Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_198953.1
Sequence Length
728 nt
GC Content
0.5618
AGGGCUUUCUGUAUCCCUAGGUUUCUUGCCUUGAUGUACUGGAGCAAUCAGAUCACACGGCGGCUUGGAGAAACCCAGGGACCAUGGGCGCCUCCAGGCUCUAUACCCUGGUGCUGGUCCUGCAGCCUCAGCGAGUUCUCCUGGGCAUGAAAAAGCGAGGCUUCGGGGCCGGCCGGUGGAAUGGCUUUGGGGGCAAAGUGCAAGAAGGAGAGACCAUCGAGGAUGGGGCUAGGAGGGAGCUGCAGGAGGAGAGCGGUCUGACAGUGGACGCCCUGCACAAGGUGGGCCAGAUCGUGUUUGAGUUCGUGGGCGAGCCUGAGCUCAUGGACGUGCAUGUCUUCUGCACAGACAGCAUCCAGGGGACCCCCGUGGAGAGCGACGAAAUGCGCCCAUGCUGGUUCCAGCUGGAUCAGAUCCCCUUCAAGGACAUGUGGCCCGACGACAGCUACUGGUUUCCACUCCUGCUUCAGAAGAAGAAAUUCCACGGGUACUUCAAGUUCCAGGGUCAGGACACCAUCCUGGACUACACACUCCGCGAGGUGGACACGGUCUAGCGGGAGCCCAGGGCAGCCCCUGGGCAGGAGACGUGGCUGCUGAACAGCCGCAAACCAUCUUCACCUGGGGGCAUUGAGUGGCGCAGAGCCGGGUUUCAUCUGGAAUUAACUGGAUGGAAGGGAAAAUAAAGCUAUCUAGCGGUGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-280.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -291.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 223.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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