Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_198935.3
Sequence Length
4549 nt
GC Content
0.4676
GCAGCCGGAGUAUCCACCUCGAUGACCACGGGCUGAGCCCCGCGCCGCCACCAUGUCCGUGGCCUUCGCGUCUGCCCGGCCAAGAGGCAAAGGGGAGGUUACGCAGCAAACCAUCCAGAAGAUGCUGGACGAGAACCACCACCUGAUCCAGUGCAUCCUGGAGUACCAGAGCAAGGGCAAGACGGCCGAGUGCACGCAGUACCAGCAGAUCCUGCACCGGAACCUGGUAUACCUGGCCACGAUCGCAGACUCCAACCAGAACAUGCAGUCCCUGCUUCCUGCCCCGCCCACGCAGAACAUGAACCUGGGCCCUGGAGCCCUGACUCAGAGCGGCUCCAGCCAGGGCCUGCACUCUCAGGGCAGCCUGAGUGACGCCAUCAGCACGGGCCUGCCACCCUCCUCCCUCCUGCAGGGCCAGAUUGGCAACGGGCCGAGCCACGUGUCCAUGCAGCAGACGGCGCCUAACACGCUGCCCACCACCUCCAUGAGCAUCUCUGGGCCCGGCUACAGCCACGCGGGACCCGCCUCGCAGGGCGUCCCCAUGCAGGGGCAAGGCACCAUCGGCAACUACGUGUCUCGGACCAACAUCAACAUGCAGUCCAACCCAGUCUCCAUGAUGCAGCAGCAGGCGGCCACGUCGCACUACAGCUCGGCGCAGGGCGGCAGCCAGCACUACCAGGGCCAGUCGUCCAUCGCCAUGAUGGGGCAGGGCAGCCAGGGGAGCAGCAUGAUGGGGCAGCGGCCCAUGGCGCCCUACCGGCCCUCCCAGCAAGGCUCUUCCCAGCAGUACCUGGGCCAGGAGGAGUACUAUGGCGAGCAGUACAGCCACAGCCAGGGCGCCGCGGAGCCCAUGGGCCAGCAGUACUACCCCGACGGCCAUGGCGAUUACGCCUACCAGCAGUCAUCCUACACGGAGCAGAGCUACGACCGGUCCUUCGAGGAGUCCACGCAGCACUACUAUGAGGGGGGAAACUCCCAGUACAGCCAGCAGCAGGCCGGGUACCAGCAGGGUGCCGCGCAGCAGCAGACGUACUCCCAGCAGCAGUACCCCAGCCAGCAGAGCUACCCCGGGCAGCAGCAGGGCUACGGGUCUGCCCAGGGAGCCCCGUCACAGUACCCCGGCUACCAGCAAGGCCAAGGCCAGCAGUACGGAAGCUACCGAGCACCGCAGACAGCGCCGUCUGCCCAGCAGCAGCGGCCCUACGGCUAUGAACAGGGCCAGUAUGGAAAUUACCAGCAGUAAGGGACACACAUUCUGGCUGGAGCCCUUGUGGUAGCGUGUUCAUCCAGGGGCCGGAUGGGCUGGCGGCAGCUCUGGUGAAUUGUGACAUGUUGGUUACCUGUUCGCCCAGUGCCACGUCUGCAUGUGAAGCGUGCUCAUUUCAUGCUGGGUAUGACGCCGAGCGCACACCACUGGCGUGAGACAGCGCUUGGUGGUGUGAUACUUUUGGUGCUGUGUAUAGUAUUGUAUGUCGGUACACGGAGAGGUAUCCUUUUUUUGUCCCCCGCCCCCUUCUCAAUGUUUCUAGCUAGCUUUGGGGGUCAUUUUGUCAUCAGAGCAUUCUGUGCCCAGGGACAGGACAGAUCUCGAGGACACCACAGUCCACCUGUUCCCGUCAACAGACGUUAGGUCUCAUUUUCCUCCUCAUGCAGUGUUGUAGUGUGGGUUGUCAACUUUUCUUUAACUGGCUACGCCACAGCUGGACACACAUGCAGCCCCUGGAGGGCAGCCUCUUCCUGUGCCUCGAUGGGGUGGGUGGGAGGGCAUCUUCUGUGCGUUGGGUCAGUUUCUGUUACGUAACGAAAAGGAUAAACAUCUCCCACGGGAGAGGCCACAGAUGGCCACUUCCAGAGCUUGCCCAUUGCCUGUCUCUCGCCAAUUCCGUUUAUCCAAAAAGGUACAUGUUUUUGUAUUAAAAAGUAAACAGGGAUCAGUGACUGUAUUCCAAAUAAAUAUGAAUCCCUAAGGGCCGUGGACAAAUUGCCUAACCCAGGGCCAGCGGUAUUGCUGAAGGAAAGGGGCAGCUCUCUGGGAAGUGGGCCCUCAGAGAUUACUCUGGCUUUGACCCUUGUUUAGCUGAUGGUCAUUUCUGGGAUUGGAAUAUUUAAUAAGCCCAAUUCUAAGUUGAUAGGUAAUUUUAAAUAUUCAAACCAAAUCUUCCCAACAGUUGGCAAGUUGUUUAUUUUAUAUUAUUUCUUCCAGGACCUACUUGCUCAGAUCUCCAAGCAAGCAUUUCUUUUCUUUUAGGGAUGUCUGAAAGUCACAUCCAGUUACAUUACUGUGUUCUUUCUAAUGAAAAGUAAAGGUUUUAUAUAGAGAAACUUGAGUAAUUUUUACAUUUCUAAGACAUUAAAUCCCAUUUAAAUUCUGUGUGAACAUUAAAGACAGCACACUUGCAAAAGUAUGGUCAAAGGAAAAAAAUCCCACAUUUCAAUUAACAAGUAGCAUGGACAUUUGAUCAACCUUUAGUUGGAAUAAUAAUAUUCAUAUUUGCUAUGAAUCCUUUUAAAAAAAUCUUUGGAUAAAUGCUGACAGAUUUCCAAGAACUACCAAGAAAAUACAAGAGAUAUCCAAUGCUUGAUAUAUGAGGCCUAGUAAUAACGAUAUUUCUCUUUAAUUGAUGUUUUGUUUUAAAAGUUAAAAGUAAUUCUUGGCGUGGUGGUUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAAGCGGGCGGAUCACCUGAGGUCGGGAGUUCGAGACCAGCCUGACCAACAUGGAGAAACCCCGUCCCUACUAAAAAUACAAAAUUAGCCAGGUAUGGUGGUGCAUACCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAACCUGAGGCAGGAGAAUGGCUUGAACCCAGGAGACAGAGGUUGUGGUGGGGCAAGAUCGCACCAUUGCACCCGAGCCUAGGCAACAAGAGUGAAAUUCCGUCUCAAAAAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAGUUAAAAUUAAUUCUUUAUCCAGAGUCGGGUGCUUUAGAAUUUAUAAGUCACUUAUGUGUUUUGCUUGAAUUAAUUCUGACAGCCCCUAUGAGGAAAUCUGGAGGCAGGUAACAGUUCCCAUUUUAGAGAUGAAGAACUGAGGCACAGAUUAAAGGACUUGCCUGUGUUGAAUACCAGUCCUGUUCUAGGACAUUCUCCCCUCUCCUAGGAGACGGAUGUCACGCACAAAUGGGGAGAGAAGUGUUUAUUUUGUAGGCACUAAGGGUUUCUAAAACCCUUAACACUGGUAAGGGCUCAAAAAUAAACGUAUGUGUUCAUAUUCGAUCACCGAAAUGAGAGUUCUUAAUUGCUAAUUGACAAACGCGUUAGCAAUUUCAGUUAGGGAGUCAUCUCCCUUGAUUGUGUUCUUUUCCUGUCAAUUUUCAUAGACCUAAUUUGCAAACUCAAUCGGGGACUAAAAUUUCCCACUGAAAAUGUUAAACAUUUUAGAUAACUGUGAAGAUAGUUUAUUUUUAUUCCUUGCCAAUCUGGGAAUAUGCCUUUUUUGUGUGUUUGUGUGUUUUUUUAAGUGCUGUAUUAAUAAUACUUUCUGAAAGAAAAGGACACUUACCCCAAAACUUCAAUCUGAAAUGUCUUACAUUAAGAAUAUCUUGAAUGUUGUGUAUAUAUUUUAAAAAGCACUUUGCAAAAUAGUUUGUACAUUUAUUUCCUAAUUUAUACAUGAUUUUUGGUGUUAAUAUAUUUAAUGAUUAAUAACAGAAUGUUUAUUUAAUGUGCUGUCCAUUUUUAUGUAAUAUUAUGGGGAAAGUGAUGCCAGCAGUUCCUUUUCAUUAUUCUAUCUUCUGUCAUAUGAAUGUUGAGCAAAGCUUAGGCCAACAUGAAUUGUUUGUGAAGUGUGGUUGAUGGUGCUUUGUUUUUUUCUGACUACUUCUAUGGAAGGCCAGUGAAGAAGCAAAGGAAGACAUGAAAAUUGACGCUCAUUCUUCUUCCUAUUGUUCCCUGACAUCCAGCAAAUUGUGAAUUUGAAAAAUGAUGGCCAGUUUUCAGAAGUGCUGACAAAUUCAUAUUGGUAUGCAAAAGCUCAUCACCCAUUAAGGUUUGUUGUUGAAUCAACAGUACUCAGCAUAUUAAAACAGUACAUCAGAACUCAUGCCAACAGUCUUUAUGAUGGGAUUAAGGUGGACAAGAUCUCCUAAGAUCUGUGAAUGGGAUUAAGGUGGACAAGAUCUCCUAAGAUCUGAAAAGAAACCUUAAUACGCUCAUAUGGUUGGAGUGUUAAGUGAACCUCUGAUUUUGUCAGGGUUUUUCUACGUGUAGGCGUGAAUAGGGGGCACCCCUUCAAAACUGUACAAAGAAGACGACUGUUUUCCAUUUCCAUUUAAACAUUUUUAGCCACUUCAUUUCUAUUUAUUGAACAGGUCAAAUUUGUCUUGUUAUUUGUGAGUACAGUACAUUUAAAAAACAUCCUUAUCGGUUAUUUUUUUUUCAGUCGGAGUUUGACGUAUAAAUUGUUUAUGCUUUUGGUGUAAUCUCUUAAUAAACUGGUUCUUCAAAAAUCAUCCUAUAAAGUGAGUUUUCAUGAAGUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1446.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1528.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 964.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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