Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_198679.2
Sequence Length
6169 nt
GC Content
0.5722
GAGAUUCCUCAGGCUUCCCUUGUGAGGCUGCCUGGGUUCUGCCGCUGGGUGGUUUGGGAUGUCCAAGAGAUAUCCCCUUUCAGCCAGUGACUCGGUCCUCAGUUGCUGCUCCGGAAAGACGCUGGGGCUGGGAAGGGCCCUGUGUCCUCUGGCUUUAAAAUGGGCAAUGCUAUUGAAAAACAGAAGCCCUUGAAACGAAGUCAUCUGUACCCCUGGAAACAAGACUCUCAGCGUUCUCAUCUCUCUUCCUUCACCAUGAAGCUGAUGGACAAAUUCCACUCACCCAAAAUCAAGAGAACGCCAUCAAAGAAGGGAAAACCAGCUGAGGUGUCCGUAAAGAUUCCAGAGAAGCCUGUGAACAAAGAGGCAACAGACAGAUUUCUACCAGAGGGCUACCCUCUCCCCUUGGAUCUGGAGCAGCAGGCAGUAGAAUUUAUGUCCACCAGUGCUGUGGCUUCCAGGUCUCAAAGGCAGAAGAACCUGAGCUGGCUGGAGGAGAAAGAGAAGGAAGUUGUCAGUGCCCUGCGCUACUUUAAGACCAUUGUGGACAAAAUGGCAAUUGAUAAGAAGGUACUGGAGAUGCUUCCAGGGUCAGCCAGCAAGGUGCUGGAGGCCAUCUUACCCCUGGUGCAGAACGAUCCUCGAAUUCAGCACAGCUCAGCCCUCUCUUCCUGCUAUAGCCGAGUGUACCAAAGCCUCGCCAACCUCAUUCGCUGGUCUGACCAAGUGAUGCUGGAAGGCGUGAACUCAGAAGACAAGGAGAUGGUGACGACUGUGAAGGGGGUCAUCAAGGCUGUGCUGGAUGGAGUGAAGGAGCUGGUCAGGCUCACCAUCGAGAAGCAGGGACGUCCGUCUCCGACGAGCCCCGUGAAGCCCAGUUCCCCUGCCAGCAAGCCUGAUGGCCCAGCAGAGCUCCCCCUGACAGACCGCGAGGUAGAGAUCCUAAACAAGACGACUGGGAUGUCACAGUCAACUGAGCUCCUCCCAGAUGCCACGGAUGAAGAGGUCGCGCCCCCCAAGCCUCCUCUGCCUGGCAUUCGGGUGGUUGAUAAUAGUCCUCCACCAGCAUUGCCACCCAAGAAAAGACAGUCGGCGCCGUCCCCUACCCGAGUGGCUGUGGUGGCCCCCAUGAGCCGAGCCACCAGUGGCUCCAGUUUGCCUGUUGGAAUCAAUAGGCAGGAUUUUGAUGUUGACUGUUACGCACAGAGGCGACUGUCAGGAGGCAGCCACUCAUAUGGUGGAGAGUCGCCCCGCCUCUCCCCCUGCAGCAGCAUAGGCAAGCUCAGCAAGUCAGACGAGCAGCUGUCCUCUCUGGACAGGGACAGUGGGCAGUGCUCCCGGAACACAAGCUGUGAAACACUAGACCACUAUGAUCCCGACUAUGAAUUCCUCCAGCAAGACCUCUCUAACGCAGACCAGAUACCUCAGCAGACGGCCUGGAACCUUAGCCCGUUGCCAGAGUCUUUGGGGGAGUCUGGGUCUCCAUUUCUUGGCCCUCCUUUCCAGCUGCCUCUUGGCGGCCAUCCCCAGCCAGACGGACCUCUGGCCCCAGGGCAGCAGACAGAUACGCCACCUGCUCUCCCCGAGAAGAAGCGCAGGAGCGCAGCCUCCCAGACGGCGGACGGCUCUGGCUGCAGGGUGUCCUACGAGCGGCAUCCCUCGCAGUAUGACAACAUCUCUGGGGAGGACCUGCAGAGCACAGCCCCGAUCCCAUCCGUCCCCUACGCGCCCUUUGCUGCUAUUCUGCCCUUUCAGCAUGGAGGUUCCUCAGCCCCUGUCGAAUUUGUGGGUGAUUUUACUGCUCCUGAGUCAACCGGUGACCCAGAAAAACCACCUCCUCUACCAGAGAAGAAAAACAAACACAUGCUGGCCUACAUGCAGUUGCUGGAGGACUACUCGGAGCCGCAGCCCUCUAUGUUCUACCAGACGCCACAGAACGAGCACAUCUACCAGCAGAAGAACAAGCUCCUCAUGGAGGUAUACGGCUUCAGCGACUCCUUCAGUGGGGUGGACUCCGUGCAGGAGCUGGCCCCGCCGCCCGCCCUACCCCCCAAGCAGCGGCAGCUGGAGCCACCGGCUGGGAAAGACGGACAUCCCAGAGAUCCCUCAGCGGUCAGCGGCGUCCCUGGGAAGGACAGCAGAGACGGCAGUGAGAGGGCCCCAAAGUCACCAGAUGCUCUGGAGUCGGCUCAGUCGGAGGAGGAAGUGGACGAGCUGUCCCUCAUUGACCACAACGAAAUUAUGUCCAGGCUGACGCUCAAGCAGGAGGGUGAUGACGGGCCGGACGUCCGCGGAGGAUCUGGGGACAUCUUACUGGUCCAUGCUACUGAGACUGACAGGAAAGAUUUGGUGUUGUACUGCGAGGCAUUCCUGACCACCUACAGGACCUUCAUCUCCCCAGAGGAGCUCAUCAAGAAGCUGCAGUACAGAUAUGAGAAAUUCUCUCCCUUUGCCGACACAUUCAAGAAGCGCGUCAGCAAGAACACGUUCUUCGUGCUGGUACGGGUGGUGGAUGAGCUCUGCCUGGUGGAGUUGACAGAAGAGAUCCUGAAGCUGCUGAUGGAACUGGUCUUCCGCCUGGUGUGCAAUGGGGAGCUGAGCCUGGCCCGUGUGCUCCGGAAGAACAUCCUGGACAAGGUGGACCAGAAGAAGCUACUCAGGUGUGCCACCUCCAGCCAGCCCCUGGCAGCCCGGGGGGUAGCAGCCAGGCCGGGGACCUUGCACGACUUUCACAGCCAUGAGAUAGCGGAGCAGCUAACGCUGCUGGAUGCUGAGCUCUUCUAUAAAAUAGAGAUUCCUGAGGUUUUGCUUUGGGCAAAAGAGCAGAAUGAGGAGAAGAGCCCCAACUUGACCCAGUUCACGGAGCACUUCAACAACAUGUCCUACUGGGUCCGGUCCAUAAUCAUGUUACAGGAAAAGGCCCAGGACAGGGAACGGCUGCUCUUGAAGUUCAUCAAGAUCAUGAAGCACUUGCGGAAGCUGAAUAACUUCAACUCCUACUUGGCCAUCCUCUCUGCCCUGGACUCGGCGCCCAUCCGCAGGCUGGAGUGGCAGAAGCAGACUUCAGAGGGCCUGGCCGAGUACUGCACACUGAUCGACAGCUCGUCCUCCUUCCGAGCCUACCGGGCCGCCCUCUCGGAGGUGGAACCGCCGUGCAUCCCGUACCUGGGGCUGAUCCUGCAGGACCUGACCUUCGUUCACCUGGGAAACCCAGACUACAUCGACGGGAAAGUGAACUUCUCCAAGCGGUGGCAGCAGUUCAACAUCCUCGACAGCAUGCGCUGCUUCCAGCAGGCGCACUAUGACAUGCGGAGGAACGACGACAUUAUAAACUUCUUCAAUGACUUCAGUGACCACCUGGCUGAGGAGGCCCUAUGGGAACUGUCUCUGAAAAUUAAACCCAGGAACAUAACAAGGAGAAAAACAGACCGGGAAGAGAAGACCUAGGAGCAGACGCCGGGAUCCAGGAGAAUGCUCGAGGGGCGCAGAGGGCAGCUCCCAGACCGGAGAGGACCUUGGACCUGUUAGGCGCAUGGCAGGAGUCCCGGCCUCGGAGCCAUGAGGCUGGCCAGCCCUCAGCGGGGCCGGGCGGGAGCUGGAGCCUGCCAGCCGCUUCCUGCCUCCUUCCUCUGUGGGAGCAGACCCGUGGGCCUCAGGGCAGCCAGCAGGCAGGUCUUGUUGCCAAUUUACAAACCGGUGGUUUUCUGGUUUGGUUUUGUUUUCUGCUUUUACUUCCAUCUCUCCCCUCUUGACCUUCCACCCACUCCCCUCCAGGGAGAGAGCAGCAGAGACCUCAUCAGCAGACCAAGGAAGUGGUGGGUGCUCCCCCUCCCUAAGCUCCAGGGUCCCUGAAUCUUCUGAAAUCUCAAAUGAGUGGAGGCCUCCUGGGGUGGCCUGUCCUGCAGGGGCCCUGGAAUGGGGGCAAGCAGCUGGGUGGGCAGAAUGCAGAGUAGACUCGGGGGAGGAUCCUUUCACUUUCCGCUUCCCCUUCUGAUGCAUGGAGGAUGGUGUGAGCUUUUCAGCAGGCCCGGAAAGGUACGCAGGUGACGCCUUAGCAGCCCCGCAGCUGGUGCUCUGCCCCGCGGUACUGGCGCCAUCAGGGCCUCCCUUGCCCGCCUGAGAGCAGCAGCAGUCUCUGUCAUCCCGUCGCCCCUUACCCCCCACCCCAGGCCACUGGGCCCCUCCCACACCACCUGGGGAGCUGAGAAGAGGAGGCUGGAGUAAGGGAGGACUUGAUCAUCCAAGAAAUACUUUUUAUUGCUGGGAGUCUUCUGAACCUCACCAAACUGAGGCCAGAGCUGAGCUCCUGGGGGAGUUAAUUCAGAGGGGAGAGGCCAGCACCUCCCUCCUCCAUCGCUCGCUGUGUGCCUUAAACUCCAUCUCAUGUCCCUCCCCAUCCCCUGGCUUUCCCUCCCUCCUUGCCCCAUCCUGGGCCAGCCAGCAGGGCUCCUCCUCUGGCUCUUCAGACCUUUCAGCCAGUGCUGUCAGUGCCCCUGGGAGGGAAGGGCAUCCCUGAGGCACCCGAAUGGUCCCUCAGGGUGCAGGGAGGCAGAAGCCUGGCCACAGAGGAGCCUCCUAAGGCAGCAGCUGCAGCAAGCGCACCCUCUCCCCACUCUCCCCACGCCAGAGCGGCUUCCAGAGCAGAUGCUGUUUCCAUCCUCCUCGUCAAAACCAUUCUCGCUGCUGAGCUUGACAAUCUGGGCAAGGCUUGUGGGGCGCUUGACAAACAGAAUCUGCCCUGUGCCGCCUGGUUCCGUGGCCUCCAGCAUGAGCCUGCAGGCAGGGCGCUGCGGGAACCCAGUUGUGCUGCCCCAGCCCAUGCCUCCGGGUCUGCUGUGCAUGAAUGAGUGCUCACUUGUCCCGGGUUUAGGACGUGGUCAAGUGAACAGCAGGGUCUAACUGUGCUUACUUAGCCCAGUUCAAACAGAACAAAGGAAAAAUAUAGAAAGCAACAUCUGUUGAUCAUUUAGGUUUUUUUUUAAACCACCAUGUCACUUUGA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2424.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2526.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 1829.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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