Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_199245.3
Sequence Length
3139 nt
GC Content
0.5234
AGUAAGUUCCAGCGCAGCUAGACCGCGGGGUAGUCGGCGCGAGGCGGAGCUUGGCAGUUCCGUCCACUUCAGCCGCAGCGUCCCUCACCGGGUGUCUCGCCGCAGCCUCCGGAGAGGAACAGACCCUCACUCUCUCUGUCAGAAAAAUGUCUGCUCCAGCUCAGCCACCUGCUGAAGGGACAGAAGGGACUGCCCCAGGUGGGGGUCCCCCUGGCCCUCCUCCUAACAUGACCAGUAACAGACGACUACAGCAAACCCAGGCACAAGUGGAGGAGGUGGUGGACAUCAUACGUGUGAACGUGGACAAGGUCCUGGAGAGGGACCAGAAGCUGUCAGAGCUGGAUGACCGAGCUGAUGCCUUGCAGGCAGGAGCAUCACAAUUUGAGAGCAGUGCUGCCAAGCUAAAGAGGAAGUAUUGGUGGAAAAACUGCAAGAUGAUGAUCAUGCUGGGAGCCAUCUGUGCCAUCAUCGUGGUAGUUAUUGUAAGUAAGUAUCGCUGAAGUUGCUGGUGGGGUGAAGAGGUGGGAAGGUCCUGGAGUCUUCUCCCUGCCUGCCUGCCUGCCUGGGGAGUGGGGCUGCUCUGACUGAGGUAUGGAGACCGCUGCUAUGGGAUCGUCACCUGGUUCGGGACGGGGGAAGGGCAGAGACAAGGGAUUUCUUUGAUGGACAAGCCUUCCCCCUGCAACGCAUUGCAGGGAGAUGGCGCCUCCUGUUCUGAGGAAGUGGGGCUAUGCUGUGUGUCACUGGCUUGGGUUGGAGGGAGACCAUGGGGAUGGGGCACUUAACAAUGGAGAGACCUGAAUGUCUGGUAACUUGGUGUAAUUCACCCUCUUGUUUUCUCCUGUCUCUUUCUCUUUUCCGUCUGGGACUUCCUGAUUCCUGUGUCCAGUCUACUUUUUUACUUGAGAAUGUACCACCCCUUCCCUGUUGUCCAUUGCCAUCCACAUUCAUGUCCUCUGCCCUCUGUUUGCUCUCUCAACACACUUCCCCACCCACCGUCCUCCAUUCCAGCCCAGGCUUCUCCAUCACCCAUUCCUCCUUUUUCGUUGCGUUCAUUUGCACUCUGUCCCUCAACACUAGAAAUGCUGCUCGUGGCACAAUCUAAGUCAUUACCCGAAGAGCAACAGCUGGCGCCUCCUCCCUGCCUGCUUUUUCUGUACUCUCAAGUUCCCCCAAAGCCCCAAAGAGUUGGAGGCCAAGGGAAGGGGCAGGGAGGGGAGUGGCUGAGGCGAAGUACCCAUGAAGCUGCCCAGACUUGGGAGGAGAAGAGUAUCGGUGCCCAUGGUGACUUCUAGAAAACCUGGCCACUGGUAGGAGCUAGGGAGGGGCUGGGAAGAUGGCAGCUCACUCAGUACUGCCUGGUCAUGUGGAGCUUUCCUUCCUGGACCAGGCCUGAAGAGGGUCCUGGGGGUGGACCAAAGUCCAACUUGGUUUCAGUGCAGUACCCUUUUCGAAAGUAAAAACUUGUUUUUUGUAGUUAUUUCUAAUCUGUUCGUCCAGGAUUUUCCGUGUCUUUGGGGAUCUUACAACUUUACUUUGUUCUCCAGAGGCCUGGAGAACACUUAGGGAUUGUGAAAAUAGCAGGACUUGUUUCCAUCCUAGAAGCAGUCCCAUGUGCUUCUAGCUGGAAGGAGCUUUCUCUUCUUUACAUUUUCUACAGCAUUCUGUAUGAGGGCACCAAAUAAAUCCAUCUAGCUGGUAGUUUUAUCUAGCCAAAUAAUUUAACCUAGCUCCCAGUUAAUUGUUGGCAUAAAGAGAGAGAUUGCCUGUUAGUUAUAGAGAAACAGUGAGUCAAGUGCUUAAUUUGAAAGUAACAAGCUCAGAGGAAGCCACUCCUUGCCCUCGUUAAAGAGGGUCCUGUUCCUCUCUUCCUGUUGAUGAAGGAGCGUGAGGGUGUUAGCAGUGUGAGAUCUUUGGACACCCAUGGAAUCCUUUCCUCCACACCACCCGUGCACUUGCCAAAGACAGGGAUGAGGCAAGUGGUUCUUCCUGGGGCCCGGCCGAUCCUCAGGAUGCAGAGAAGUCAUGUAGACCCACCAGCCCCACCUUGGGGGGAGGCGUGCCAGCCUGUGUCAGGUGUGCUUGUGUAUUGCUGUGCUGUCAUGGGGCCCUCUCCUUGAGAGCCGCCUCUCUGUUCUUCCUGUAGUAUAUUCCCCUUUGAACCACCCUUUCCUGUCUGAAUUCUACUUUGCCUCCUUUCUCUUCCUCCUCUUUGCAUGGUUUGUGUGUAUAGACAGUGGAACCUGAGGAUGGGAUCUGCUCAGCCUAUCUUCGGGGCAAUUGCUGAGCUUCAGGAUGGGCUAUUAAUGUGGGAUAAGCCCAGGUGCAAGGGGAGGAGGGCAGGCUGGGAACAGAGCGGAGAAUGCCCAUGGCCCUUUAUUCCUUCUUCCCUCGGUCCACGAACAGGAAGAGGCUGAGGCCAUGCUGGGCAGGGUCUGGAUGCCCACUUUCCAUGCAGCAGCAUUUCAUUGCUCAAAACCAUCCUUCCUUUCCUUUCGCCCUUGUUUCCCACAUUCCCUUCGUCCUGCCCAAGGGCGGGACUGAAGAGCUGGAAGAAAGCAGUCAGUACCCUCCCAACGGCCCCCCUCGAAGGUCUCCACUCUCCUCUGGGCUCCUCCUUGCCUAAUGCAGGGGGUCACCGCUGGAGAAGAACCACCACUGUCCUCGAUGUGUCCCAAGCCUGGAGCGAAUCCGUCCUCUUGGCUCUCCCAGCCCUAUCACAGGAAUCAUUCCUGGGUUUCUGUCCCUCUGAGGCUCACCAGGUGUAGUUGGCCUUGUUCUUUGGGGGUAUUAGCCCUUCUACUUUCUUUCUCACCCACCCUGUACCCUCUUCUGUGUGUCUCUGCUAUCCCCCUUUCCUCCCACCACCCAUGUGCAUGAGCAAAUGUGCAACAAAACCCUGGGACUUUGCAGUCAAAUGAAGCUGAGCUUCCCACAUCCCGUUCUUCGGUUUGCCAUGAGACGAUGUGGGGUUUCCACUGUGUGUCUGUCAUCACCUCUUUGUCUUUUUUUCCUAACCCUGAUCUCAUACUUGUAUAGAGUAAUAACAACAGUUGUACUUCCACCAAAGGCAUGUGGCAUAUUUACCAAUGUCAUGUAUUCUGAACAAAGGCAAAAAAUACAAAUUCCUACCAUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1119.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1181.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 842.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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