Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_198718.2

Sequence Length

1971 nt

GC Content

0.5611

GCCUCGCCACCAGAGGUUUCCCAGAGAGGAAGGCGUGGCUCCCUCCCGGGCCAGUGAGCCCUGGCGCCGCCGCGGCCGCGGUCCCAGCAGCGGAGUAGGGCGGCGGCUGCGCCCCGCACCAUGGGGGGCAGCCCAGCCCCAGCCGCGGUAAACGCCGACCUCCGCCGCCGCCCGCGCCGCGUCUGCCCCCUCCCGCUGCGGCUCUCUGGACGCCAUCCCCUCCUCACCUCGAAGCCAACAUGAAGGAGACCCGGGGCUACGGAGGGGAUGCCCCCUUCUGCACCCGCCUCAACCACUCCUACACAGGCAUGUGGGCGCCCGAGCGUUCCGCCGAGGCGCGGGGCAACCUCACGCGCCCUCCAGGGUCUGGCGAGGAUUGCGGAUCGGUGUCCGUGGCCUUCCCGAUCACCAUGCUGCUCACUGGUUUCGUGGGCAACGCACUGGCCAUGCUGCUCGUGUCGCGCAGCUACCGGCGCCGGGAGAGCAAGCGCAAGAAGUCCUUCCUGCUGUGCAUCGGCUGGCUGGCGCUCACCGACCUGGUCGGGCAGCUUCUCACCACCCCGGUCGUCAUCGUCGUGUACCUGUCCAAGCAGCGUUGGGAGCACAUCGACCCGUCGGGGCGGCUCUGCACCUUUUUCGGGCUGACCAUGACUGUUUUCGGGCUCUCCUCGUUGUUCAUCGCCAGCGCCAUGGCCGUCGAGCGGGCGCUGGCCAUCAGGGCGCCGCACUGGUAUGCGAGCCACAUGAAGACGCGUGCCACCCGCGCUGUGCUGCUCGGCGUGUGGCUGGCCGUGCUCGCCUUCGCCCUGCUGCCGGUGCUGGGCGUGGGCCAGUACACCGUCCAGUGGCCCGGGACGUGGUGCUUCAUCAGCACCGGGCGAGGGGGCAACGGGACUAGCUCUUCGCAUAACUGGGGCAACCUUUUCUUCGCCUCUGCCUUUGCCUUCCUGGGGCUCUUGGCGCUGACAGUCACCUUUUCCUGCAACCUGGCCACCAUUAAGGCCCUGGUGUCCCGCUGCCGGGCCAAGGCCACGGCAUCUCAGUCCAGUGCCCAGUGGGGCCGCAUCACGACCGAGACGGCCAUUCAGCUUAUGGGGAUCAUGUGCGUGCUGUCGGUCUGCUGGUCUCCGCUCCUGAUAAUGAUGUUGAAAAUGAUCUUCAAUCAGACAUCAGUUGAGCACUGCAAGACACACACGGAGAAGCAGAAAGAAUGCAACUUCUUCUUAAUAGCUGUUCGCCUGGCUUCACUGAACCAGAUCUUGGAUCCUUGGGUUUACCUGCUGUUAAGAAAGAUCCUUCUUCGAAAGUUUUGCCAGAUGAGAAAAAGAAGACUCAGAGAGCAAUUAAUCUGCAGUUUGCAGAACUCUCAGAUACAGAGGGCAACUGCACAUUGUGGGCAAGUACAAACCUAUCGUGUGCUGAACAGAGAAGAAAUGGAGGUACUCGUGAGCAGCAUUAAUGUGUACACCAGAAUCUCAACAGUAAAGACAGAAUAACAUGAAGAAAAUAACUACAGGAGUGCUGUGUUUUAAAAAAGCAAGCUCCUCCAGCUGAGUUUGUGACUCUAAUCCCUGCUUAUUUUGAGCACUUUCCAUGUGUUGAUUGACUCGGAAAGGUGGGAGAUUACCAGCAAGCCAGGUCAUUUGGGCAAACAUGGGCAUAUUUUUAGCAAAGCUGAACAAACUGGUUGGUCACUCGAACUACCCAAUUUAGACUUAUAGUAAGAAUAGCACAUGGUUCAGAAUUGCCAAGACUGCUGCUUUAGUCAACAGAAAUUUUUUCAUAUGCAUGCUGGUAAUGCAGUGCAUCUCUGGAAGAAAUGCAAGAGUAUUUUAACAUUUGGUCCAGAAGAAAUAUGUAAAGGGUGUUUGUAGAAUUUGAUGCCCUCUUCAGUGACAUAAGGUUAUGGGUUUGUGAAUGGAAAAUCUGUUAUUUGUUCAGGUUAUUAAAACACAUUCUAAUUCAACAUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-743.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -776.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 630.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.......)))))...((((((((.(..(((((((((((..(((((.(.((((((...(((((.((.(((((.(.((((......((((....((((.(.((((((.(((((.....))))).))))))).))))...))))(((....))))))).).))))).))..)))))((((.(((...((((((.(((((((...(((((((((((((.(((((.((......((........))(((((((((((..((..((((.((((((.....((....)).....((((.(((....)))...))))(((((((.(((...))))).))))))))))).)))).)).)))))...)))))))).)))))..).)))).)))))))).))))..........(((((((((((((.......)))))))..))).)))....(((((.((...)).))))).....))).)))))).))).)))).....(.((..((.((((.....)))).))..))))))))).).)))))..))).))))((((.((((((((((((((.((((((((...(.((((.(((((((..((((((...((((.(.((((.((((((((............)))))).)).)))).)...))))))))))..)))))))....(((((((((...((......)).)))))))))(((..((((((.(.(((((...((.(((((((((..(((((((((.....)))).)))....))..))))))))).)).(((((.((((.(((((.((.......)).))))).)))).)))))...((((..(.((((((..(.(((((...))))))..)))))).)..))))..((((((..((.....))......(((((............))))).(((...(((((..(((((((...((...((.(((..........))))).)).)))).)))..)))))...))))))))).((((((((....))).)))))..))))).).)))))).))))))).)...))))).)))))))))((.(((((.((((((((((((((.....(((((...(((.((.((((.(((((((((..(((((..((......))..).))))...)))))..)))).(((((((((.....((((((((((.......)))....(((((((((((((.((..((((((.((((..((......)).)))).))..))))..))..))))))))).))))...)))))))...)))))).))).((((..........)))))))).)).....((((((...)))))).(((((.......))))).....((((((.(((((..........))))).))))))......((((.....(((..((((.(((...........))).)))).)))...))))..)))....)))))....))))))..............((((.(((.((((((...)))))))))..))))....(((((...))))).......((((((...)))))).)))))))).))))).))...)))...))))))))).((((((((.((..(((..(((((((...((((.((.((((((((...((((((((.....(((((.(.....).))))).....))))).)))....)))))))))).)))))))))))...)))..(((((......)))))....((((...))))....)).))))))))))))..).).)))))))..(((((((....)))))))(((.((..((((.(((((..........(((((((..........)))))))))))).).)))..)).)))...((..((((....((.((((((.........)))))).))....))))..))............

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((((({,,.{.((({{(,{,,.(((((,((,(({((,(((.,,,|||((((.{((((,{(((((,(,((((({,({((...{.((.(((({(..((((,(,((((((.(((({.....})))).)))))),.)))}...,.{(({{...,))})..}})))).)).),)))))))))).},)}...,...,)))),)))}}.}}||{{|||||{|}.|||||.{{..,,,,||........}}(((((((((((..{({{((((.{{{|||,,,,.||.,,,}}.....((((.(((....)))...))))(((((((.(((...))))).)))))))))}}.)))).}}.))))}...))))))))})))),.,|,}||}.}||||||((({{{..,,{{,...{{,((((((((((.,,...,)))))}}..)}}.,)}}}},(((((.((...}|.}}}}}...,})}|}})}}||}||,,||({,.,.,,..}))}}),))}})}.}}||||}|||||}((({,{,((({{{|}|}}{,}},.((((.((((({{(((((((.((((((((...,,({{,.(((((((..((((((...,{((,,.((((.((((((((............)))))).)).)))).),,.}}}}))))))..)))))))....(((((((((...{(......)).))))))))).,.,,{(((((,({(((((.,{({,(((({{{((..(({(((,(({{{,,||||||.},.,,}),,))))}))})}))}|||||,|(((,(((((.(({.,,{{,||{|||||,|}}}.}}}}),.,}}|}}})}||}|||,|{.|((((({.....)))))))}||||||}|||,.{((({{..((.,,..}}......|||||..,,...,,.,,)))}}.(((...(((({..,|))))....)))|,{{,{((..........}})},{((.((((........))))..))))))))}.{(((((((....))).))))),,.}}}}})})))))},}}))))),}...)))))},))))))))|{.(((((.((((((({((((((...,.(((((,.{(({{((,((({.(((((((((..(((({,{((,.....,,,}))})))...)))))..)))).(((((((((.....(((((((({{.......}}}....{((((((((((((.((..((((((.((((..({......}}.)))).))..))))..))..))))))))))},)}..,)))))))...))))))},)).,{{{.......,,,)})))))).),.....((((((...}))))).(((((.......)))))...,.((((((.(((((..........))))).)))))).,....{{({.....(((..((((.{(({,......,,.})).)))).)))...))))..}}}....)))))....))))))..............((((.(((.((((({...}))))))))..))))....(((({...})))).......((((({...}))))).||||}}}|.}}}}}.,,,,.,))...)))))))))...}}|))..))),)))}..,})))}...|||)))),|..,{{{{|,,((.(((((((({.(((,(((({....}}}))).}}}.,,,.{(({...,||,,},,||{{,|.{(((........)))).|,,||}}},}.})))){(((((...((((((((.{(((.(((.(((((...{(({{({((((((..(((((..{{{....)))..)))))..)))))},},....{{...((((((((..........))))))))...},}}).)}}...))))).))).)))}.)))))))))))))).,)))))))).)).,,,,,.....................