Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_199123.2
Sequence Length
1401 nt
GC Content
0.4918
AGGCUGCCGUCCCGCCCCUCCCGUCCGGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCACCGCCUGGGGGUUGGUUGAGGCGGACGGCGGGGUCCGGGCCGGAGUACGUCGUUCCCGCUGCGCUAGGGGAAGCGGGCAGUCAGAAAAAUGGGUAAGAAGAGUCGAGUAAAAACUCAGAAAUCUGGCACUGGUGCUACAGCAACUGUGUCACCAAAGGAAAUCUUGAACCUGACCAGUGAGCUGCUGCAGAAAUGCAGCAGUCCGGCGCCUGGCCCAGGAAAAGAGUGGGAAGAGUAUGUGCAGAUCCGGACUCUGGUUGAGAAAAUACGGAAAAAGCAAAAAGGUCUGUCCGUUACUUUUGAUGGAAAAAGAGAAGAUUACUUUCCUGAUCUAAUGAAAUGGGCCUCUGAAAAUGGGGCUUCUGUCGAGGGUUUUGAAAUGGUUAACUUCAAAGAAGAGGGCUUUGGUUUGAGAGCAACAAGAGAUAUCAAGGCAGAAGAAUUGUUUUUAUGGGUUCCACGAAAAUUGCUAAUGACUGUUGAAUCUGCUAAAAAUUCAGUGUUGGGGCCCUUAUAUUCUCAAGACCGAAUCCUUCAAGCCAUGGGAAACAUCGCACUGGCCUUUCAUUUGCUGUGUGAGCGAGCCAGCCCUAACUCCUUCUGGCAGCCCUAUAUUCAAACCCUCCCCAGUGAAUAUGACACUCCUCUCUACUUUGAAGAAGAUGAAGUUCGGUAUCUUCAGUCCACACAAGCUAUACAUGAUGUCUUCAGCCAGUAUAAAAACACAGCUCGACAGUACGCCUACUUCUAUAAAGUCAUCCAGACCCAUCCUCAUGCCAACAAACUACCCUUGAAGGAUUCUUUCACUUACGAGGACUACAGGUGGGCAGUCUCUUCUGUUAUGACGAGGCAAAACCAAAUUCCCACAGAGGAUGGUUCCCGCGUGACCCUGGCUCUGAUUCCUUUAUGGGAUAUGUGUAACCACACCAACGGCCUGACACCAGAAGAUUCCUUCGCUCUUGCUGUCGCCUCUGCCUAAGACCCUCCAUUCCUUAGGCACUUACGGGACUCACUCAUAGACCUCCUCCAGCGUGGCUGCCCUGAGCACCCUAUGUGGAAUGACUACGCCUCCAGCUCAUCCGCCCUCCUGCCCUGUCCUGUUACAUUUCCCUCUAUUGUCCAGAUCCGCUUGUUUCUGCCUUUUUAAAAAAUUAUUGUUGGUUCACCCCCCCGCCUCCCAUUAGAAUGGAAGAUCCAUGAACGCAGGGUGAUUUUGGGGGAGGGUCUGUUUUGCUCAUUGCUAUAUCGCUGUGGUUUUUAAUGAAUUCAUGACCGGUAAAUAAAUGACUGUAAAAGCCCCAUGCCUAGGAAAAAAGAUCAGAAAGAAAUAAACCAAAAUGUUAACGUGA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-414.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -442.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 350.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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