))))))))))...(((((..(((((.((((((((((((((((((((((((..(.(((..((...))..))).).))))))...((((..((((((..(((((...((((((((((((..(((((((.((((((((((((...((((((((((((.((...(((((...............))))).)).))))..((((.((.((((.(((((.((((....)))).....((((((((((.........((((((((...(((((((((..((((((((((.((((..((((((((((.......)))))..((((((.(((......)))))))))..))))))))).)))).)))))).....))))).)))).))))))))..............................(((((...(((.(((((...((((.(((.........(((.......))).(((((((((((..((.......))..)))..))))).)))...)))..))))....)))))))))))))..))))).)).))).)))))))))))..))))....))))))))..)))))).))....))))...))))))))))))))).)).)))))))..)))).))..))))..))))))))))))))).......)))...))))).)))))......)))))))))))))))).)))..)).))...)))))))))))))))).((((.(...(((((.(.((.(((((.((((((((....(((((((.....((((.....(((((((.(....((((((........))))))...).)))))))..))))...)))))))((((...(((....(((.(((..(((((.(((((.....)))).).)))))))))))(((((((((......((((....))))..)))).)))))..((.....))))).))))(((....)))....)).)))))).))))).)).)..))))).)))))..))))))....)).)))))))).(((((..((((..(((((.((...((((.(((.(((((....(((....((((((((....(((((((((((((((((..((((((....)))..)))..))))...))))))....((((((.(.(.((.(((((((....(..(((((.((((...((((...................)))))))))))))..)))))).)).)).).).)))))).............(((.((((((.((.((((((((((.((..((((.((......)).))))..)).)))).((((....(((((((((.(((.(((((..((((........(((((.(((((((...((((((((.....(((....)))....)))).))))..)))))))))))))))).))))).))).)).))))))).))))...(((((.((((........)))).)))))......(((.(((....(((((((.(((.(......)))))))))))..))))))............)))))))).)))))))))....))))))))))))))))))..))))).)))...)).))...))..)))))))))..)))))........)))).)))))).))..))))).........))))))........)))))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

....,,,,{{{.,,{,,,.,{{{.{((,,,{{{.,{{{{{,.,,,|..,|}}...,{{{|...})))..,,,,,||,{|(|(,(({|...,,||}}.}|)}}||||||,.{{|,..}}}.||{{|{|,|(((,,({((.,,{{{{..|||...{((({{((((,{,({(((((.,((((((((,((({(.((((((((((,.((((((((((((....(((((((..((((..(((.(((...)))))))))))))))))...............)}))))))(((((((,...(((((((((((,({..(((.(((((,.....,(((.(((((.(({{{(((((((((.((((.....(((((..((((((...))))))))))))))).)))))))},.((((((((((.((({,(((((.(.((.......,)).))))))))))..)))))))}))...{{{||,,|||{(,(({(((((((((((((((((((((..{.(((..{{...,,..))).}.))))))...((((..((((((..(((((...({((((((((((..(((((((.((((((((((((...(((((((((,{{.{{....,............,.......,,}.)).,)),..((((.((.((({{(((((.((((....)))).....((((((((((.......,,({((((((...(((((((((..((((((((((.((((..((((((((({.......})))}..(((({{{(((......)))))))))..})))})))).)))).)))))).....))))).)))).)))))))),...,,.........,.,............(((((...(((.(((((...((((.(((.........{((.......))).{((((((((((..{(.......})..)))..)))))},))...)))..))))....)))))))))))))..))))).)).))).)))))))))))..))))...)))))))))..)))))).))....))))...))))))))))))))).)).)})))))..)))).))..))))..))))))))))))))).,,.,..,,....}}))}.}))))||....)))))))))))))))).)))..)).})...)))))))))))))))).((((.(...(((((.{.((.(((((.(((((((,....(((((((.....((((.....(((((((.(....((((((........))))))...).)))))))..))))...)))))))({((,..,{(..(((({,((,.,(((((.(((((.....)))).).))))))))))))|,,{{({(,,,...((((....))))..}}}}.||||{..((,.....,,,),)},,|||,}..}}},,,,}}}}))))).))))).)).}..))))),}))))..))))))....))}}))))))).|,|||.}||||}}|{{{({{(..,{{{{|(((,{((({....{{,....((((((((....(((((((((((((((((..((((((....))),.}))..))))...)))))).....,,{{(,{.{.((.(((((((....{..(((((.((((...((((...,,,........,},..)))))))))))))..)))))).)).)).).}.))||((((.....))))},{((.((((((.{(.((((((((((.((..((((.((......)).))))..)).)))}.{{{{,,..(((((((({.(((.(((((..((((........((({({(((((((...((((((({.....(((....)))....)))).))))..)))))))))))))))).))))).))).)),))))})).))})|..((({{.((((........)))).)))))....,,|||,||,.{{{(((((((.,((.(......)))})))))).})))}||......,.....,}))))))).))))))))},,,})))})}}))))))))})),,)}))),})}.,})))}}..,))}}}))}))))}}})),))}..}}}},)))),)))),)}))}})}})),,,.,,,,,,,}}},........}))})))}.........